公开(公告)号：US20070065867A1

公开(公告)日：2007-03-22

申请号：US11541810

申请日：2006-10-02

申请人： Mark Payne ,  Stephen Picataggio ,  Amy Hsu ,  Ramesh Nair ,  Fernado Valle ,  Philippe Soucaille ,  Donald Trimbur

发明人： Mark Payne ,  Stephen Picataggio ,  Amy Hsu ,  Ramesh Nair ,  Fernado Valle ,  Philippe Soucaille ,  Donald Trimbur

IPC分类号： C40B30/06 ,  C40B40/10 ,  C07H21/04 ,  C12N15/74

CPC分类号： C07K14/36 ,  C12N9/90 ,  C12N15/70 ,  C12N15/76 ,  C12P7/18

摘要： This invention provides a series of low-copy number plasmids comprising restriction endonuclease recognition sites useful for cloning at least three different genes or operons, each flanked by a terminator sequence, the plasmids containing variants of glucose isomerase promoters for varying levels of protein expression. The materials and methods are useful for genetic engineering in microorganisms, especially where multiple genetic insertions are sought.

摘要翻译： 本发明提供了一系列含有限制性内切核酸酶识别位点的低拷贝数质粒，所述限制性内切核酸酶识别位点用于克隆至少三种不同的基因或操纵子，每个侧翼有终止子序列，所述质粒含有不同水平的蛋白质表达的葡萄糖异构酶启动子的变体。 这些材料和方法可用于微生物的遗传工程，特别是在寻求多种遗传插入的情况下。

公开(公告)号：US20060177915A1

公开(公告)日：2006-08-10

申请号：US11282498

申请日：2005-11-18

申请人： Ramesh Nair ,  Mark Payne ,  Donald Trimbur ,  Fernando Valle

发明人： Ramesh Nair ,  Mark Payne ,  Donald Trimbur ,  Fernando Valle

IPC分类号： C12P7/20 ,  C12N9/04 ,  C12N9/16

CPC分类号： C12P7/20

摘要： Recombinant organisms are provided comprising genes encoding a glycerol-3-phosphate dehydrogenase and/or a glycerol-3-phosphatase activity useful for the production of glycerol from a variety of carbon substrates. The organisms further contain disruptions in the endogenous genes encoding proteins having glycerol kinase and glycerol dehydrogenase activities.

公开(公告)号：US20050147968A1

公开(公告)日：2005-07-07

申请号：US10420587

申请日：2003-04-22

申请人： Mark Payne ,  Stephen Picataggio ,  Amy Hsu ,  Ramesh Nair ,  Fernado Valle ,  Philippe Soucaille ,  Donald Trimbur

发明人： Mark Payne ,  Stephen Picataggio ,  Amy Hsu ,  Ramesh Nair ,  Fernado Valle ,  Philippe Soucaille ,  Donald Trimbur

IPC分类号： C12N15/09 ,  C12N1/21 ,  C12N9/90 ,  C12N15/61 ,  C12N15/70 ,  C12P7/18 ,  C12Q1/68 ,  C07H21/04 ,  C12N15/74

CPC分类号： C07K14/36 ,  C12N9/90 ,  C12N15/70 ,  C12N15/76 ,  C12P7/18

摘要： This invention provides a series of low-copy number plasmids comprising restriction endonuclease recognition sites useful for cloning at least three different genes or operons, each flanked by a terminator sequence, the plasmids containing variants of glucose isomerase promoters for varying levels of protein expression. The materials and methods are useful for genetic engineering in microorganisms, especially where multiple genetic insertions are sought.

摘要翻译： 本发明提供了一系列含有限制性内切核酸酶识别位点的低拷贝数质粒，所述限制性内切核酸酶识别位点用于克隆至少三种不同的基因或操纵子，每个侧翼有终止子序列，所述质粒含有不同水平的蛋白质表达的葡萄糖异构酶启动子的变体。 这些材料和方法可用于微生物的遗传工程，特别是在寻求多种遗传插入的情况下。

公开(公告)号：US20060286653A1

公开(公告)日：2006-12-21

申请号：US11282978

申请日：2005-11-18

申请人： Ramesh Nair ,  Mark Payne ,  Donald Trimbur ,  Fernando Valle

发明人： Ramesh Nair ,  Mark Payne ,  Donald Trimbur ,  Fernando Valle

IPC分类号： C12P7/18 ,  C12P7/20 ,  C12N9/02 ,  C12N9/12 ,  C12N15/74 ,  C12N1/21

CPC分类号： C12P7/20 ,  C12P7/18

摘要： Recombinant organisms are provided comprising genes encoding a glycerol-3-phosphate dehydrogenase and/or a glycerol-3-phosphatase activity useful for the production of glycerol from a variety of carbon substrates. The organisms further contain disruptions in the endogenous genes encoding proteins having glycerol kinase and glycerol dehydrogenase activities.

