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公开(公告)号:CN110551752B
公开(公告)日:2023-03-14
申请号:CN201910812765.8
申请日:2019-08-30
申请人: 北京市农林科学院
摘要: 本发明公开了xCas9n‑epBE碱基编辑系统及其在基因组碱基替换中的应用。本发明公开的xCas9n‑epBE碱基编辑系统包括xCas9n、PmCDA1、UGI和tRNA‑esgRNA组成;所述tRNA‑esgRNA靶向靶点序列;所述tRNA‑esgRNA如式I所示:tRNA‑所述靶点序列转录的RNA‑esgRNA骨架(式I)。通过实验证明:本发明的xCas9n‑epBE碱基编辑系统可在植物基因组中实现靶点序列的编辑,尤其是在PAM序列为GAC或GAG时实现靶点序列中碱基C到碱基T的碱基替换。本发明的xCas9n‑epBE碱基编辑系统在植物或动物基因组碱基替换中具有广泛的应用前景。
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公开(公告)号:CN110982818B
公开(公告)日:2022-03-08
申请号:CN201911323608.7
申请日:2019-12-20
申请人: 北京市农林科学院
IPC分类号: C12N15/113 , C12N15/61 , C12N9/90 , C12N9/22 , C12N9/78 , C12N15/55 , C12N15/82 , A01H5/00 , A01H6/46
摘要: 本发明公开了核定位信号F4NLS在高效创制水稻除草剂抗性材料中的应用。所述核定位信号F4NLS由核定位信号甲和核定位信号乙组成,所述核定位信号甲包括3*Flag2标签蛋白和NLS2蛋白;所述核定位信号乙包括所述NLS2蛋白。本发明还公开了一种ACCase抑制除草剂抗性水稻的制备方法。所述方法包括使受体水稻中表达esgRNA、腺嘌呤脱氨酶、Cas9核酸酶、核定位信号甲和核定位信号乙的步骤;所述腺嘌呤脱氨酶、所述Cas9核酸酶、所述核定位信号甲和所述核定位信号乙在所述esgRNA的向导下,可将受体水稻基因组中OsACC1基因靶点序列的第7位由A突变为G,从而获得ACCase抑制除草剂抗性水稻。
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公开(公告)号:CN110669775B
公开(公告)日:2021-07-16
申请号:CN201910938672.X
申请日:2019-09-30
申请人: 北京市农林科学院
摘要: 本发明公开了差异代理技术在A·G碱基替换细胞富集中的应用。本发明的差异代理技术载体包括靶向目标基因靶点序列的esgRNA、靶向功能丧失的筛选剂抗性基因靶点序列的sgRNA、A·G碱基替换系统和功能丧失的筛选剂抗性基因;A·G碱基替换系统在靶向功能丧失的筛选剂抗性基因靶点序列的sgRNA的向导下,可通过对所述功能丧失的筛选剂抗性基因靶点序列进行A·G碱基替换使所述功能丧失的筛选剂抗性基因功能恢复。本发明实现了细胞水平上A·G碱基替换细胞富集,大大提高A·G碱基替换效率。
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公开(公告)号:CN112538477A
公开(公告)日:2021-03-23
申请号:CN202011398790.5
申请日:2020-12-02
申请人: 北京市农林科学院
摘要: 本发明公开了xCas9基因编辑系统在基因组编辑中的应用。所述xCas9基因编辑系统包括xCas9和sgRNA。所述基因组编辑的方法包括如下步骤:将xCas9和sgRNA导入生物体或生物细胞内,实现基因组靶点序列的编辑;所述编辑为使所述靶点序列或其邻近序列发生碱基插入和/或缺失;所述sgRNA靶向靶点序列;所述靶点序列的PAM序列为GAD或NGN;D为G、T或A;N为A、T、C或G。通过实验证明:本发明的xCas9基因编辑系统可对位于生物基因组上的PAM序列为GAD或NGN的靶点序列或其邻近序列进行编辑,大大拓展了可编辑靶点的范围。
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公开(公告)号:CN110951773A
公开(公告)日:2020-04-03
申请号:CN201911323194.8
申请日:2019-12-20
申请人: 北京市农林科学院
摘要: 本发明公开了FNLS-sABE系统在创制水稻除草剂抗性材料中的应用。所述FNLS-sABE系统包括核定位信号甲和核定位信号乙,所述核定位信号甲包括3*Flag1标签蛋白和NLS1蛋白;所述核定位信号乙包括所述NLS1蛋白。本发明还公开了一种ACCase抑制除草剂抗性水稻的制备方法。所述方法包括使受体水稻中表达esgRNA、腺嘌呤脱氨酶、Cas9核酸酶、核定位信号甲和核定位信号乙的步骤;所述腺嘌呤脱氨酶、所述Cas9核酸酶、所述核定位信号甲和所述核定位信号乙在所述esgRNA的向导下,可将受体水稻基因组中OsACC1基因靶点序列的第7位由A突变为G,从而获得ACCase抑制除草剂抗性水稻。
