公开(公告)号：US06733963B2

公开(公告)日：2004-05-11

申请号：US10010227

申请日：2001-12-06

申请人： Lisbeth Hamer ,  Kiichi Adachi ,  Todd DeZwaan ,  Sze-Chung Lo ,  Maria Victoria Montenegro-Chamorro ,  Sheryl Frank ,  Blaise Darveaux ,  Sanjoy Mahanty ,  Ryan Heiniger ,  Amy Skalchunes ,  Huaqin Pan ,  Rex Tarpey ,  Jeffrey Shuster ,  Matthew M. Tanzer

发明人： Lisbeth Hamer ,  Kiichi Adachi ,  Todd DeZwaan ,  Sze-Chung Lo ,  Maria Victoria Montenegro-Chamorro ,  Sheryl Frank ,  Blaise Darveaux ,  Sanjoy Mahanty ,  Ryan Heiniger ,  Amy Skalchunes ,  Huaqin Pan ,  Rex Tarpey ,  Jeffrey Shuster ,  Matthew M. Tanzer

IPC分类号： C12Q100

CPC分类号： C12N9/93 ,  C12N9/1029 ,  C12N9/16 ,  C12N9/88 ,  C12Q1/18 ,  Y10S514/924

摘要： The present inventors have discovered that 3-Isopropylmalate dehydratase is essential for fungal pathogenicity. Specifically, the inhibition of 3-Isopropylmalate dehydratase gene expression in fungi results in no signs of successful infection or lesions. Thus, 3-Isopropylmalate dehydratase can be used as a target for the identification of antibiotics, preferably antifungals. Accordingly, the present invention provides methods for the identification of compounds that inhibit 3-Isopropylmalate dehydratase expression or activity. The methods of the invention are useful for the identification of antibiotics, preferably antifungals.

摘要翻译： 本发明人已经发现3-异丙基苹果酸脱水酶对于真菌致病性是必需的。 具体来说，真菌中3-异丙基苹果酸脱水酶基因表达的抑制没有导致成功感染或病变的迹象。 因此，3-异丙基马来酸脱水酶可用作鉴定抗生素，优选抗真菌剂的靶标。 因此，本发明提供了鉴定抑制3-异丙基苹果酸脱水酶表达或活性的化合物的方法。 本发明的方法可用于鉴定抗生素，优选抗真菌剂。

公开(公告)号：US06740498B2

公开(公告)日：2004-05-25

申请号：US10010084

申请日：2001-12-06

申请人： Kiichi Adachi ,  Todd DeZwaan ,  Sze-Chung Lo ,  Maria Victoria Montenegro-Chamorro ,  Sheryl Frank ,  Blaise Darveaux ,  Sanjoy Mahanty ,  Ryan Heiniger ,  Amy Skalchunes ,  Huaqin Pan ,  Rex Tarpey ,  Jeffrey Shuster ,  Matthew M. Tanzer ,  Lisbeth Hamer

发明人： Kiichi Adachi ,  Todd DeZwaan ,  Sze-Chung Lo ,  Maria Victoria Montenegro-Chamorro ,  Sheryl Frank ,  Blaise Darveaux ,  Sanjoy Mahanty ,  Ryan Heiniger ,  Amy Skalchunes ,  Huaqin Pan ,  Rex Tarpey ,  Jeffrey Shuster ,  Matthew M. Tanzer ,  Lisbeth Hamer

IPC分类号： C12Q142

CPC分类号： C12N9/93 ,  C12N9/1029 ,  C12N9/16 ,  C12N9/88 ,  C12Q1/18

摘要： The present inventors have discovered that histidinol-phosphatase is essential for fungal pathogenicity. Specifically, the inhibition of histidinol-phosphatase gene expression in fungi results in small, non-sporulating lesions and reduced pathogenicity. Thus, histidinol-phosphatase can be used as a target for the identification of antibiotics, preferably antifungals. Accordingly, the present invention provides methods for the identification of compounds that inhibit histidinol-phosphatase expression or activity. The methods of the invention are useful for the identification of antibiotics, preferably antifungals.