摘要翻译： 提供了包含编码甘油-3-磷酸脱氢酶和/或甘油-3-磷酸酶活性的基因的重组生物体，其可用于从各种碳底物生产甘油。 生物体还含有编码具有甘油激酶和甘油脱氢酶活性的蛋白质的内源基因的破坏。

公开(公告)号：US20060121581A1

公开(公告)日：2006-06-08

申请号：US10527827

申请日：2003-10-03

申请人： Marguerite Cervin ,  Philippe Soucaille ,  Donald Trimbur ,  Fernando Valle

发明人： Marguerite Cervin ,  Philippe Soucaille ,  Donald Trimbur ,  Fernando Valle

IPC分类号： C12P13/22 ,  C07H21/04 ,  C12N15/74 ,  C12N1/21

CPC分类号： C07K14/24 ,  C12N15/70 ,  C12P7/06 ,  C12P7/065 ,  C12P7/18 ,  C12P7/20 ,  C12P7/28 ,  C12P7/40 ,  C12P7/44 ,  C12P7/46 ,  C12P13/04 ,  C12P13/22 ,  Y02E50/17

摘要： The present invention provides methods to enhance production of desired products and increase the growth rate of a bacterial strain by inactivating an endogenous arcA and optionally overexpressing a ppc gene.

摘要翻译： 本发明提供了通过灭活内源性arcA和任选地过表达ppc基因来增强所需产物的产生和增加细菌菌株的生长速率的方法。

公开(公告)号：US06953684B2

公开(公告)日：2005-10-11

申请号：US09308207

申请日：1997-11-13

申请人： Nigel Dunn-Coleman ,  Maria Diaz-Torres ,  Matthew W. Chase ,  Donald Trimbur

发明人： Nigel Dunn-Coleman ,  Maria Diaz-Torres ,  Matthew W. Chase ,  Donald Trimbur

IPC分类号： C12N15/09 ,  C12N1/15 ,  C12N1/19 ,  C12N1/21 ,  C12N9/02 ,  C12N9/04 ,  C12N9/16 ,  C12N9/88 ,  C12N15/52 ,  C12N15/53 ,  C12P7/18 ,  C12R1/22 ,  C12R1/85 ,  C12R1/865 ,  C12N1/14 ,  C12N1/20

CPC分类号： C12N9/0004 ,  C12N9/16 ,  C12N9/88 ,  C12N15/52 ,  C12P7/18 ,  Y10S530/824

摘要： The present invention provides a microorganism for the production of 1,3-propanediol from a variety of carbon sources in an organism capable of 1,3-propanediol production and comprising a) at least one gene encoding a dehydratase activity; b) at least one gene encoding a glycerol-3-phosphatase; and c) at least one gene encoding protein X. The protein X may be derived from a Klebsiella or Citrobacter gene cluster. The recombinant microorganism may further comprise d) at least one gene encoding a protein having at least 50% similarity to a protein selected from the group consisting of protein 1 (SEQ ID NO:60 or SEQ ID NO:61), of protein 2 (SEQ ID NO:62 or SEQ ID NO:63) and of protein 3 (SEQ ID NO:64 or SEQ ID NO:65) from Klebsiella or Citrobacter.

摘要翻译： 本发明提供一种用于在能够进行1,3-丙二醇生产的生物体中从多种碳源生产1,3-丙二醇的微生物，其包含：a）至少一种编码脱水酶活性的基因; b）至少一种编码甘油-3-磷酸酶的基因; 和c）至少一个编码蛋白X的基因。蛋白X可以来自克雷伯菌或柠檬酸杆菌基因簇。 重组微生物还可以包含d）至少一种编码与蛋白质2（SEQ ID NO：60或SEQ ID NO：61）蛋白质具有至少50％相似性的蛋白质的基因，蛋白质2（SEQ ID NO：60或SEQ ID NO：61） SEQ ID NO：62或SEQ ID NO：63）和来自克雷伯杆菌或柠檬酸杆菌的蛋白质3（SEQ ID NO：64或SEQ ID NO：65）。

公开(公告)号：US6136576A

公开(公告)日：2000-10-24

申请号：US969683

申请日：1997-11-13

申请人： Maria Diaz-Torres ,  Nigel S Dunn-Coleman ,  Matthew W. Chase ,  Donald Trimbur

发明人： Maria Diaz-Torres ,  Nigel S Dunn-Coleman ,  Matthew W. Chase ,  Donald Trimbur

IPC分类号： C12N15/09 ,  C12N1/15 ,  C12N1/19 ,  C12N1/21 ,  C12N9/02 ,  C12N9/04 ,  C12N9/16 ,  C12N9/88 ,  C12N15/52 ,  C12N15/53 ,  C12P7/18 ,  C12R1/22 ,  C12R1/85 ,  C12R1/865

CPC分类号： C12N9/0004 ,  C12N15/52 ,  C12N9/16 ,  C12N9/88 ,  C12P7/18 ,  Y10S530/824

摘要： The present invention provides an improved method for the production of 1,3-propanediol from a variety of carbon sources in an organism capable of 1,3-propanediol production and comprising DNA encoding protein X of a microorganismal dehydratase or protein X in combination with at least one of protein 1, protein 2 and protein 3, which proteins are comparable to those encoded by orfY, orfX and orfW, respectively from a microorganismal dha regulon. The protein X may be isolated from a diol dehydratase or a glycerol dehydratase. The present invention also provides host cells comprising protein X that are capable of increased production of 1,3-propanediol.

摘要翻译： 本发明提供了一种用于在能够进行1,3-丙二醇生产的生物体中从各种碳源生产1,3-丙二醇的改进方法，并且包括编码微生物脱水酶或蛋白质X的蛋白X的DNA， 蛋白质1，蛋白质2和蛋白质3中的至少一个，该蛋白质与来自微生物dha调节子的orfY，orfX和orfW编码的蛋白质相当。 蛋白质X可以从二醇脱水酶或甘油脱水酶中分离出来。 本发明还提供了能够增加1,3-丙二醇生产的含有蛋白质X的宿主细胞。