RNA MICROCHIP DETECTION USING NANOPARTICLE-ASSISTED SIGNAL AMPLIFICATION
    5.
    发明申请
    RNA MICROCHIP DETECTION USING NANOPARTICLE-ASSISTED SIGNAL AMPLIFICATION 审中-公开
    使用纳米辅助信号放大的RNA微RNA检测

    公开(公告)号:WO2014165814A1

    公开(公告)日:2014-10-09

    申请号:PCT/US2014/033062

    申请日:2014-04-04

    Inventor: HUANG, Zhen

    Abstract: Disclosed are methods and materials for detecting RNA in a sample. In some forms, the method involves (a) bringing into contact the sample and a probe array, (b) bringing into contact the probe array and a ribonuclease specific for RNA/DNA hybrids (such as RNase H), (c) bringing into contact the probe array, labeled nucleotides, and a nucleic acid polymerase capable of extending a RNA strand using a DNA template and capable of incorporating the labeled nucleotides in the extension from the RNA strand (such as Klenow fragment DNA polymerase), and (d) detecting the labeled nucleotides in the extended nucleic acid strand. The probe array comprises one or more chimeric probes. The chimeric probes comprise a DNA region and a RNA region, where the DNA region and the RNA region are contiguous and where the DNA region is 5' of the RNA region. The chimeric probe can also include a second DNA region. The second DNA region can also be contiguous with the RNA region and can be 3' of the RNA region.

    Abstract translation: 公开了用于检测样品中的RNA的方法和材料。 在某些形式中,该方法包括(a)使样品和探针阵列接触,(b)使探针阵列和RNA / DNA杂合物(例如RNase H)特异性的核糖核酸酶接触,(c)引入 接触探针阵列,标记的核苷酸和能够使用DNA模板延伸RNA链的核酸聚合酶,并且能够从RNA链延伸引入标记的核苷酸(例如Klenow片段DNA聚合酶),和(d) 检测延伸的核酸链中的标记的核苷酸。 探针阵列包含一个或多个嵌合探针。 嵌合探针包含DNA区域和RNA区域,其中DNA区域和RNA区域是连续的,其中DNA区域是RNA区域的5'。 嵌合探针也可以包括第二DNA区。 第二个DNA区也可以与RNA区连续,可以是RNA区的3'。

    절단 가능한 프로브를 이용한 만성골수성백혈병 유전자의 멀티플렉스 검출 방법
    6.
    发明申请
    절단 가능한 프로브를 이용한 만성골수성백혈병 유전자의 멀티플렉스 검출 방법 审中-公开
    使用可切割探针多次检测慢性髓性白血病基因的方法

    公开(公告)号:WO2013105775A1

    公开(公告)日:2013-07-18

    申请号:PCT/KR2013/000140

    申请日:2013-01-09

    Abstract: 일 구체예는 일 양상은 만성골수성백혈병 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머 쌍 및 상기 프라이머쌍에 의해 증폭되는 만성골수성백혈병 증폭 산물의 내부에 특이적으로 결합하는 절단 가능한 프로브를 포함하는 만성골수성백혈병 유전자의 발현량을 검출하는 검출용 키트를 제공하는 것이고, 다른 구체예는 일 구체예 따른 검출용 키트를 이용하여 시료에 있는 만성골수성백혈병 유전자의 발현량을 측정하는 것이다. 구체예의 방법을 이용할 경우, 낮은 농도의 만성골수성백혈병 유전자의 발현량도 효율적으로 실시간으로 검출하여 만성골수성백혈병 진단 및 예후 진단에 유용하게 이용할 수 있다.

