一种基于生成式对抗网络的DNA存储纠错方法及系统

    公开(公告)号:CN118155722A

    公开(公告)日:2024-06-07

    申请号:CN202410191413.6

    申请日:2024-02-21

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 本说明书实施例提供了一种基于生成式对抗网络的DNA存储纠错方法及系统,其中,方法包括:基于A、T、C、G分布均匀的DNA模板链生成DNA序列数据集,分为训练集和测试集;构建生成式对抗网络模型GAN,基于训练集对生成式对抗网络模型GAN进行训练,并通过测试集进行测试后得到训练好的GAN模型;对存储的DNA分子序列进行测序,根据测序结果进行聚类筛选,得到DNA簇;根据预设规则选取合适的DNA簇,对测序得到序列信息按照预设的规则进行图像转换,生成对应的序列图片;将生成的序列图片经GAN模型的生成器得到纠错后的图片信息,再按照规则还原成编码序列,完成纠错。本发明能够获得到准确和可信的DNA序列,复现率较高。

    一种基于动态异构图的药物-靶点关系预测方法及系统

    公开(公告)号:CN118039023A

    公开(公告)日:2024-05-14

    申请号:CN202410097624.3

    申请日:2024-01-23

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于动态异构图的药物‑靶点关系预测方法及系统,所述方法包括:获取药物与靶点相互作用数据集,将数据集划分为训练集、验证集和测试集;基于数据集建立药物‑靶点动态异构图网络;建立相互作用预测模型,所述相互作用预测模型用于,基于药物‑靶点动态异构图网络,采用图神经网络模型计算药物和靶点的表征向量,计算药物的表征向量与靶点的表征向量的内积,得到二者的相关性,将相关性作为药物靶点预测;通过训练集对相互作用预测模型进行训练,验证集选择与优化相互作用预测模型超参数、权重及训练轮数;将测试集输入训练好的相互作用预测模型预测药物‑靶点关系。本发明可以实现基于动态异构图的药物‑靶点关系预测方法。

    激光软钎焊设备的温度控制方法、系统、设备和介质

    公开(公告)号:CN117020346A

    公开(公告)日:2023-11-10

    申请号:CN202311035609.8

    申请日:2023-08-16

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 本方案涉及激光软钎焊设备的温度控制方法、系统、设备和介质,控制方法包括:根据目标曲线获取预测时域内的目标温度序列,根据目标温度序列和预测模型的预测温度建立代价函数,并建立约束条件,预测模型用于预测未来一段时间内的预测温度,在满足约束条件的情况下,使代价函数最小,求解得到最优控制序列,从最优控制序列中确定目标控制功率,根据目标控制功率驱动激光软钎焊设备加热焊点。本发明可以减少实际输出温度与目标温度之间的误差值,提高系统的响应速度和控制精度,应用于焊接控制领域。

    基于注意力机制的跨社交网络虚拟身份关联方法及装置

    公开(公告)号:CN116776193A

    公开(公告)日:2023-09-19

    申请号:CN202310553976.0

    申请日:2023-05-17

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于注意力机制的跨社交网络虚拟身份关联方法及装置,方法包括:首先对用户进行特征提取,然后使用图注意力网络来聚合邻居节点特征作为用户的图向量;然后使用一个分层的语言注意网络来编码每个用户的文本特征,即文本向量;最后将用户的图向量和文本向量相加得到用户的最终表示,通过将来自不同社交网络的两个用户向量拼接输入到MLP中来输出分类结果,判断两个用户是否为同一个人的账户。本发明通过对用户的社交关系和发表内容进行特征提取,利用注意力机制对用户的社交关系和发表内容进行融合,得到更加全面的用户表征,能够解决依赖人工标注、单模态表征能力弱等问题。

    一种基于深度自编码器的疾病相关miRNAs预测方法及系统

    公开(公告)号:CN116705168A

    公开(公告)日:2023-09-05

    申请号:CN202310681068.X

    申请日:2023-06-08

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 本说明书实施例提供了一种基于深度自编码器的疾病相关miRNAs预测方法及系统,其中,方法包括:从TCGA数据库中获取样本的miRNAs表达谱数据,对获取的miRNAs表达谱数据分别进行标准化处理;所述样本包括疾病样本和正常样本;利用矩阵分解方法,对标准化处理后的miRNAs表达谱数据中的零值进行填充,使用填充后的miRNAs表达谱数据训练深度自编码器模型;基于所述深度自编码器模型训练反向编码器,根据所述反向编码器获得疾病样本的miRNA表达谱数据与疾病相关性大小,得到与疾病相关性高的miRNA。本发明能够发现新的疾病相关miRNAs,促进疾病的诊断及治疗。

