公开(公告)号：WO2015042201A2

公开(公告)日：2015-03-26

申请号：PCT/US2014/056175

申请日：2014-09-17

申请人： ZYMOCHEM INC. ,  CHOKHAWALA, Harshal

发明人： CHOKHAWALA, Harshal

IPC分类号： C12P13/04 ,  C12N1/21

CPC分类号： C12N15/52 ,  C12N9/00 ,  C12N9/0006 ,  C12N9/0008 ,  C12N9/001 ,  C12N9/0016 ,  C12N9/1029 ,  C12N9/1096 ,  C12N9/1205 ,  C12N9/13 ,  C12N9/16 ,  C12N9/2402 ,  C12N9/88 ,  C12N9/93 ,  C12P7/04 ,  C12P7/18 ,  C12P7/24 ,  C12P7/40 ,  C12P7/42 ,  C12P7/44 ,  C12P7/6409 ,  C12P13/001 ,  C12P13/005 ,  C12P17/08 ,  C12P17/10 ,  C12Y101/01001 ,  C12Y101/01002 ,  C12Y101/01035 ,  C12Y101/01078 ,  C12Y101/01268 ,  C12Y101/01269 ,  C12Y102/01003 ,  C12Y102/01005 ,  C12Y102/01022 ,  C12Y102/01024 ,  C12Y102/01026 ,  C12Y102/01048 ,  C12Y102/01063 ,  C12Y102/07005 ,  C12Y102/99006 ,  C12Y103/01044 ,  C12Y103/01045 ,  C12Y103/01086 ,  C12Y104/01 ,  C12Y203/01001 ,  C12Y203/01032 ,  C12Y203/01035 ,  C12Y203/01057 ,  C12Y206/01008 ,  C12Y206/01009 ,  C12Y206/01036 ,  C12Y206/01043 ,  C12Y206/01048 ,  C12Y206/01076 ,  C12Y206/01082 ,  C12Y207/01031 ,  C12Y207/01165 ,  C12Y208/03 ,  C12Y301/03 ,  C12Y301/03002 ,  C12Y301/03008 ,  C12Y301/03019 ,  C12Y301/0302 ,  C12Y302/01 ,  C12Y401/01001 ,  C12Y401/02 ,  C12Y401/02014 ,  C12Y401/0202 ,  C12Y401/02021 ,  C12Y401/03016 ,  C12Y401/03017 ,  C12Y402/01002 ,  C12Y402/01003 ,  C12Y402/01028 ,  C12Y402/0103 ,  C12Y402/01079 ,  C12Y402/0112 ,  C12Y602/01 ,  Y02E50/343

摘要： Provided herein are methods, compositions, and non-naturally occurring microbial organism for preparing compounds such as1-butanol, butyric acid, succinic acid, 1,4-butanediol, 1-pentanol, pentanoic acid, glutaric acid, 1,5-pentanediol, 1-hexanol, hexanoic acid, adipic acid, 1,6-hexanediol, 6-hydroxy hexanoic acid, ε-Caprolactone, 6-amino-hexanoic acid, ε-Caprolactam, hexamethylenediamine, linear fatty acids and linear fatty alcohols that are between 7-25 carbons long, linear alkanes and linear -alkenes that are between 6-24 carbons long, sebacic acid and dodecanedioic acid comprising: a) converting a C N aldehyde and pyruvate to a C N+3 -hydroxyketone intermediate through an aldol addition; and b) converting the C N+3 -hydroxyketone intermediate to the compounds through enzymatic steps, or a combination of enzymatic and chemical steps.

摘要翻译： 本文提供的方法，组合物和非天然存在的微生物用于制备化合物，例如1-丁醇，丁酸，琥珀酸，1,4-丁二醇，1-戊醇，戊酸，戊二酸，1,5-戊二醇， 1-己醇，己酸，己二酸，1,6-己二醇，6-羟基己酸，ε-己内酯，6-氨基己酸，ε-己内酰胺，六亚甲基二胺，直链脂肪酸和直链脂肪醇， 长度在7-25个碳原子之间，直链烷烃和6-24个碳原子的直链烷烃，癸二酸和十二烷二酸包括：a）通过醛醇缩合将CN醛和丙酮酸酯转化为CN + 3-羟基酮中间体; 和b）通过酶促步骤或酶和化学步骤的组合将CN + 3-羟基酮中间体转化为化合物。

