公开(公告)号：CN109688820A

公开(公告)日：2019-04-26

申请号：CN201780052145.8

申请日：2017-06-23

申请人： 科罗拉多州立大学董事会(法人团体) ,  因思科瑞普特公司

发明人： R·T·吉尔 ,  安德鲁·加斯特 ,  塔尼娅·伊丽莎白·瓦内克·利普斯科姆 ,  马塞洛·可利卡·巴萨洛 ,  拉姆齐·易卜拉欣·泽图恩

IPC分类号： A01N63/00 ,  C12N1/21 ,  C12N15/00

CPC分类号： C12N15/1065 ,  C12N15/102 ,  C12N15/1079 ,  C12N15/1082 ,  C12N15/11 ,  C12N2310/20 ,  C12Q2563/179

摘要： 本文提供了用于可追踪遗传变体文库的方法和组合物。本文进一步提供了用于递归工程化的方法和组合物。本文进一步提供了用于多路工程化的方法和组合物。本文进一步提供了使用核酸指导的核酸酶来富集编辑序列和可追踪工程化序列以及细胞的方法和组合物。

公开(公告)号：CN108699505A

公开(公告)日：2018-10-23

申请号：CN201680081032.6

申请日：2016-12-02

申请人： 安可济控股有限公司

发明人： 翁莉 ,  林盛榕 ,  马利克·法哈姆

IPC分类号： C12M1/34 ,  C12N15/10 ,  C40B30/04

CPC分类号： C12Q1/6839 ,  C12M1/34 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6855 ,  C12Q2521/531 ,  C12Q2525/179 ,  C12Q2525/191 ,  C12Q2525/307 ,  C12Q2531/125 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q2563/179 ,  C12Q2521/301

摘要： 在一些方面，本公开内容提供了用于形成包含单链多核苷酸的连接产物的方法。由本公开内容的各个方面形成的连接产物可用于各种应用，包括但不限于序列分析。在一些实施方案中，所述连接产物包含无细胞多核苷酸。在一些方面，本公开内容提供了与本文方法一致的反应混合物、试剂盒和复合体。

公开(公告)号：CN108474026A

公开(公告)日：2018-08-31

申请号：CN201780008365.0

申请日：2017-01-26

申请人： 豪夫迈·罗氏有限公司

发明人： D.克拉斯

IPC分类号： C12Q1/6806 ,  C12Q1/6855 ,  C12Q1/6869

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  C12N15/1065 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6855 ,  C12Q2525/155 ,  C12Q2525/191 ,  C12Q2535/119 ,  C12Q2563/179 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q2565/514

摘要： 本发明是用于以减少的误差率对核酸进行测序的新的Y形（叉状）衔接子，其包含引物结合位点和每个单链部分中的条形码。

公开(公告)号：CN108368546A

公开(公告)日：2018-08-03

申请号：CN201680071449.4

申请日：2016-10-10

申请人： 夸登特健康公司

发明人： 雷扎·莫克塔里 ,  巴赫拉姆·加法尔扎德·克曼尼

IPC分类号： C12Q1/686 ,  C12N15/11 ,  G06F19/22

CPC分类号： G16B30/00 ,  C12Q1/686 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/6874 ,  C12Q1/6886 ,  G16B40/00 ,  C12Q2537/157 ,  C12Q2563/179

摘要： 公开了用于通过以下来确定基因融合的系统和方法：确定含有融合的染色体DNA分子的一部分的测序数据的融合读段；确定基因组上的预定点，其中融合读段的至少一个映射部分在所述预定点(断点)处剪切；将来自两个断点(断点对)的两个映射读段部分识别为潜在的融合候选；基于断点对创建一个或更多个融合集并将融合集聚类到一个或更多个融合簇中；和将符合预定标准的每个融合簇识别为基因融合。

公开(公告)号：CN107250445A

公开(公告)日：2017-10-13

申请号：CN201680012542.8

申请日：2016-02-26

申请人： 富鲁达公司

发明人： 卡罗林·G·科南特 ,  曾子豪 ,  詹森·A·A·韦斯特 ,  晓辉·王

IPC分类号： C40B20/00 ,  C40B30/04 ,  C40B40/06 ,  C40B50/06 ,  C12Q1/68 ,  C12P19/34

CPC分类号： C12Q1/6874 ,  B01L3/5027 ,  C12Q1/6844 ,  C12Q2525/179 ,  C12Q2563/179 ,  C12Q2565/629

摘要： 本文描述了基于细胞的分析方法，所述方法包括将核酸序列掺入到来自细胞群体的反应产物中的方法，其中将核酸序列掺入到单独地每一个细胞或单独地小的细胞组的反应产物中。本文还描述了一种矩阵型微流体装置，所述矩阵型微流体装置允许至少两种试剂分开地递送至每一个细胞或细胞的组，以及可用于该方法和装置的引物组合。

