公开(公告)号：EP2836604A4

公开(公告)日：2016-04-13

申请号：EP13775787

申请日：2013-04-08

申请人： UNIV COLUMBIA ,  US GOVERNMENT

发明人： JU JINGYUE ,  KUMAR SHIV ,  TAO CHUANJUAN ,  CHIEN MINCHEN ,  RUSSO JAMES J ,  KASIANOVICZ JOHN J ,  ROBERTSON JOSEPH W F

IPC分类号： C12Q1/42

CPC分类号： C12Q1/6883 ,  B82Y5/00 ,  C07H19/06 ,  C07H19/16 ,  C12Q1/42 ,  C12Q1/48 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2600/158 ,  G01N33/48721 ,  G01N2333/9125 ,  C12Q2565/631 ,  C12Q2521/525 ,  C12Q2521/543 ,  C12Q2535/107

摘要： This disclosure provides systems and methods for sequencing nucleic acids using nucleotide analogues and translocation of tags from incorporated nucleotide analogues through a nanopore. In aspects, this disclosure is related to composition, method, and system for sequencing a nucleic acid using tag molecules and detection of translocation through a nanopore of tags released from incorporation of the molecule.

公开(公告)号：EP3233881A4

公开(公告)日：2018-06-06

申请号：EP15871195

申请日：2015-12-18

申请人： UNIV COLUMBIA

发明人： BESTOR TIMOTHY H ,  JU JINGYUE ,  LI XIAOXU ,  RUSSO JAMES J

IPC分类号： C07H19/167 ,  C12Q1/6806

CPC分类号： C07H19/16 ,  C07H19/167 ,  C12N9/1007 ,  C12P19/34 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6827 ,  C12Q1/6874 ,  C12Y201/01 ,  C12Q2535/101 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q2563/101 ,  C12Q2565/631 ,  C12Q2563/167 ,  C12Q2563/107

摘要： The present invention provides a method of determining whether cytosine residues present at a predetermined positions within a single strand of a double stranded DNA of known sequence are methylated as well as compounds for carrying out this method.

公开(公告)号：EP2864502A4

公开(公告)日：2016-04-13

申请号：EP13807639

申请日：2013-04-08

申请人： UNIV COLUMBIA ,  GENIA TECHNOLOGIES INC

发明人： JU JINGYUE ,  DAVIS RANDALL ,  CHEN ROGER

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12Q1/00

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  G01N33/48721 ,  C12Q2521/101 ,  C12Q2521/543 ,  C12Q2537/157 ,  C12Q2565/631

摘要： This disclosure provides systems and methods for sequencing nucleic acids using nucleotide analogues and translocation of tags from incorporated nucleotide analogues through a nanopore. In aspects, this disclosure is related to composition, method, and system for sequencing a nucleic acid using tag molecules and detection of translocation through a nanopore of tags released from incorporation of the molecule.

摘要翻译： 本公开提供了使用核苷酸类似物对核酸进行测序的系统和方法，以及通过纳米孔从掺入的核苷酸类似物转移标签。 在一些方面，本公开涉及使用标签分子对核酸测序的组合物，方法和系统，以及通过从分子掺入释放的标记的纳米孔的易位检测。

公开(公告)号：EP2652153A4

公开(公告)日：2014-05-14

申请号：EP11848220

申请日：2011-12-16

申请人： UNIV COLUMBIA

发明人： JU JINGYUE ,  KUMAR SHIV ,  LI ZENGMIN ,  TAO CHUANJUAN ,  CHIEN MINCHEN ,  RUSSO JAMES J ,  KALACHIKOV SERGEY ,  SHEPARD KEN ,  ROSENSTEIN JACOB KARL

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  C07H19/10 ,  C07H21/00 ,  G01N33/48721 ,  C12Q2525/113 ,  C12Q2525/117 ,  C12Q2565/518 ,  C12Q2565/631

公开(公告)号：EP3122759A4

公开(公告)日：2017-12-13

申请号：EP15768383

申请日：2015-03-23

申请人： UNIV COLUMBIA ,  GENIA TECH INC

发明人： FULLER CARL W ,  KUMAR SHIV ,  JU JINGYUE ,  DAVIS RANDALL ,  CHEN ROGER

IPC分类号： C07H19/04

CPC分类号： C12Q1/6874 ,  C07H17/02 ,  C07H19/10 ,  C07H19/20 ,  C12Q1/6806

摘要： This disclosure provides systems and methods for attaching nanopore-detectable tags to nucleotides. The disclosure also provides methods for sequencing nucleic acids using the disclosed tagged nucleotides.