公开(公告)号：WO2015189400A1

公开(公告)日：2015-12-17

申请号：PCT/EP2015/063195

申请日：2015-06-12

申请人： ACIB GMBH - AUSTRIAN CENTRE OF INDUSTRIAL BIOTECHNOLOGY ,  TECHNISCHE UNIVERSITÄT GRAZ

发明人： STEINER, Kerstin ,  GRUBER, Mandana ,  WIEDNER, Romana ,  SCHWAB, Helmut

IPC分类号： C12P13/00 ,  C12N9/88

CPC分类号： C12P13/008 ,  C12N9/88 ,  C12Y401/02

摘要： The present invention relates to a method for producing chiral β-nitro alcohol compounds. The invention relates in particular to an (R)-selective cupin- nitroaldolase, which enantioselectively can catalyze the Henry reaction, wherein an aldehyde or ketone compound is converted to the corresponding β-nitro alcohol compound in the presence of a nitroalkane compound and a cupin-nitroaldolase.

摘要翻译： 本发明涉及手性β-硝基醇化合物的制造方法。 本发明特别涉及（R）选择性的铜 - 硝基醛缩酶，其对称选择性地可以催化亨利反应，其中醛或酮化合物在硝基烷烃化合物和杯状蛋白存在下转化为相应的β-硝基醇化合物 -nitroaldolase。

公开(公告)号：WO2015042201A3

公开(公告)日：2015-06-04

申请号：PCT/US2014056175

申请日：2014-09-17

申请人： ZYMOCHEM INC ,  CHOKHAWALA HARSHAL

发明人： CHOKHAWALA HARSHAL

IPC分类号： C12P7/40

CPC分类号： C12N15/52 ,  C12N9/00 ,  C12N9/0006 ,  C12N9/0008 ,  C12N9/001 ,  C12N9/0016 ,  C12N9/1029 ,  C12N9/1096 ,  C12N9/1205 ,  C12N9/13 ,  C12N9/16 ,  C12N9/2402 ,  C12N9/88 ,  C12N9/93 ,  C12P7/04 ,  C12P7/18 ,  C12P7/24 ,  C12P7/40 ,  C12P7/42 ,  C12P7/44 ,  C12P7/6409 ,  C12P13/001 ,  C12P13/005 ,  C12P17/08 ,  C12P17/10 ,  C12Y101/01001 ,  C12Y101/01002 ,  C12Y101/01035 ,  C12Y101/01078 ,  C12Y101/01268 ,  C12Y101/01269 ,  C12Y102/01003 ,  C12Y102/01005 ,  C12Y102/01022 ,  C12Y102/01024 ,  C12Y102/01026 ,  C12Y102/01048 ,  C12Y102/01063 ,  C12Y102/07005 ,  C12Y102/99006 ,  C12Y103/01044 ,  C12Y103/01045 ,  C12Y103/01086 ,  C12Y104/01 ,  C12Y203/01001 ,  C12Y203/01032 ,  C12Y203/01035 ,  C12Y203/01057 ,  C12Y206/01008 ,  C12Y206/01009 ,  C12Y206/01036 ,  C12Y206/01043 ,  C12Y206/01048 ,  C12Y206/01076 ,  C12Y206/01082 ,  C12Y207/01031 ,  C12Y207/01165 ,  C12Y208/03 ,  C12Y301/03 ,  C12Y301/03002 ,  C12Y301/03008 ,  C12Y301/03019 ,  C12Y301/0302 ,  C12Y302/01 ,  C12Y401/01001 ,  C12Y401/02 ,  C12Y401/02014 ,  C12Y401/0202 ,  C12Y401/02021 ,  C12Y401/03016 ,  C12Y401/03017 ,  C12Y402/01002 ,  C12Y402/01003 ,  C12Y402/01028 ,  C12Y402/0103 ,  C12Y402/01079 ,  C12Y402/0112 ,  C12Y602/01 ,  Y02E50/343

摘要： Provided herein are methods, compositions, and non-naturally occurring microbial organism for preparing compounds such as1-butanol, butyric acid, succinic acid, 1,4-butanediol, 1-pentanol, pentanoic acid, glutaric acid, 1,5-pentanediol, 1-hexanol, hexanoic acid, adipic acid, 1,6-hexanediol, 6-hydroxy hexanoic acid, ε-Caprolactone, 6-amino-hexanoic acid, ε-Caprolactam, hexamethylenediamine, linear fatty acids and linear fatty alcohols that are between 7-25 carbons long, linear alkanes and linear -alkenes that are between 6-24 carbons long, sebacic acid and dodecanedioic acid comprising: a) converting a CN aldehyde and pyruvate to a CN+3 -hydroxyketone intermediate through an aldol addition; and b) converting the CN+3 -hydroxyketone intermediate to the compounds through enzymatic steps, or a combination of enzymatic and chemical steps.