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公开(公告)号:CN110551752A
公开(公告)日:2019-12-10
申请号:CN201910812765.8
申请日:2019-08-30
申请人: 北京市农林科学院
摘要: 本发明公开了xCas9n-epBE碱基编辑系统及其在基因组碱基替换中的应用。本发明公开的xCas9n-epBE碱基编辑系统包括xCas9n、PmCDA1、UGI和tRNA-esgRNA组成;所述tRNA-esgRNA靶向靶点序列;所述tRNA-esgRNA如式I所示:tRNA-所述靶点序列转录的RNA-esgRNA骨架(式I)。通过实验证明:本发明的xCas9n-epBE碱基编辑系统可在植物基因组中实现靶点序列的编辑,尤其是在PAM序列为GAC或GAG时实现靶点序列中碱基C到碱基T的碱基替换。本发明的xCas9n-epBE碱基编辑系统在植物或动物基因组碱基替换中具有广泛的应用前景。
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公开(公告)号:CN118272370A
公开(公告)日:2024-07-02
申请号:CN202211724810.2
申请日:2022-12-30
申请人: 北京市农林科学院 , 北京农科院种业科技有限公司
摘要: 本发明公开了一种适用于饱和突变进化植物基因的碱基编辑系统及其应用。所述碱基编辑系统包括sgRNA、依次由核定位信号、尿嘧啶糖苷酶、胞嘧啶脱氨酶、尿嘧啶糖苷酶、Cas9切刻酶和核定位信号融合而成的融合蛋白(或依次由核定位信号、DNA聚合酶、胞嘧啶脱氨酶、尿嘧啶糖苷酶、Cas9切刻酶和核定位信号融合而成的融合蛋白)和筛选标记蛋白。通过实验表明:使用该碱基编辑系统对植物进行编辑,具有突变形式多、编辑窗口大、C‑to‑G编辑效率高的特点,该碱基编辑系统适用于植物进行饱和突变,可用于产生并筛选出有利的变异类型,创制新的种质材料。
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公开(公告)号:CN111019968A
公开(公告)日:2020-04-17
申请号:CN201911405272.9
申请日:2019-12-31
申请人: 北京市农林科学院
摘要: 本发明公开了NTS/dNTS组合在制备植物突变体中的应用。该方法包括如下步骤:将esgRNA、Cas9切刻酶、筛选剂抗性蛋白、供体DNA导入植物中;esgRNA靶向DNA片段甲靶点序列;DNA片段甲靶点序列位于植物基因组中的转录链上;供体DNA的转录链依次由DNA片段甲靶点序列、DNA片段乙和DNA片段甲靶点序列组成;DNA片段乙为将DNA片段甲突变后得到的DNA分子;在esgRNA引导下,Cas9切刻酶在植物基因组的非转录链上产生一个单链DNA切刻,在供体DNA的非转录链上产生两个单链DNA切刻,通过植物体内的修复机制将植物基因组中DNA片段甲替换为DNA片段乙,实现植物基因替换。
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公开(公告)号:CN110951736A
公开(公告)日:2020-04-03
申请号:CN201911323222.6
申请日:2019-12-20
申请人: 北京市农林科学院
IPC分类号: C12N15/113 , C12N9/22 , C12N15/29 , C12N9/78 , C12N15/55 , C12N15/82 , C12N5/10 , C07K14/415 , A01H5/00 , A01H6/46
摘要: 本发明公开了一种核定位信号F4NLS及其在提高碱基编辑效率与拓展可编辑碱基范围中的应用。所述核定位信号F4NLS由核定位信号甲和核定位信号乙组成,所述核定位信号甲包括3*Flag标签蛋白和NLS蛋白;所述核定位信号乙包括所述NLS蛋白;所述3*Flag标签蛋白的氨基酸序列为序列10第1-22位;所述NLS蛋白的氨基酸序列为序列11第1-7位。通过实验证明:本发明的核定位信号F4NLS可提高碱基编辑效率和拓展可编辑碱基范围,在生物基因组编辑领域具有良好的应用前景。
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公开(公告)号:CN110628794A
公开(公告)日:2019-12-31
申请号:CN201910938668.3
申请日:2019-09-30
申请人: 北京市农林科学院
摘要: 本发明公开了以失活的筛选剂抗性基因为报告体系的C·T碱基替换的细胞富集技术及其应用。所述细胞富集技术载体包括如下试剂:sgRNA、C·T碱基替换系统和功能丧失的筛选剂抗性基因;sgRNA由靶向目标基因靶点序列的tRNA-sgRNA和靶向功能丧失的筛选剂抗性基因靶点序列的tRNA-sgRNA组成;C·T碱基替换系统在靶向功能丧失的筛选剂抗性基因靶点序列的tRNA-sgRNA的向导下,可通过对功能丧失的筛选剂抗性基因靶点序列进行C·T碱基替换使功能丧失的筛选剂抗性基因功能恢复。本发明实现了细胞水平上C·T碱基替换细胞富集,大大提高C·T碱基替换效率。
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