公开(公告)号：CN116504320A

公开(公告)日：2023-07-28

申请号：CN202310337659.5

申请日：2023-03-31

Applicant: 江南大学

Inventor： 夏小乐 ,  郑楠 ,  龙梦飞 ,  张泽华

IPC: G16C10/00 ,  G16B5/00 ,  G16B30/10 ,  C12N9/08 ,  C12N9/02

Abstract: 本发明涉及一种基于构象动力学设计提高酶稳定性和活性的方法，属于计算化学，生物信息学，基因工程以及蛋白质工程技术领域。该方法包括以下步骤：基于高压分子动力学模拟的等温压缩系数扰动筛选出与酶的性质和功能密切相关的高可塑性区域，然后对高可塑性区域的氨基酸进行动态柔性指数和动态耦合指数计算，筛选出高稳定性和活性的突变体。本发明实现了从区域到点的筛选，克服了现有技术实用性不强的问题，并且同时提高了酶的稳定性和活性，提高了酶在工业上的应用价值。

公开(公告)号：CN114330025A

公开(公告)日：2022-04-12

申请号：CN202210059055.4

申请日：2022-01-18

Applicant: 江南大学

Inventor： 夏小乐 ,  张泽华 ,  龙梦飞 ,  高玲 ,  王颖妤 ,  郑楠

IPC: G06F30/20 ,  G16B15/20 ,  C12N9/02 ,  C12N9/10 ,  C12N9/20 ,  G06F119/02

Abstract: 本发明公开了一种空腔工程化技术提高酶热稳定性和催化活性的方法，属于生物信息学、计算化学、生物工程、生物物理及蛋白质工程等领域。本发明首先以分子动力学模拟(MD)蛋白运动，通过聚类分析挑选出代表性构象后通过AQUA‑DUCT分析模拟轨迹并筛选出蛋白内部关键空腔，再筛选出组成关键内部空腔附近的氨基酸残基同时排除结合活性位点一定范围的氨基酸残基，再结合多尺度自由能计算软件以能量为指标对上述残基位点执行饱和突变，经筛选获得潜在的阳性突变体。利用本发明方法得到的阳性突变率最高达到90％，酶的热稳定性和催化活性均得到增强，具有非常高的应用潜力。

公开(公告)号：CN114121154A

公开(公告)日：2022-03-01

申请号：CN202111211545.3

申请日：2021-10-18

Applicant: 江南大学

Inventor： 夏小乐 ,  张悦 ,  高玲 ,  龙梦飞 ,  周庆同 ,  周景文

IPC: G16B20/50 ,  G16B15/30 ,  G16B50/30 ,  C12N15/115

Abstract: 本发明属于生物工程技术领域，具体涉及一种利用分子设计导向提高适配体特异性和亲和力的方法，包括以下步骤，S1：利用虚拟计算，从化合物信息库中筛选出适配体的靶标；S2：通过实验验证步骤S1筛选的结果；S3：对适配体的位点进行虚拟突变，筛选出适配体的突变位点；S4：对所述适配体的突变位点进行碱基替代；S5：检测碱基替代后的适配体与步骤S1筛选出的靶标的结合参数，选择碱基替代后提高了特异性和亲和力的适配体。本发明利用计算机理性计算开发一种高效分子设计导向的提高适配体结合特异性和亲和力的理性设计方法，从而定向改造提升适配体的特异性和结合力，对于适配体投入实际应用具有重要意义。

公开(公告)号：CN113215120A

公开(公告)日：2021-08-06

申请号：CN202110335568.9

申请日：2021-03-29

Applicant: 江南大学

Inventor： 饶志明 ,  龙梦飞 ,  乔郅钠 ,  徐美娟 ,  杨套伟 ,  张显 ,  邵明龙

IPC: C12N9/02 ,  C12P13/24 ,  C12R1/19

Abstract: 本发明公开了重组大肠杆菌转化生产反式‑4‑羟基‑L‑脯氨酸的方法，属于生物工程技术领域。本发明克隆了来源于uncultured bacterium esnapd2的P4H酶，并在其基础上做了相关改造获得了突变体，并构建了表达L‑脯氨酸羟化酶或其突变体的重组大肠杆菌。利用表达L‑脯氨酸羟化酶或其突变体的重组大肠杆菌全细胞转化生产Hyp，转化24h trans‑4‑Hyp的产量为5.38g/L，转化率可达94.5％。为微生物工业化生产Hyp提供了基础。

