公开(公告)号：US12110534B2

公开(公告)日：2024-10-08

申请号：US16945099

申请日：2020-07-31

申请人： Roche Sequencing Solutions, Inc. ,  Kapa Biosystems, Inc.

发明人： Daleen Badenhorst ,  Michael S. Berry ,  Richard Dannebaum ,  Ashley Hayes ,  Severine Margeridon ,  Martin Ranik ,  Etienne Slabbert

IPC分类号： C12Q1/6806 ,  C12Q1/6869

CPC分类号： C12Q1/6806 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2521/319 ,  C12Q2525/155 ,  C12Q2525/191 ,  C12Q2525/307 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2525/307 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q2525/191 ,  C12Q2525/155 ,  C12Q2521/319

摘要： The invention is a novel method of sequencing nucleic acids involving making and sequencing a library of single stranded circular target nucleic acids.

公开(公告)号：US20210115510A1

公开(公告)日：2021-04-22

申请号：US16945099

申请日：2020-07-31

申请人： Roche Sequencing Solutions, Inc. ,  Kapa Biosystems, Inc.

发明人： Daleen Badenhorst ,  Michael S. Berry ,  Richard Dannebaum ,  Ashley Hayes ,  Severine Margeridon ,  Martin Ranik ,  Etienne Slabbert

IPC分类号： C12Q1/6874

摘要： The invention is a novel method of sequencing nucleic acids involving making and sequencing a library of single stranded circular target nucleic acids.

公开(公告)号：US20200308576A1

公开(公告)日：2020-10-01

申请号：US16808173

申请日：2020-03-03

申请人： Roche Sequencing Solutions, Inc. ,  Kapa Biosystems, Inc.

发明人： Daleen Badenhorst ,  Richard Dannebaum ,  Ashley Hayes ,  Monica Herrera ,  Severine Margeridon ,  Martin Ranik

IPC分类号： C12N15/10 ,  C12Q1/6874

摘要： The invention is a novel method of making and using a library such as a sequencing library of single stranded circular nucleic acid templates via splint ligation.

公开(公告)号：US20240279725A1

公开(公告)日：2024-08-22

申请号：US18004365

申请日：2021-07-07

申请人： Roche Sequencing Solutions, Inc. ,  Kapa Biosystems, Inc.

发明人： Richard Dannebaum ,  Brian Christopher Godwin ,  David L. Penkler ,  Etienne Slabbert ,  Ruben van der Merwe

IPC分类号： C12Q1/6848 ,  C12Q1/6876

CPC分类号： C12Q1/6848 ,  C12Q1/6876

摘要： The present disclosure is directed to compositions, kits, and methods of target enrichment by unidirectional primer extension, whereby the compositions, kits, and methods utilize both poison primers and target capture primers.

公开(公告)号：US11345955B2

公开(公告)日：2022-05-31

申请号：US16813379

申请日：2020-03-09

申请人： Roche Sequencing Solutions, Inc. ,  Kapa Biosystems, Inc.

发明人： Daleen Badenhorst ,  Richard Dannebaum ,  Ashley Hayes ,  Monica Herrera ,  Severine Margeridon ,  Martin Ranik

IPC分类号： C12P19/34 ,  C12Q1/6851 ,  C12N15/10 ,  C12Q1/6869

摘要： The invention is a novel method of making and using a library such as a sequencing library of single stranded circular nucleic acid templates via splint ligation. In particular, disclosed are methods of making circular target nucleic acid molecules and libraries of such molecules for downstream analysis such as nucleic acid sequencing. The method comprises the steps of adding universal sequences to nucleic acid molecules, rendering single-stranded these nucleic acid molecules with universal sequences on their ends by contacting with a probe complementary to at least a portion of the universal sequences, and allowing the hybridized probe to enable circularization and formation of single-stranded circular (sscDNA) molecules.

公开(公告)号：US20240287606A1

公开(公告)日：2024-08-29

申请号：US18475498

申请日：2023-09-27

申请人： Roche Sequencing Solutions, Inc.

发明人： Jan Berka ,  Richard Dannebaum ,  Khai Luong ,  Florian Rubelt ,  Dilduz Telman

IPC分类号： C12Q1/6881

CPC分类号： C12Q1/6881

摘要： The disclosure includes methods and compositions for accurately detecting subject's immune cell repertoire based on sequencing genomic DNA of immune cells.

公开(公告)号：US11773511B2

公开(公告)日：2023-10-03

申请号：US16996733

申请日：2020-08-18

申请人： Roche Sequencing Solutions, Inc

发明人： Jan Berka ,  Carolina Dallett ,  Richard Dannebaum ,  Brian Godwin ,  Seoyoung Kim ,  Jainee Lewis ,  Khai Luong ,  Sedide Ozturk ,  Joseph Platzer ,  Florian Rubelt ,  Dilduz Telman

IPC分类号： C40B50/06 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/6881 ,  C12N15/10 ,  C12Q1/6886

CPC分类号： C40B50/06 ,  C12N15/1065 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/6881 ,  C12Q1/6886 ,  C12Q2600/16 ,  C12Q1/68 ,  C12Q2525/161 ,  C12Q2525/186 ,  C12Q2537/143

摘要： Methods and compositions are described herein for primer extension target enrichment of immune receptor (BCR or TCR) sequences.

公开(公告)号：US12043919B2

公开(公告)日：2024-07-23

申请号：US18400744

申请日：2023-12-29

申请人： Roche Sequencing Solutions, Inc.

发明人： Jan Berka ,  Carolina Dallett ,  Richard Dannebaum ,  Brian Godwin ,  Seoyoung Kim ,  Jainee Lewis ,  Khai Luong ,  Sedide Ozturk ,  Joseph Platzer ,  Florian Rubelt ,  Dilduz Telman

IPC分类号： C40B50/06 ,  C12N15/10 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/6881 ,  C12Q1/6886

CPC分类号： C40B50/06 ,  C12N15/1065 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/6881 ,  C12Q1/6886 ,  C12Q2600/16

摘要： Methods and compositions are described herein for primer extension target enrichment of immune receptor (BCR or TCR) sequences.

公开(公告)号：US20220372566A1

公开(公告)日：2022-11-24

申请号：US17753937

申请日：2020-09-16

申请人： Roche Sequencing Solutions, Inc.

发明人： Jan Berka ,  Richard Dannebaum ,  Brian Godwin ,  Joseph Platzer

IPC分类号： C12Q1/6858 ,  C12N15/10

摘要： The invention is a method of assessing a mammalian immune repertoire by primer extension target enrichment (PETE). Methods and compositions for assessing an immune repertoire and the status of additional genetic markers are disclosed.

公开(公告)号：US20210172015A1

公开(公告)日：2021-06-10

申请号：US16996733

申请日：2020-08-18

申请人： Roche Sequencing Solutions, Inc

发明人： Jan Berka ,  Carolina Dallett ,  Richard Dannebaum ,  Brian Godwin ,  Seoyoung Kim ,  Jainee Lewis ,  Khai Luong ,  Sedide Ozturk ,  Joseph Platzer ,  Florian Rubelt ,  Dilduz Telman

IPC分类号： C12Q1/6881 ,  C12N15/10 ,  C40B50/06 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/6886

摘要： Methods and compositions are described herein for primer extension target enrichment of immune receptor (BCR or TCR) sequences.