摘要翻译： 本发明人已经发现，组氨醇磷酸酶是真菌致病性所必需的。 具体来说，在真菌中抑制组氨醇磷酸酶基因表达导致小的，非孢子形成的病变和致病性降低。 因此，组氨醇磷酸酶可用作鉴定抗生素，优选抗真菌剂的靶标。 因此，本发明提供了鉴定抑制组氨酸磷酸酶表达或活性的化合物的方法。 本发明的方法可用于鉴定抗生素，优选抗真菌剂。

公开(公告)号：US06689578B2

公开(公告)日：2004-02-10

申请号：US10007022

申请日：2001-12-06

申请人： Todd DeZwaan ,  Sze-Chung Lo ,  Maria Victoria Montenegro-Chamarro ,  Sheryl Frank ,  Blaise Darveaux ,  Sanjoy K. Mahanty ,  Ryan Heiniger ,  Amy Skalchunes ,  Huaqin Pan ,  Rex Tarpey ,  Jeffrey Shuster ,  Matthew M. Tanzer ,  Lisbeth Hamer ,  Kiichi Adachi

发明人： Todd DeZwaan ,  Sze-Chung Lo ,  Maria Victoria Montenegro-Chamarro ,  Sheryl Frank ,  Blaise Darveaux ,  Sanjoy K. Mahanty ,  Ryan Heiniger ,  Amy Skalchunes ,  Huaqin Pan ,  Rex Tarpey ,  Jeffrey Shuster ,  Matthew M. Tanzer ,  Lisbeth Hamer ,  Kiichi Adachi

IPC分类号： C12Q118

CPC分类号： C12N9/93 ,  C12N9/1029 ,  C12N9/16 ,  C12N9/88 ,  C12Q1/18

摘要： The present inventors have discovered that 5-Aminolevulinate synthase is essential for fungal pathogenicity. Specifically, the inhibition of 5-Aminolevulinate synthase gene expression in fungi results in no signs of successful infection or lesions. Thus, 5-Aminolevulinate synthase can be used as a target for the identification of antibiotics, preferably antifungals. Accordingly, the present invention provides methods for the identification of compounds that inhibit 5-Aminolevulinate synthase expression or activity. The methods of the invention are useful for the identification of antibiotics, preferably antifungals.

摘要翻译： 本发明人已经发现5-氨基乙酰丙酸合酶是真菌致病性所必需的。 具体来说，真菌中5-氨基乙酰丙酸合酶基因表达的抑制没有导致成功感染或病变的迹象。 因此，5-氨基乙酰丙酸合酶可用作鉴定抗生素，优选抗真菌剂的靶标。 因此，本发明提供了鉴定抑制5-氨基乙酰丙酸合酶表达或活性的化合物的方法。 本发明的方法可用于鉴定抗生素，优选抗真菌剂。

公开(公告)号：US06852484B2

公开(公告)日：2005-02-08

申请号：US10012991

申请日：2001-12-10

申请人： Sze-Chung Lo ,  Maria Victoria Montenegro-Chamorro ,  Sheryl Frank ,  Blaise Darveaux ,  Sanjoy Mahanty ,  Ryan Heiniger ,  Amy Skalchunes ,  Huaqin Pan ,  Rex Tarper ,  Jeffrey Shuster ,  Matthew M. Tanzer ,  Lisbeth Hamer ,  Kiichi Adachi ,  Todd M. DeZwaan

发明人： Sze-Chung Lo ,  Maria Victoria Montenegro-Chamorro ,  Sheryl Frank ,  Blaise Darveaux ,  Sanjoy Mahanty ,  Ryan Heiniger ,  Amy Skalchunes ,  Huaqin Pan ,  Rex Tarper ,  Jeffrey Shuster ,  Matthew M. Tanzer ,  Lisbeth Hamer ,  Kiichi Adachi ,  Todd M. DeZwaan

IPC分类号： C12N9/00 ,  C12N9/10 ,  C12N9/16 ,  C12N9/88 ,  C12Q1/18 ,  C12Q1/00 ,  C07H21/04 ,  C12N1/20 ,  C12P21/06 ,  A31K31/18

CPC分类号： C12N9/93 ,  C12N9/1029 ,  C12N9/16 ,  C12N9/88 ,  C12Q1/18 ,  Y10S514/924

摘要： The present inventors have discovered that Asparagine Synthase is essential for fungal pathogenicity. Specifically, the inhibition of Asparagine Synthase gene expression in fungi results in no signs of successful infection or lesions. Thus, Asparagine Synthase can be used as a target for the identification of antibiotics, preferably antifungals. Accordingly, the present invention provides methods for the identification of compounds that inhibit Asparagine Synthase expression or activity. The methods of the invention are useful for the identification of antibiotics, preferably antifungals.

