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公开(公告)号：CN115466794B
公开(公告)日：2023-08-25
申请号：CN202211303789.9
申请日：2022-10-24
Applicant: 江南大学
IPC: C12Q1/6886 , C12M1/34 , C12M1/00 , G16B30/10
Abstract: 本发明公开了肿瘤标记物及其在制备结直肠癌诊断试剂盒中的应用，属于表观遗传及肿瘤学领域。在本发明中，我们研究了CRC患者肿瘤黏膜和邻近正常黏膜中的3个不同基因IGFBP7、BLCAP和PPIA的6个RNA编辑位点IGFBP7:chr4:57110068、IGFBP7:chr4:57110120、BLCAP:chr20:37519170、BLCAP:chr20:37519161、BLCAP:chr20:37519131和PPIA:chr7:44802500的编辑水平存在明显差异，此3种不同基因与癌症的发生发展存在关联，并且其RNA编辑的组合用于诊断CRC的发生具有很高的准确率。
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公开(公告)号：CN115992124A
公开(公告)日：2023-04-21
申请号：CN202111217385.3
申请日：2021-10-19
Applicant: 江南大学
Abstract: 本发明公开了一种基于食蟹猴APOBEC3A及其突变体的胞嘧啶碱基编辑器，属于基因工程技术领域。本发明构建的一系列CBE单碱基编辑器主要包含sgRNA、mA3A或其突变体、nCas9(D10A)、红色荧光蛋白、尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂、高拷贝复制起点以及氨苄青霉素抗性筛选标记基因。本发明构建的单碱基编辑器的编辑窗口为C3‑C14位点，编辑效率最高可达75％，产物纯度最高可达95％，本发明首次采用非人灵长类动物食蟹猴的APOBEC3A作为CBE系统的胞嘧啶脱氨酶，丰富了基因编辑工具包，为今后胞嘧啶碱基编辑器的优化提供了一个很好的思路和方向。
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公开(公告)号：CN115466794A
公开(公告)日：2022-12-13
申请号：CN202211303789.9
申请日：2022-10-24
Applicant: 江南大学
IPC: C12Q1/6886 , C12M1/34 , C12M1/00 , G16B30/10
Abstract: 本发明公开了肿瘤标记物及其在制备结直肠癌诊断试剂盒中的应用，属于表观遗传及肿瘤学领域。在本发明中，我们研究了CRC患者肿瘤黏膜和邻近正常黏膜中的3个不同基因IGFBP7、BLCAP和PPIA的6个RNA编辑位点IGFBP7:chr4:57110068、IGFBP7:chr4:57110120、BLCAP:chr20:37519170、BLCAP:chr20:37519161、BLCAP:chr20:37519131和PPIA:chr7:44802500的编辑水平存在明显差异，此3种不同基因与癌症的发生发展存在关联，并且其RNA编辑的组合用于诊断CRC的发生具有很高的准确率。
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公开(公告)号：CN115992123A
公开(公告)日：2023-04-21
申请号：CN202111217333.6
申请日：2021-10-19
Applicant: 江南大学
Abstract: 本发明公开了一种基于食蟹猴改造后的APOBEC3A的胞嘧啶碱基编辑器，属于基因工程技术领域。本发明以食蟹猴来源的APOBEC3A为亲本酶，删除了第27～29位的丝氨酸，缬氨酸和精氨酸，获得了mA3A‑delSVR基因片段，并将其应用于单碱基编辑器的构建，本发明构建的CBE单碱基编辑器BE4‑mA3A‑delSVR特异性的在第C5和C6位进行C>T转换，编辑效率和产物纯度较高。因此本发明构建的编辑器编辑效率高，产物纯度高，编辑窗口更特异，丰富了基因编辑的工具包，也为单基因遗传病的基因治疗提供一个潜在的工具。
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公开(公告)号：CN115992122B
公开(公告)日：2025-05-16
申请号：CN202111215861.8
申请日：2021-10-19
Applicant: 江南大学
Abstract: 本发明公开了一种基于人的改造后的APOBEC3A的胞嘧啶碱基编辑器，属于基因工程技术领域。本发明构建的CBE单碱基编辑器BE4‑hA3A‑SVR+的编辑窗口为C3‑C14位点，编辑效率较BE4‑rA1最高提高近5倍，较BE4‑hA3A提高了将近1倍和产物纯度最高可达97％。因此本发明构建的hA3A‑SVR+是优于rA1的用于CBE基因编辑系统优化的胞嘧啶脱氨酶，且获得一个编辑效率高，产物纯度高，编辑窗口宽的基因编辑工具。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN113564257B
公开(公告)日：2024-02-27
申请号：CN202110975001.8
申请日：2021-08-24
Applicant: 江南大学
