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    Benchmarks for Normal Cell Identification
    3.
    发明申请
    Benchmarks for Normal Cell Identification 审中-公开
    正常细胞鉴定的基准

    公开(公告)号：US20130218474A1

    公开(公告)日：2013-08-22

    申请号：US13750700

    申请日：2013-01-25

    申请人： Nodality, Inc.

    发明人： Diane Longo

    IPC分类号： G06F19/12

    CPC分类号： G16B5/00 ,  G01N33/56972

    摘要： Methods for determining a model that can characterize and distinguish normal cell from a diseased cell and methods for determining health or health-risk status of an individual based on a normal/health cell reference population of cells are described.

    摘要翻译： 描述了用于确定可以表征和区分正常细胞与病变细胞的模型的方法以及用于基于正常/健康细胞参考群体细胞确定个体的健康或健康风险状态的方法。

    METHODS FOR DIAGNOSIS, PROGNOSIS AND METHODS OF TREATMENT
    4.
    发明申请
    METHODS FOR DIAGNOSIS, PROGNOSIS AND METHODS OF TREATMENT 有权
    诊断，预防和治疗方法的方法

    公开(公告)号：US20120309029A1

    公开(公告)日：2012-12-06

    申请号：US13493857

    申请日：2012-06-11

    申请人： Wendy J. Fantl ,  Santosh K. Putta ,  Omar D. Perez ,  Helen L. Francis-Lang ,  Aileen C. Cohen

    发明人： Wendy J. Fantl ,  Santosh K. Putta ,  Omar D. Perez ,  Helen L. Francis-Lang ,  Aileen C. Cohen

    IPC分类号： G01N33/574 ,  G01N33/577

    CPC分类号： G01N33/57426 ,  G01N33/5041 ,  G01N33/5047 ,  G01N2333/4703 ,  G01N2333/7051 ,  G01N2333/70514 ,  G01N2333/70517 ,  G01N2333/70596 ,  G01N2333/912

    摘要： This invention is directed to methods and compositions for diagnosis, prognosis and for determining methods of treatment. The physiological status of cells present in a sample (e.g. clinical sample) can be used in diagnosis or prognosis of a condition (e.g. Chronic Lymphocytic Leukemia), in patient selection for therapy, to monitor treatment and to modify or optimize therapeutic regimens. The physiological status of a cell can be determined by comparing the intracellular status of one or more activation elements (e.g. the phosphorylation status of a signaling molecule) in a cell (e.g. a cancer cell) to that of another cell (e.g. a normal cell). The physiological status of a cell can be further classified by adding one or more modulators (e.g. an inhibitor or activator) to the cell in question. In some embodiments, the invention is directed to methods of determining a phenotypic profile of a population of cells.

    摘要翻译： 本发明涉及用于诊断，预后和确定治疗方法的方法和组合物。 存在于样品（例如临床样品）中的细胞的生理状态可以用于病症（例如慢性淋巴细胞性白血病）的诊断或预后，用于治疗的患者选择，以监测治疗和修饰或优化治疗方案。 可以通过将细胞（例如癌细胞）中的一种或多种激活元件的细胞内状态（例如信号分子的磷酸化状态）与另一细胞（例如正常细胞）的细胞内状态进行比较来确定细胞的生理状态， 。 通过向所述细胞中加入一种或多种调节剂（例如抑制剂或活化剂）可以进一步分类细胞的生理状态。 在一些实施方案中，本发明涉及确定细胞群的表型谱的方法。

    KITS FOR MULTIPARAMETRIC PHOSPHO ANALYSIS
    5.
    发明申请
    KITS FOR MULTIPARAMETRIC PHOSPHO ANALYSIS 审中-公开
    多功能磷光体分析仪

    公开(公告)号：US20120276558A1

    公开(公告)日：2012-11-01

    申请号：US13544053

    申请日：2012-07-09

    申请人： David Soper ,  David Rosen ,  Todd Covey ,  Ying-Wen Huang ,  Wenday Fantl ,  Ralph Lin

    发明人： David Soper ,  David Rosen ,  Todd Covey ,  Ying-Wen Huang ,  Wenday Fantl ,  Ralph Lin

    IPC分类号： G01N33/53

    CPC分类号： G01N33/6842 ,  G01N33/5011 ,  G01N33/5041 ,  G01N33/5094 ,  G01N33/6845 ,  G01N33/80 ,  G01N2440/14 ,  G01N2510/00

    摘要： As disclosed herein, the present invention provides for kits and a composition for diagnosis, prognosis, drug discovery, drug development, and patient stratification. The kits can comprise a plurality of binding elements for cell surface markers, and a plurality of binding elements for state-specific intracellular markers. The kits can further comprise a plurality of modulators directed for the particular cell function or signaling pathways. The kits can further include fixatives, permeabilizing agent, buffers, containers, instructions, and software for data analysis/compilation.

