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公开(公告)号：CN114836448A
公开(公告)日：2022-08-02
申请号：CN202210546009.7
申请日：2022-05-19
摘要： 本申请公开了一种编码T4多聚核苷酸激酶的核酸分子，所述核酸分子包括如SEQ ID NO：01所示的核苷酸序列，本申请还公开了一种包含上述核苷酸序列的重组载体和宿主细胞，及其表达方法和所生产的T4多聚核苷酸激酶的用途，通过本申请公开的T4多聚核苷酸激酶的核酸分子为T4多聚核苷酸激酶的产量、纯度和活力提供了技术保障。
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公开(公告)号：CN111334501A
公开(公告)日：2020-06-26
申请号：CN202010173001.1
申请日：2020-03-13
IPC分类号： C12N15/10 , C12Q1/6806 , C12Q1/70
摘要： 本发明公开了一种复合缓冲液。根据本发明的实施例，该复合缓冲液包括：1-5mM两性离子缓冲液、0.05-0.5mM非离子螯合剂、0.002-0.03质量/体积％非离子型表面活性剂，pH＝7.0-8.0。该复合缓冲液适于低浓度核酸的保存，有利于核酸保持良好的稳定性和活性。并且，该复合缓冲液有利于核酸抵抗非低吸附处理耗材，降低核酸之间的交缠，和非特异吸附，尤其适于高通量测序的低浓度核酸样本的保存，能显著降低长期反复冻融对样本活性的影响。
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公开(公告)号：CN111383717A
公开(公告)日：2020-07-07
申请号：CN201911092196.0
申请日：2019-11-11
摘要： 本发明提供一种构建生物信息分析参照数据集的方法，其包括：获取多个参照样本的测序数据，将所有参照样本的测序数据组成初始参照数据集，对所述初始参照数据集进行分类处理，得到两个以上的参照数据子集，将所述任一个参照数据子集作为一个生物信息分析参照数据集。
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公开(公告)号：CN111383714A
公开(公告)日：2020-07-07
申请号：CN201910202238.5
申请日：2019-03-18
申请人： 安诺优达基因科技(北京)有限公司 , 安诺优达生命科学研究院
摘要： 本发明公开了模拟目标疾病仿真测序文库的方法及其应用，其中，该模拟目标疾病仿真测序文库的方法能根据需要得到不同体系和胚系变异特征、杂合/纯合比例和不同患病序列纯度，并能准确地模拟出接近真实的捕获测序条件下目标区域的深度波动，从而更加真实地模拟出了捕获测序条件下的下机数据。并且，该方法既能模拟全基因组下机数据，也能模拟捕获测序下机数据，适用范围广。同时，该方法运行速度快，能够在较短的时间内生成所需的模拟序列，并且模拟得到的序列的仿真程度高。
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公开(公告)号：CN111383714B
公开(公告)日：2023-07-28
申请号：CN201910202238.5
申请日：2019-03-18
申请人： 安诺优达基因科技(北京)有限公司 , 安诺优达生命科学研究院
摘要： 本发明公开了模拟目标疾病仿真测序文库的方法及其应用，其中，该模拟目标疾病仿真测序文库的方法能根据需要得到不同体系和胚系变异特征、杂合/纯合比例和不同患病序列纯度，并能准确地模拟出接近真实的捕获测序条件下目标区域的深度波动，从而更加真实地模拟出了捕获测序条件下的下机数据。并且，该方法既能模拟全基因组下机数据，也能模拟捕获测序下机数据，适用范围广。同时，该方法运行速度快，能够在较短的时间内生成所需的模拟序列，并且模拟得到的序列的仿真程度高。
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公开(公告)号：CN116469456B
公开(公告)日：2023-12-15
申请号：CN202310454928.6
申请日：2023-04-21
申请人： 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号： G16B5/00 , G16B20/30 , G06F18/214 , G06N20/00
摘要： 本发明涉及一种用于可变剪切事件预测的机器学习模型的训练方法和可变剪切事件的预测方法及应用。该用于可变剪切事件预测的机器学习模型的训练方法包括：确定用于获取可变剪切事件的预测结果的候选软件；基于所述候选软件获得机器学习模型的训练真集；以及，使用所述机器学习模型的训练真集对预定机器学习模型进行训练，所述预定机器学习模型采用从所述候选软件中确定的多个软件对可变剪切事件的预测结果获得单一可变剪切事件预测结果。本发明的方法能够显著提高预测结果的置信度，可以(56)对比文件Wangrui Liu et al..Integratingmachine learning to construct aberrantalternative splicing event relatedclassifiers to predict prognosis andimmunotherapy response in patients withhepatocellular carcinoma《.Front.Pharmacol.》.2022,第13卷全文.Kristoffer Vitting-Seerup etal..spliceR: an R package forclassification of alternative splicingand prediction of coding potential fromRNA-seq data《.BMC Bioinformatics》.2014,全文.
