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公开(公告)号：CN115171792A
公开(公告)日：2022-10-11
申请号：CN202210781902.8
申请日：2022-06-30
申请人： 湖南大学
IPC分类号： G16B40/20 , G16B30/10 , G16B10/00 , G16B50/00 , G06K9/62 , G06N3/04 , G06N3/08 , G06N20/20 , G06N5/00
摘要： 本发明公开了深度学习和生物信息学技术领域的一种毒力因子和抗生素抗性基因的混合预测方法，该毒力因子和抗生素抗性基因的混合预测方法包括以下步骤：S1.分别从数据库中获取已知的抗生素抗性基因序列数据、毒力因子序列数据以及负样本基因序列数据；S2.利用基因序列信息分别计算多种核心基因特征，构建深度学习神经网络架构和经典集成学习架构；S3.将S1中三类序列数据作为样本，划分中训练数据集和测试数据集；S4.利用多种分类方法获取新的训练数据集；对新的训练数据集构建分类模型，获取分类模型的性能评价指标。该毒力因子和抗生素抗性基因的混合预测方法预测效果好、预测准确率较高。
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公开(公告)号：CN114913925A
公开(公告)日：2022-08-16
申请号：CN202210477651.4
申请日：2022-04-29
申请人： 杭州市第一人民医院
IPC分类号： G16B40/20 , G16B40/10 , G16B45/00 , G16B25/10 , G16B25/20 , G16B10/00 , G16B20/10 , G16B20/20 , G16B20/50 , G16H50/30
摘要： 本发明公开了一种预测早期肺癌术后复发的模型，其通过如下方法构建：收集早期肺癌术后复发患者和未复发患者的样本，进行全外显子测序和RNA测序，并整合基因组和转录组的特征构建复发预测模型。本发明还提供一种预测早期肺癌术后复发的方法，采用上述的模型对早期肺癌术后患者是否复发进行预测。本发明能为预测复发提供更有价值的标记物，这可能会通过提供支持应用某些治疗方案的证据，使亚群患者受益。
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公开(公告)号：CN114613426A
公开(公告)日：2022-06-10
申请号：CN202210094499.1
申请日：2022-01-26
申请人： 西北大学
IPC分类号： G16B10/00
摘要： 本发明公开了一种基于动态多目标优化的系统发育树构建方法，首先，通过在含有标准树的多组形态学数据上进行单目标优化建树，得到不同类型数据与优化目标之间的对应关系。进而在单目标建树无法处理树冲突的情况下根据数据类型动态选择多个最优单目标进行融合，采用多目标优化算法，结合非支配排序与遗传算法进行系统发育树构建，最终对含有缺失和不可适用的数据构建出在多个目标下最优的系统发育树集合。该方法为形态学数据提供了新方法，相比基于单个目标优化的谱系树构建方法，有效的解决了古生物形态学数据谱系树构建过程中存在的缺失和不可适用以及在多个评价指标下出现冲突的问题，提高了物种谱系分析的准确率和稳定性。
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公开(公告)号：CN112216341B
公开(公告)日：2022-05-17
申请号：CN202010975825.0
申请日：2020-09-16
申请人： 中国人民解放军国防科技大学
摘要： 本发明提供了一种群体行为逻辑优化方法及计算机可读存储介质，将群体行为逻辑优化方法将抽象的离散的群体行为和行为的执行逻辑先映射到行为树BT，然后再将所述行为树映射到能够被基因表达式编程GEP算法优化的表达式树ET，以最终通过所述GEP算法优化的所述ET中的特定代码来优化所述BT，从而最终实现所述群体行为逻辑的优化，本发明提供的群体行为逻辑优化方法具有良好的优化性能，使得优化后的群体行为逻辑在执行任务时能够节省大量时间。
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公开(公告)号：CN108475297B