公开(公告)号：EP1957983A4

公开(公告)日：2010-03-24

申请号：EP06838256

申请日：2006-11-20

申请人： UNIV COLUMBIA

发明人： JU JINGYUE ,  BAI XIAOPENG ,  TURRO NICHOLAS J

IPC分类号： G01N33/53

CPC分类号： G01N33/6848

公开(公告)号：EP1337541A4

公开(公告)日：2004-07-14

申请号：EP01977533

申请日：2001-10-05

申请人： UNIV COLUMBIA

发明人： ITAGAKI YASUHIRO ,  JU JINGYUE ,  LI ZENGMIN ,  EDWARDS JOHN ROBERT

IPC分类号： G01N33/53 ,  C07B61/00 ,  C07H19/10 ,  C07H19/20 ,  C07H21/00 ,  C12N15/09 ,  G01N37/00 ,  C12Q1/68 ,  C07H19/207 ,  H01J49/04

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  C07B2200/11 ,  C07H19/10 ,  C07H19/14 ,  C07H21/00 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/686 ,  C12Q1/6872 ,  C12Q1/6874 ,  C12Q1/6876 ,  C12Q2525/117 ,  C12Q2535/101 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q2563/107 ,  C40B40/00 ,  C12Q2565/501 ,  C12Q2525/186

摘要： This invention provides methods for attaching a nucleic acid to a solid surface and for sequencing nucleic acid by detecting the identity of each nucleotide analogue after the nucleotide analogue is incorporated into a growing strand of DNA in a polymerase reaction. The invention also provides nucleotide analogues which comprise unique labels attached to the nucleotide analogue through a cleavable linker, and a cleavable chemical group to cap the -OH group at the 3'-position of the deoxyribose.

摘要翻译： 本发明提供了通过在聚合酶反应中将核苷酸类似物掺入DNA的生长链中之后​​检测核苷酸类似物的同一性来提供将核酸连接到固体表面和测序核酸的方法。 本发明还提供核苷酸类似物，其包含通过可切割连接体连接到核苷酸类似物的独特标记，以及可脱离化学基团以在脱氧核糖的3'-位上封端-OH基团。

公开(公告)号：EP3105354A4

公开(公告)日：2018-02-14

申请号：EP15749646

申请日：2015-02-12

申请人： UNIV COLUMBIA

发明人： TAO CHUANJUAN ,  KUMAR SHIV ,  CHIEN MINCHEN ,  JU JINGYUE

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6858 ,  C12Q1/6853 ,  C12Q2525/186 ,  C12Q2565/631 ,  C12Q2535/113

摘要： This invention provides methods of using labeled primers or probes for nucleic acid target detection and to detect the identity or presence of a nucleotide at certain positions in nucleic acid sequences with single molecule sensitivity using nanopore detection, and sets of oligonucleotide primers for use in such methods, as well as methods of quantitative PCR coupled with nanopore detection.

公开(公告)号：EP2971051A4

公开(公告)日：2017-03-01

申请号：EP14764268

申请日：2014-03-14

申请人： UNIV COLUMBIA

发明人： JU JINGYUE ,  KUMAR SHIV ,  TAO CHUANJUAN ,  KALACHIKOV SERGEY ,  RUSSO JAMES J

IPC分类号： C12Q1/00

CPC分类号： G01N33/6818 ,  C08G65/48 ,  G01N33/48721

公开(公告)号：EP1322785A4

公开(公告)日：2005-11-09

申请号：EP01968905

申请日：2001-09-11

申请人： UNIV COLUMBIA

发明人： JU JINGYUE ,  LI ZENGMIN ,  TONG ANTHONY ,  RUSSO JAMES J

IPC分类号： G01N21/64 ,  C07B61/00 ,  C12N15/09 ,  C12Q1/68 ,  G01N21/78 ,  G01N33/53 ,  G01N33/566 ,  G01N33/58 ,  C07H21/04

CPC分类号： B82Y20/00 ,  B82Y5/00 ,  B82Y10/00 ,  C12Q1/6818 ,  C12Q1/6827 ,  C40B40/00 ,  C12Q2533/107 ,  C12Q2565/101

摘要： This invention provides a combinatorial fluorescence energy transfer tag which comprises a plurality of fluorescent molecules, comprising one or more energy transfer donor and one or more energy transfer acceptor, linked through a molecular scaffold wherein the fluorescent molecules are separated along the scaffold to produce a unique fluorescene emission signature. The invention further provides for the use of said tags in multi-component analyses, including multiplex biological analyses.