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    EVOLUTION OF SITE-SPECIFIC RECOMBINASES
    1.
    发明申请
    EVOLUTION OF SITE-SPECIFIC RECOMBINASES 审中-公开
    网站特定重组的演变

    公开(公告)号：WO2017015545A1

    公开(公告)日：2017-01-26

    申请号：PCT/US2016/043513

    申请日：2016-07-22

    申请人： PRESIDENT AND FELLOWS OF HARVARD COLLEGE

    发明人： LIU, David R. ,  THOMPSON, David B. ,  BESSEN, Jeffrey L.

    IPC分类号： C12N9/22 ,  C12N15/85 ,  C12N15/90

    CPC分类号： C12Y207/07 ,  C12N9/1241 ,  C12N15/1037 ,  C12N15/1058 ,  C12N15/1093 ,  C12N15/907 ,  C12N2795/00021 ,  C12N2795/00043 ,  C12N2795/14121 ,  C12N2795/14143 ,  C12Q1/6876

    摘要： Some aspects of the present disclosure provide methods for evolving recombinases to recognize target sequences that differ from the canonical recognition sequences. Some aspects of this disclosure provide evolved recombinases, e.g., recombinases that bind and recombine naturally-occurring target sequences, such as, e.g., target sequences within the human Rosa26 locus. Methods for using such recombinases for genetically engineering nucleic acid molecules in vitro and in vivo are also provided. Some aspects of this disclosure also provide libraries and screening methods for assessing the target site preferences of recombinases, as well as methods for selecting recombinases that bind and recombine a non- canonical target sequence with high specificity.

    摘要翻译： 本公开的一些方面提供了用于进化重组酶以识别不同于规范识别序列的靶序列的方法。 本公开的一些方面提供了进化的重组酶，例如重组酶，其结合并重组天然存在的靶序列，例如人类Rosa26基因座内的靶序列。 还提供了在体外和体内使用这些重组酶用于遗传工程核酸分子的方法。 本公开的一些方面还提供用于评估重组酶的靶位点偏好的文库和筛选方法，以及用于选择以高特异性结合和重组非标准靶序列的重组酶的方法。

    ARGININE IMPROVES POLYMERASE STORAGE STABILITY
    2.
    发明申请
    ARGININE IMPROVES POLYMERASE STORAGE STABILITY 审中-公开
    ARGININE改善聚合酶储存稳定性

    公开(公告)号：WO2016085546A1

    公开(公告)日：2016-06-02

    申请号：PCT/US2015/043421

    申请日：2015-08-03

    申请人： BIO-RAD LABORATORIES, INC.

    发明人： CHENG, Man

    IPC分类号： C12N9/96

    CPC分类号： C12N9/1252 ,  C12N9/96 ,  C12Y207/07 ,  C12Y207/07007

    摘要： Liquid storage solutions comprising polymerases are provided. In some embodiments, provided herein are liquid storage solution for storing a polynucleotide manipulating enzyme (e.g., a polymerase or other enzyme as described herein). In some embodiments, the solution comprises, the enzyme (e.g., polymerase orrestriction enzyme); free arginine or a salt thereof or an arginine derivative (for example, but not limited to arginine ethyl ester, argininainide dihydrochloride) or a salt thereof; and 5% or more cryoprotectant.

    摘要翻译： 提供了包含聚合酶的液体储存溶液。 在一些实施方案中，本文提供了用于储存多核苷酸操纵酶（例如本文所述的聚合酶或其它酶）的液体储存溶液。 在一些实施方案中，溶液包含酶（例如聚合酶或限制性酶）; 游离精氨酸或其盐或精氨酸衍生物（例如但不限于精氨酸乙酯，精氨酸二盐酸盐）或其盐; 和5％以上的冷冻保护剂。

