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公开(公告)号：CN103361406A
公开(公告)日：2013-10-23
申请号：CN201210095970.5
申请日：2012-04-01
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
Abstract: 本发明涉及检测分析领域，特别涉及利用油品中的核酸序列信息对油品进行标识，区分以及质量检测的方法。本发明通过测序至少部分核酸分子或片段的至少部分序列信息，基于该序列信息对油品进行标识，获得标识物。在标识物的基础上实现对油品的标识、区分和质量检测。本发明的方法灵敏度高、适用性强，可以实现高通量。
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公开(公告)号：CN102839168A
公开(公告)日：2012-12-26
申请号：CN201210269087.3
申请日：2012-07-31
Applicant: 深圳华大基因研究院
Abstract: 本发明提出了探针及其制备方法和应用。其中，制备探针的方法包括：将DNA样本进行片段化，以便获得第一DNA片段；将第一DNA片段进行平端化，以便获得经过平端化的第一DNA片段；将经过平端化的第一DNA片段与接头进行连接，以便获得连接接头的第一DNA片段；利用PCR引物组对连接接头的第一DNA片段进行扩增，以便得到第一扩增产物，该PCR引物组包括第一PCR引物和第二PCR引物，该第一PCR引物和第二PCR引物的5’末端碱基均被生物素标记，该第一扩增产物构成双链DNA探针。利用该方法得到的探针，能够有效地用于降低宏基因组构建文库中宿主基因组DNA的污染。
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公开(公告)号：CN106715714A
公开(公告)日：2017-05-24
申请号：CN201480082163.7
申请日：2014-10-17
Applicant: 深圳华大基因研究院
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12N15/1093 , C12N15/10 , C12Q1/68 , C12Q1/6806 , C12Q1/6853 , C12Q1/686 , C40B40/08 , C40B50/06 , C12Q2521/501 , C12Q2525/155 , C12Q2525/179 , C12Q2525/186 , C12Q2535/122
Abstract: 本发明提供了用于核酸随机片段化的引物及核酸随机片段化方法。所述引物由若干条上游随机引物和下游随机引物组成；上游随机引物序列组成为：5’‑X‑Y‑3’；下游随机引物序列组成为：5’‑P‑Y’‑X’‑close‑3’；Y和Y’为随机序列，X为测序平台5’端接头全部或部分序列，X’为测序平台5’端接头全部或部分序列，P为磷酸化修饰，close为封闭修饰。本发明的引物利用上下游随机引物的双随机锚定，能对DNA样品进行随机打断。
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公开(公告)号：CN106319032A
公开(公告)日：2017-01-11
申请号：CN201510355193.7
申请日：2015-06-24
Applicant: 深圳华大基因研究院
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q1/48 , C12Q2531/125 , C12Q2563/107
Abstract: 本发明公开了一种测定Phi29 DNA聚合酶活性的方法和滚环测序方法，包括：以环状单链DNA为模板，在扩增引物的存在下，以Phi29 DNA聚合酶引发滚环复制，产生大量连续的单链DNA拷贝；然后将荧光分子掺入扩增产物，通过检测扩增产物的荧光信号来定量所产生的单链DNA拷贝数量，从而计算出Phi29 DNA聚合酶的活性。本发明的方法无放射性污染，具有简便、快速、高灵敏等优点，可用于高通量、自动化的聚合酶活筛选。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN104834833B
公开(公告)日：2017-12-05
申请号：CN201410048518.2
申请日：2014-02-12