    Abstract translation: 一个具体实施例的一种形式提供了用于检测慢性骨髓性白血病基因表达量的检测试剂盒,其包括特异性偶联于慢性骨髓性白血病基因的一对引物,以及特异性偶联于慢性骨髓瘤内的可切割探针 白血病扩增产物由一对引物扩增。 在另一个具体实例中,通过使用根据一个具体实施例的检测试剂盒来测量样品中慢性骨髓性白血病基因表达的量。 当使用根据具体实施例的方法时,即使以低浓度也可以实时有效地检测慢性骨髓性白血病基因表达的量,因此可用于慢性骨髓性白血病诊断和预后。

    核酸鎖の結合および修飾方法
    10.
    发明申请
    核酸鎖の結合および修飾方法 审中-公开
    核酸酸束结合方法和核酸酸碱改性方法

    公开(公告)号:WO2011052013A1

    公开(公告)日:2011-05-05

    申请号:PCT/JP2009/005755

    申请日:2009-10-29

    CPC classification number: C12Q1/6827 C12Q2561/125 C12Q2521/501 C12Q2525/121

    Abstract: 【課題】 第一の核酸鎖と第二の核酸鎖と第三の核酸鎖とを用いて、短時間で反応が終了し、且つ放射性アイソトープを使用せず安全に実験を遂行できる、第一の核酸鎖と第二の核酸鎖との結合方法およびそれを利用した核酸鎖の標識方法を提供すること。 【解決手段】 第一の核酸鎖の3'ヒドロシル基と、第二の核酸鎖の5'リン酸基とを結合する方法であって、前記第一の核酸鎖の少なくとも一部と前記第二の核酸鎖の少なくとも一部とに相補的に結合する第三の核酸鎖の存在下において、少なくとも1以上のリボヌクレオチドを3'末端に有する前記第一の核酸鎖と前記第三の核酸鎖との塩基対形成、および前記第二の核酸鎖と前記第三の核酸鎖との塩基対形成を、同時にまたは別々に行う工程と、その工程で得られた前記第一の核酸鎖、前記第二の核酸鎖、前記第三の核酸鎖の三者の核酸鎖の混合物に、EC6.5.1.3に分類され且つ二本鎖核酸ニック修復活性を有するRNAリガーゼを添加する工程を有し、前記第三の核酸鎖は、前記第一の核酸鎖の3'末端の塩基を含む少なくとも1以上の連続する塩基配列と相補的な塩基配列を有し、また前記第三の核酸鎖は、前記第二の核酸鎖の5'末端の塩基を含む少なくとも1以上の連続する塩基配列と相補的な塩基配列を有し、且つ前記第二の核酸鎖に対して相補的となる前記第三の核酸鎖における塩基配列が、前記第二の核酸鎖の鎖長の1/2未満となるものであることを特徴とする方法。

    Abstract translation: 公开了将第一核酸链与第二核酸链结合的方法,其中可以在短的反应时间内通过使用第一核酸链,第二核酸链和第三核酸来安全地进行实验 而不需要使用任何放射性同位素。 还公开了利用结合方法来标记核酸链的方法。 具体公开的是在第二核酸链中具有至少一个在3'末端的核糖核苷酸与5'-磷酸基团的第一核酸链中的3'-羟基结合的方法。 该方法的特征在于包括以下步骤:在第一核酸链和能够与第一核酸链的至少一部分互补的第三核酸链和第一核酸链的至少一部分之间进行碱基对形成 第二核酸链和第二核酸链与第三核酸链之间的碱基对形成,在第三核酸链的存在下同时或分开; 并加入分类为EC6.5.1.3的RNA连接酶,并具有将双链核酸中的切口修复到前述步骤中获得的第一,第二和第三核酸链的混合物的活性,其中 第三核酸链具有与由包含位于第一核酸链的3'末端的核苷酸的一个或多个连续核苷酸组成的核苷酸序列互补的核苷酸序列,并且还具有与由1个核苷酸组成的核苷酸序列互补的核苷酸序列 或更多连续的核苷酸,包括位于第二核酸链的5'端的核苷酸,并且其中包含在第三核酸链中并与第二核酸链互补的核苷酸序列的长度小于 第二核酸链的长度的一半。

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