子宫内膜细胞定量模型的构建方法和子宫内膜细胞定量方法

    公开(公告)号:CN117726597A

    公开(公告)日:2024-03-19

    申请号:CN202311753000.4

    申请日:2023-12-19

    IPC分类号: G06T7/00 G06N3/09 G06N20/10

    摘要: 本申请涉及一种子宫内膜细胞定量模型的构建方法和子宫内膜细胞定量方法,构建方法包括:获取子宫内膜细胞集的单细胞表达数据,子宫内膜细胞集包括来自子宫内膜组织的基质细胞、上皮细胞、内皮细胞、T细胞、NK细胞、B细胞和髓性细胞;根据子宫内膜细胞集的单细胞表达数据确定目标细胞特征基因集以及目标细胞特征基因集中每个特征基因在目标细胞集中每种细胞的平均表达量;根据目标细胞特征集中每个特征基因在目标细胞集中每种细胞的平均表达量构建目标细胞定量模型。本申请利用不同类型子宫内膜细胞在单细胞水平的基因表达谱,筛选出子宫内膜细胞的特征基因组合,开发了一种利用转录组数据检测子宫内膜组织中不同类型子宫内膜细胞比例的方法。

    构建目标蛋白质组谱图库的方法和应用

    公开(公告)号:CN116844640A

    公开(公告)日:2023-10-03

    申请号:CN202310806229.3

    申请日:2023-07-03

    IPC分类号: G16B30/10 G16B50/30 G01N30/02

    摘要: 本申请涉及一种构建目标蛋白质组谱图库的方法和在微量目标蛋白质组分析上的应用,方法包括:通过不同扫描范围对目标蛋白质组进行多次无动态排除的数据依赖采集模式的质谱扫描,以得到目标蛋白质组的质谱数据,目标蛋白质组的质谱数据包括目标蛋白质组多个扫描范围的一级谱,以及每个扫描范围中母离子强度满足预设阈值的二级谱;基于目标蛋白质组的质谱数据进行搜库以构建目标蛋白质组谱图库。本申请通过多个扫描范围无动态排除的数据依赖采集的质谱数据构建谱图库,对微量蛋白质组的DIA数据进行搜库分析,提高了DIA数据匹配的成功率,进而提高DIA数据分析的准确性和灵敏度,提高了微量蛋白鉴定的准确性和灵敏度。