公开(公告)号：CN112877318A

公开(公告)日：2021-06-01

申请号：CN202110333266.8

申请日：2021-03-29

Applicant: 江南大学

Inventor： 饶志明 ,  龙梦飞 ,  乔郅钠 ,  徐美娟 ,  杨套伟 ,  张显 ,  邵明龙

IPC: C12N9/88 ,  C12N15/60 ,  C12N15/53 ,  C12N15/55 ,  C12N15/70 ,  C12N1/21 ,  C12P13/24 ,  C12R1/19

Abstract: 本发明公开了一种全细胞催化L‑精氨酸合成反式‑4‑羟基‑L‑脯氨酸的方法，属于生物工程领域。本发明在大肠杆菌中表达了精氨酸羟化酶、精氨酸酶以及鸟氨酸环化脱氨酶，能够以L‑精氨酸为底物生产trans‑4‑Hyp的重组大肠杆菌，为微生物发酵生产Hyp提供了新的途径及生产思路。本发明提供的这种微生物全细胞生产Hyp的方法，具有反应条件温和、原工艺简单、易于控制等优点，同时有利于环境保护，易于推广应用。

公开(公告)号：CN112779205A

公开(公告)日：2021-05-11

申请号：CN202110333623.0

申请日：2021-03-29

Applicant: 江南大学

Inventor： 饶志明 ,  龙梦飞 ,  乔郅钠 ,  徐美娟 ,  杨套伟 ,  张显 ,  邵明龙

IPC: C12N1/21 ,  C12P13/24 ,  C12R1/19

Abstract: 本发明公开了一种利用微生物发酵生产L‑脯氨酸的方法，属于生物工程技术领域。本发明通过在大肠杆菌中敲除L‑脯氨酸降解以及转运基因putA、putP、proP及aceA，构建得到的基因工程菌能够显著提升L‑脯氨酸的含量，于5L发酵罐中培养60h得到32.2g·L‑1的L‑脯氨酸，L‑脯氨酸的生产效率提高至0.805g·L‑1·h‑1。

公开(公告)号：CN109628476A

公开(公告)日：2019-04-16

申请号：CN201910120166.X

申请日：2019-02-18

Applicant: 江南大学

Inventor： 饶志明 ,  乔郅钠 ,  龙梦飞 ,  徐美娟 ,  杨套伟 ,  张显

IPC: C12N15/53 ,  C12N15/75 ,  C12N1/21 ,  C12N9/02 ,  C12P13/06 ,  C12R1/125

Abstract: 本发明公开了一种利用全细胞转化生产4‑羟基异亮氨酸的方法，属于基因工程技术领域。本发明提供了一段可用于编码L‑异亮氨酸羟化酶的基因(核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示)，将此基因在枯草芽孢杆菌中进行表达，可使枯草芽孢杆菌能够高效合成比酶活高且4‑羟基异亮氨酸转化率高的L‑异亮氨酸羟化酶；将本发明的枯草芽孢杆菌工程菌培养12～24h，即可使粗酶液中的L‑异亮氨酸羟化酶的酶活高达171.67U/mL；利用本发明的的枯草芽孢杆菌工程菌生产得到的L‑异亮氨酸羟化酶比酶活和4‑羟基异亮氨酸转化率均较高，其中，比酶活可达437.6U/mg，4‑羟基异亮氨酸转化率可达99.87％。

公开(公告)号：CN217868768U

公开(公告)日：2022-11-22

申请号：CN202221193409.6

申请日：2022-05-17

Applicant: 江南大学 ,  无锡锡遵科技有限公司

Inventor： 夏小乐 ,  董国琛 ,  吴梦尧 ,  高玲 ,  龙梦飞 ,  郑志永

IPC: C12G3/02

Abstract: 本实用新型公开了一种自动翻曲装置，属于白酒酿造技术领域。所述自动翻曲装置包括机架，所述机架上连接有驱动机构，所述驱动机构转动连接有传动机构，所述传动机构固定连接有框架，所述框架内设置有若干个曲架，若干个曲架之间相互连接，所述曲架包括底板，所述底板上开设有若干个曲块定位槽，若干个曲块定位槽之间互不接触，所述曲块定位槽上设置有曲块，所述框架和曲架具有若干个通气口。本实用模型结构简单，操作便捷，能够实现曲块位置上下移动，同时自身360°翻转，自动调节曲块的位置，使每个曲块上的微生物能够均衡繁殖，降低了劳动强度，提高出曲率。