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公开(公告)号:CN109266728A
公开(公告)日:2019-01-25
申请号:CN201811145591.6
申请日:2018-09-29
申请人: 曲阜师范大学
发明人: 曹博
IPC分类号: C12Q1/6869
CPC分类号: C12Q1/6869 , C12Q2521/327 , C12Q2521/319 , C12Q2535/122 , C12Q2525/117
摘要: 本发明提供了一种定位基因组DNA上损伤和修饰位点的方法,首先将DNA样品的损伤或修饰位点转化为断裂位点;然后加入硫代核苷酸和DNA聚合酶I进行切口平移;终止反应后获得的样品中加入对磷硫酰化修饰DNA敏感核酸酶消化模板;最后将获得的磷硫酰化修饰DNA测序,所得序列的5'端即为原损伤或者修饰位点。本发明提供的方法,填补了国内外现有技术无法精确定位基因组DNA上损伤位点的空白,能够实现对不同长度和不同来源的DNA样品进行损伤和修饰位点定量和定位分析,使用简便,易于操作,而且对样品无特殊要求,准确率高、检测背景影响低、分辨率高。
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公开(公告)号:CN109022542A
公开(公告)日:2018-12-18
申请号:CN201810829360.0
申请日:2018-07-25
申请人: 山西农业大学
IPC分类号: C12Q1/6816 , C12N15/11
CPC分类号: C12Q1/6816 , C12Q2521/319 , C12Q2531/113
摘要: 本发明涉及植物遗传育种技术领域,具体涉及一种可视化鉴定大豆A类皂苷类型的方法;通过设计加入DNAzyme标记的检测大豆皂苷合成酶基因的特异性探针,用正反引物对大豆皂苷合成酶基因进行扩增,利用核酸外切酶特异性地识别并酶切大豆皂苷合成酶基因,形成单链目标片段,再与探针发生杂交链式反应,将探针中的DNAzyme标记释放,最后通过显色反应判断样品中的皂苷类型;本发明方法快速、准确、高效且廉价,可应用于各种代谢产物类型的基因检测体系,特别是对作物品质育种和特异性材料的筛选均有很高的实用价值。
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公开(公告)号:CN104903463B
公开(公告)日:2018-02-06
申请号:CN201380062971.2
申请日:2013-10-04
申请人: 贝斯4创新公司
发明人: 卡梅伦·亚历山大·弗雷林 , 巴纳比·巴姆福思 , 布鲁诺·弗拉维奥·诺盖拉·德·索萨·苏亚 , 雷斯 , 托马斯·亨利·艾萨克 , 鲍里斯·布赖纳 , 亚历山德拉·纳塔莱 , 米歇尔·阿马西奥
IPC分类号: C12Q1/68
CPC分类号: C12Q1/6874 , C12Q1/6869 , C12Q2521/101 , C12Q2521/301 , C12Q2521/319 , C12Q2521/501 , C12Q2525/301 , C12Q2563/159 , C12Q2565/1015 , C12Q2565/629
摘要: 本发明公开了用于测序多核苷酸分析物的方法,所述方法包括:·a.产生含有单核苷酸的小滴流,其中在所述小滴流中的单核苷酸的顺序与所述分析物中核苷酸的序列对应;·b.向每个小滴中引入多个生物探针类型,每个类型包含处于不可检测状态的不同的标记且适于捕获不同的单核苷酸;·c.使包含在所述小滴中的单核苷酸与其互补探针结合;·d.使所述标记以可检测状态从已经结合单核苷酸的探针释放。所述探针是哑铃形状的探针,其包含荧光供体和猝灭剂标记和单核苷酸缺口。在通过聚合酶和连接酶修复缺口后,通过限制酶切割限制酶识别位点,然后进行外切核酸酶消化,以释放所述标记。
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公开(公告)号:CN107447002A
公开(公告)日:2017-12-08
申请号:CN201710642049.0
申请日:2017-07-31
申请人: 重庆微奥云生物技术有限公司
IPC分类号: C12Q1/68
CPC分类号: C12Q1/6825 , C12Q2565/607 , C12Q2522/101 , C12Q2521/319
摘要: 本发明提出了一种检测DNA的方法,将目标检验物置于所述包被有DNA探针的反应单元,通过测量单元对所述反应单元中的目标检验物中的DNA进行检测,并将检测信息进行存储及分析,获取DNA的检测结果,检测结果便于存档,且便于本领域技术人员对存储的检测结果进行分析,减小了检测成本;进一步,将DNA探针预先包被在反应单元上,一方面减少了检测时间,一方面筛选包被后的反应单元进行DNA检测,提高了检测精度及检测准确性。
