公开(公告)号：US20050037387A1

公开(公告)日：2005-02-17

申请号：US10852630

申请日：2004-05-24

申请人： Donna Ward ,  Andrew Watt ,  Brenda Baker ,  Timothy Vickers ,  Kenneth Dobie ,  Bryan Kraynack

发明人： Donna Ward ,  Andrew Watt ,  Brenda Baker ,  Timothy Vickers ,  Kenneth Dobie ,  Bryan Kraynack

IPC分类号： C07H21/02 ,  C12N20060101 ,  C12N15/11 ,  C12N15/113 ,  C12Q1/68

CPC分类号： C12N15/111 ,  C12N15/113 ,  C12N2310/11 ,  C12N2310/14 ,  C12N2310/315 ,  C12N2310/321 ,  C12N2310/3341 ,  C12N2310/341 ,  C12N2310/346 ,  C12N2320/10 ,  C12N2320/50 ,  C12N2310/3525

摘要： Compounds, compositions and methods are provided for modulating the RNAi pathway. The compositions comprise oligonucleotides, targeted to nucleic acid molecules encoding EIF2C2. Methods of using these compounds for modulation of RNA interference as well as EIF2C2 expression and for diagnosis and treatment of disease associated with expression of EIF2C2 are provided. Also provided are compounds, compositions and methods for modulating the expression of DDX36. The compositions comprise oligonucleotides, targeted to nucleic acid encoding DDX36. Methods of using these compounds for modulation of DDX36 expression and for diagnosis and treatment of diseases and conditions associated with expression of DDX36 are provided.

摘要翻译： 提供化合物，组合物和方法用于调节RNAi途径。 组合物包含靶向编码EIF2C2的核酸分子的寡核苷酸。 提供了使用这些化合物调节RNA干扰以及EIF2C2表达以及用于诊断和治疗与EIF2C2表达相关的疾病的方法。 还提供了用于调节DDX36表达的化合物，组合物和方法。 组合物包含针对编码DDX36的核酸的寡核苷酸。 提供了使用这些化合物调制DDX36表达和用于诊断和治疗与DDX36表达相关的疾病和病症的方法。

公开(公告)号：US6096722A

公开(公告)日：2000-08-01

申请号：US85759

申请日：1998-05-27

申请人： C. Frank Bennett ,  Christopher K. Mirabelli ,  Brenda Baker

发明人： C. Frank Bennett ,  Christopher K. Mirabelli ,  Brenda Baker

IPC分类号： A01N43/04 ,  A61K31/70 ,  A61K38/00 ,  A61K48/00 ,  C07H21/00 ,  C07H21/02 ,  C07H21/04 ,  C12N15/113 ,  C12P19/34 ,  C12Q1/68

CPC分类号： C12N15/1138 ,  A61K38/00 ,  C12N2310/315 ,  C12N2310/321 ,  C12N2310/3341 ,  C12N2310/341 ,  C12N2310/346

摘要： Compositions and methods are provided for the modulation of expression of cellular adhesion molecules. In accordance with preferred embodiments, oligonucleotides are provided which are specifically hybridizable with nucleic acids encoding intercellular adhesion molecule-1, vascular cell adhesion molecule-1, and endothelial leukocyte adhesion molecule-1. Methods of modulating expression of cellular adhesion molecules are provided, as are methods of treating conditions associated with cellular adhesion molecules. In a preferred embodiment, the cellular adhesion molecule is ICAM-1, and a preferred antisense sequence targeted to human ICAM-1 is demonstrated to have clinical utility in several disease indications.

摘要翻译： 提供组合物和方法用于调节细胞粘附分子的表达。 根据优选实施方案，提供了与编码细胞间粘附分子-1，血管细胞粘附分子-1和内皮细胞粘附分子-1的核酸特异性杂交的寡核苷酸。 提供调节细胞粘附分子表达的方法，以及治疗与细胞粘附分子相关的病症的方法。 在优选的实施方案中，细胞粘附分子是ICAM-1，并且针对人ICAM-1的优选反义序列证明在几种疾病适应症中具有临床效用。

公开(公告)号：US20060154885A1

公开(公告)日：2006-07-13

申请号：US11072846

申请日：2005-03-04

申请人： C. Bennett ,  Brett Monia ,  Nicholas Dean ,  Xiaoxing Xu ,  Sanjay Bhanot ,  Brenda Baker ,  Susan Freier ,  Lex Cowsert ,  Robert McKay ,  Muthiah Manoharan ,  F. Dorr ,  Jon Holmlund ,  Alexander Borchers ,  Vickie Brown-Driver ,  Jacqueline Wyatt ,  Shin Flournoy ,  Elizabeth Ackermann ,  Hong Zhang ,  Andrew Watt ,  Eric Maracusson ,  Scott Cooper ,  Erich Koller ,  Loren Miraglia ,  William Ricketts ,  Kenneth Dobie ,  Tamara Sipes

