公开(公告)号：WO2012065043A2

公开(公告)日：2012-05-18

申请号：PCT/US2011/060338

申请日：2011-11-11

Applicant: PACIFIC BIOSCIENCES OF CALIFORNIA, INC. ,  FLUSBERG, Benjamin ,  KORLACH, Jonas ,  WEGENER, Jeffrey ,  CLARK, Tyson, A. ,  VILFAN, Igor ,  KISLYUK, Andrey ,  TURNER, Stephen ,  SORENSON, Jon ,  TRAVERS, Kevin ,  HEINER, Cheryl ,  TOMANEY, Austin, B. ,  MARKS, Patrick ,  LEE, Jessica ,  JIA, Lei ,  WEBSTER, Dale ,  LYLE, John ,  HANES, Jeremiah ,  PUGLISI, Joseph

Inventor： FLUSBERG, Benjamin ,  KORLACH, Jonas ,  WEGENER, Jeffrey ,  CLARK, Tyson, A. ,  VILFAN, Igor ,  KISLYUK, Andrey ,  TURNER, Stephen ,  SORENSON, Jon ,  TRAVERS, Kevin ,  HEINER, Cheryl ,  TOMANEY, Austin, B. ,  MARKS, Patrick ,  LEE, Jessica ,  JIA, Lei ,  WEBSTER, Dale ,  LYLE, John ,  HANES, Jeremiah ,  PUGLISI, Joseph

IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/11 ,  C12Q1/34 ,  C12Q1/48 ,  C12Q1/25

CPC classification number: C12Q1/6869 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q1/6858 ,  C12Q1/6874 ,  C12Q1/689 ,  C12Q2600/154 ,  C12Q2537/164 ,  C12Q2527/113 ,  C12Q2521/101 ,  C12Q2525/307 ,  C12Q2525/117

Abstract: Methods, compositions, and systems are provided for characterization of modified nucleic acids. In certain preferred embodiments, single molecule sequencing methods are provided for identification of modified nucleotides within nucleic acid sequences. Modifications detectable by the methods provided herein include chemically modified bases, enzymatically modified bases, abasic sites, non-natural bases, secondary structures, and agents bound to a template nucleic acid.

Abstract translation: 提供了用于表征修饰的核酸的方法，组合物和系统。 在某些优选的实施方案中，提供单分子测序方法用于鉴定核酸序列内的修饰的核苷酸。 通过本文提供的方法可检测的修饰包括化学修饰的碱基，酶修饰的碱基，无碱基位点，非天然碱基，二级结构和与模板核酸结合的试剂。

公开(公告)号：WO2012065043A9

公开(公告)日：2012-12-20

申请号：PCT/US2011060338

申请日：2011-11-11

Applicant: PACIFIC BIOSCIENCES CALIFORNIA ,  FLUSBERG BENJAMIN ,  KORLACH JONAS ,  WEGENER JEFFREY ,  CLARK TYSON A ,  VILFAN IGOR ,  KISLYUK ANDREY ,  TURNER STEPHEN ,  SORENSON JON ,  TRAVERS KEVIN ,  HEINER CHERYL ,  TOMANEY AUSTIN B ,  MARKS PATRICK ,  LEE JESSICA ,  JIA LEI ,  WEBSTER DALE ,  LYLE JOHN ,  HANES JEREMIAH ,  PUGLISI JOSEPH

Inventor： FLUSBERG BENJAMIN ,  KORLACH JONAS ,  WEGENER JEFFREY ,  CLARK TYSON A ,  VILFAN IGOR ,  KISLYUK ANDREY ,  TURNER STEPHEN ,  SORENSON JON ,  TRAVERS KEVIN ,  HEINER CHERYL ,  TOMANEY AUSTIN B ,  MARKS PATRICK ,  LEE JESSICA ,  JIA LEI ,  WEBSTER DALE ,  LYLE JOHN ,  HANES JEREMIAH ,  PUGLISI JOSEPH

IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/11 ,  C12Q1/25 ,  C12Q1/34 ,  C12Q1/48

CPC classification number: C12Q1/6869 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q1/6858 ,  C12Q1/6874 ,  C12Q1/689 ,  C12Q2600/154 ,  C12Q2537/164 ,  C12Q2527/113 ,  C12Q2521/101 ,  C12Q2525/307 ,  C12Q2525/117

Abstract: Methods, compositions, and systems are provided for characterization of modified nucleic acids. In certain preferred embodiments, single molecule sequencing methods are provided for identification of modified nucleotides within nucleic acid sequences. Modifications detectable by the methods provided herein include chemically modified bases, enzymatically modified bases, abasic sites, non-natural bases, secondary structures, and agents bound to a template nucleic acid.

Abstract translation: 提供了用于表征修饰的核酸的方法，组合物和系统。 在某些优选的实施方案中，提供单分子测序方法用于鉴定核酸序列内的修饰的核苷酸。 通过本文提供的方法可检测的修饰包括化学修饰的碱基，酶修饰的碱基，无碱基位点，非天然碱基，二级结构和与模板核酸结合的试剂。

公开(公告)号：WO2012065043A3

公开(公告)日：2012-08-16

申请号：PCT/US2011060338

申请日：2011-11-11

Applicant: PACIFIC BIOSCIENCES CALIFORNIA ,  FLUSBERG BENJAMIN ,  KORLACH JONAS ,  WEGENER JEFFREY ,  CLARK TYSON A ,  VILFAN IGOR ,  KISLYUK ANDREY ,  TURNER STEPHEN ,  SORENSON JON ,  TRAVERS KEVIN ,  HEINER CHERYL ,  TOMANEY AUSTIN B ,  MARKS PATRICK ,  LEE JESSICA ,  JIA LEI ,  WEBSTER DALE ,  LYLE JOHN ,  HANES JEREMIAH ,  PUGLISI JOSEPH

Inventor： FLUSBERG BENJAMIN ,  KORLACH JONAS ,  WEGENER JEFFREY ,  CLARK TYSON A ,  VILFAN IGOR ,  KISLYUK ANDREY ,  TURNER STEPHEN ,  SORENSON JON ,  TRAVERS KEVIN ,  HEINER CHERYL ,  TOMANEY AUSTIN B ,  MARKS PATRICK ,  LEE JESSICA ,  JIA LEI ,  WEBSTER DALE ,  LYLE JOHN ,  HANES JEREMIAH ,  PUGLISI JOSEPH

IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/11 ,  C12Q1/25 ,  C12Q1/34 ,  C12Q1/48

CPC classification number: C12Q1/6869 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q1/6858 ,  C12Q1/6874 ,  C12Q1/689 ,  C12Q2600/154 ,  C12Q2537/164 ,  C12Q2527/113 ,  C12Q2521/101 ,  C12Q2525/307 ,  C12Q2525/117

Abstract: Methods, compositions, and systems are provided for characterization of modified nucleic acids. In certain preferred embodiments, single molecule sequencing methods are provided for identification of modified nucleotides within nucleic acid sequences. Modifications detectable by the methods provided herein include chemically modified bases, enzymatically modified bases, abasic sites, non-natural bases, secondary structures, and agents bound to a template nucleic acid.

Abstract translation: 提供了方法，组合物和系统用于表征修饰的核酸。 在某些优选实施方案中，提供单分子测序方法用于鉴定核酸序列内的修饰的核苷酸。 通过本文提供的方法可检测的修饰物包括化学修饰的碱基，酶修饰的碱基，脱碱基位点，非天然碱基，二级结构和与模板核酸结合的试剂。