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公开(公告)号:CN111019968B
公开(公告)日:2023-06-23
申请号:CN201911405272.9
申请日:2019-12-31
申请人: 北京市农林科学院
摘要: 本发明公开了NTS/dNTS组合在制备植物突变体中的应用。该方法包括如下步骤:将esgRNA、Cas9切刻酶、筛选剂抗性蛋白、供体DNA导入植物中;esgRNA靶向DNA片段甲靶点序列;DNA片段甲靶点序列位于植物基因组中的转录链上;供体DNA的转录链依次由DNA片段甲靶点序列、DNA片段乙和DNA片段甲靶点序列组成;DNA片段乙为将DNA片段甲突变后得到的DNA分子;在esgRNA引导下,Cas9切刻酶在植物基因组的非转录链上产生一个单链DNA切刻,在供体DNA的非转录链上产生两个单链DNA切刻,通过植物体内的修复机制将植物基因组中DNA片段甲替换为DNA片段乙,实现植物基因替换。
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公开(公告)号:CN110951736B
公开(公告)日:2023-03-14
申请号:CN201911323222.6
申请日:2019-12-20
申请人: 北京市农林科学院
IPC分类号: C12N15/113 , C12N9/22 , C12N15/29 , C12N9/78 , C12N15/55 , C12N15/82 , C12N5/10 , C07K14/415 , A01H5/00 , A01H6/46
摘要: 本发明公开了一种核定位信号F4NLS及其在提高碱基编辑效率与拓展可编辑碱基范围中的应用。所述核定位信号F4NLS由核定位信号甲和核定位信号乙组成,所述核定位信号甲包括3*Flag标签蛋白和NLS蛋白;所述核定位信号乙包括所述NLS蛋白;所述3*Flag标签蛋白的氨基酸序列为序列10第1‑22位;所述NLS蛋白的氨基酸序列为序列11第1‑7位。通过实验证明:本发明的核定位信号F4NLS可提高碱基编辑效率和拓展可编辑碱基范围,在生物基因组编辑领域具有良好的应用前景。
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公开(公告)号:CN110835631B
公开(公告)日:2022-12-27
申请号:CN201911202321.9
申请日:2019-11-29
申请人: 北京市农林科学院
摘要: 本发明提供了一种高效的sgRNA及其在基因编辑中的应用。所述改造的sgRNA如式I所示:所述靶点序列转录的RNA‑改造的sgRNA骨架(式I);所述改造的sgRNA骨架为在sgRNA骨架第14‑15位之间插入RNA片段甲,且在所述sgRNA骨架第18‑19位之间插入RNA片段乙后得到的RNA分子;所述RNA片段甲与所述RNA片段乙反向互补;所述RNA片段甲与所述RNA片段乙大小均为5nt;所述sgRNA骨架为序列9所示的RNA分子。通过实验证明:本发明的改造的sgRNA可显著提高胞嘧啶碱基编辑器(CBE)的C·T碱基替换效率,最高可达81.8%。
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公开(公告)号:CN111378051B
公开(公告)日:2022-03-01
申请号:CN202010219352.1
申请日:2020-03-25
申请人: 北京市农林科学院
摘要: 本发明公开了PE‑P2引导编辑系统及其在基因组碱基编辑中的应用。所述PE‑P2引导编辑系统包括融合蛋白、pegRNA;所述融合蛋白为依次由Cas9切刻酶或其变体、反转录酶、自切割寡肽和筛选标记蛋白组成的融合蛋白或依次由筛选标记蛋白、自切割寡肽、Cas9切刻酶或其变体和反转录酶组成的融合蛋白。本发明通过自剪切多肽P2A使得PE‑P1系统中的RT、Cas9n(H840A)和HPT三者融合表达,并将sgRNA骨架替换为了esgRNA骨架,得到PE‑P2引导编辑系统。与PE‑P1引导编辑系统相比,本发明的PE‑P2引导编辑系统不仅可提高编辑靶点的编辑效率,还实现了不可编辑靶点的有效编辑。
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公开(公告)号:CN110951743A
公开(公告)日:2020-04-03
申请号:CN201911405303.0
申请日:2019-12-31
申请人: 北京市农林科学院
摘要: 本发明公开了一种提高植物基因替换效率的方法。所述方法包括如下步骤:将esgRNA、Cas9切刻酶、筛选剂抗性蛋白、供体DNA导入目的植物中;esgRNA靶向DNA片段甲靶点序列;Cas9切刻酶与筛选剂抗性蛋白共表达;供体DNA依次包括DNA片段甲靶点序列、DNA片段乙和DNA片段甲靶点序列;DNA片段乙为将DNA片段甲经过一个或几个碱基突变后得到的DNA分子;在esgRNA引导下,Cas9切刻酶在目的植物基因组中的DNA片段甲靶点序列处和供体DNA中的DNA片段甲靶点序列处均产生单链DNA切刻,并通过目的植物体内的修复机制将目的植物基因组中的DNA片段甲替换为DNA片段乙,实现植物基因替换。