发明人： C. Bennett ,  Brett Monia ,  Nicholas Dean ,  Xiaoxing Xu ,  Sanjay Bhanot ,  Brenda Baker ,  Susan Freier ,  Lex Cowsert ,  Robert McKay ,  Muthiah Manoharan ,  F. Dorr ,  Jon Holmlund ,  Alexander Borchers ,  Vickie Brown-Driver ,  Jacqueline Wyatt ,  Shin Flournoy ,  Elizabeth Ackermann ,  Hong Zhang ,  Andrew Watt ,  Eric Maracusson ,  Scott Cooper ,  Erich Koller ,  Loren Miraglia ,  William Ricketts ,  Kenneth Dobie ,  Tamara Sipes

IPC分类号： A61K48/00 ,  C07H21/02

CPC分类号： C12N15/1138 ,  A61K48/00 ,  C12N2310/11 ,  C12N2310/315 ,  C12N2310/321 ,  C12N2310/3341 ,  C12N2310/341 ,  C12N2310/346 ,  C12N2310/3525

摘要： Compounds, compositions and methods are provided for modulating the expression of SLC26A2. The compositions comprise oligonucleotides, targeted to nucleic acid encoding SLC26A2. Methods of using these compounds for modulation of SLC26A2 expression and for diagnosis and treatment of disease associated with expression of SLC26A2 are provided.

摘要翻译： 提供化合物，组合物和方法用于调节SLC26A2的表达。 组合物包含针对编码SLC26A2的核酸的寡核苷酸。 提供了使用这些化合物调节SLC26A2表达和用于诊断和治疗与SLC26A2表达相关的疾病的方法。

公开(公告)号：US20050260755A1

公开(公告)日：2005-11-24

申请号：US11101017

申请日：2005-04-06

申请人： Brenda Baker ,  Bryan Kraynack ,  Namir Sioufi

发明人： Brenda Baker ,  Bryan Kraynack ,  Namir Sioufi

IPC分类号： A61K48/00 ,  C12N15/11 ,  C12N15/85

CPC分类号： C12Y301/03048 ,  C12N15/111 ,  C12N2310/14 ,  C12N2310/315 ,  C12N2310/321 ,  C12N2310/346 ,  C12N2310/351 ,  C12N2320/30 ,  C12N2330/30 ,  C12N2310/3521

摘要： The present invention provides double stranded compositions that have a region that is complementary to a target nucleic acid. The targeting strand comprises linked ribofuranosyl nucleosides and the second strand comprises linked modified nucleosides that have 3′-endo conformational geometry. The strands can be linked together or separate and may contain additional groups. The present invention also provides methods of using the compositions for modulating gene expression.

摘要翻译： 本发明提供具有与靶核酸互补的区域的双链组合物。 靶向链包含连接的呋喃核糖核苷，第二链包含具有3'端构象几何形状的连接的修饰核苷。 链可以连接在一起或分离，并且可以含有另外的基团。 本发明还提供使用该组合物调节基因表达的方法。

公开(公告)号：US20050227938A1

公开(公告)日：2005-10-13

申请号：US11015193

申请日：2004-12-17

申请人： C. Bennett ,  Brenda Baker ,  Nicholas Dean ,  Brett Monia ,  Susan Freier ,  James Karras ,  Hong Zhang ,  Susan Murray ,  Madeline Butler ,  Erich Koller ,  Thomas Condon ,  William Gaarde ,  Andrew Watt ,  Mark Graham ,  Jacqueline Wyatt ,  Lex Cowsert ,  Kenneth Dobie ,  Mark Roach

发明人： C. Bennett ,  Brenda Baker ,  Nicholas Dean ,  Brett Monia ,  Susan Freier ,  James Karras ,  Hong Zhang ,  Susan Murray ,  Madeline Butler ,  Erich Koller ,  Thomas Condon ,  William Gaarde ,  Andrew Watt ,  Mark Graham ,  Jacqueline Wyatt ,  Lex Cowsert ,  Kenneth Dobie ,  Mark Roach

IPC分类号： A61K38/00 ,  A61K48/00 ,  C07H21/02 ,  C12N15/113

CPC分类号： C12N15/1138 ,  A61K38/00 ,  C12N2310/315 ,  C12N2310/321 ,  C12N2310/322 ,  C12N2310/335 ,  C12N2310/341 ,  C12N2310/346 ,  Y02P20/582 ,  C12N2310/3521 ,  C12N2310/3525

摘要： Antisense compounds, compositions and methods are provided for modulating the expression of TFAP2C. The compositions comprise antisense compounds, particularly antisense oligonucleotides, targeted to nucleic acids encoding TFAP2C. Methods of using these compounds for modulation of TFAP2C expression and for treatment of diseases associated with expression of TFAP2C are provided.

