公开(公告)号：US20160060663A1

公开(公告)日：2016-03-03

申请号：US14843525

申请日：2015-09-02

申请人： Katrin GRAMMANN ,  Jan Wolter ,  Liv Reinecke ,  Steffen Schaffer ,  Eileen C. Spindler ,  Wendy K. Ribble ,  Brittany L. Prather ,  Catherine B. Poor ,  Tanya Warnecke Lipscomb ,  Hans H. Liao ,  Dave A. Hogsett ,  Ronald J. Evans

发明人： Katrin GRAMMANN ,  Jan Wolter ,  Liv Reinecke ,  Steffen Schaffer ,  Eileen C. Spindler ,  Wendy K. Ribble ,  Brittany L. Prather ,  Catherine B. Poor ,  Tanya Warnecke Lipscomb ,  Hans H. Liao ,  Dave A. Hogsett ,  Ronald J. Evans

IPC分类号： C12P7/64 ,  C12N9/10

CPC分类号： C12P7/6436 ,  C12N9/1029 ,  C12Y203/01041 ,  C12Y203/01075

摘要： A microbial cell is used for producing at least one fatty acid ester, wherein the cell is genetically modified to contain (i) at least one first genetic mutation that enables the cell to produce at least one fatty acid and/or acyl coenzyme A (CoA) thereof by increased enzymatic activity in the cell relative to the wild type cell of malonyl-CoA dependent and malonyl-ACP independent fatty acyl-CoA metabolic pathway, wherein the fatty acid contains at least 5 carbon atoms; and (ii) a second genetic mutation that increases the activity of at least one wax ester synthase in the cell relative to the wild type cell and the wax ester synthase has sequence identity of at least 50% to a polypeptide of SEQ ID NO: 1-8 and combinations thereof or to a functional fragment of any of the polypeptides for catalyzing the conversion of fatty acid and/or acyl coenzyme A thereof to the fatty acid ester.

摘要翻译： 微生物细胞用于生产至少一种脂肪酸酯，其中所述细胞被遗传修饰以包含（i）至少一种能使细胞产生至少一种脂肪酸和/或酰基辅酶A（CoA）的第一遗传突变 ），其相对于丙二酰辅酶A依赖性和丙二酰-ACP无关脂肪酰基辅酶A代谢途径的野生型细胞增加细胞中的酶活性，其中所述脂肪酸含有至少5个碳原子; 和（ii）增加细胞中至少一种蜡酯合酶相对于野生型细胞的活性的第二种遗传突变，并且蜡酯合成酶与SEQ ID NO：1的多肽具有至少50％的序列同一性 -8及其组合或任何多肽的功能片段，用于催化脂肪酸和/或其酰基辅酶A转化为脂肪酸酯。

公开(公告)号：US20070218533A1

公开(公告)日：2007-09-20

申请号：US11686864

申请日：2007-03-15

申请人： Ryan Gill ,  Michael Lynch ,  Tanya Warnecke

发明人： Ryan Gill ,  Michael Lynch ,  Tanya Warnecke

IPC分类号： C12P7/06 ,  C12N15/74 ,  C12N1/21

CPC分类号： C12P7/065 ,  C07K14/245 ,  Y02E50/17

摘要： Embodiments of the present invention provide methods and compositions for microorganisms having increased alcohol tolerance. In certain embodiments, methods for using such microorganisms, and methods for identifying gene or genetic regions responsible for increased alcohol tolerance are contemplated.