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公开(公告)号:CN110835631A
公开(公告)日:2020-02-25
申请号:CN201911202321.9
申请日:2019-11-29
申请人: 北京市农林科学院
摘要: 本发明提供了一种高效的sgRNA及其在基因编辑中的应用。所述改造的sgRNA如式I所示:所述靶点序列转录的RNA-改造的sgRNA骨架(式I);所述改造的sgRNA骨架为在sgRNA骨架第14-15位之间插入RNA片段甲,且在所述sgRNA骨架第18-19位之间插入RNA片段乙后得到的RNA分子;所述RNA片段甲与所述RNA片段乙反向互补;所述RNA片段甲与所述RNA片段乙大小均为5nt;所述sgRNA骨架为序列9所示的RNA分子。通过实验证明:本发明的改造的sgRNA可显著提高胞嘧啶碱基编辑器(CBE)的C·T碱基替换效率,最高可达81.8%。
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公开(公告)号:CN110564752A
公开(公告)日:2019-12-13
申请号:CN201910938686.1
申请日:2019-09-30
申请人: 北京市农林科学院
摘要: 本发明公开了差异代理技术在C·T碱基替换细胞富集中的应用。本发明的差异代理技术载体包括如下试剂:sgRNA、C·T碱基替换系统和功能丧失的筛选剂抗性基因;sgRNA由靶向目标基因靶点序列的esgRNA和靶向功能丧失的筛选剂抗性基因靶点序列的sgRNA组成;C·T碱基替换系统在靶向功能丧失的筛选剂抗性基因靶点序列的sgRNA的向导下,可通过对所述功能丧失的筛选剂抗性基因靶点序列进行C·T碱基替换使所述功能丧失的筛选剂抗性基因功能恢复。本发明实现了细胞水平上C·T碱基替换细胞富集,大大提高C·T碱基替换效率。
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公开(公告)号:CN118240818A
公开(公告)日:2024-06-25
申请号:CN202211660998.9
申请日:2022-12-23
申请人: 北京市农林科学院 , 北京农科院种业科技有限公司
摘要: 本发明公开了PE‑P6引导编辑系统及其在基因组碱基编辑中的应用。为了提高引导编辑系统的编辑效率,本发明设计了PE‑P3~PE‑P7引导编辑系统。通过实验表明:与PE‑P3、PE‑P4、PE‑P5和PE‑P7引导编辑系统相比,引导编辑系统PE‑P6大大提高了水稻靶点在愈伤中的编辑效率,同时在水稻T0苗中,8个水稻靶点经引导编辑系统PE‑P6编辑后的效率最高。此外,除了水稻,引导编辑系统PE‑P6亦能大大提高了玉米靶点在原生质体中的编辑效率。
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公开(公告)号:CN114763556B
公开(公告)日:2024-04-26
申请号:CN202011621689.1
申请日:2020-12-31
申请人: 北京市农林科学院
摘要: 本发明公开了一种基因编辑效率提高的引导碱基编辑系统及其应用。所述引导碱基编辑系统包括融合蛋白或与所述融合蛋白相关的生物材料、pegRNA或与所述pegRNA相关的生物材料;所述融合蛋白包括反转录酶、Cas9切刻酶、自切割寡肽和筛选标记蛋白;所述pegRNA包括esgRNA、逆转录模板序列和引物结合位点序列;所述逆转录模板序列中引入的突变碱基包括在目标突变位点引入的突变碱基和在目标突变位点以外的其它位点引入的额外的突变碱基。通过实验证明:该引导碱基编辑系统可显著提高PE‑P2或PE‑P3引导编辑系统的编辑效率。
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公开(公告)号:CN114317596B
公开(公告)日:2024-01-16
申请号:CN202011060349.6
申请日:2020-09-30
申请人: 北京市农林科学院
摘要: 本发明公开了一种将植物基因组靶点序列中的A突变为G的方法。该方法包括如下步骤:将SpRYn、腺嘌呤脱氨酶和esgRNA导入植物体内,实现将植物基因组靶点序列中的A突变为G;所述esgRNA靶向靶点序列;所述esgRNA如式I所示:所述靶点序列转录的RNA‑esgRNA骨架(式I)。通过实验证明:本发明方法可对位于植物基因组上的PAM序列为NGC或NGA或NGG的靶点序列中的碱基A进行编辑,实现碱基A到碱基G的替换,在拓展可编辑的A的范围的同时,还提高了碱基替换效率。
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