摘要翻译： 提供反义化合物，组合物和方法用于调节TFAP2C的表达。 组合物包含靶向编码TFAP2C的核酸的反义化合物，特别是反义寡核苷酸。 提供了使用这些化合物调节TFAP2C表达和治疗与TFAP2C表达相关的疾病的方法。

公开(公告)号：US20050164209A1

公开(公告)日：2005-07-28

申请号：US10763367

申请日：2004-01-23

申请人： C. Bennett ,  Robert McKay ,  Brett Monia ,  Brenda Baker

发明人： C. Bennett ,  Robert McKay ,  Brett Monia ,  Brenda Baker

IPC分类号： C12N15/11 ,  C12N15/113 ,  C12P19/34 ,  C12Q1/00 ,  C12Q1/68 ,  C12N5/08

CPC分类号： C12N15/113 ,  C12N15/111 ,  C12N15/1137 ,  C12N2310/11 ,  C12N2310/14 ,  C12N2310/315 ,  C12N2310/321 ,  C12N2310/322 ,  C12N2310/341 ,  C12N2310/346 ,  C12N2320/11 ,  C12Y301/03048 ,  C12N2310/3525 ,  C12N2310/3521

摘要： The present invention provides methods of identifying an oligomeric compound having bioactivity in vivo, methods of identifying a small interfering RNA having bioactivity in vivo, and kits.

摘要翻译： 本发明提供鉴定体内具有生物活性的寡聚化合物的方法，鉴定体内具有生物活性的小干扰RNA的方法和试剂盒。

公开(公告)号：US20050053965A1

公开(公告)日：2005-03-10

申请号：US10770970

申请日：2004-02-02

申请人： Brenda Baker ,  C. Bennett

发明人： Brenda Baker ,  C. Bennett

IPC分类号： A61K48/00 ,  C07H21/02 ,  C12Q1/68

CPC分类号： C07H21/02 ,  C12N15/1136 ,  C12N2310/11 ,  C12N2310/315 ,  C12N2310/3341 ,  C12N2310/341 ,  C12N2310/321 ,  C12N2310/3525

摘要： Compositions and methods are provided for inhibiting the expression of human tumor necrosis factor-α (TNF-α). Antisense oligonucleotides targeted to nucleic acids encoding TNF-α are preferred. Methods of using these oligonucleotides for inhibition of TNF-α expression and for treatment of diseases, particularly inflammatory and autoimmune diseases, associated with overexpression of TNF-α are provided.

摘要翻译： 提供了抑制人肿瘤坏死因子-α（TNF-α）表达的组合物和方法。 靶向编码TNF-α的核酸的反义寡核苷酸是优选的。 提供了使用这些寡核苷酸抑制TNF-α表达和治疗与TNF-α过度表达相关的疾病，特别是炎性和自身免疫性疾病的方法。

公开(公告)号：US20050048495A1

公开(公告)日：2005-03-03

申请号：US10651772

申请日：2003-08-29

申请人： Brenda Baker ,  Timothy Vickers

发明人： Brenda Baker ,  Timothy Vickers

IPC分类号： C07H21/04 ,  C12Q1/68 ,  A61K48/00

CPC分类号： C07H21/04

摘要： Compounds, compositions and methods are provided for modulating the expression of splice variants or products. The compositions comprise oligonucleotides, targeted to nucleic acid encoding splice variants or products. Methods of using these compounds for modulation of expression of splice variants or products and for diagnosis and treatment of disease associated with expression of splice variants or products are provided.