    一种基于调制技术的多级目录DNA存储编解码方法

    公开(公告)号:CN116364185A

    公开(公告)日:2023-06-30

    申请号:CN202310173414.3

    申请日:2023-02-27

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于调制技术的多级目录DNA存储编解码方法,其包括如下步骤:S100:生成引物序列和文件数据序列的调制码表,构建引物序列数据集和文件绝对路径集;S200:将待存储二进制文件调制成DNA序列,合成后进行体外存储;S300:选择目标引物,从合成池中扩增出目标逻辑磁盘下的DNA分子并测序;S400:对测序数据的每个读长根据观测调制序列,计算其文件绝对路径并以此对测序数据进行分组;S500:根据编码DNA链长度及文件绝对路径,生成用于解码各分组数据的调制序列;并用此调制序列按照调制DNA存储解码算法解码数据。本发明基于调制技术设计寻址序列,提出多级目录DNA存储编解码方法,可实现高效、灵活的DNA存储文件管理方式。

    一种基于生物网络的个性化疾病病前状态识别方法

    公开(公告)号:CN114783520A

    公开(公告)日:2022-07-22

    申请号:CN202210380866.4

    申请日:2022-04-12

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 一种基于生物网络的个性化疾病病前状态识别方法,包括:对获取的单个体个性化时序样本数据进行标准化处理,根据时间点将标准化处理后的样本时序数据分为参考样本数据与待测样本数据;根据参考样本数据,得到基准样本数据;从全局蛋白质互作网络提取每个基因的表达模式,计算待测样本数据或参考样本数据中,每个时间点中每个基因相对于基准样本的距离分数;根据距离分数,得到每个时间点标准化的距离分数,根据每个时间点标准化距离分数,识别疾病病前状态;本发明识别疾病病前状态精度高,由于该方法主要是使用基因间调控关系作为背景进行数据处理和分析,因此该方法更具有生物意义,计算过程简单,计算耗时少。

    DNA分子螺旋除法器的构建方法及DNA分子螺旋除法器

    公开(公告)号:CN109992241B

    公开(公告)日:2020-12-08

    申请号:CN201910220120.5

    申请日:2019-03-22

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 本发明公开了一种DNA分子螺旋除法器的构建方法及DNA分子螺旋除法器,所述方法包括:利用DNA分子的Sub‑Tile结构,合成具有特异性黏性末端的6‑arm tile,包括除数被除数数据粒子、除法算子以及检测输出粒子;除数被除数数据粒子自组装形成除数被除数的三维螺旋结构,并输入各种除法算子完成除法运算;当除法运算完成后,通过检测输出粒子检测余数,标记出计算结果是设定余数的除法器,形成DNA分子螺旋除法器。本发明通过除数被除数粒子的黏贴反应,形成大量除数被除数的三维螺旋结构,输入各种除法算子完成除法运算,最后输入检测输出粒子,则完成稳定完整的DNA分子螺旋除法器,该DNA分子螺旋除法器可以实现不同除数同时随机生成,并且可以并行进行除法运算。

    一种基于GSA识别基因通路的方法

    公开(公告)号:CN107203704B

    公开(公告)日:2020-08-25

    申请号:CN201710300928.5

    申请日:2017-05-02

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 本发明实施例公开了一种基于GSA识别基因通路的方法,包括获取样本,并确定样本的信号通路及基因,且对所有信号通路中所含基因进行排序;确定每一个信号通路中基因总数量及每一个基因的正负得分平均值,计算出每一个信号通路的通路分数;获取每一个基因的基因出度并统计出最大和最小基因出度,并计算出每一个基因的基因出度权重;筛选出同一信号通路中的基因出度权重,并根据同一信号通路的基因出度权重,对相应信号通路的通路分数进行修订,且将修订后的通路分数进行排序,确定排序后最大通路分数所对应的信号通路出现变化的概率最大。实施本发明,能考虑到通路中调控大量基因的基因比仅调控少量基因的重要性,从而提高通路的识别精度。

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