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    MULTIPLE BEADS PER DROPLET RESOLUTION
    2.
    发明申请
    MULTIPLE BEADS PER DROPLET RESOLUTION 审中-公开
    多个珠子每滴子分辨率

    公开(公告)号：WO2017120531A1

    公开(公告)日：2017-07-13

    申请号：PCT/US2017/012618

    申请日：2017-01-06

    Applicant: BIO-RAD LABORATORIES, INC.

    Inventor： LEBOFSKY, Ronald ,  HEREDIA, Nicholas

    IPC: C12N15/10 ,  C12Q1/68 ,  G01N33/53

    CPC classification number: B01J19/0046 ,  B01J2219/00547 ,  B01J2219/00596 ,  B01J2219/00722 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q2525/131 ,  C12Q2563/149 ,  C12Q2563/159 ,  C12Q2565/514 ,  C12Q2565/519 ,  C12Q2523/319 ,  C12Q2535/122

    Abstract: Methods of generating a nucleic acid signature for identifying particles associated in a partition are provided. In one aspect, the method comprises: partitioning a sample into a plurality of partitions comprising a particle comprising a solid support surface, the solid support surface having a plurality of oligonucleotide primers conjugated thereon, wherein the oligonucleotide primers comprise a barcode sequence, and wherein the partitions have 0, 1, or more than 1 particles per partition; providing in a partition a substrate comprising a barcode sequence or repeating clonal barcode sequences; and in the partition, associating a first particle conjugated to oligonucleotide primers comprising a first barcode sequence and a second particle conjugated to oligonucleotide primers comprising a second barcode sequence to a barcode sequence from the substrate, thereby generating a nucleic acid signature for the particles in the partition.

    Abstract translation: 提供了产生用于鉴定分区中相关颗粒的核酸标签的方法。 在一个方面，该方法包括：将样品分配到包含含有固体支持物表面的颗粒的多个分区中，所述固体支持物表面具有缀合在其上的多个寡核苷酸引物，其中所述寡核苷酸引物包含条形码序列，并且其中所述 分区每个分区有0个，1个或多于1个粒子; 在分区中提供包含条形码序列或重复克隆条形码序列的底物; 并且在分区中，将缀合至包含第一条形码序列的寡核苷酸引物的第一颗粒和缀合至包含第二条形码序列的寡核苷酸引物的第二颗粒与来自底物的条形码序列相关联，从而生成核酸序列中的颗粒的核酸特征 分区。

    PHOTOBLOCKED PROBES AND METHODS FOR SEQUENTIAL DETECTION OF NUCLEIC ACIDS
    3.
    发明申请
    PHOTOBLOCKED PROBES AND METHODS FOR SEQUENTIAL DETECTION OF NUCLEIC ACIDS 审中-公开
    荧光探针和用于核酸核酸序列检测的方法

    公开(公告)号：WO2016079078A1

    公开(公告)日：2016-05-26

    申请号：PCT/EP2015/076742

    申请日：2015-11-17

    Applicant: ROCHE DIAGNOSTICS GMBH ,  F. HOFFMANN-LA ROCHE AG ,  ROCHE MOLECULAR SYSTEMS, INC.

    Inventor： JOHNSON, Jenny A. ,  WILL, Stephen G.

    IPC: C07H21/00 ,  C12Q1/68

    CPC classification number: C12Q1/6818 ,  C07H21/00 ,  C12Q1/6832 ,  C12Q2561/101 ,  C12Q2523/319

    Abstract: Photoblocked probes are disclosed including a specific hydrolysis probe having a first nucleic acid sequence complementary to a target having a second nucleic acid sequence, a first and a second interactive labels, a 5' end and a 3' end, and one or more photocleavable moieties coupled to one or more nucleotides of the specific hydrolysis probe, wherein the photocleaveable moiety interferes with the hybridization of the specific hydrolysis probe with the region of the amplification product. Also disclosed are PCR methods for the detection of the presence or absence of a target nucleic acid in a sample utilizing the photoblocked probes, as well as kits.