    IMPROVEMENTS TO EUKARYOTIC TRANSPOSASE MUTANTS AND TRANSPOSON END COMPOSITIONS FOR MODIFYING NUCLEIC ACIDS AND METHODS FOR PRODUCTION AND USE IN THE GENERATION OF SEQUENCING LIBRARIES
    4.
    发明申请
    IMPROVEMENTS TO EUKARYOTIC TRANSPOSASE MUTANTS AND TRANSPOSON END COMPOSITIONS FOR MODIFYING NUCLEIC ACIDS AND METHODS FOR PRODUCTION AND USE IN THE GENERATION OF SEQUENCING LIBRARIES 审中-公开
    用于改性核酸的真核转运突变体和转运末端组合物的改进以及用于生产和使用序列库的生成方法

    公开(公告)号：WO2015157611A3

    公开(公告)日：2016-03-03

    申请号：PCT/US2015025261

    申请日：2015-04-10

    申请人： UNIV JOHNS HOPKINS

    发明人： CRAIG NANCY L ,  GANGADHARAN SUNIL ,  DYDA FRED ,  HICKMAN ALISON

    IPC分类号： C12N9/12 ,  C12N15/09 ,  C12N15/52 ,  C12Q1/68

    CPC分类号： C12N9/1241 ,  C12Q1/6874 ,  C12Y207/07

    摘要： Hyperactive Hermes Transposase mutants and genes encoding them are disclosed. These transposases are easily purified in large quantity after expression in bacteria. The modified Hermes Transposases are soluble and stable and exist as smaller active complexes compared to the native enzyme. The consensus target DNA recognition sequence is the same as the native enzyme and shows minimal insertional sequence bias. These properties are useful in whole genome sequencing applications that involve sample DNA preparation requiring simultaneous fragmentation and attachment of custom sequences to the ends of the fragments. Methods and compositions using these transposases in fragmentation and 5' end-tagging are also disclosed.

    摘要翻译： 公开了多活性Hermes转座酶突变体和编码它们的基因。 这些转座酶在细菌表达后容易大量纯化。 与天然酶相比，改进的Hermes转录酶是可溶性和稳定的，并且以较小的活性复合物存在。 共有靶DNA识别序列与天然酶相同，显示最小插入序列偏差。 这些性质在全基因组测序应用中是有用的，其涉及样品DNA制备，需要同时片段化并将定制序列连接到片段的末端。 还公开了使用这些转座酶破碎和5'端标签的方法和组合物。

    BUFFERS FOR USE WITH POLYMERASES
    5.
    发明申请
    BUFFERS FOR USE WITH POLYMERASES 审中-公开
    与聚合物一起使用的缓冲剂

    公开(公告)号：WO2016014493A1

    公开(公告)日：2016-01-28

    申请号：PCT/US2015/041284

    申请日：2015-07-21

    申请人： BIO-RAD LABORATORIES, INC.

    发明人： GONG, Xiao-Song

    IPC分类号： C12P19/34

    CPC分类号： C12N9/96 ,  C12N9/1252 ,  C12P19/34 ,  C12Q1/6844 ,  C12Y207/07 ,  C12Y207/07007 ,  C12Q2527/125

    摘要： Amplification reaction mixtures comprising a cationic surfactant and an anionic surfactant are provided. Provided herein is a solution for storing a polymerase. In some embodiments, the solution comprises a polymerase; an anionic surfactant; and a cationic surfactant. In some embodiments, the concentration of the anionic surfactant and the cationic surfactant is between 0.0001 % and 0.1%. In some embodiments, the anionic detergent is sodium dodecyl sulfate (SDS). In some embodiments, the cationic detergent is cetyl trimethylammonium bromide (CTAB). In some embodiments, the anionic detergent is SDS and the cationic detergent is CTA 13.

    摘要翻译： 提供包含阳离子表面活性剂和阴离子表面活性剂的扩增反应混合物。 本文提供了用于存储聚合酶的溶液。 在一些实施方案中，溶液包含聚合酶; 阴离子表面活性剂; 和阳离子表面活性剂。 在一些实施方案中，阴离子表面活性剂和阳离子表面活性剂的浓度为0.0001％至0.1％。 在一些实施方案中，阴离子洗涤剂是十二烷基硫酸钠（SDS）。 在一些实施方案中，阳离子洗涤剂是十六烷基三甲基溴化铵（CTAB）。 在一些实施方案中，阴离子洗涤剂为SDS，阳离子洗涤剂为CTA 13。