摘要翻译： 本发明人已经发现天门冬酰胺合酶对于真菌致病性是必需的。 具体来说，真菌中天冬酰胺合酶基因表达的抑制没有导致成功感染或病变的迹象。 因此，天门冬酰胺合酶可用作鉴定抗生素，优选抗真菌剂的靶标。 因此，本发明提供了鉴定抑制天门冬酰胺合酶表达或活性的化合物的方法。 本发明的方法可用于鉴定抗生素，优选抗真菌剂。

公开(公告)号：US06723529B2

公开(公告)日：2004-04-20

申请号：US10011146

申请日：2001-11-09

申请人： Matthew M. Tanzer ,  Jeffrey Shuster ,  Lisbeth Hamer ,  Kiichi Adachi ,  Todd M. DeZwaan ,  Sze-Chung Lo ,  Maria Victoria Montenegro-Chamorro ,  Sheryl Frank ,  Blaise Darveaux ,  Sanjoy K. Mahanty ,  Ryan Heiniger ,  Amy Skalchunes ,  Huaqin Pan ,  Rex Tarpey

发明人： Matthew M. Tanzer ,  Jeffrey Shuster ,  Lisbeth Hamer ,  Kiichi Adachi ,  Todd M. DeZwaan ,  Sze-Chung Lo ,  Maria Victoria Montenegro-Chamorro ,  Sheryl Frank ,  Blaise Darveaux ,  Sanjoy K. Mahanty ,  Ryan Heiniger ,  Amy Skalchunes ,  Huaqin Pan ,  Rex Tarpey

IPC分类号： C12Q104

CPC分类号： C12N9/0008 ,  C12N9/88 ,  C12Q1/18 ,  C12Q1/26 ,  C12Q1/527 ,  C12Y102/01031

摘要： The present inventors have discovered that &agr;-Aminoadipate Reductase is essential for fungal pathogenicity. Specifically, the inhibition of &agr;-Aminoadipate Reductase gene expression in fungi results in no signs of successful infection or lesions. Thus, &agr;-Aminoadipate Reductase can be used as a target for the identification of antibiotics, preferably antifungals. Accordingly, the present invention provides methods for the identification of compounds that inhibit &agr;-Aminoadipate Reductase expression or activity. The methods of the invention are useful for the identification of antibiotics, preferably antifungals.

摘要翻译： 本发明人已经发现α-氨基己二酸还原酶对于真菌致病性是必需的。 具体来说，在真菌中抑制α-氨基己二酸还原酶基因表达没有导致成功感染或病变的迹象。 因此，α-氨基己酸还原酶可用作鉴定抗生素，优选抗真菌剂的靶标。 因此，本发明提供了鉴定抑制α-氨基己二酸还原酶表达或活性的化合物的方法。 本发明的方法可用于鉴定抗生素，优选抗真菌剂。

公开(公告)号：US06632631B1

公开(公告)日：2003-10-14

申请号：US10011200

申请日：2001-11-09

申请人： Jeffrey Shuster ,  Matthew M. Tanzer ,  Lisbeth Hamer ,  Kiichi Adachi ,  Todd M. DeZwaan ,  Sze-Chung Lo ,  Maria Victoria Montenegro-Chamorro ,  Blaise Darveaux ,  Sheryl Frank ,  Ryan Heiniger ,  Sanjoy K. Mahanty ,  Huaqin Pan ,  Amy Skalchunes ,  Rex W. Tarpey

发明人： Jeffrey Shuster ,  Matthew M. Tanzer ,  Lisbeth Hamer ,  Kiichi Adachi ,  Todd M. DeZwaan ,  Sze-Chung Lo ,  Maria Victoria Montenegro-Chamorro ,  Blaise Darveaux ,  Sheryl Frank ,  Ryan Heiniger ,  Sanjoy K. Mahanty ,  Huaqin Pan ,  Amy Skalchunes ,  Rex W. Tarpey

IPC分类号： C12Q118

CPC分类号： C12N9/0008 ,  C12N9/88 ,  C12Q1/18 ,  C12Q1/26 ,  C12Q1/527 ,  C12Y102/01031

摘要： The present inventors have discovered that homocitrate synthase is essential for fungal pathogenicity. Specifically, the inhibition of homocitrate synthase gene expression in fungi results in no signs of successful infection or lesions. Thus, homocitrate synthase can be used as a target for the identification of antibiotics, preferably antifungals. Accordingly, the present invention provides methods for the identification of compounds that inhibit homocitrate synthase expression or activity. The methods of the invention are useful for the identification of antibiotics, preferably antifungals.

