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    Characterization of the yeast transcriptome
    1.
    发明授权
    Characterization of the yeast transcriptome 有权
    表达酵母转录组

    公开(公告)号：US07504493B2

    公开(公告)日：2009-03-17

    申请号：US10915727

    申请日：2004-08-11

    申请人： Victor E. Velculescu ,  Bert Vogelstein ,  Kenneth Kinzler

    发明人： Victor E. Velculescu ,  Bert Vogelstein ,  Kenneth Kinzler

    IPC分类号： C12N15/11

    CPC分类号： C12Q1/6895 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q2600/158

    摘要： Yeast genes which are differentially expressed during the cell cycle are described. They can be used to study, affect, and monitor the cell cycle of a eukaryotic cell. They can be used to obtain human homologs involved in cell cycle regulation. They can be used to identify antifungal agents and other classes of drugs. They can be formed into arrays on solid supports for interrogation of a cell's transcriptome under various conditions.

    摘要翻译： 描述在细胞周期期间差异表达的酵母基因。 它们可用于研究，影响和监测真核细胞的细胞周期。 它们可用于获得涉及细胞周期调节的人类同源物。 它们可用于鉴定抗真菌剂和其他类别的药物。 它们可以在固体支持物上形成阵列，用于在各种条件下询问细胞的转录组。

    Serial analysis of transcript expression using MmeI and long tags
    3.
    发明授权
    Serial analysis of transcript expression using MmeI and long tags 有权
    使用MmeI和长标签进行转录表达的连续分析

    公开(公告)号：US06498013B1

    公开(公告)日：2002-12-24

    申请号：US09916228

    申请日：2001-07-27

    申请人： Victor E. Velculescu ,  Andrew Sparks ,  Kenneth W. Kinzler ,  Bert Vogelstein

    发明人： Victor E. Velculescu ,  Andrew Sparks ,  Kenneth W. Kinzler ,  Bert Vogelstein

    IPC分类号： C12Q168

    CPC分类号： C12Q1/6809 ,  C12Q2525/191 ,  C12Q2521/501 ,  C12Q2521/313 ,  C12Q2521/301

    摘要： Serial analysis of gene expression, SAGE, a method for the rapid quantitative and qualitative analysis of transcripts, has been improved to provide more genetic information about each analyzed transcript by use of MmeI restriction endonuclease. In SAGE, defined sequence tags corresponding to expressed genes are isolated and analyzed. Sequencing of over 1,000 defined tags in a short period of time (e.g., hours) reveals a gene expression pattern characteristic of the function of a cell or tissue. Moreover, SAGE is useful as a gene discovery tool for the identification and isolation of novel sequence tags corresponding to novel transcripts and genes.

    摘要翻译： 基因表达的序列分析，SAGE，用于快速定量和定性分析转录物的方法已被改进，以通过使用MmeI限制性内切核酸酶提供关于每个分析的转录物的更多遗传信息。 在SAGE中，分离和分析与表达基因相对应的定义的序列标签。 在短时间（例如，小时）内测定超过1,000个定义的标签显示了细胞或组织功能特征的基因表达模式。 此外，SAGE可用作用于鉴定和分离对应于新转录物和基因的新序列标签的基因发现工具。

    Method for serial analysis of gene expression
    4.
    发明授权
    Method for serial analysis of gene expression 失效
    基因表达序列分析方法

    公开(公告)号：US5695937A

    公开(公告)日：1997-12-09

    申请号：US527154

    申请日：1995-09-12

    申请人： Kenneth W. Kinzler ,  Bert Vogelstein ,  Victor E. Velculescu ,  Lin Zhang

    发明人： Kenneth W. Kinzler ,  Bert Vogelstein ,  Victor E. Velculescu ,  Lin Zhang

    IPC分类号： C12N15/10 ,  C12Q1/68 ,  C07H21/00 ,  C12N15/00 ,  C12P19/34

    CPC分类号： C12N15/1096 ,  C12Q1/6809 ,  C12Q1/6869

    摘要： Serial analysis of gene expression, SAGE, a method for the rapid quantitative and qualitative analysis of transcripts is provided. Short defined sequence tags corresponding to expressed genes are isolated and analyzed. Sequencing of over 1,000 defined tags in a short period of time (e.g., hours) reveals a gene expression pattern characteristic of the function of a cell or tissue. Moreover, SAGE is useful as a gene discovery tool for the identification and isolation of novel sequence tags corresponding to novel transcripts and genes.

