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公开(公告)号:CN118760980A
公开(公告)日:2024-10-11
申请号:CN202410836234.3
申请日:2024-06-25
Applicant: 复旦大学附属华山医院 , 复旦大学
IPC: G06F18/2415 , G06F18/214 , G06F18/25 , G06F18/213
Abstract: 一种基于拉曼和质谱的数据分类及模型的构建方法、相关设备,所述基于拉曼和质谱的数据分类模型的构建方法,包括:获取第一训练数据集和第二训练数据集,所述第一训练数据集包括多条拉曼光谱训练数据,所述第二训练数据集包括多条质谱训练数据;将所述第一训练数据集中的拉曼光谱训练数据分别与所述第二训练数据集中的质谱训练数据进行融合处理,获取对应的多条融合训练数据,形成融合训练数据集;采用所述融合训练数据集中的融合训练数据进行训练,获取基于拉曼和质谱的数据分类模型。本发明实施例的技术方案有利于提高基于拉曼和质谱的数据分类模型的构建方法的性能,从而进一步提高样品分析的准确性。
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公开(公告)号:CN107164473B
公开(公告)日:2020-08-25
申请号:CN201710363814.5
申请日:2017-05-22
Applicant: 复旦大学附属华山医院 , 复旦大学 , 上海速创诊断产品有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种检测CALR基因1型突变的引物组合物,其包括含有SEQ ID NO:2‑SEQ ID NO:7所示序列的引物和SEQ ID NO:8所示序列的PNA探针;本发明还涉及一种含有上述引物组合物的试剂盒及其检测方法,以及上述引物组合物扩增的CALR基因1型突变的靶序列,该靶序列为SEQ ID NO:1所示序列。本发明所述的试剂盒及其检测方法具有良好的特异性和稳定性,梯度突变负荷浓度的样本用所建立的LAMP反应体系进行扩增,发现突变负荷检出敏感性可达到1%,与探针法实时PCR的效果相当,且其可对CALR基因1型突变进行可视化检测,与传统的检测方法相比,该方法对设备和环境要求低,检测速度更快,检测灵敏度更高。
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公开(公告)号:CN107338289A
公开(公告)日:2017-11-10
申请号:CN201710471433.9
申请日:2017-06-20
Applicant: 复旦大学附属华山医院 , 复旦大学 , 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 , 上海速创诊断产品有限公司
CPC classification number: C12Q1/6844 , C12Q2531/119 , C12Q2525/307 , C12Q2527/125 , C12Q2527/101 , C12Q2521/101
Abstract: 本发明公开了一种锁核酸修饰的LAMP引物组合物,在该LAMP引物组合物中,锁核酸的修饰位置为FIP引物和BIP引物3’端最外侧的3个碱基中的至少一个;本发明还涉及一种含有上述LAMP引物组合物的LAMP反应体系,该体系还包括甲酰胺和热启动酶;本发明还涉及一种采用上述LAMP引物组合物的扩增方法,其扩增温度为58℃-72℃。本发明针对LAMP的非特异性扩增问题,采用上述技术方案,在小幅提高扩增效率的同时,大幅降低非特异性扩增,显著提高了LAMP反应体系的稳定性和特异性,此对于LAMP技术的进一步完善和临床应用的推广具有重要意义。
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公开(公告)号:CN107164473A
公开(公告)日:2017-09-15
申请号:CN201710363814.5
申请日:2017-05-22
Applicant: 复旦大学附属华山医院 , 复旦大学 , 上海速创诊断产品有限公司
Abstract: 本发明涉及一种检测CALR基因1型突变的引物组合物,其包括含有SEQ ID NO:2‑SEQ ID NO:7所示序列的引物和SEQ ID NO:8所示序列的PNA探针;本发明还涉及一种含有上述引物组合物的试剂盒及其检测方法,以及上述引物组合物扩增的CALR基因1型突变的靶序列,该靶序列为SEQ ID NO:1所示序列。本发明所述的试剂盒及其检测方法具有良好的特异性和稳定性,梯度突变负荷浓度的样本用所建立的LAMP反应体系进行扩增,发现突变负荷检出敏感性可达到1%,与探针法实时PCR的效果相当,且其可对CALR基因1型突变进行可视化检测,与传统的检测方法相比,该方法对设备和环境要求低,检测速度更快,检测灵敏度更高。
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公开(公告)号:CN118861619A
公开(公告)日:2024-10-29
申请号:CN202410836217.X
申请日:2024-06-25
Applicant: 复旦大学附属华山医院 , 复旦大学
IPC: G06F18/213 , G06N3/08 , G06N3/088 , G06F18/2415 , G06F17/16 , G06N20/00
Abstract: 一种质谱数据的处理方法及其系统、设备以及存储介质,质谱数据的处理方法,包括:获取原始质谱数据,所述原始质谱数据包含随着质荷比变化的信号强度;获取所述信号强度的高斯分布;对所述信号强度的高斯分布进行数据抽样,并基于抽样结果实现对所述原始质谱数据的信号强度的分布进行不同程度的调整,得到所述原始质谱数据所对应的多个不同的新增质谱数据。由于信号强度的高斯分布能够表征信号强度的正常波动规律,因此基于信号强度的高斯分布来对信号强度进行抽样,使得新增质谱数据的可靠性更高,而且实现了对所述原始质谱数据的数据扩增,从而在增加数据的数量的同时,提升数据的多样性。
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公开(公告)号:CN107164474B
