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公开(公告)号：CN109920485B
公开(公告)日：2023-10-31
申请号：CN201910202272.2
申请日：2019-03-18
申请人： 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号： G16B30/00
摘要： 本发明公开了对测序序列进行变异模拟的方法及其应用，其中，对测序序列进行变异模拟的方法包括：获取待模拟区域的碱基序列；将所述碱基序列进行变异状态标记，以便得到标记后的特征串；选取待添加的变异；将所述待添加的变异整合至所述标记后的特征串上，以便得到添加变异后的特征串；以及将所述添加变异后的特征串进行碱基还原，以便得到变异模拟后的序列。该方法通过对碱基序列的变异状态进行标记，设定碱基的变异类型，从而对各种变异进行模拟，变异模拟的方法简单，生成速度快，并能根据需要设计特殊的变异组合用于测试，变异模拟后的序列的仿真程度高。
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公开(公告)号：CN111073952B
公开(公告)日：2023-09-22
申请号：CN201910202577.3
申请日：2019-07-15
申请人： 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C40B50/06
摘要： 本发明公开了构建DNA文库的方法及其应用。其中，该方法包括将DNA样本进行末端修复后，利用耐高温聚合酶对DNA样本进行加腺苷酸尾处理，以便得到加尾后的DNA，其中，所述末端修复和所述加腺苷酸尾处理是连续进行的；以及将所述加尾后的DNA进行接头连接处理，以便得到连接产物，DNA文库其中，所述末端修复和加腺苷酸尾处理的条件是：27‑37摄氏度，5‑30分钟；70‑75摄氏度，10‑20分钟。该方法末端修复和加腺苷酸尾处理连续进行，中间无需纯化处理，稳定性好，同时还显著缩短了反应时间和反应流程。
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公开(公告)号：CN110021357B
公开(公告)日：2021-06-04
申请号：CN201810256018.6
申请日：2018-03-27
申请人： 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号： G16B30/00
摘要： 本发明涉及一种模拟癌症基因组测序数据生成装置，其包括人参考基因组序列位置信息获取模块、捕获区域参考基因组序列获取模块、癌症基因组变异数据模拟模块、模拟癌症基因组测序数据生成模块以及模拟癌症基因组测序数据输出模块。根据本发明，提供了一种能够对各种类型的变异进行模拟、使得生成的模拟测序数据能够适用于评估各种检测软件的性能的算法及装置。
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公开(公告)号：CN111100905B
公开(公告)日：2021-04-06
申请号：CN201911354966.4
申请日：2019-12-25
申请人： 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806
摘要： 本发明公开了缓冲液及其应用，其中，该缓冲液包括：33‑66mM Tris缓冲液，1.6‑5mM二价阳离子、25‑75mM一价阳离子、0.5‑10mM二硫苏糖醇(DTT)、5‑15％PEG4000‑8000和0.5‑2mM ATP，pH值为7‑9。该缓冲液能提高连接反应效率，增加底物的转化率，降低连接反应的错配率，并且兼容性好，对连接酶的抑制作用小，同时，显著降低体系用酶量，从而降低了实验的成本。
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公开(公告)号：CN109801677A
公开(公告)日：2019-05-24
申请号：CN201811636702.3
申请日：2018-12-29
申请人： 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达生命科学研究院 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
摘要： 公开了一种用于染色体异常检测的测序数据自动化分析方法、装置和电子设备。该方法包括：获取原始数据；从用户接收分析指令；基于所述分析指令从所述原始数据获取批次数据；将所述批次数据拆分为样本数据；将拆分后的样本数据进行数据质控；以及，对数据质控成功的每条所述样本数据进行染色体非整倍体及基因微缺失分析以获得分析结果。这样，能够基于用户指令直接从原始数据获得染色体非整倍体及基因微缺失分析结果，从而降低染色体分析的人力和时间成本并提高易用性。