    摘要翻译： 提供基因表达的串行分析，SAGE，一种用于快速定量和定性分析转录本的方法。 分离并分析与表达基因相对应的短定义序列标签。 在短时间（例如，小时）内测定超过1,000个定义的标签显示了细胞或组织功能特征的基因表达模式。 此外，SAGE可用作用于鉴定和分离对应于新转录物和基因的新序列标签的基因发现工具。

    Integrated Analyses of Breast and Colorectal Cancers
    6.
    发明申请
    Integrated Analyses of Breast and Colorectal Cancers 审中-公开
    乳腺癌和结肠直肠癌综合分析

    公开(公告)号：US20100136560A1

    公开(公告)日：2010-06-03

    申请号：US12619726

    申请日：2009-11-17

    申请人： Bert Vogelstein ,  Kenneth W. Kinzler ,  Rebecca J. Leary ,  Victor E. Velculescu

    发明人： Bert Vogelstein ,  Kenneth W. Kinzler ,  Rebecca J. Leary ,  Victor E. Velculescu

    IPC分类号： C12Q1/68

    CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/156

    摘要： Genome-wide analysis of copy number changes in breast and colorectal tumors used approaches that can reliably detect homozygous deletions and amplifications. The number of genes altered by major copy number changes—deletion of all copies or amplification of at least twelve copies per cell—averaged thirteen per tumor. These data were integrated with previous mutation analyses of the Reference Sequence genes in these same tumor types to identify genes and cellular pathways affected by both copy number changes and point alterations. Pathways enriched for genetic alterations include those controlling cell adhesion, intracellular signaling, DNA topological change, and cell cycle control. These analyses provide an integrated view of copy number and sequencing alterations on a genome-wide scale and identify genes and pathways that are useful for cancer diagnosis and therapy.

    摘要翻译： 使用可以可靠地检测纯合缺失和扩增的方法对乳腺和结肠直肠肿瘤的拷贝数变化进行全基因组分析。 通过主要拷贝数变化改变的基因数量 - 全部拷贝的缺失或每个细胞至少12个拷贝的扩增，平均每个肿瘤13个。 这些数据与这些相同肿瘤类型中的参考序列基因的先前突变分析相结合，以鉴定受拷贝数变化和点改变影响的基因和细胞途径。 富含遗传改变的途径包括控制细胞粘附，细胞内信号转导，DNA拓扑变化和细胞周期控制的途径。 这些分析提供了在全基因组范围内的拷贝数和排序变化的综合视图，并确定了可用于癌症诊断和治疗的基因和途径。

    Integrated analyses of breast and colorectal cancers
    7.
    发明授权
    Integrated analyses of breast and colorectal cancers 有权
    乳腺癌和结肠直肠癌的综合分析

    公开(公告)号：US08709723B2

    公开(公告)日：2014-04-29

    申请号：US13461268

    申请日：2012-05-01

    申请人： Bert Vogelstein ,  Kenneth W. Kinzler ,  Rebecca J. Leary ,  Victor E. Velculescu

    发明人： Bert Vogelstein ,  Kenneth W. Kinzler ,  Rebecca J. Leary ,  Victor E. Velculescu

    IPC分类号： C12Q1/66 ,  C12P19/34 ,  C07H21/02

    CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/156

    摘要： Genome-wide analysis of copy number changes in breast and colorectal tumors used approaches that can reliably detect homozygous deletions and amplifications. The number of genes altered by major copy number changes—deletion of all copies or amplification of at least twelve copies per cell—averaged thirteen per tumor. These data were integrated with previous mutation analysis of the Reference Sequence genes in these same tumor types to identify genes and cellular pathways affected by both copy number changes and point alterations. Pathways enriched for genetic alterations include those controlling cell adhesion, intracellular signaling, DNA topological change, and cell cycle control. These analysis provide an integrated view of copy number and sequencing alterations on a genome-wide scale and identify genes and pathways that are useful for cancer diagnosis and therapy.