    摘要翻译： 如本文所公开的，本发明提供用于诊断，预后，药物发现，药物开发和患者分层的试剂盒和组合物。 试剂盒可以包含用于细胞表面标记的多个结合元件，以及用于状态特异性细胞内标记物的多个结合元件。 试剂盒还可以包含针对特定细胞功能或信号传导途径的多个调节剂。 试剂盒还可以包括固定剂，渗透剂，缓冲液，容器，说明书和用于数据分析/汇编的软件。

    Methods for diagnosis prognosis and methods of treatment
    7.
    发明申请
    Methods for diagnosis prognosis and methods of treatment 审中-公开
    诊断预后的方法和治疗方法

    公开(公告)号：US20090098594A1

    公开(公告)日：2009-04-16

    申请号：US12229476

    申请日：2008-08-21

    申请人： Wendy J. Fantl ,  Santosh K. Putta ,  Omar D. Perez ,  Helen L. Francis-Lang ,  Aileen C. Cohen

    发明人： Wendy J. Fantl ,  Santosh K. Putta ,  Omar D. Perez ,  Helen L. Francis-Lang ,  Aileen C. Cohen

    IPC分类号： C12Q1/02

    CPC分类号： G01N33/57426 ,  G01N33/5041 ,  G01N33/5047 ,  G01N2333/4703 ,  G01N2333/7051 ,  G01N2333/70514 ,  G01N2333/70517 ,  G01N2333/70596 ,  G01N2333/912

    摘要： This invention is directed to methods and compositions for diagnosis, prognosis and for determining methods of treatment. The physiological status of cells present in a sample (e.g. clinical sample) can be used in diagnosis or prognosis of a condition (e.g. Chronic Lymphocytic Leukemia), in patient selection for therapy, to monitor treatment and to modify or optimize therapeutic regimens. The physiological status of a cell can be determined by comparing the intracellular status of one or more activation elements (e.g. the phosphorylation status of a signaling molecule) in a cell (e.g. a cancer cell) to that of another cell (e.g. a normal cell). The physiological status of a cell can be further classified by adding one or more modulators (e.g. an inhibitor or activator) to the cell in question. In some embodiments, the invention is directed to methods of determining a phenotypic profile of a population of cells.

    摘要翻译： 本发明涉及用于诊断，预后和确定治疗方法的方法和组合物。 存在于样品（例如临床样品）中的细胞的生理状态可以用于病症（例如慢性淋巴细胞性白血病）的诊断或预后，用于治疗的患者选择，以监测治疗和修饰或优化治疗方案。 可以通过将细胞（例如癌细胞）中的一种或多种激活元件的细胞内状态（例如信号分子的磷酸化状态）与另一细胞（例如正常细胞）的细胞内状态进行比较来确定细胞的生理状态， 。 通过向所述细胞中加入一种或多种调节剂（例如抑制剂或活化剂）可以进一步分类细胞的生理状态。 在一些实施方案中，本发明涉及确定细胞群的表型谱的方法。

    METHODS FOR DIAGNOSIS, PROGNOSIS AND METHODS OF TREATMENT
    8.
    发明申请
    METHODS FOR DIAGNOSIS, PROGNOSIS AND METHODS OF TREATMENT 有权
    诊断，预防和治疗方法的方法

    公开(公告)号：US20150017119A1

    公开(公告)日：2015-01-15

    申请号：US14279905

    申请日：2014-05-16

    申请人： Nodality, Inc.

    发明人： Wendy J. FANTL ,  David B. ROSEN ,  Alessandra CESANO ,  Santosh K. PUTTA ,  Garry NOLAN ,  Aileen COHEN ,  Erik EVENSEN

    IPC分类号： G01N33/574

    CPC分类号： G01N33/57426 ,  G01N33/5041 ,  G01N33/5044 ,  G01N33/5055 ,  G01N33/5073 ,  G01N33/6893 ,  G01N2333/70589 ,  G01N2800/22 ,  G01N2800/52

    摘要： The present invention provides an approach for the determination of the activation states of a plurality of proteins in single cells. This approach permits the rapid detection of heterogeneity in a complex cell population based on activation states, expression markers and other criteria, and the identification of cellular subsets that exhibit correlated changes in activation within the cell population. Moreover, this approach allows the correlation of cellular activities or properties. In addition, the use of modulators of cellular activation allows for characterization of pathways and cell populations. Several exemplary diseases that can be analyzed using the invention include AML, MDS, and MPN.

    摘要翻译： 本发明提供了用于确定单细胞中多种蛋白质的活化状态的方法。 这种方法允许基于活化状态，表达标志物和其他标准快速检测复杂细胞群体中的异质性，以及在细胞群体内表现出相关的激活变化的细胞亚群的鉴定。 此外，这种方法允许细胞活动或性质的相关性。 此外，使用细胞激活的调节剂允许表征途径和细胞群体。 可以使用本发明分析的几种示例性疾病包括AML，MDS和MPN。

    METHOD AND APPARATUS FOR REPRESENTING MULTIDIMENSIONAL DATA
    10.
    发明申请
    METHOD AND APPARATUS FOR REPRESENTING MULTIDIMENSIONAL DATA 审中-公开
    用于表示多维数据的方法和装置

    公开(公告)号：US20140040265A1

    公开(公告)日：2014-02-06

    申请号：US14014110

    申请日：2013-08-29

    申请人： Nodality, Inc.

    发明人： Allan Robert Moser ,  Wade Thomas Rogers ,  Herbert Alan Holyst

    IPC分类号： G06F17/30

    CPC分类号： G06F16/283 ,  G01N15/1429 ,  G06F16/22 ,  G06K9/6298 ,  G16B40/00

    摘要： The present invention relates to methods for representing multidimensional data. The methods of the present invention are well suited but not limited to the representation of multidimensional data in such a way as to enable the comparison and differentiation of data sets. For example, the invention may be applied to the representation of flow cytometric data. The invention further relates to a program storage device having instructions for controlling a computer system to perform the methods, and to a program storage device containing data structures used in the practice of the methods.

    摘要翻译： 本发明涉及用于表示多维数据的方法。 本发明的方法非常适合于但不限于以能够进行数据集的比较和区分的方式表示多维数据。 例如，本发明可以应用于流式细胞术数据的表示。 本发明还涉及具有用于控制计算机系统执行方法的指令的程序存储装置，以及包含在实施方法中使用的数据结构的程序存储装置。