摘要翻译： 本发明人已经发现，高柠檬酸合酶对于真菌致病性是必需的。 具体来说，抑制真菌中的高柠檬酸合酶基因表达没有导致成功感染或病变的迹象。 因此，高柠檬酸合酶可以用作鉴定抗生素，优选抗真菌剂的靶标。 因此，本发明提供了鉴定抑制高柠檬酸合酶表达或活性的化合物的方法。 本发明的方法可用于鉴定抗生素，优选抗真菌剂

公开(公告)号：US06562624B2

公开(公告)日：2003-05-13

申请号：US09826630

申请日：2001-04-05

申请人： Kiichi Adachi ,  John E. Hamer ,  Lisbeth Hamer

发明人： Kiichi Adachi ,  John E. Hamer ,  Lisbeth Hamer

IPC分类号： C12N1587

CPC分类号： C12N15/90 ,  C12N9/22 ,  C12N15/1034

摘要： The present invention relates to methods for facilitating site directed homologous recombination in a eukaryotic organism to produce genomic mutants using transposon mediated mutagenesis of cosmid vectors carrying large genomic inserts from the target eukaryotic organism. The transposon carries a bifunctional marker that can be used for selection in both bacteria and the target eukaryotic organism. Minimization of the length of the cosmid vector allows for maximization of the size of the genomic insert carried by the cosmid. Maximization of the size of the genomic insert increases the frequency of homologous recombination with the genome of the target eukaryotic organism.

公开(公告)号：US06703200B1

公开(公告)日：2004-03-09

申请号：US09658859

申请日：2000-09-11

申请人： John E. Hamer ,  Lisbeth Hamer

发明人： John E. Hamer ,  Lisbeth Hamer

IPC分类号： C12Q168

CPC分类号： H01G9/155 ,  H01M4/663 ,  Y02E60/13 ,  Y02T10/7022

摘要： The present invention relates to a method for facilitating site directed homologous recombination in an organism to produce mutants comprising: 1) providing a large insert vector library comprising one or more large insert vectors, each of said large insert vectors comprising a piece of DNA, said DNA piece comprising multiple genes from a target organism and a first selectable marker functional for selection in bacteria; 2) providing a second vector comprising a transposable element, said transposable element comprising a nucleotide sequence coding for a second selectable marker flanked on each side by an inverted repeat sequence, wherein said selectable marker is bifunctional for selection in bacteria and the target organism and wherein said inverted repeat sequences are functional as a binding site for a transposase; 3) incubating said library with said second vector in the presence of a transposase specific for the inverted repeat sequences on the plasmid vector, such that the transposable element is transferred randomly into an individual large insert of the large insert library to produce disrupted large insert vectors; 4) optionally, amplifying the disrupted large insert vectors resulting from step 3); 5) introducing at least one of said disrupted large insert vectors into a target host cell; and 6) selecting for successful homologous recombination in said target host cell using the second selectable marker.

摘要翻译： 本发明涉及一种用于促进生物体中的位点定向同源重组以产生突变体的方法，其包括：1）提供包含一个或多个大插入载体的大插入载体文库，每个所述大插入载体包含一片DNA，所述 DNA片段，其包含来自靶生物体的多个基因和用于在细菌中选择的第一选择性标记; 2）提供包含转座元件的第二载体，所述转座元件包含编码第二选择标记的核苷酸序列， 反向重复序列，其中所述选择性标记是双功能的，用于在细菌和靶生物中进行选择，并且其中所述反向重复序列作为转座酶的结合位点起作用; 3）在转座酶特异性存在下将所述文库与所述第二载体一起温育 对于质粒载体上的反向重复序列，使得转座 随机携带的元素被随机转移到大插入文库的单个大插入物中以产生破坏的大插入载体; 4）任选地扩增由步骤3）产生的破坏的大插入片段; 5）引入至少一个所述破坏的大插入片段 进入目标宿主细胞; 和6）使用第二选择标记物在所述靶宿主细胞中选择成功的同源重组。