公开(公告)号：CN107002290A

公开(公告)日：2017-08-01

申请号：CN201580063859.X

申请日：2015-09-24

申请人： 赛科恩斯生物科学公司 ,  南加利福尼亚大学

发明人： 约瑟夫·邓纳姆

IPC分类号： C40B40/06 ,  C40B50/06 ,  C12P19/34

CPC分类号： C12N15/1093 ,  C12Q2521/327 ,  C12Q2521/531 ,  C12Q2525/121 ,  C12Q2525/191 ,  C12Q2563/179

摘要： 本公开内容提供了制备用于测序的核酸样品的单扩增法和双扩增法。

公开(公告)号：CN107002076A

公开(公告)日：2017-08-01

申请号：CN201580062006.4

申请日：2015-09-15

申请人： 阿布维特罗有限责任公司

发明人： 弗朗索瓦·维格纳尔特 ,  阿德里安·阮格汉姆布里格斯 ,  克里斯多佛·赖安·克劳泽 ,  斯蒂芬·雅各布·戈德弗莱斯 ,  索尼亚·汀布莱克

IPC分类号： C12N15/10 ,  C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6874 ,  C12N15/1093 ,  C12Q2525/179 ,  C12Q2563/179 ,  C12Q2565/514 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q2563/185

摘要： 本文提供了用于免疫组库测序和单细胞条码化的方法和组合物。该方法和组合物可用于匹配来源于单细胞任何两个序列，诸如重链和轻链抗体序列，α和β链T细胞受体序列，或γ和δ链T细胞受体序列，以供抗体和T细胞受体发现、疾病和免疫诊断以及低错误测序。

公开(公告)号：CN106834105A

公开(公告)日：2017-06-13

申请号：CN201710092823.5

申请日：2017-02-21

申请人： 齐齐哈尔医学院

发明人： 刘立琨 ,  岳丽玲 ,  刘溪 ,  朱文斌

IPC分类号： C12M1/34 ,  C12Q1/68 ,  G01N33/68

CPC分类号： C12Q1/68 ,  G01N33/6875 ,  C12Q2563/179 ,  C12Q2565/629 ,  C12Q2563/107 ,  C12Q2563/119

摘要： 本发明公开了表观遗传学技术领域的一种用于表观遗传分析的设备，包括箱体，所述箱体的内腔设置有通道，所述通道的内腔顶部设置有光源装置，所述通道的内腔底部设置有接触装置，所述箱体的顶部左右两侧分别设置有控制器和显示屏，所述箱体的左侧设置有激光器，所述控制器分别与光源装置、接触装置、显示屏和激光器电性连接，该种用于表观遗传分析的设备和方法，结构简单，增设了全基因组分析或调查多于两种表观遗传标记的研究，提供了更可靠的全基因组表观遗传分析可选择的方法，满足了组合物的需求，大大减少了成本，使得人们在表观遗传学上更好的进行进一步的研究。

公开(公告)号：CN106661631A

公开(公告)日：2017-05-10

申请号：CN201580042765.4

申请日：2015-06-08

申请人： 康奈尔大学

发明人： F·巴拉尼 ,  J·W·爱夫卡维茨

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6874 ,  C12N15/1068 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6809 ,  C12Q1/6816 ,  C12Q1/6844 ,  C12Q1/6848 ,  C12Q1/6855 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2531/125 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q2537/143 ,  C12Q2565/501 ,  C12Q2521/319 ,  C12Q2521/325 ,  C12Q2521/331 ,  C12Q2521/501 ,  C12Q2525/155 ,  C12Q2525/161 ,  C12Q2525/179 ,  C12Q2525/191 ,  C12Q2525/307 ,  C12Q2563/179

摘要： 本发明涉及一种用于从血液(即，从无细胞循环DNA、外来体、微RNA、循环肿瘤细胞或总血细胞)高度特异性地靶向捕获人类基因组和转录组的区域的方法，以允许使用组合的核酸酶、连接、聚合酶和大规模并行测序反应的高度灵敏地检测突变、表达、拷贝数、易位、可变剪接和甲基化变化。所述方法产生适于在多个平台上测序的不同环状嵌合单链核酸构建体的集合。在一些实施方案中，所述集合的每个构建体包含来自宿主生物体的原始基因组DNA的第一单链区段和连接至所述第一单链区段且包含对所述宿主生物体而言为外源性的核苷酸序列的第二单链合成核酸区段。这些嵌合构建体适用于识别和枚举突变、拷贝变化、易位和甲基化变化。在其它实施方案中，输入mRNA、IncRNA或miRNA用来生成反映特异性mRNA、IncRNA的拼接位点变体、易位和miRNA的存在和拷贝数的环状DNA产物。

公开(公告)号：CN106574298A

公开(公告)日：2017-04-19

申请号：CN201580034146.0

申请日：2015-06-26

申请人： 10X基因组学有限公司

发明人： 米尔娜·雅罗什 ,  克里斯多佛·辛德森 ,  迈克尔·史诺-莱文 ,  凯文·迪安·奈斯 ,  瑟奇·萨克森诺夫 ,  本杰明·J·辛德森 ,  约翰·史图尔普纳格

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12N15/1058 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/686 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q2563/159 ,  C12Q2563/179

摘要： 本公开涉及当输入样品的总量低时或当所关注的靶标在全部样品内以相对较小或罕见的群体存在时进行样品处理和分析的方法和系统。本公开尤其涉及分析核酸样品，包括其中所关注的靶核酸在全部核酸中以相对低比例存在的样品。