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/689 , C12Q1/04 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及肿瘤标记物及其在制备结直肠癌诊断试剂盒中的应用，属于微生物及肿瘤学领域。本发明中提供了一种新的肿瘤标记物，由20种微生物Stenotrophomonas、Allobaculum、Kaistobacter、Phyllobacterium、Rhodoplane、Phenylobacterium、Cytophagaceae、Koribacteraceae、Psychrobacter、Enhydrobacter、Chryseobacterium、Thermomonas、Cloacibacterium、Cetobacterium、Geobacter、Brevundimonas、Pseudomonas、Flavisolibacter、Brochothrix和Symbiobacterium组成。该标志物可用于诊断试剂盒的制备，用于结直肠癌的辅助诊断，分期及预后生存情况的分析。
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公开(公告)号：CN116356020A
公开(公告)日：2023-06-30
申请号：CN202310179621.X
申请日：2023-02-28
Applicant: 江南大学
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6837 , C40B40/06
Abstract: 本发明公开了PVR RNA编辑作为肿瘤标记物及其在制备结直肠癌诊断试剂盒中的应用，属于表观遗传及肿瘤学领域。发明人在研究中发现，CRC患者肿瘤黏膜和邻近正常黏膜中PVR基因的两个位点的A>I RNA编辑存在显著差异，且与PVR mRNA表达水平呈显著正相关，PVR的表达水平与癌症的发生发展存在关联。在本发明中，我们研究了CRC患者肿瘤黏膜和邻近正常黏膜中的基因——PVR细胞粘附分子基因的2个A>I RNA编辑位点PVR:chr19:44665483和PVR:chr19:44665513的A>I RNA编辑水平存在明显差异，PVR与CRC的发生发展存在关联，并且上述2个差异A>I RNA编辑位点的组合用于诊断CRC的发生具有很高的准确率。
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公开(公告)号：CN115992124B
公开(公告)日：2025-05-13
申请号：CN202111217385.3
申请日：2021-10-19
Applicant: 江南大学
Abstract: 本发明公开了一种基于食蟹猴APOBEC3A及其突变体的胞嘧啶碱基编辑器，属于基因工程技术领域。本发明构建的一系列CBE单碱基编辑器主要包含sgRNA、mA3A或其突变体、nCas9(D10A)、红色荧光蛋白、尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂、高拷贝复制起点以及氨苄青霉素抗性筛选标记基因。本发明构建的单碱基编辑器的编辑窗口为C3‑C14位点，编辑效率最高可达75％，产物纯度最高可达95％，本发明首次采用非人灵长类动物食蟹猴的APOBEC3A作为CBE系统的胞嘧啶脱氨酶，丰富了基因编辑工具包，为今后胞嘧啶碱基编辑器的优化提供了一个很好的思路和方向。
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公开(公告)号：CN115992122A
公开(公告)日：2023-04-21
申请号：CN202111215861.8
申请日：2021-10-19
Applicant: 江南大学
Abstract: 本发明公开了一种基于人的改造后的APOBEC3A的胞嘧啶碱基编辑器，属于基因工程技术领域。本发明构建的CBE单碱基编辑器BE4‑hA3A‑SVR+的编辑窗口为C3‑C14位点，编辑效率较BE4‑rA1最高提高近5倍，较BE4‑hA3A提高了将近1倍和产物纯度最高可达97％。因此本发明构建的hA3A‑SVR+是优于rA1的用于CBE基因编辑系统优化的胞嘧啶脱氨酶，且获得一个编辑效率高，产物纯度高，编辑窗口宽的基因编辑工具。
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公开(公告)号：CN113564257A
公开(公告)日：2021-10-29
申请号：CN202110975001.8
申请日：2021-08-24
Applicant: 江南大学
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/689 , C12Q1/04 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及肿瘤标记物及其在制备结直肠癌诊断试剂盒中的应用，属于微生物及肿瘤学领域。本发明中提供了一种新的肿瘤标记物，由20种微生物Stenotrophomonas、Allobaculum、Kaistobacter、Phyllobacterium、Rhodoplane、Phenylobacterium、Cytophagaceae、Koribacteraceae、Psychrobacter、Enhydrobacter、Chryseobacterium、Thermomonas、Cloacibacterium、Cetobacterium、Geobacter、Brevundimonas、Pseudomonas、Flavisolibacter、Brochothrix和Symbiobacterium组成。该标志物可用于诊断试剂盒的制备，用于结直肠癌的辅助诊断，分期及预后生存情况的分析。
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