    摘要翻译： 使用可以可靠地检测纯合缺失和扩增的方法对乳腺和结肠直肠肿瘤的拷贝数变化进行全基因组分析。 通过主要拷贝数变化改变的基因数量 - 全部拷贝的缺失或每个细胞至少12个拷贝的扩增，平均每个肿瘤13个。 这些数据与以前相同肿瘤类型的参考序列基因的突变分析结合起来，以鉴定受拷贝数变化和点变化影响的基因和细胞途径。 富含遗传改变的途径包括控制细胞粘附，细胞内信号转导，DNA拓扑变化和细胞周期控制的途径。 这些分析提供了在全基因组范围内的拷贝数和测序改变的综合视图，并确定了可用于癌症诊断和治疗的基因和途径。

    HUMAN TRANSCRIPTOMES
    9.
    发明申请
    HUMAN TRANSCRIPTOMES 审中-公开
    人物代码

    公开(公告)号：US20110033466A1

    公开(公告)日：2011-02-10

    申请号：US12858717

    申请日：2010-08-18

    申请人： Victor E. Velculescu ,  Bert Vogelstein ,  Kenneth W. Kinzler

    发明人： Victor E. Velculescu ,  Bert Vogelstein ,  Kenneth W. Kinzler

    IPC分类号： C12Q1/68 ,  C07H21/00 ,  C12N5/071 ,  C12N15/00 ,  A61K31/7088 ,  A61K39/395 ,  A61P35/00 ,  A61P43/00

    CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/136

    摘要： Global gene expression patterns have been characterized in normal and cancerous human cells using serial analysis of gene expression (SAGE). Cancer cell-specific, cell-type specific, and ubiquitously expressed genes have been identified. This information can be used to provide combinations of cell type- and cancer-specific gene probes, as well as methods of using these probes to identify particular cell types, screen for useful drugs, reduce cancer-specific gene expression, standardize gene expression, and restore function to a diseased cell or tissue.

    摘要翻译： 使用基因表达（SAGE）的连续分析，在正常和癌性人类细胞中表征全球基因表达模式。 已经鉴定了癌细胞特异性，细胞型特异性和普遍表达的基因。 该信息可用于提供细胞类型和癌症特异性基因探针的组合，以及使用这些探针来鉴定特定细胞类型，筛选有用药物，降低癌症特异性基因表达，标准化基因表达的方法，以及 恢复功能到病变细胞或组织。

    Method for serial analysis of gene expression
    10.
    发明授权
    Method for serial analysis of gene expression 失效
    基因表达序列分析方法

    公开(公告)号：US06383743B1

    公开(公告)日：2002-05-07

    申请号：US09107228

    申请日：1998-06-30

    申请人： Kenneth W. Kinzler ,  Bert Vogelstein ,  Victor E. Velculescu ,  Lin Zhang

    发明人： Kenneth W. Kinzler ,  Bert Vogelstein ,  Victor E. Velculescu ,  Lin Zhang

    IPC分类号： C12Q168

    CPC分类号： C12N15/1096 ,  C12Q1/6809 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2539/103

    摘要： Serial analysis of gene expression, SAGE, a method for the rapid quantitative and qualitative analysis of transcripts is provided. Short defined sequence tags corresponding to expressed genes are isolated and analyzed. Sequencing of over 1,000 defined tags in a short period of time (e.g., hours) reveals a gene expression pattern characteristic of the function of a cell or tissue. Moreover, SAGE is useful as a gene discovery tool for the identification and isolation of novel sequence tags corresponding to novel transcripts and genes.

    摘要翻译： 提供基因表达的串行分析，SAGE，一种用于快速定量和定性分析转录本的方法。 分离并分析与表达基因相对应的短定义序列标签。 在短时间（例如，小时）内测定超过1,000个定义的标签显示了细胞或组织功能特征的基因表达模式。 此外，SAGE可用作用于鉴定和分离对应于新转录物和基因的新序列标签的基因发现工具。