公开(公告)号：JP2018527012A

公开(公告)日：2018-09-20

申请号：JP2018514967

申请日：2016-09-16

申请人： ぺタオミクス, インコーポレイテッド

发明人： リザルディ, ポール エム. ,  ファーガソン, ブレント ダブリュー.

IPC分类号： C12Q1/6876 ,  C12Q1/6844 ,  C12Q1/6816

CPC分类号： C12Q1/6839 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q2525/107

摘要： 配列特異的PNAハイブリダイゼーションプローブを使用してゲノムDNA断片から1つ以上の大型二本鎖DNA断片(それぞれ2,000〜40,000塩基のサイズ)がキャプチャ及び単離され得ることが確立されている。任意の真核生物のゲノムから選択された複数の長いDNA配列をエンリッチするための組成物及び方法が提供される。キャプチャは、中性化学基と、ジエチレングリコール、ガンマ−L−リジン、ガンマ−L−チアリジンなどの正の化学基との混合物を含む、ガンマ修飾されたキラル骨格を有する複数のPNA分子を使用して実施される。共有結合的に結合したハプテン、好ましくはビオチンを有する2つ以上のPNAプローブが、DNAメチル化シーケンシングを含め、複数のエンリッチ標的のキャプチャ、単離、及び続くシーケンシング解析のために目的の各DNAドメインを標的化する。

公开(公告)号：JP2018522574A

公开(公告)日：2018-08-16

申请号：JP2018506936

申请日：2016-08-24

申请人： リパブリック オブ コリア(ナショナル フィッシェリーズ リサーチ アンド デベロップメント インスティチュート)

发明人： チョ,ミヨン ,  パク,ミョンエ ,  チ,ボヨン ,  ファン,ソントン

IPC分类号： C12Q1/6888

CPC分类号： C12Q1/6837 ,  C12Q1/6809 ,  C12Q1/6897 ,  C12Q1/705 ,  C12Q2525/107

摘要： 本発明は、水産生物伝染病原因ウイルスの判別または検出用遺伝子マーカー、及びこれを利用した原因ウイルスの判別または検出方法に関し、より詳しくはウイルス性出血性敗血症ウイルス(Viral Hemorrhagic Septicemia Virus,VHSV)、マダイイリドウイルス病の原因ウイルスであるマダイイリドウイルス(Red Sea Bream Iridovirus,RSIV)/感染性脾臓及び腎臓壊死ウイルス(Infectious Spleen and Kidney Necrosis Virus,ISKNV)、またはコイヘルペスウイルス(Koi Herpesvirus,KHV)の特定遺伝子をコードするDNA塩基配列を選定して増幅させた後、増幅産物を特異的に認識するペプチド核酸(Peptide Nucleic Acid,PNA)をハイブリダイゼーションさせて、ハイブリダイゼーションされた産物の温度調節を介して温度依存融解曲線を得て、前記得た融解曲線の分析を介して融解温度を決定してウイルス類型を判別し、または魚類における前記ウイルス類型に対する感染の有無を検出する方法に関する。 【選択図】図8

公开(公告)号：JP2014506472A

公开(公告)日：2014-03-17

申请号：JP2013554022

申请日：2012-02-15

申请人： マッツ ニルソン ベルニッツ ,  カタリーナ ラーソン ,  イダ グルンドベルク

发明人： マッツ ニルソン ベルニッツ ,  カタリーナ ラーソン ,  イダ グルンドベルク

IPC分类号： C12N15/09 ,  C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6827 ,  C12Q1/6809 ,  C12Q1/6841 ,  C12Q1/6886 ,  C12Q2600/112 ,  C12Q2600/156 ,  C12Q2600/16 ,  C12Q2521/107 ,  C12Q2521/327 ,  C12Q2525/107 ,  C12Q2525/125 ,  C12Q2525/161 ,  C12Q2525/307 ,  C12Q2531/125 ,  C12Q2537/143 ,  C12Q2543/10

摘要： 本発明は、細胞の試料中のRNAの検出に関する。 より詳細には、本発明は、インサイチューでのRNAの局在検出に関する。 本方法は、RNAを相補的DNAに変換した後、パドロックプローブにより該cDNAを標的化することに依る。 パドロックプローブのハイブリダイゼーションは、標的RNAの対応するヌクレオチド配列に由来するcDNAのヌクレオチド配列に依る。 その後環状化されたパドロックプローブのローリングサークル増幅により、ローリングサークル産物が生成され、これが検出され得る。 有利なことには、これによってインサイチューでのRNAの検出が可能になる。

公开(公告)号：JP2010530249A

公开(公告)日：2010-09-09

申请号：JP2010513390

申请日：2008-06-18

申请人： アプライド バイオシステムズ, エルエルシー

发明人： ロリ ケー． ヘネシー， ,  ジュリオ ジェイ． ムレロ，

IPC分类号： C12N15/09 ,  C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6853 ,  C12Q1/6848 ,  C12Q1/686 ,  C12Q2527/127 ,  C12Q2525/113 ,  C12Q2525/107