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公开(公告)号:CN106661631A
公开(公告)日:2017-05-10
申请号:CN201580042765.4
申请日:2015-06-08
申请人: 康奈尔大学
IPC分类号: C12Q1/68
CPC分类号: C12Q1/6874 , C12N15/1068 , C12Q1/6806 , C12Q1/6809 , C12Q1/6816 , C12Q1/6844 , C12Q1/6848 , C12Q1/6855 , C12Q1/6869 , C12Q2531/125 , C12Q2535/122 , C12Q2537/143 , C12Q2565/501 , C12Q2521/319 , C12Q2521/325 , C12Q2521/331 , C12Q2521/501 , C12Q2525/155 , C12Q2525/161 , C12Q2525/179 , C12Q2525/191 , C12Q2525/307 , C12Q2563/179
摘要: 本发明涉及一种用于从血液(即,从无细胞循环DNA、外来体、微RNA、循环肿瘤细胞或总血细胞)高度特异性地靶向捕获人类基因组和转录组的区域的方法,以允许使用组合的核酸酶、连接、聚合酶和大规模并行测序反应的高度灵敏地检测突变、表达、拷贝数、易位、可变剪接和甲基化变化。所述方法产生适于在多个平台上测序的不同环状嵌合单链核酸构建体的集合。在一些实施方案中,所述集合的每个构建体包含来自宿主生物体的原始基因组DNA的第一单链区段和连接至所述第一单链区段且包含对所述宿主生物体而言为外源性的核苷酸序列的第二单链合成核酸区段。这些嵌合构建体适用于识别和枚举突变、拷贝变化、易位和甲基化变化。在其它实施方案中,输入mRNA、IncRNA或miRNA用来生成反映特异性mRNA、IncRNA的拼接位点变体、易位和miRNA的存在和拷贝数的环状DNA产物。
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公开(公告)号:CN105567871A
公开(公告)日:2016-05-11
申请号:CN201610029446.6
申请日:2016-01-15
申请人: 中国农业科学院兰州兽医研究所
CPC分类号: C12Q1/70 , C12Q1/686 , C12Q2561/113 , C12Q2563/107 , C12Q2545/114 , C12Q2521/507 , C12Q2521/107 , C12Q2521/319
摘要: 本发明公开了一种快速检测高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒的RT-RPA检测试剂盒及其用途。所述试剂盒包括有一对引物和一条探针,所述引物的序列如SEQ ID NO.1以及SEQ ID NO.2所示,所述探针的序列如SEQ ID NO.3所示。实验证明本发明的试剂盒能够特异性的检测高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(HP-PRRSV),与猪瘟病毒、C型-猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪2型圆环病毒、猪伪狂犬病毒以及口蹄疫病毒等不反应。实验证明,本发明的试剂盒能够在40℃,扩增20min的条件下检出最少70个拷贝的模板,且与RT-qPCR具有很高的符合度。由此说明,本发明的试剂盒能够快捷、高效、灵敏的检测HP-PRRSV,本发明的提出为HP-PRRSV的鉴别诊断提供了有效技术手段。
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公开(公告)号:CN105349627A
公开(公告)日:2016-02-24
申请号:CN201510673915.3
申请日:2015-10-16
申请人: 柳州市妇幼保健院
IPC分类号: C12Q1/68
CPC分类号: C12Q1/6858 , C12Q2531/113 , C12Q2535/125 , C12Q2537/143 , C12Q2521/319 , C12Q2521/525