    Abstract translation: 公开了光阻探针，包括具有与具有第二核酸序列的第一核酸序列互补的特异性水解探针，第一和第二相互作用标记，5'末端和3'末端以及一个或多个可光切割部分 与特异性水解探针的一个或多个核苷酸偶联，其中光可洗脱部分干扰特异性水解探针与扩增产物区域的杂交。 还公开了使用光阻探针的样品中检测靶核酸的存在或不存在的PCR方法，以及试剂盒。

    COMBINED NUCLEIC ACID BLOCKING, EXTRACTION, AND DETECTION IN A SINGLE REACTION VESSEL
    4.
    发明申请
    COMBINED NUCLEIC ACID BLOCKING, EXTRACTION, AND DETECTION IN A SINGLE REACTION VESSEL 审中-公开
    在单反应容器中组合的核酸堵塞，萃取和检测

    公开(公告)号：WO2011002319A2

    公开(公告)日：2011-01-06

    申请号：PCT/NZ2010/000137

    申请日：2010-07-02

    Applicant: ZYGEM CORPORATION LIMITED ,  SAUL, David James

    Inventor： SAUL, David James

    IPC: C12Q1/68

    CPC classification number: C12Q1/6806 ,  C12Q1/6848 ,  C12Q2521/301 ,  C12Q2521/537 ,  C12Q2523/101 ,  C12Q2523/319 ,  C12Q2527/101 ,  C12Q2531/113 ,  C12Q2547/101

    Abstract: The invention relates to a method that utilizes nucleic acid deactivating reagents for the deactivation of contaminating nucleic acids, and thermophilic proteinases for the extraction of nucleic acids in a closed-system to be used in tandem with methods for the amplification of target nucleic acids present in a sample. The combined method enables simplified, temperature-controlled devices to be used for accurate, streamlined testing at the point of care for a wide variety of applications in the medical, industrial, environmental, quality control, security and research fields.

    Abstract translation: 本发明涉及一种利用核酸去活化试剂去除污染性核酸的方法，以及用于提取封闭系统中的核酸的嗜热蛋白酶，以与用于扩增目的核酸的扩增方法一起使用 一个样品。 组合的方法使得简化的温度控制设备可用于在医疗，工业，环境，质量控制，安全和研究领域的各种应用的护理点进行准确，精简的测试。

    光機能性核酸及びその製造方法、並びにメチル化判定方法
    6.
    发明申请
    光機能性核酸及びその製造方法、並びにメチル化判定方法 审中-公开
    光功能核酸，其制备方法和确定甲基化方法

    公开(公告)号：WO2006137190A1

    公开(公告)日：2006-12-28

    申请号：PCT/JP2006/302332

    申请日：2006-02-10

    Applicant: 国立大学法人京都大学 ,  西本 清一 ,  田邉 一仁 ,  山田 久嗣

    Inventor： 西本 清一 ,  田邉 一仁 ,  山田 久嗣

    IPC: C12N15/09 ,  C12N15/11 ,  C12Q1/68

    CPC classification number: C12Q1/6827 ,  C12Q2537/164 ,  C12Q2525/119 ,  C12Q2523/319

    Abstract: 　グアニン連続配列が存在するＤＮＡ鎖についても、シトシンのメチル化の状態を明瞭に判定できる光機能性核酸を提供する。本発明の一実施形態に係る光機能性核酸は、メチル化状態の判定対象となるシトシン領域を含むｐ５３遺伝子の塩基配列と相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドの１塩基がナフトキノン化合物によって置換されたものとなっている。ここで、ナフトキノン化合物は、光機能性核酸とｐ５３遺伝子の塩基配列を有するＤＮＡとがハイブリダイゼーションした際に、判定対象のシトシンと対向する位置に設けられている。この光機能性核酸をｐ５３遺伝子の塩基配列を有するＤＮＡとハイブリダイゼーションさせ、さらに光照射することによって、ナフトキノン化合物と対向するシトシンがメチル化されている場合にのみＤＮＡを切断する。よって、ＤＮＡの断片をポリアクリルアミドゲル電気泳動で解析すれば、ＤＮＡに含まれるシトシンがメチル化されているかどうかを判定することができる。

    Abstract translation: 旨在提供即使在具有连续的鸟嘌呤序列的DNA链的情况下也可以清楚地确定胞嘧啶的甲基化状态的光功能性核酸。 在一种模式的光功能核酸中，具有与含有甲基化状态待测定的胞嘧啶区的p53基因的碱基序列互补的寡核苷酸中的一个碱被萘醌化合物取代。 当该光官能核酸与具有p53基因的碱基序列的DNA杂交时，该萘醌化合物位于面向胞嘧啶的位置。 光功能核酸与具有p53基因的碱基序列的DNA杂交，然后进行光照射。 因此，在面向萘醌化合物的胞嘧啶已被甲基化的情况下，DNA被完全切割。 通过使用聚丙烯酰胺凝胶电泳分析DNA片段，可以确定DNA中所含的胞嘧啶是否已被甲基化。