公开(公告)日：2022-04-29
申请号：CN201680063722.9
申请日：2016-10-28
申请人： 皇家飞利浦有限公司
摘要： 本文提供了用于确定针对相关病原体的传播度量或传播路径的计算机实施的方法、系统和过程。本文还提供了其上存储有可执行程序的非瞬态计算机可读存储介质，所述程序被配置为向微处理器发出指令以生成针对相关病原体的传播路径。
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公开(公告)号：CN114300055A
公开(公告)日：2022-04-08
申请号：CN202111629600.0
申请日：2021-12-28
申请人： 江苏先声医学诊断有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司 , 南京先声医学检验实验室有限公司
摘要： 本发明提供一种通过降维分群和校正基因组长度优化宏基因组纳米孔测序数据定量的方法，所述方法能够提高宏基因组数据的定量准确度，与传统定量方法相比，相关性平均提高50％左右。
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公开(公告)号：CN114041187A
公开(公告)日：2022-02-11
申请号：CN201980091273.2
申请日：2019-09-27
申请人： 黄延梅 , 伊莎贝尔·费尔南德斯·埃斯卡帕 , 凯瑟琳·莱蒙 , 弗洛伊德·E·德惠尔斯特
发明人： 黄延梅 , 伊莎贝尔·费尔南德斯·埃斯卡帕 , 凯瑟琳·莱蒙 , 弗洛伊德·E·德惠尔斯特
摘要： 公开了用于生成用于分类学分类的增强的序列集的系统、方法和计算机程序产品。在各个实施方案中，接收多个参考序列。多个参考序列中的每一个对应于分类学分类。将对应于参考序列中的至少一个的标记分配给多个补充序列中的每一个。将多个补充序列中的每一个和多个参考序列中的每一个截短到感兴趣的区域，从而生成截短的序列集。测量截短的序列集中截短的序列对之间的相似性，以确定相似性是否高于预定阈值。当相似性高于预定阈值时，将中间分类学标记分配给截短的序列集中截短的序列对，从而生成增强的序列集。
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公开(公告)号：CN113921087A
公开(公告)日：2022-01-11
申请号：CN202111122349.9
申请日：2021-09-24
申请人： 佛山科学技术学院
摘要： 本发明提供一种公猪预测受胎率计算方法及应用，涉及动物遗传育种技术领域。该方法包括：确定影响效应，所述影响效应包括公猪近交系数、后代近交系数、公猪配种时月龄和公猪个体随机效应；根据所述影响效应，建立评价模型，计算公猪近交系数的回归系数、后代近交系数的回归系数、公猪配种时月龄的效应值和公猪个体随机效应的效应值；根据计算结果，计算公猪的预测受胎率。该预测受胎率可作为评估公猪繁殖性能的依据，用于判断群体中公猪繁殖性能的优劣，因而可根据该预测受胎率区别不同繁殖性能的公猪，便于淘汰繁殖性能低的公猪，降低生产成本。该方法计算简便，对混合品种公猪与单一品种公猪均能实现较好的分类效果。
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公开(公告)号：CN112967751A
公开(公告)日：2021-06-15
申请号：CN202110299297.6
申请日：2021-03-21
申请人： 湖南大学
摘要： 本发明属于生物信息学、智能优化、计算机应用领域，公开了基于进化搜索的蛋白质构象空间优化方法。本发明包括：用氨基酸序列在第0代时的随机构象初始化种群；将种群中个体按照势能值排序；选择低势能个体作为当前采样前的父代个体，对每一个父代个体应用片段替换技术进行修改生成子代个体；对得到的每一个子代个体，应用最小化策略进行一系列的片段替换运动，映射到附近的极小值状态；将经过最小化策略处理后的所有子代个体与种群中其他个体形成的并集经过截断选择后选出新的种群。本发明改进了基本进化方法的不足，如：容易过早收敛到次优区域。本发明借助于以局部贪婪搜索为特征的最小化步骤，实现了采样能力更高的蛋白质构象空间探索方法。
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