公开(公告)号：US20130149697A1

公开(公告)日：2013-06-13

申请号：US13768794

申请日：2013-02-15

申请人： Angela Hudson ,  Tamara Sander ,  Poonam Agarwal ,  Michelle Garsha ,  Hon Ip ,  Robert W. Kwiatkowski, JR. ,  Vecheslav Elagin ,  Marilyn Olson-Munoz ,  Michelle Curtis ,  Sarah Olson ,  Ilse Tyler

发明人： Angela Hudson ,  Tamara Sander ,  Poonam Agarwal ,  Michelle Garsha ,  Hon Ip ,  Robert W. Kwiatkowski, JR. ,  Vecheslav Elagin ,  Marilyn Olson-Munoz ,  Michelle Curtis ,  Sarah Olson ,  Ilse Tyler

IPC分类号： C12Q1/70

CPC分类号： C12Q1/708 ,  C12Q2561/109

摘要： The present invention provides compositions and methods for the detection and characterization of HPV sequences. More particularly, the present invention provides compositions, methods and kits for using invasive cleavage structure assays (e.g. the INVADER assay) to screen nucleic acid samples, e.g., from patients, for the presence of any one of a collection of HPV sequences. The present invention also provides compositions, methods and kits for screening sets of HPV sequences in a single reaction container.

摘要翻译： 本发明提供用于检测和表征HPV序列的组合物和方法。 更具体地，本发明提供了使用侵入性切割结构测定法（例如INVADER测定法）筛选核酸样品（例如来自患者）以存在HPV序列集合中的任何一个的组合物，方法和试剂盒。 本发明还提供了用于在单个反应容器中筛选HPV序列的组合物，方法和试剂盒。

公开(公告)号：US08389245B2

公开(公告)日：2013-03-05

申请号：US11857942

申请日：2007-09-19

申请人： Angela Hudson ,  Tamara Sander ,  Poonam Agarwal ,  Michelle Garsha ,  Hon Ip ,  Robert W. Kwiatkowski, Jr. ,  Vecheslav Elagin ,  Marilyn Olson-Munoz ,  Michelle Curtis ,  Sarah Olson ,  Ilse Tyler

发明人： Angela Hudson ,  Tamara Sander ,  Poonam Agarwal ,  Michelle Garsha ,  Hon Ip ,  Robert W. Kwiatkowski, Jr. ,  Vecheslav Elagin ,  Marilyn Olson-Munoz ,  Michelle Curtis ,  Sarah Olson ,  Ilse Tyler

IPC分类号： C12P19/34

CPC分类号： C12Q1/708 ,  C12Q2561/109

摘要： The present invention provides compositions and methods for the detection and characterization of HPV sequences. More particularly, the present invention provides compositions, methods and kits for using invasive cleavage structure assays (e.g. the INVADER assay) to screen nucleic acid samples, e.g., from patients, for the presence of any one of a collection of HPV sequences. The present invention also provides compositions, methods and kits for screening sets of HPV sequences in a single reaction container.

公开(公告)号：US07527948B2

公开(公告)日：2009-05-05

申请号：US10951241

申请日：2004-09-27

申请人： Angela Hudson ,  Tamara Sander ,  Poonam Agarwal ,  Michelle Garsha ,  Hon Ip ,  Robert W. Kwiatkowski, Jr. ,  Vecheslav Elagin ,  Marilyn Olson-Munoz ,  Michelle Curtis ,  Sarah Olson ,  Ilse Tyler

发明人： Angela Hudson ,  Tamara Sander ,  Poonam Agarwal ,  Michelle Garsha ,  Hon Ip ,  Robert W. Kwiatkowski, Jr. ,  Vecheslav Elagin ,  Marilyn Olson-Munoz ,  Michelle Curtis ,  Sarah Olson ,  Ilse Tyler

IPC分类号： C12P19/34 ,  C12Q1/68 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12Q1/708 ,  C12Q2561/109

摘要： The present invention provides compositions and methods for the detection and characterization of HPV sequences. More particularly, the present invention provides compositions, methods and kits for using invasive cleavage structure assays (e.g. the INVADER assay) to screen nucleic acid samples, e.g., from patients, for the presence of any one of a collection of HPV sequences. The present invention also provides compositions, methods and kits for screening sets of HPV sequences in a single reaction container.