公开(公告)日:2020-09-04
申请号:CN201710364251.1
申请日:2017-05-22
Applicant: 复旦大学附属华山医院 , 复旦大学 , 上海速创诊断产品有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6844 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种用于检测CALR基因2型突变的引物组合物,其包括含有SEQ ID NO:2‑SEQ ID NO:7所示序列的引物;本发明还涉及一种含有上述引物组合物的试剂盒及其检测方法,以及上述引物组合物扩增的CALR基因2型突变的靶序列,该靶序列为SEQ ID NO:1所示序列。本发明所述的试剂盒及其检测方法具有良好的特异性和稳定性,梯度突变负荷浓度的样本用所建立的LAMP反应体系进行扩增,发现突变负荷检出敏感性可达到3%,几乎与探针法实时PCR的效果相当,且其可对CALR基因2型突变进行可视化检测,与传统的检测方法相比,该方法对设备和环境要求低,检测速度更快,检测灵敏度更高。
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公开(公告)号:CN118782154A
公开(公告)日:2024-10-15
申请号:CN202410836320.4
申请日:2024-06-25
Applicant: 复旦大学 , 复旦大学附属华山医院
IPC: G16B40/00 , G06F18/24 , G06F18/213 , G06F18/25 , G06N3/0464 , G06N3/084 , G01N21/65 , G01N27/62
Abstract: 一种基于拉曼和质谱的致病菌鉴定及模型生成方法、相关设备,所述基于拉曼和质谱的致病菌鉴定模型生成方法,包括:获取第一训练数据集和第二训练数据集,所述第一训练数据集包括多条拉曼光谱训练数据,所述第二训练数据集包括多条质谱训练数据;将所述第一训练数据集中的拉曼光谱训练数据分别与所述第二训练数据集中的质谱训练数据进行拼接处理,获取对应的多条拼接训练数据,形成拼接训练数据集;采用所述拼接训练数据集中的拼接训练数据进行训练,获取基于拉曼和质谱的致病菌鉴定模型。本发明实施例的技术方案有利于提高基于拉曼和质谱的致病菌鉴定模型的性能,从而进一步提高样品分析的准确性。
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公开(公告)号:CN107164474A
公开(公告)日:2017-09-15
申请号:CN201710364251.1
申请日:2017-05-22
Applicant: 复旦大学附属华山医院 , 复旦大学 , 上海速创诊断产品有限公司
Abstract: 本发明涉及一种用于检测CALR基因2型突变的引物组合物,其包括含有SEQ ID NO:2‑SEQ ID NO:7所示序列的引物;本发明还涉及一种含有上述引物组合物的试剂盒及其检测方法,以及上述引物组合物扩增的CALR基因2型突变的靶序列,该靶序列为SEQ ID NO:1所示序列。本发明所述的试剂盒及其检测方法具有良好的特异性和稳定性,梯度突变负荷浓度的样本用所建立的LAMP反应体系进行扩增,发现突变负荷检出敏感性可达到3%,几乎与探针法实时PCR的效果相当,且其可对CALR基因2型突变进行可视化检测,与传统的检测方法相比,该方法对设备和环境要求低,检测速度更快,检测灵敏度更高。
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公开(公告)号:CN118443838A
公开(公告)日:2024-08-06
申请号:CN202410565564.3
申请日:2024-05-09
Applicant: 复旦大学附属华山医院 , 上海润达榕嘉生物科技有限公司
Abstract: 本发明提供基于液相色谱质谱联用技术检测血清中M蛋白的方法,从血清样品提取得到蛋白质萃取物,对蛋白质萃取物检测,以此判断蛋白质萃取物是否满足预设杂质含量条件,并对不满足预设杂质含量条件的蛋白质萃取物进行二次萃取处理;还对满足预设杂质含量条件的蛋白质萃取物进行液相色谱分离处理,得到蛋白质萃取物在液相色谱分离处理过程中的物质分离状态信息,以此调整液相色谱分离处理的操作参数;再对分离样品进行质谱检测并调整质谱检测的操作参数,确保最终质谱曲线的可信度,以此得到血清样品中M蛋白含量信息,其并不需要耗费较多人力物力准备样品,还能有效降低对蛋白检测的干扰,确保M蛋白定量检测的准确性。
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公开(公告)号:CN113846184B
公开(公告)日:2024-06-04
申请号:CN202110770772.3
申请日:2021-07-07
Applicant: 复旦大学附属华山医院
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6858 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本发明提供了一种快速检测SARS‑CoV‑2Delta变异株变异的引物组合物和试剂盒。该引物组合物包括针对L452R的引物体系和针对T478K的引物体系;针对L452R的引物体系包括序列为SEQ ID NO.2~SEQ ID NO.6或序列为SEQID NO.8~SEQ ID NO.12的引物以及序列为SEQ ID NO.7的探针;针对T478K的引物体系包括序列为SEQ ID NO.14~SEQ ID NO.19或序列为SEQ ID NO.15、17、21‑23的引物或序列为SEQ ID NO.14‑17、23‑24的引物或序列为SEQ IDNO.15、17、23、25‑26的引物以及序列为SEQ ID NO.20的探针。本发明提供的引物组合物灵敏度高、特异性强,相应的试剂盒在使用过程中不受退火温度的限制,易于实现多靶标的同步检测,无需复杂、昂贵的辅助设备,在30‑60min内即可准确检测出Delta变异株,便于及时的掌握病毒的变异状况,具有良好的应用前景。
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