    光増感還元反応を利用した遺伝子検出方法および遺伝子検出キット
    7.
    发明申请
    光増感還元反応を利用した遺伝子検出方法および遺伝子検出キット 审中-公开
    基因检测方法和基因检测试剂盒利用光致降解反应

    公开(公告)号：WO2006098049A1

    公开(公告)日：2006-09-21

    申请号：PCT/JP2005/016816

    申请日：2005-09-13

    Applicant: 国立大学法人京都大学 ,  西本 清一 ,  田邉 一仁 ,  城 幸弘

    Inventor： 西本 清一 ,  田邉 一仁 ,  城 幸弘

    IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/09

    CPC classification number: C12Q1/6818 ,  C12Q2523/319

    Abstract: 　核酸の増幅や核酸の標識などの煩雑な操作を必要としない、簡便な遺伝子検出方法を提供する。 　標的ポリヌクレオチドにハイブリダイズし得る、異なる２つのポリヌクレオチドをサンプルに添加した後、光を照射する。ここで、第１のポリヌクレオチドは、光増感還元剤が連結されており、第２のポリヌクレオチドは、電子受容体－機能性分子複合体が切断可能に連結されており、該複合体は、該光照射に基づいて該光増感還元剤により放出された電子を受容して該機能性分子を遊離させ、その結果、該機能性分子の機能が発現される。

    Abstract translation: 提供了不需要诸如核酸扩增或核酸标记的复杂操作的方便的基因检测方法。 将两种可与靶多核苷酸杂交的多核苷酸加入到样品中，照射光。 这里，第一多核苷酸与光敏还原剂​​连接，第二多核苷酸以可分离的方式连接到电子受体功能分子复合物。 复合物通过光照射接受由光敏还原剂​​释放的电子，释放功能分子。 结果表达了功能分子的功能。

    PARTIALLY DOUBLE-STRANDED NUCLEIC ACIDS, METHODS OF MAKING, AND USE THEREOF
    9.
    发明申请
    PARTIALLY DOUBLE-STRANDED NUCLEIC ACIDS, METHODS OF MAKING, AND USE THEREOF 审中-公开
    部分双重棒状核酸，其制备方法及其用途

    公开(公告)号：WO02103013A3

    公开(公告)日：2003-03-13

    申请号：PCT/US0142845

    申请日：2001-10-30

    Applicant: GENE LOGIC INC

    Inventor： HOKE GLENN ,  STEEL ADAM ,  HARTWELL JOHN

    IPC: C12Q1/68

    CPC classification number: C12Q1/6844 ,  C12Q1/6853 ,  C12Q2521/531 ,  C12Q2525/113 ,  C12Q2521/319 ,  C12Q2525/161 ,  C12Q2523/319 ,  C12Q2523/107

    Abstract: A process is disclosed for generating at least one partially double-stranded target nucleic acid, which contains at least one single-stranded region at a tenninal end. The process comprises the steps of (a) providing at least one primer, P1, containing at least one labile nucleotide; (b) combining at least one target nucleic acid sequence with P1 to generate a double-stranded polynucleotide containing at least one labile nucleotide; (c) exposing the double-stranded polynucleotide to conditions that promote single-strand cleavage of the polynucleotide at the site of the at least one labile nucleotide of primer P1; and (d) exposing the cleaved polynucleotide to conditions that promote the dissociation of the cleaved portions of primer PI from a terminal end. The labile nucleotide may be dUTP, wherein the single-stranded cleavage of the polynucleotide at the site of the labile nucleotide occurs by treatment with uracil N-glycosylase.

    Abstract translation: 公开了用于产生至少一个部分双链靶核酸的方法，其在末端含有至少一个单链区域。 该方法包括以下步骤：（a）提供至少一种含有至少一个不稳定核苷酸的引物P1; （b）将至少一个靶核酸序列与P1结合以产生含有至少一个不稳定核苷酸的双链多核苷酸; （c）将双链多核苷酸暴露于在引物P1的至少一个不稳定核苷酸的位点处促进单链切割多核苷酸的条件; 和（d）将切割的多核苷酸暴露于促进引物PI的切割部分从末端解离的条件。 不稳定核苷酸可以是dUTP，其中在不稳定核苷酸位点处的多核苷酸的单链切割通过尿嘧啶N-糖基化酶的处理发生。

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