摘要翻译： 本发明提供用于检测和表征HPV序列的组合物和方法。 更具体地，本发明提供了使用侵入性切割结构测定法（例如INVADER测定法）筛选核酸样品（例如来自患者）以存在HPV序列集合中的任何一个的组合物，方法和试剂盒。 本发明还提供了用于在单个反应容器中筛选HPV序列的组合物，方法和试剂盒。

公开(公告)号：US06913881B1

公开(公告)日：2005-07-05

申请号：US09713601

申请日：2000-11-15

申请人： Brian D. Aizenstein ,  Eric B. Rasmussen ,  Jeff G. Hall ,  Poonam Agarwal ,  David Arco ,  Myrta W. Atiles ,  Deborah E. Burris ,  Monika de Arruda Indig ,  Scott M. Law ,  Andrea L. Mast ,  David J. Marshall ,  Carolyn W. Miller ,  Mary C. Oldenberg ,  James R. Prudent ,  Jennifer M. Schneiders ,  Mary Ann Brow ,  Victor Lyamichev

发明人： Brian D. Aizenstein ,  Eric B. Rasmussen ,  Jeff G. Hall ,  Poonam Agarwal ,  David Arco ,  Myrta W. Atiles ,  Deborah E. Burris ,  Monika de Arruda Indig ,  Scott M. Law ,  Andrea L. Mast ,  David J. Marshall ,  Carolyn W. Miller ,  Mary C. Oldenberg ,  James R. Prudent ,  Jennifer M. Schneiders ,  Mary Ann Brow ,  Victor Lyamichev

IPC分类号： C12N9/12 ,  C12N9/22 ,  C12Q1/68 ,  C07H21/02 ,  C07H21/04 ,  C12P19/34 ,  C12Q1/70

CPC分类号： C12Q1/683 ,  C12N9/1252 ,  C12N9/22 ,  C12Q1/6823 ,  C12Q1/6844 ,  C12Q2537/155 ,  C12Q2525/301 ,  C12Q2521/301

摘要： The present invention relates to compositions and methods for the detection and characterization of nucleic acid sequences and variations in nucleic acid sequences. The present invention relates to methods for forming a nucleic acid cleavage structure on a target sequence and cleaving the nucleic acid cleavage structure in a site-specific manner. For example, in some embodiments, a 5′ nuclease activity from any of a variety of enzymes is used to cleave the target-dependent cleavage structure, thereby indicating the presence of specific nucleic acid sequences or specific variations thereof.

摘要翻译： 本发明涉及核酸序列的检测和表征的组合物和方法以及核酸序列的变化。 本发明涉及在目标序列上形成核酸切割结构并以位点特异性方式切割核酸切割结构的方法。 例如，在一些实施方案中，使用来自任何多种酶的5'核酸酶活性来切割靶依赖性切割结构，从而指示特异性核酸序列的存在或其特定变体。

公开(公告)号：US20090203018A1

公开(公告)日：2009-08-13

申请号：US12360819

申请日：2009-01-27

申请人： Poonam Agarwal ,  Robert W. Kwiatkowski, JR.

发明人： Poonam Agarwal ,  Robert W. Kwiatkowski, JR.

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6827 ,  C12Q1/6823 ,  C12Q2527/107 ,  C12Q2537/163 ,  C12Q2561/109

摘要： The present invention provides methods, compositions, and kits for detecting the presence or absence of target sequences in a sample, where the sample also contains interfering sequences that are similar or identical to the target sequences. In particular, the present invention provides blocker oligonucleotides that at least partially inhibit the formation of invasive cleavage structures with the interfering sequences but do not substantially inhibit the formation of invasive cleavage structures with the target sequences.