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公开(公告)号：CN109920485B
公开(公告)日：2023-10-31
申请号：CN201910202272.2
申请日：2019-03-18
申请人： 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号： G16B30/00
摘要： 本发明公开了对测序序列进行变异模拟的方法及其应用，其中，对测序序列进行变异模拟的方法包括：获取待模拟区域的碱基序列；将所述碱基序列进行变异状态标记，以便得到标记后的特征串；选取待添加的变异；将所述待添加的变异整合至所述标记后的特征串上，以便得到添加变异后的特征串；以及将所述添加变异后的特征串进行碱基还原，以便得到变异模拟后的序列。该方法通过对碱基序列的变异状态进行标记，设定碱基的变异类型，从而对各种变异进行模拟，变异模拟的方法简单，生成速度快，并能根据需要设计特殊的变异组合用于测试，变异模拟后的序列的仿真程度高。
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公开(公告)号：CN111073952B
公开(公告)日：2023-09-22
申请号：CN201910202577.3
申请日：2019-07-15
申请人： 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C40B50/06
摘要： 本发明公开了构建DNA文库的方法及其应用。其中，该方法包括将DNA样本进行末端修复后，利用耐高温聚合酶对DNA样本进行加腺苷酸尾处理，以便得到加尾后的DNA，其中，所述末端修复和所述加腺苷酸尾处理是连续进行的；以及将所述加尾后的DNA进行接头连接处理，以便得到连接产物，DNA文库其中，所述末端修复和加腺苷酸尾处理的条件是：27‑37摄氏度，5‑30分钟；70‑75摄氏度，10‑20分钟。该方法末端修复和加腺苷酸尾处理连续进行，中间无需纯化处理，稳定性好，同时还显著缩短了反应时间和反应流程。
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公开(公告)号：CN110021357B
公开(公告)日：2021-06-04
申请号：CN201810256018.6
申请日：2018-03-27
申请人： 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号： G16B30/00
摘要： 本发明涉及一种模拟癌症基因组测序数据生成装置，其包括人参考基因组序列位置信息获取模块、捕获区域参考基因组序列获取模块、癌症基因组变异数据模拟模块、模拟癌症基因组测序数据生成模块以及模拟癌症基因组测序数据输出模块。根据本发明，提供了一种能够对各种类型的变异进行模拟、使得生成的模拟测序数据能够适用于评估各种检测软件的性能的算法及装置。
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公开(公告)号：CN111100905B
公开(公告)日：2021-04-06
申请号：CN201911354966.4
申请日：2019-12-25
申请人： 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806
摘要： 本发明公开了缓冲液及其应用，其中，该缓冲液包括：33‑66mM Tris缓冲液，1.6‑5mM二价阳离子、25‑75mM一价阳离子、0.5‑10mM二硫苏糖醇(DTT)、5‑15％PEG4000‑8000和0.5‑2mM ATP，pH值为7‑9。该缓冲液能提高连接反应效率，增加底物的转化率，降低连接反应的错配率，并且兼容性好，对连接酶的抑制作用小，同时，显著降低体系用酶量，从而降低了实验的成本。
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