摘要翻译： 本文提供的方法，组合物和非天然存在的微生物用于制备化合物，例如1-丁醇，丁酸，琥珀酸，1,4-丁二醇，1-戊醇，戊酸，戊二酸，1,5-戊二醇， 1-己醇，己酸，己二酸，1,6-己二醇，6-羟基己酸，ε-己内酯，6-氨基己酸，ε-己内酰胺，六亚甲基二胺，线性脂肪酸和线性脂肪醇， 长度为6-24个碳原子的直链烷烃和直链烷烃，癸二酸和十二烷二酸包括：a）通过醛醇缩合将CN醛和丙酮酸盐转化成CN + 3-羟基酮中间体; 和b）通过酶促步骤或酶和化学步骤的组合将CN + 3-羟基酮中间体转化为化合物。

公开(公告)号：WO2013033652A1

公开(公告)日：2013-03-07

申请号：PCT/US2012/053547

申请日：2012-08-31

申请人： THE REGENTS OF THE UNIVERSITY OF CALIFORNIA ,  JUMINAGA, Darmawi ,  KEASLING, Jay, D.

发明人： JUMINAGA, Darmawi ,  KEASLING, Jay, D.

IPC分类号： C12N9/88 ,  C12N15/63 ,  C12N15/67

CPC分类号： C12N15/70 ,  C12N9/001 ,  C12N9/88 ,  C12N15/52 ,  C12P7/42 ,  C12P13/22 ,  C12P13/225 ,  C12P13/227 ,  C12Y103/01012 ,  C12Y401/02 ,  Y02P20/52

摘要： The present disclosure relates to engineered microorganisms that produce amino acids and amino acid intermediates. In particular, the disclosure relates to recombinant nucleic acids encoding operons that increase production of aromatic amino acids and the aromatic amino acid intermediate shikimate; microorganisms with increased production of aromatic amino acids and the aromatic amino acid intermediate shikimate; and methods related to the production of aromatic amino acids, the aromatic amino acid intermediate shikimate, and commodity chemicals derived therefrom.

摘要翻译： 本公开涉及产生氨基酸和氨基酸中间体的工程微生物。 特别地，本公开涉及编码增加芳族氨基酸的产生和芳香族氨基酸中间体莽草酸的操纵子的重组核酸; 芳香族氨基酸生产微生物和芳香族氨基酸中间体莽草酸; 以及与芳香族氨基酸的生成，芳香族氨基酸中间体莽草酸以及从其衍生的商品化学品有关的方法。

公开(公告)号：WO2006096527A3

公开(公告)日：2007-11-22

申请号：PCT/US2006007642

申请日：2006-03-03

申请人： DIVERSA CORP ,  MATHUR ERIC ,  CHANG CATHY

发明人： MATHUR ERIC ,  CHANG CATHY

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12N9/88 ,  C07K2/00 ,  C12N9/00 ,  C12N9/0061 ,  C12N9/0065 ,  C12N9/0071 ,  C12N9/1241 ,  C12N9/14 ,  C12N9/16 ,  C12N9/2411 ,  C12N9/2428 ,  C12N9/2437 ,  C12N9/2445 ,  C12N9/2482 ,  C12N9/78 ,  C12N9/80 ,  C12Q1/02 ,  C12Q1/04 ,  C12Y111/01016 ,  C12Y301/03 ,  C12Y302/01004 ,  C12Y303/02009 ,  C12Y305/01004 ,  C12Y401/02 ,  C12Y402/02002

摘要： The invention provides polypeptides, including enzymes, structural proteins and binding proteins, polynucleotides encoding these polypeptides, and methods of making and using these polynucleotides and polypeptides. Polypeptides, including enzymes and antibodies, and nucleic acids of the invention can be used in industrial, experimental, food and feed processing, nutritional and pharmaceutical applications, e.g., for food and feed supplements, colorants, neutraceuticals, cosmetic and pharmaceutical needs.