摘要翻译： 提供化合物，组合物和方法用于调节剪接变体或产物的表达。 组合物包含针对核酸编码剪接变体或产物的寡核苷酸。 提供了使用这些化合物调节剪接变体或产物的表达以及用于诊断和治疗与剪接变体或产物的表达相关的疾病的方法。

公开(公告)号：US20050033524A1

公开(公告)日：2005-02-10

申请号：US10649467

申请日：2003-08-27

申请人： Lex Cowsert ,  Brenda Baker ,  John McNeil ,  Susan Freier ,  Henri Sasmor ,  Douglas Brooks ,  Cara Ohashi ,  Jacqueline Wyatt ,  Alexander Borchers ,  Timothy Vickers

发明人： Lex Cowsert ,  Brenda Baker ,  John McNeil ,  Susan Freier ,  Henri Sasmor ,  Douglas Brooks ,  Cara Ohashi ,  Jacqueline Wyatt ,  Alexander Borchers ,  Timothy Vickers

IPC分类号： C12N15/09 ,  C07B61/00 ,  C12N15/10 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/6811 ,  C40B30/02 ,  C40B40/02 ,  C40B50/02 ,  C40B50/06 ,  G06F17/30 ,  G06F17/50 ,  G06F19/18 ,  G06F19/22 ,  G06F19/00 ,  G01N33/48 ,  G01N33/50 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12Q1/6811 ,  B01J2219/007 ,  C12N15/1048 ,  G16B20/00 ,  G16B30/00 ,  G16B35/00 ,  G16C20/60

摘要： Interative, preferably computer based iterative processes for generating synthetic compounds with desired physical, chemical and/or bioactive properties, i.e., active compounds, are provided. During iterations of the processes, a target nucleic acid sequence is provided or selected, and a library of candidate nucleobase sequences is generated in silico according to defined criteria. A “virtual” oligonucleotide chemistry is chosen and a library of virtual oligonucleotide compounds having the selected nucleobase sequences is generated. These virtual compounds are reviewed and compounds predicted to have particular properties are selected. The selected compounds are robotically synthesized and are preferably robotically assayed for a desired physical, chemical or biological activity. Active compounds are thus generated and, at the same time, preferred sequences and regions of the target nucleic acid that are amenable to oligonucleotide or sequence-based modulation are identified.

摘要翻译： 提供了用于产生具有期望的物理，化学和/或生物活性的合成化合物（即活性化合物）的相互优选的基于计算机的迭代方法。 在该过程的迭代过程中，提供或选择靶核酸序列，并且根据确定的标准以计算机生成候选核碱基序列的文库。 选择“虚拟”寡核苷酸化学，并产生具有选定的核碱基序列的虚拟寡核苷酸化合物文库。 审查这些虚拟化合物，并选择预测具有特定性质的化合物。 所选择的化合物是机械合成的，并且优选机械地测定所需的物理，化学或生物活性。 因此产生活性化合物，并且同时确定适用于寡核苷酸或基于序列的调节的靶核酸的优选序列和区域。

公开(公告)号：US5789573A

公开(公告)日：1998-08-04

申请号：US653653

申请日：1996-05-24

申请人： Brenda Baker ,  C. Frank Bennett ,  Kevin P. Anderson

发明人： Brenda Baker ,  C. Frank Bennett ,  Kevin P. Anderson

IPC分类号： C12N15/09 ,  A61K31/00 ,  A61K31/70 ,  A61K31/7088 ,  A61K31/712 ,  A61K38/00 ,  A61K48/00 ,  A61P29/00 ,  A61P31/00 ,  A61P31/22 ,  A61P37/00 ,  A61P37/02 ,  C07H21/00 ,  C07K14/045 ,  C07K14/705 ,  C12N9/12 ,  C12N15/113 ,  C12Q1/70 ,  C07H21/02 ,  C07H21/04 ,  C12Q1/68

CPC分类号： C12N15/113 ,  A61K31/711 ,  C07K14/005 ,  C07K14/705 ,  C07K14/70525 ,  C07K14/70542 ,  C07K14/70564 ,  C12N15/1133 ,  C12N15/1138 ,  C12N9/1252 ,  C12Q1/705 ,  A61K38/00 ,  A61K48/00 ,  C12N2310/315 ,  C12N2310/318 ,  C12N2310/3181 ,  C12N2310/321 ,  C12N2310/322 ,  C12N2310/346 ,  C12N2310/352 ,  C12N2310/3521 ,  C12N2310/3531 ,  C12N2310/3533 ,  C12N2710/16122

摘要： Compositions and methods are provided for inhibiting the translation of a capped target mRNA. Antisense oligomers of the invention are targeted to the 5' cap region of the target mRNA and include oligonucleosides, PNAs, or oligonucleotides modified at the 2' position of the sugar. Preferably said oligomers inhibit protein translation directly via interference with ribosome assembly.

摘要翻译： 提供组合物和方法用于抑制加盖靶mRNA的翻译。 本发明的反义寡聚体靶向靶mRNA的5'帽区域，并且包括在糖的2'位置修饰的寡核苷，PNA或寡核苷酸。 所述低聚物优选通过干扰核糖体组装直接抑制蛋白质翻译。