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种单核苷酸多态性SNP的检测方法及装置，包括获取含有核酸序列信息的读段序列；将读段序列与参考序列进行比对，获取比对上的读段序列；将比对上的读段序列按照碱基序列5’端比对位置划分为不同的冗余读段序列组；对不同冗余读段序列组中的每个冗余读段序列组中的每个读段序列进行计分，依据读段序列的得分从一个冗余读段序列组中得到一个代表读段序列组；判断代表读段序列组是否存在支持假阴性SNP的读段序列；若判断结果为是，则从代表读段序列组中去除支持假阴性SNP的代表读段序列，获得不支持假阴性SNP的代表读段序列组；对不支持假阴性SNP的代表读段序列组进行SNP检测。通过本发明提供的SNP检测方法，可以提高测序分析结果准确率。
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公开(公告)号：CN104834833A
公开(公告)日：2015-08-12
申请号：CN201410048518.2
申请日：2014-02-12
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种单核苷酸多态性SNP的检测方法及装置，包括获取含有核酸序列信息的读段序列；将读段序列与参考序列进行比对，获取比对上的读段序列；将比对上的读段序列按照碱基序列5’端比对位置划分为不同的冗余读段序列组；对不同冗余读段序列组中的每个冗余读段序列组中的每个读段序列进行计分，依据读段序列的得分从一个冗余读段序列组中得到一个代表读段序列组；判断代表读段序列组是否存在支持假阴性SNP的读段序列；若判断结果为是，则从代表读段序列组中去除支持假阴性SNP的代表读段序列，获得不支持假阴性SNP的代表读段序列组；对不支持假阴性SNP的代表读段序列组进行SNP检测。通过本发明提供的SNP检测方法，可以提高测序分析结果准确率。
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公开(公告)号：CN103902852B
公开(公告)日：2017-03-22
申请号：CN201410108121.8
申请日：2014-03-21
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
IPC: G06F19/20
Abstract: 本发明公开了一种基因表达的定量方法和装置，包括：获取含有核酸序列信息的读段序列；将读段序列与所有参考基因进行比对，获取比对上的读段序列；对比对上的读段序列进行过滤，舍去软剪切比例超过第一预设值，序列长度小于第二预设值，以及比对得分小于第三预设值的读段序列，软剪切比例是指没有比对上的碱基数目占该读段序列总碱基数目的比例；比对得分是按照每个读段序列与参考基因的匹配程度以及读段序列的长度而确定的数值；对于已过滤的读段序列，使用RPKM对目标基因表达进行定量。通过将读段序列与参考基因进行比对，而不是现有的与参考基因组进行比对，可以简化比对过程，提高比对效率。
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公开(公告)号：CN103902852A
公开(公告)日：2014-07-02
申请号：CN201410108121.8
申请日：2014-03-21
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
IPC: G06F19/20
Abstract: 本发明公开了一种基因表达的定量方法和装置，包括：获取含有核酸序列信息的读段序列；将读段序列与所有参考基因进行比对，获取比对上的读段序列；对比对上的读段序列进行过滤，舍去软剪切比例超过第一预设值，序列长度小于第二预设值，以及比对得分小于第三预设值的读段序列，软剪切比例是指没有比对上的碱基数目占该读段序列总碱基数目的比例；比对得分是按照每个读段序列与参考基因的匹配程度以及读段序列的长度而确定的数值；对于已过滤的读段序列，使用RPKM对目标基因表达进行定量。通过将读段序列与参考基因进行比对，而不是现有的与参考基因组进行比对，可以简化比对过程，提高比对效率。
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公开(公告)号：CN107075561A
公开(公告)日：2017-08-18
申请号：CN201480082162.2
申请日：2014-10-13
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6806 , C12Q1/6855 , C12Q1/686 , C12Q2525/179 , C12Q2525/191 , C12Q2535/122
Abstract: 本发明公开了一种核酸片段化方法和序列组合，包括如下步骤：使用单链5’端延伸引物对变性后的核酸进行退火、延伸反应，其中单链5’端延伸引物包括5’端的测序平台接头序列和相连的随机序列，随机序列在变性后的核酸的随机位点发生退火；将双链3’端接头序列定向连接到延伸反应生成的核酸的3’端，变性纯化后得到片段化的包含两端接头序列的单链核酸。
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