公开(公告)号：US20050112584A1

公开(公告)日：2005-05-26

申请号：US10718342

申请日：2003-11-20

申请人： Francisco Cifuentes ,  Meha Kapadia ,  Eric Leproust ,  Stephanie Fulmer-Smentek ,  Bill Peck

发明人： Francisco Cifuentes ,  Meha Kapadia ,  Eric Leproust ,  Stephanie Fulmer-Smentek ,  Bill Peck

IPC分类号： C12Q1/68 ,  G01N33/48 ,  G01N33/50 ,  G06F19/00

CPC分类号： G16B25/00

摘要： Methods are disclosed for selecting a combination of nucleic acid sample pairs for evaluating the ability of an oligonucleotide probe to measure differential expression of genes. Differential gene expression experiments are conducted using (i) nucleic acid sample pairs and (ii) nucleic acid probes immobilized on a substrate, the probes representing a set of genes. The number of genes in the set is a portion of an expected number of genes in a sample. A nucleic acid sample pair combination is selected based on the members of the combination having a maximized number of genes from the set of genes that exhibit differential expression and a minimized number of the genes that do not exhibit differential expression.

摘要翻译： 公开了用于选择核酸样品对的组合以评估寡核苷酸探针以测量基因差异表达的能力的方法。 使用（i）核酸样品对和（ii）固定在底物上的核酸探针进行差异基因表达实验，探针代表一组基因。 该组中的基因数目是样品中预期基因数量的一部分。 基于组合的成员选择核酸样品对组合，其具有来自显示差异表达的基因组的最大数量的基因和不显示差异表达的基因的最小数目。

公开(公告)号：US20070172993A1

公开(公告)日：2007-07-26

申请号：US11338122

申请日：2006-01-23

申请人： Bill Peck ,  Allen Thompson ,  Anthea Dokidis

发明人： Bill Peck ,  Allen Thompson ,  Anthea Dokidis

IPC分类号： H01L21/82

CPC分类号： C40B60/14 ,  B01J19/0046 ,  B01J2219/00286 ,  B01J2219/00378 ,  B01J2219/00418 ,  B01J2219/00527 ,  B01J2219/00547 ,  B01J2219/00596 ,  B01J2219/00605 ,  B01J2219/00659 ,  B01J2219/00675 ,  B01J2219/00689 ,  B01J2219/00722 ,  B01J2219/00725 ,  B82Y30/00 ,  C40B50/14

摘要： A method of uniformly draining liquid from a patterned surface using a flow cell is provided. The method may be employed in a variety of applications, including in chemical array fabrication. In an exemplary embodiment, the invention provides an apparatus for fabricating a chemical array that employs a flow cell. Methods of fabricating a chemical array that employ the subject apparatus and drainage methods are also provided. Also provided are the arrays produced using the subject methods, as well as methods for using those arrays.

摘要翻译： 提供了使用流动池从图案化表面均匀排出液体的方法。 该方法可以用于各种应用中，包括在化学阵列制造中。 在示例性实施例中，本发明提供了一种用于制造采用流动池的化学阵列的装置。 还提供了使用本发明装置和排水方法制造化学阵列的方法。 还提供了使用主题方法制作的阵列，以及使用这些阵列的方法。

公开(公告)号：US20050214778A1

公开(公告)日：2005-09-29

申请号：US10813337

申请日：2004-03-29

申请人： Bill Peck ,  Eric Leproust

发明人： Bill Peck ,  Eric Leproust

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12M1/34

CPC分类号： C07H21/00 ,  B01J19/0046 ,  B01J2219/00286 ,  B01J2219/00353 ,  B01J2219/00529 ,  B01J2219/00585 ,  B01J2219/00605 ,  B01J2219/00626 ,  B01J2219/00659 ,  B01J2219/00722

摘要： Methods of producing nucleic acid arrays using an in situ nucleic acid synthesis protocol are provided, where the in situ nucleic acid synthesis protocol includes a plurality of cycles, each of which includes: (I) a monomer attachment step; and (II) a functional group generation step. A feature of the subject methods is that the functional group generation step is performed by sequentially flowing a plurality of different fluids across the surface of a substrate in a manner such that the surface is not contacted with a with a triple phase interface line. Also provided are the arrays produced using the subject methods, as well as methods for use of the arrays and kits that include the same.

摘要翻译： 提供了使用原位核酸合成方案生产核酸阵列的方法，其中原位核酸合成方案包括多个循环，每个循环包括：（I）单体附着步骤; 和（II）官能团生成步骤。 本发明方法的特征在于，功能组生成步骤是通过使表面不与三相界面线接触的方式使多个不同的流体顺序地流过衬底的表面而进行的。 还提供了使用主题方法产生的阵列，以及使用包括其的阵列和试剂盒的方法。

公开(公告)号：US20050090013A1

公开(公告)日：2005-04-28

申请号：US10695316

申请日：2003-10-28

申请人： Joel Myerson ,  Magdalena Bynum ,  Bill Peck ,  David Hirschberg ,  Viorica Lopez-Avila ,  Dan-Hui Yang

发明人： Joel Myerson ,  Magdalena Bynum ,  Bill Peck ,  David Hirschberg ,  Viorica Lopez-Avila ,  Dan-Hui Yang

IPC分类号： G01N27/447 ,  G01N30/46 ,  G01N30/84 ,  G01N30/02

CPC分类号： G01N30/463 ,  G01N27/44795 ,  G01N30/466 ,  G01N30/84 ,  G01N2030/8417

摘要： A multi-dimensional chemical-analysis system includes a longitudinally extending iso-electric focusing (IEF) channel and transversely extending high-pressure liquid chromatography (HPLC) channels. Piezo-electric pumps force sample fluid from the IEF channel to form jets as it exits through respective pump nozzles. The jets then enter the HPLC channels for parallel second-dimension separations. Alternatively, the jets can be used to “print” sample onto a moving medium to provide a two-dimensional time-vs.-band-position distribution of sample components.

摘要翻译： 多维化学分析系统包括纵向延伸的等离子聚焦（IEF）通道和横向延伸的高压液相色谱（HPLC）通道。 压电电泵迫使来自IEF通道的样品流体通过相应的泵喷嘴离开时形成喷嘴。 喷射机然后进入HPLC通道进行平行二维分离。 或者，喷射可用于将样品“打印”到移动介质上以提供样品组分的二维时间 - 带 - 位置分布。