摘要: 本发明涉及一种中国儿童矮小症易感基因SNP分型用试剂盒及其使用方法,具体公开了一种针对中国儿童8个矮小症易感基因12个SNP位点的同时定性分型试剂盒及其使用方法,以SPAG17基因rs17038182位点、KBTBD基因rs1378850位点、HHIP基因rs1812175位点、HIST1H1D基因rs10946808位点、ACAN基因rs8041863位点、GHR基因rs6182位点、GHR基因rs6184位点、GHR基因rs4410646位点、GHR基因rs12515480位点、GHR基因rs2940913位点、IGF-1R基因rs1976667位点和IHH基因rs3099位点为检测对象,针对每个SNP位点的突变分别设计出扩增引物和延伸引物,针对12个SNP位点进行多重PCR扩增和标记延伸,通过毛细管电泳分析,同时获得12个SNP位点的基因型。本发明的SNP分型试剂盒使用方便,操作简单,成本低,通量高,检测结果直接可靠,适用于中国儿童矮小症易感基因SNP分型的大规模筛查。
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公开(公告)号:CN105256018A
公开(公告)日:2016-01-20
申请号:CN201510652725.3
申请日:2015-10-11
申请人: 苏州承美生物科技有限公司
发明人: 孙喜元
IPC分类号: C12Q1/68
CPC分类号: C12Q1/686 , C12Q2525/117 , C12Q2565/125 , C12Q2521/319
摘要: 本发明经优化PCR引物的设计,使每个PCR扩增区域至少包含10个C盘G位点,所累积的变性温度差异将超过5度。温度通过加热,使PCR产物部分解链变性,即加热到一个特定温度,只使非甲基化DNA的PCR产物发生变性。用对单链DNA特异的核酸外切酶消化这样处理的PCR产物,非甲基化DNA的PCR产物将被消化,而甲基化DNA的PCR产物维持不变,从而可以提高甲基化DNA的检测灵敏度。本发明的有益效果是:本发明在甲基化DNA特异性多重PCR扩增技术的基础上,通过对引物序列的选择,使甲基化DNA的检测灵敏度得到提高,通过使用毛细管电泳检测PCR产物,有效提高甲基化DNA检测的稳定性和重复性,多重PCR一次性检测多个甲基化基因,提高检测效率,提高检测的灵敏度和检测的稳定性。
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公开(公告)号:CN103534358B
公开(公告)日:2015-03-25
申请号:CN201280022152.0
申请日:2012-03-29
申请人: SEEGENE株式会社
CPC分类号: C12Q1/6823 , C12Q1/6834 , C12Q1/6853 , C12Q2521/319 , C12Q2521/327 , C12Q2525/121 , C12Q2525/155 , C12Q2525/161 , C12Q2525/186 , C12Q2537/149 , C12Q2561/101 , C12Q2565/1015 , C12Q2527/107 , C12Q2561/109
摘要: 本发明涉及基于PTO切割以及延伸-依赖性切割(PTO Cleavage and Extension-Dependent Cleavage:PCEC)试验的靶核酸序列的检测。本发明的特征在于,在随着靶核酸序列的存在与否而形成的延伸二聚物上,生成被核酸切割酶切割的切割位点。本发明检测延伸二聚物是否发生切割,由此决定靶核酸序列存在与否。
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公开(公告)号:CN104145029A
公开(公告)日:2014-11-12
申请号:CN201280071069.2
申请日:2012-07-03
申请人: SEEGENE株式会社
CPC分类号: C12Q1/6823 , C12Q1/6818 , C12Q2521/319 , C12Q2525/131 , C12Q2525/161 , C12Q2525/186 , C12Q2533/101 , C12Q2563/173 , C12Q2565/1015 , C12Q2565/514
摘要: 本发明涉及利用探测和标记寡核苷酸切割及延伸-依赖性信号传导寡核苷酸杂交(PCE-SH,PTO Cleavage and Extension-Dependent Signaling Oligonucleotide Hybridization)的靶核酸序列的检测。本发明不使用与靶核酸序列杂交来提供靶信号的探针。本发明利用与以靶-依赖性的方式形成的延伸链杂交的探针(信号传导寡核苷酸),将具有人为选择的序列的捕捉和模板化寡核苷酸作为模板合成上述延伸链。
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