摘要翻译： 本发明提供用于检测样品中靶序列存在或不存在的方法，组合物和试剂盒，其中样品还含有与靶序列相似或相同的干扰序列。 特别地，本发明提供了阻断型寡核苷酸，该阻断剂寡核苷酸至少部分地抑制了具有干扰序列形成侵入性切割结构，但基本上不抑制靶序列形成侵入性切割结构。

公开(公告)号：US20070202517A1

公开(公告)日：2007-08-30

申请号：US11592458

申请日：2006-11-03

申请人： Poonam Agarwal ,  Robert Kwiatkowski

发明人： Poonam Agarwal ,  Robert Kwiatkowski

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6827 ,  C12Q1/6823 ,  C12Q2527/107 ,  C12Q2537/163 ,  C12Q2561/109

摘要： The present invention provides methods, compositions, and kits for detecting the presence or absence of target sequences in a sample, where the sample also contains interfering sequences that are similar or identical to the target sequences. In particular, the present invention provides blocker oligonucleotides that at least partially inhibit the formation of invasive cleavage structures with the interfering sequences but do not substantially inhibit the formation of invasive cleavage structures with the target sequences.

摘要翻译： 本发明提供用于检测样品中靶序列存在或不存在的方法，组合物和试剂盒，其中样品还含有与靶序列相似或相同的干扰序列。 特别地，本发明提供了阻断型寡核苷酸，该阻断剂寡核苷酸至少部分地抑制了具有干扰序列形成侵入性切割结构，但基本上不抑制靶序列形成侵入性切割结构。

公开(公告)号：US20060147938A1

公开(公告)日：2006-07-06

申请号：US10713653

申请日：2003-11-14

申请人： Molly Accola ,  Susan Wigdal ,  Andrea Mast ,  Christian Bartholomay ,  Robert Kwiatkowski ,  Vincent Tevere ,  Hon Ip ,  Kathleen Carroll ,  Patrick Peterson ,  Poonam Agarwal ,  Nancy Jarvis ,  Jeff Hall ,  Robert Roeven

发明人： Molly Accola ,  Susan Wigdal ,  Andrea Mast ,  Christian Bartholomay ,  Robert Kwiatkowski ,  Vincent Tevere ,  Hon Ip ,  Kathleen Carroll ,  Patrick Peterson ,  Poonam Agarwal ,  Nancy Jarvis ,  Jeff Hall ,  Robert Roeven

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12Q1/6883 ,  C12Q2600/156 ,  C12Q2600/16

摘要： The present invention provides compositions and methods for the detection and characterization of mutations associated with cystic fibrosis. More particularly, the present invention provides compositions, methods and kits for using invasive cleavage structure assays (e.g. the INVADER assay) to screen nucleic acid samples, e.g., from patients, for the presence of any one of a collection of mutations in the CFTR gene associated with cystic fibrosis. The present invention also provides compositions, methods and kits for screening sets of CFTR alleles in a single reaction container.

摘要翻译： 本发明提供了用于检测和表征与囊性纤维化相关的突变的组合物和方法。 更具体地，本发明提供了组合物，方法和试剂盒，其用于使用侵入性切割结构测定法（例如INVADER测定法）筛选核酸样品，例如来自患者，以存在CFTR基因中的任何突变集合 与囊性纤维化有关。 本发明还提供用于筛选单个反应容器中的CFTR等位基因组的组合物，方法和试剂盒。

公开(公告)号：US20080176215A1

公开(公告)日：2008-07-24

申请号：US11857942

申请日：2007-09-19

申请人： Angela Hudson ,  Tamara Sander ,  Poonam Agarwal ,  Michelle Garsha ,  Hon Ip ,  Robert W. Kwiatkowski ,  Vecheslav Elagin ,  Marilyn Olson-Munoz ,  Michelle Curtis ,  Sarah Olson ,  Ilse Tyler