摘要： 本発明の教示は、核酸増幅のための方法、組成物およびキットを提供する。 本発明の教示のいくつかの実施形態において、増幅反応が少なくとも１つの高安定性プライマーとともに行われる。 いくつかの実施形態において、本発明の教示は、標的核酸配列およびＰＣＲ阻害剤を含むサンプルにおける核酸配列を増幅するための高安定性プライマーを含む方法を提供する。 いくつかの態様において、ヒト法医学サンプルにおける標的核酸配列を増幅するための方法が提供される。 この方法は、標的核酸配列を含むヒト法医学サンプルを提供する工程、少なくとも１つの高安定性核酸アナログを含む少なくとも１つの高安定性プライマーを標的核酸配列と合わせる工程、および、増幅反応をサンプルに対して行うことによって、標的核酸配列を高安定性プライマーにより増幅する工程を含む。

公开(公告)号：JP4528115B2

公开(公告)日：2010-08-18

申请号：JP2004516105

申请日：2003-06-20

申请人： ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニアThe Regents of The University of California

发明人： ゲイロード，ブレント，エス． ,  バザン，グイレルモ，シー．

IPC分类号： G01N33/53 ,  G01N33/543 ,  C07H21/02 ,  C08G63/48 ,  C08G63/91 ,  C12Q1/68 ,  G01N20060101 ,  G01N21/78 ,  G01N33/566

CPC分类号： C12Q1/6818 ,  C12Q1/682 ,  Y10T436/143333 ,  C12Q2565/107 ,  C12Q2525/107 ,  C12Q2527/125

公开(公告)号：JP2008253251A

公开(公告)日：2008-10-23

申请号：JP2008060342

申请日：2008-03-10

申请人： Rolf Henrik Berg ,  Buchardt Dorte ,  Michael Egholm ,  Peter Eigil Nielsen ,  エグホルム、ミカエル ,  ニールセン、ピーター・アイギル ,  ブカルト、ドルテ ,  ベルク、ロルフ・ヘンリク

发明人： BUCHARDT OLE ,  EGHOLM MICHAEL ,  NIELSEN PETER EIGIL ,  BERG ROLF HENRIK

IPC分类号： A61K31/70 ,  C12N15/09 ,  A61K38/00 ,  A61K48/00 ,  A61P31/12 ,  A61P43/00 ,  C07D519/00 ,  C07H21/00 ,  C07H21/04 ,  C07K1/22 ,  C07K5/06 ,  C07K5/078 ,  C07K5/08 ,  C07K5/10 ,  C07K7/06 ,  C07K7/08 ,  C07K9/00 ,  C07K14/00 ,  C07K16/00 ,  C08G69/00 ,  C12Q1/68 ,  G01N33/53

CPC分类号： C07H21/00 ,  A61K38/00 ,  C07K5/06026 ,  C07K5/06139 ,  C07K7/06 ,  C07K7/08 ,  C07K14/003 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/6813 ,  C12Q1/6832 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2535/107 ,  C12Q2525/107

摘要： PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a nucleic acid analog for performing capture, recognition, detection, identification or quantification about chemically or microbiologically individual units. SOLUTION: The nucleic acid analogues provided are: (a) a PNA (peptide nucleic acid) including a polyamide backbone bearing a plurality of ligands at respective spaced locations along the backbone, where each ligand being bound directly or indirectly to a nitrogen atom in the backbone and the ligand bearing nitrogen atoms mainly being separated from one another in the backbone by 4-8 intervening atoms; (b) a nucleic acid analog capable of hybridizing to a nucleic acid of complementary sequence to form a hybrid which is more stable against denaturation by heat than a hybrid between the conventional deoxyribonucleotide and the nucleic acid; or (c) a nucleic acid analogue capable of hybridizing to double-stranded nucleic acid in which one strand has a sequence complementary to the analogue, so as to displace the other strand from one strand. COPYRIGHT: (C)2009,JPO&INPIT

摘要翻译： 要解决的问题：提供用于进行关于化学或微生物学单个单元的捕获，识别，检测，鉴定或定量的核酸类似物。 提供的核酸类似物是：（a）包含聚酰胺主链的PNA（肽核酸），其中所述聚酰胺主链在主链的相应间隔位置处具有多个配体，其中每个配体直接或间接地结合于氮 骨架中的原子和带有氮原子的配体主要通过4-8个中间原子在骨架中彼此分离; （b）能够与互补序列的核酸杂交的核酸类似物，以形成与常规脱氧核糖核苷酸和核酸之间的杂交体相比对抗变性更稳定的杂交体; 或（c）能够与双链核酸杂交的核酸类似物，其中一条链具有与该类似物互补的序列，以便从一条链取代另一条链。 版权所有（C）2009，JPO＆INPIT

公开(公告)号：JP2007524843A

公开(公告)日：2007-08-30

申请号：JP2006518973

申请日：2004-07-09

申请人： サイティック コーポレーション

发明人： エリン コフマン ,  マイケル コヘンフォード ,  ジェイムス ランデ ,  ブライアン ビー． レントリシア

IPC分类号： G01N33/536 ,  C12Q20060101 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/70 ,  G01N21/78 ,  G01N33/53 ,  G01N33/531