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公开(公告)号：CN111383717B
公开(公告)日：2024-10-18
申请号：CN201911092196.0
申请日：2019-11-11
摘要： 本发明提供一种构建生物信息分析参照数据集的方法，其包括：获取多个参照样本的测序数据，将所有参照样本的测序数据组成初始参照数据集，对所述初始参照数据集进行分类处理，得到两个以上的参照数据子集，将所述任一个参照数据子集作为一个生物信息分析参照数据集。
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公开(公告)号：CN113026113B
公开(公告)日：2023-08-29
申请号：CN201911353778.X
申请日：2019-12-25
IPC分类号： C40B50/06
摘要： 本发明公开了缓冲液组合物及其应用，其中，该缓冲液组合物包括：通用缓冲液，所述通用缓冲液包括5‑25mMol通用Tris缓冲液、5‑20mMol通用二价阳离子、75‑150mMol通用一价阳离子、0.05‑2质量％表面活性剂和0.5‑2mMol二硫苏糖醇(DTT)，pH8‑10；以及连接缓冲液，所述连接缓冲液包括33‑66mM连接Tris缓冲液，0.5‑5mM连接二价阳离子、0.5‑10mM二硫苏糖醇(DTT)、5‑15％PEG4000‑8000和0.5‑2mM ATP，pH值为7‑9。由此，该缓冲液组合物能用于多样本的文库构建，并且，反应时间短，转化率高，错配率低。
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公开(公告)号：CN111321201B
公开(公告)日：2021-07-30
申请号：CN201911373203.4
申请日：2019-12-27
申请人： 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12N15/11 , C12Q1/6869
摘要： 本发明公开了制备用于测序的核酸的方法及其应用，其中，制备用于测序的核酸的方法包括：提供第一序列，所述第一序列包含靶序列和第一重组酶识别序列；提供第二序列，所述第二序列包括：中间段：所述中间段形成至少一个双链体区域，且含有第二重酶识别序列，且所述第一重组酶识别序列与所述第二重酶识别序列具有至少一个相同的酶切序列；两个接头段：所述两个接头段分别位于所述中间段的端部，且每个所述接头段含有至少一个单链体区域，且其中一个接头段含有至少一个引物结合位点；以及将所述第一序列和所述第二序列接触，进行重组反应，以便获得所述用于测序的核酸，所述用于测序的核酸含有所述靶序列。
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公开(公告)号：CN113026114A
公开(公告)日：2021-06-25
申请号：CN201911353781.1
申请日：2019-12-25
申请人： 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号： C40B50/06
摘要： 本发明公开了缓冲液及其应用，其中，该缓冲液包括：5‑25mM Tris缓冲液、5‑20mM二价阳离子、75‑150mM一价阳离子、0.05‑2质量％表面活性剂和0.5‑2mM二硫苏糖醇，pH8‑10。该缓冲液的兼容性好，稳定性高，适用于文库构建过程中的多步反应，使文库构建过程中的多步反应可以连续进行，无需纯化，显著降低了反应时间，并且，有利于提高构建DNA文库的方法的效率和稳定性，同时，对T4DNA连接酶无明显的抑制作用。
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公开(公告)号：CN111383714A
公开(公告)日：2020-07-07
申请号：CN201910202238.5
申请日：2019-03-18
申请人： 安诺优达基因科技(北京)有限公司 , 安诺优达生命科学研究院
摘要： 本发明公开了模拟目标疾病仿真测序文库的方法及其应用，其中，该模拟目标疾病仿真测序文库的方法能根据需要得到不同体系和胚系变异特征、杂合/纯合比例和不同患病序列纯度，并能准确地模拟出接近真实的捕获测序条件下目标区域的深度波动，从而更加真实地模拟出了捕获测序条件下的下机数据。并且，该方法既能模拟全基因组下机数据，也能模拟捕获测序下机数据，适用范围广。同时，该方法运行速度快，能够在较短的时间内生成所需的模拟序列，并且模拟得到的序列的仿真程度高。
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