发明人： Angela Hudson ,  Tamara Sander ,  Poonam Agarwal ,  Michelle Garsha ,  Hon Ip ,  Robert W. Kwiatkowski ,  Vecheslav Elagin ,  Marilyn Olson-Munoz ,  Michelle Curtis ,  Sarah Olson ,  Ilse Tyler

IPC分类号： C12Q1/70

CPC分类号： C12Q1/708 ,  C12Q2561/109

摘要： The present invention provides compositions and methods for the detection and characterization of HPV sequences. More particularly, the present invention provides compositions, methods and kits for using invasive cleavage structure assays (e.g. the INVADER assay) to screen nucleic acid samples, e.g., from patients, for the presence of any one of a collection of HPV sequences. The present invention also provides compositions, methods and kits for screening sets of HPV sequences in a single reaction container.

摘要翻译： 本发明提供用于检测和表征HPV序列的组合物和方法。 更具体地，本发明提供了使用侵入性切割结构测定法（例如INVADER测定法）筛选核酸样品（例如来自患者）以存在HPV序列集合中的任何一个的组合物，方法和试剂盒。 本发明还提供了用于在单个反应容器中筛选HPV序列的组合物，方法和试剂盒。

公开(公告)号：US20070111200A1

公开(公告)日：2007-05-17

申请号：US10951241

申请日：2004-09-27

申请人： Angela Hudson ,  Tamara Sander ,  Poonam Agarwal ,  Michelle Garsha ,  Hon Ip ,  Robert Kwiatkowski ,  Vecheslav Elagin ,  Marilyn Olson-Munoz ,  Michelle Curtis ,  Sarah Olson ,  Ilse Tyler

发明人： Angela Hudson ,  Tamara Sander ,  Poonam Agarwal ,  Michelle Garsha ,  Hon Ip ,  Robert Kwiatkowski ,  Vecheslav Elagin ,  Marilyn Olson-Munoz ,  Michelle Curtis ,  Sarah Olson ,  Ilse Tyler

IPC分类号： C12Q1/70 ,  C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/708 ,  C12Q2561/109

摘要： The present invention provides compositions and methods for the detection and characterization of HPV sequences. More particularly, the present invention provides compositions, methods and kits for using invasive cleavage structure assays (e.g. the INVADER assay) to screen nucleic acid samples, e.g., from patients, for the presence of any one of a collection of HPV sequences. The present invention also provides compositions, methods and kits for screening sets of HPV sequences in a single reaction container.

摘要翻译： 本发明提供用于检测和表征HPV序列的组合物和方法。 更具体地，本发明提供了使用侵入性切割结构测定法（例如INVADER测定法）筛选核酸样品（例如来自患者）以存在HPV序列集合中的任何一个的组合物，方法和试剂盒。 本发明还提供了用于在单个反应容器中筛选HPV序列的组合物，方法和试剂盒。

公开(公告)号：US07932039B2

公开(公告)日：2011-04-26

申请号：US12360819

申请日：2009-01-27

申请人： Poonam Agarwal ,  Robert W. Kwiatkowski, Jr.

发明人： Poonam Agarwal ,  Robert W. Kwiatkowski, Jr.

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C07H21/02 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12Q1/6827 ,  C12Q1/6823 ,  C12Q2527/107 ,  C12Q2537/163 ,  C12Q2561/109

摘要： The present invention provides methods, compositions, and kits for detecting the presence or absence of target sequences in a sample, where the sample also contains interfering sequences that are similar or identical to the target sequences. In particular, the present invention provides blocker oligonucleotides that at least partially inhibit the formation of invasive cleavage structures with the interfering sequences but do not substantially inhibit the formation of invasive cleavage structures with the target sequences.

摘要翻译： 本发明提供用于检测样品中靶序列存在或不存在的方法，组合物和试剂盒，其中样品还含有与靶序列相似或相同的干扰序列。 特别地，本发明提供了阻断型寡核苷酸，该阻断剂寡核苷酸至少部分地抑制了具有干扰序列形成侵入性切割结构，但基本上不抑制靶序列形成侵入性切割结构。