CPC分类号： C12Q1/6881 ,  C12Q1/6841 ,  C12Q1/6888 ,  C12Q1/708 ,  C12Q2525/107

摘要： 本発明は、アルコール性保存溶液中で標的物質を検出するのに有用な、およびそのような標的への結合に有用なセンサーを同定するための、方法、物品ならびに組成物に関する。 本方法は、試料の十分な固定化および試料における対象となる標的への検出可能なセンサーの結合の同時実行を可能にする。 一つの局面において、アルコール性保存溶液において、標的を含むのではないかと疑われる試料を、そのような標的に結合することが知られている検出可能なセンサー分子と接触させる段階を含む方法が提供される。 本方法は、複数の標的の同時分析を可能にする多重形式で行われうる。 アルコール性保存溶液において所望の標的に結合する能力があるセンサーを同定するための方法もまた提供される。 1つまたは複数のそのような検出可能なセンサーを含むアルコール性保存溶液もまた提供される。 また、そのような過程により供給された結合したセンサーを含む試料も提供される。 また、そのような方法に有用なキットも提供される。

公开(公告)号：JP2007512837A

公开(公告)日：2007-05-24

申请号：JP2006542596

申请日：2004-11-15

申请人： アボット・ラボラトリーズAbbott Laboratories

发明人： アブラバヤ，クララ ,  サリツロ，ジヨン・エイ ,  ハケツト，ジヨン・アール，ジユニア ,  ホワン，シーハイ ,  モリソン，ラリー・イー ,  ルツク，カ−チヤン

IPC分类号： C12N15/09 ,  C07H21/04 ,  C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6818 ,  C12Q1/6832 ,  C12Q1/6851 ,  C12Q2561/113 ,  C12Q2537/137 ,  C12Q2525/107 ,  C12Q2565/101 ,  C12Q2565/525

摘要： 二本鎖核酸ハイブリダイゼーションプローブ及び該プローブを使用する方法が記載されている。 記載されているプローブは、リアルタイムＲＴ−ＰＣＲ反応に対して特に適しており、ミスマッチに対して高い許容性を有する。

公开(公告)号：JP2005523707A

公开(公告)日：2005-08-11

申请号：JP2003587980

申请日：2003-04-23

申请人： ユー.エス. ジェノミクス, インコーポレイテッド

发明人： ヌーノ ゴンカルベス， ,  ルドルフ ジルマンシン，

IPC分类号： G01N33/53 ,  C12N15/09 ,  C12Q1/68 ,  G01N33/566 ,  G01N33/58 ,  G01Q60/00 ,  G01Q80/00

CPC分类号： C40B40/06 ,  C12Q1/6816 ,  C12Q1/6839 ,  C40B30/04 ,  C12Q2525/197 ,  C12Q2525/107

摘要： 本発明は、隣接するが同じはない標的部位に結合するホーグスティーン結合アームおよびワトソン−クリック結合アームを含む核酸検出プローブに関する組成物および使用の方法を提供する。 本発明は、一部、ホーグスティーン塩基対合およびワトソン−クリック塩基対合の両方を用いて標的核酸分子に結合し得る新規な分子の発見に関する。 この新規分子は、２アームプローブと称される。 それは、２つの鎖または「アーム」から構成されるからであり、その１つはホーグスティーン結合し得、そしてその１つはワトソン−クリック結合し得る。

公开(公告)号：JP2004524032A

公开(公告)日：2004-08-12

申请号：JP2002571915

申请日：2002-03-09

申请人： ボストン プローブス,インコーポレイテッド

发明人： ジェイムズ エム． クール， ,  テレサ クリーシー， ,  マーク ディー． クリストジャンソン， ,  ジェンス ジェイ． ヒルディッグ−ニールセン， ,  マーク ジェイ． フィアンダカ，

IPC分类号： C12N15/09 ,  C07B61/00 ,  C07K14/00 ,  C07K17/00 ,  C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6816 ,  C07B2200/11 ,  C40B20/04 ,  C40B30/04 ,  C40B40/00 ,  C40B40/06 ,  Y10S435/81 ,  C12Q2565/137 ,  C12Q2525/107 ,  C12Q2531/113

摘要： 本発明は、組み合わせオリゴマーの分野に関し、テンプレートの非存在下での組み合わせオリゴマーのブロック合成、ならびに関連する方法、キット、ライブラリーおよび他の組成物を含む。 本発明の組み合わせオリゴマーは、第１のオリゴマーブロックおよび第２のオリゴマーブロックを含み、これらのブロックは、各々独立して、ペプチド核酸、ＰＮＡキメラまたはＰＮＡ組み合わせオリゴマーであり、ここで、第１のオリゴマーブロックおよび第２のオリゴマーブロックは、少なくとも３原子長のリンカーによって互いに共有結合しており、そして第１のオリゴマーブロックおよび第２のオリゴマーブロックは、該ポリ核酸塩基鎖における連続する核酸塩基の標的配列に配列特異的にハイブリダイズし、これによって、二本鎖標的配列／組み合わせオリゴマー複合体を形成する。