摘要翻译： 本发明提供多肽，包括酶，结构蛋白和结合蛋白，编码这些多肽的多核苷酸，以及制备和使用这些多核苷酸和多肽的方法。 本发明的多肽，包括酶和抗体以及核酸可用于工业，实验，食品和饲料加工，营养和药物应用中，例如用于食品和饲料添加剂，着色剂，中性药物，化妆品和药物需求。

公开(公告)号：WO2016201110A1

公开(公告)日：2016-12-15

申请号：PCT/US2016/036708

申请日：2016-06-09

申请人： KEMBIOTIX LLC

发明人： MILAN, Jay, L. ,  MANNAN, Ramasamy, Mannar

IPC分类号： C12P19/02 ,  C12P19/24 ,  C07C45/27 ,  C07C49/17

CPC分类号： C07C45/75 ,  C07C29/1518 ,  C07C45/38 ,  C12P19/02 ,  C12P19/24 ,  C12Y401/02 ,  C12Y503/01 ,  C07C31/04 ,  C07C47/04 ,  C07C49/17

摘要： The present invention relates to the use of dihydroxyacetone ("DHA") in the preparation of a number of natural and rare carbohydrates. The present invention comprises three stages. In the first stage of the present invention, syngas and formaldehyde are produced from natural gas, biogas, biomass and C02 from industrial plants including electricity generating plants, steel mills, cement factories and bio refineries. In the second stage of the present invention, formaldehyde and syngas from first stage are condensed to produce DHA. In the third stage of the present invention, DHA serves as a starting material for the synthesis of natural and rare carbohydrates using enzymes belonging to isomerase, aldolases, epimerase and transketolase groups.

摘要翻译： 本发明涉及二羟基丙酮（“DHA”）在制备多种天然和稀有碳水化合物中的用途。 本发明包括三个阶段。 在本发明的第一阶段，合成气和甲醛由天然气，沼气，生物质和来自包括发电厂，钢铁厂，水泥厂和生物炼油厂在内的工厂的二氧化碳产生。 在本发明的第二阶段中，来自第一阶段的甲醛和合成气被冷凝以产生DHA。 在本发明的第三阶段中，DHA作为使用属于异构酶，醛缩酶，差向异构酶和转酮酶基团的酶合成天然和稀有碳水化合物的原料。

公开(公告)号：WO2006096527A2

公开(公告)日：2006-09-14

申请号：PCT/US2006/007642

申请日：2006-03-03

申请人： DIVERSA CORPORATION ,  MATHUR, Eric ,  CHANG, Cathy

发明人： MATHUR, Eric ,  CHANG, Cathy

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12N9/88 ,  C07K2/00 ,  C12N9/00 ,  C12N9/0061 ,  C12N9/0065 ,  C12N9/0071 ,  C12N9/1241 ,  C12N9/14 ,  C12N9/16 ,  C12N9/2411 ,  C12N9/2428 ,  C12N9/2437 ,  C12N9/2445 ,  C12N9/2482 ,  C12N9/78 ,  C12N9/80 ,  C12Q1/02 ,  C12Q1/04 ,  C12Y111/01016 ,  C12Y301/03 ,  C12Y302/01004 ,  C12Y303/02009 ,  C12Y305/01004 ,  C12Y401/02 ,  C12Y402/02002

摘要： The invention provides polypeptides, including enzymes, structural proteins and binding proteins, polynucleotides encoding these polypeptides, and methods of making and using these polynucleotides and polypeptides. Polypeptides, including enzymes and antibodies, and nucleic acids of the invention can be used in industrial, experimental, food and feed processing, nutritional and pharmaceutical applications, e.g., for food and feed supplements, colorants, neutraceuticals, cosmetic and pharmaceutical needs.

摘要翻译： 本发明提供多肽，包括酶，结构蛋白和结合蛋白，编码这些多肽的多核苷酸，以及制备和使用这些多核苷酸和多肽的方法。 本发明的多肽，包括酶和抗体以及核酸可用于工业，实验，食品和饲料加工，营养和药物应用中，例如用于食品和饲料添加剂，着色剂，中性药物，化妆品和药物需求。