摘要翻译： 本发明的实施方案提供了具有增加的耐酒精性的微生物的方法和组合物。 在某些实施方案中，考虑了使用这些微生物的方法，以及用于鉴定负责增加的耐酒精性的基因或遗传区域的方法。

公开(公告)号：US07987056B2

公开(公告)日：2011-07-26

申请号：US11231018

申请日：2005-09-20

申请人： Ryan T. Gill ,  Michael D. Lynch ,  Tanya Warnecke

发明人： Ryan T. Gill ,  Michael D. Lynch ,  Tanya Warnecke

IPC分类号： G06F19/00 ,  C12Q1/68 ,  C12N15/00

CPC分类号： C07K14/245 ,  C12N15/1079

摘要： The present disclosure concerns methods and compositions relating to mixed-library parallel gene trait mapping. In particular embodiments, the methods concern quantitative microarray hybridization techniques for genome-wide identification of trait conferring genes. In other embodiments, the compositions concern genetic elements that confer or are associated with a trait. In an exemplary embodiment, the trait is enhanced growth rate. In another exemplary embodiment, genetic elements that confer enhanced bacterial growth rate comprise part or all of the sequences of SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4 or SEQ ID NO:5. In other embodiments, the genetic elements that confer enhanced bacterial growth rate correspond to the YliF, adrA, yeaP, yddV or ydeH genes of E. coli.

摘要翻译： 本公开涉及与混合型库并行基因性状图谱相关的方法和组合物。 在具体实施方案中，该方法涉及定性微阵列杂交技术，用于全基因组鉴定赋予特性的基因。 在其它实施方案中，组合物涉及赋予或与性状相关的遗传元件。 在一个示例性实施例中，性状是增强的增长率。 在另一个示例性实施方案中，赋予增强的细菌生长速率的遗传元件包含SEQ ID NO：1，SEQ ID NO：2，SEQ ID NO：3，SEQ ID NO：4或SEQ ID NO：5的部分或全部序列 。 在其他实施方案中，赋予增强的细菌生长速率的遗传元件对应于大肠杆菌的YliF，adrA，yeaP，yddV或ydeH基因。

公开(公告)号：US07842485B2

公开(公告)日：2010-11-30

申请号：US11686864

申请日：2007-03-15

申请人： Ryan T. Gill ,  Michael D. Lynch ,  Tanya Warnecke

发明人： Ryan T. Gill ,  Michael D. Lynch ,  Tanya Warnecke

IPC分类号： C12P7/06 ,  C12P7/16 ,  C12N15/74 ,  C12N1/20

CPC分类号： C12P7/065 ,  C07K14/245 ,  Y02E50/17

摘要： Embodiments of the present invention provide methods and compositions for microorganisms having increased alcohol tolerance. In certain embodiments, methods for using such microorganisms, and methods for identifying gene or genetic regions responsible for increased alcohol tolerance are contemplated.

摘要翻译： 本发明的实施方案提供了具有增加的耐酒精性的微生物的方法和组合物。 在某些实施方案中，考虑了使用这些微生物的方法，以及用于鉴定负责增加的耐酒精性的基因或遗传区域的方法。

公开(公告)号：US20060084098A1

公开(公告)日：2006-04-20

申请号：US11231018

申请日：2005-09-20

申请人： Ryan Gill ,  Michael Lynch ,  Tanya Warnecke

发明人： Ryan Gill ,  Michael Lynch ,  Tanya Warnecke

IPC分类号： C40B30/06 ,  C40B40/08

CPC分类号： C07K14/245 ,  C12N15/1079

摘要： The present disclosure concerns methods and compositions relating to mixed-library parallel gene trait mapping. In particular embodiments, the methods concern quantitative microarray hybridization techniques for genome-wide identification of trait conferring genes. In other embodiments, the compositions concern genetic elements that confer or are associated with a trait. In an exemplary embodiment, the trait is enhanced growth rate. In another exemplary embodiment, genetic elements that confer enhanced bacterial growth rate comprise part or all of the sequences of SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4 or SEQ ID NO:5. In other embodiments, the genetic elements that confer enhanced bacterial growth rate correspond to the YliF, adrA, yeaP, yddV or ydeH genes of E. coli.

摘要翻译： 本公开涉及与混合型库并行基因性状图谱相关的方法和组合物。 在具体实施方案中，该方法涉及定性微阵列杂交技术，用于全基因组鉴定赋予性状的基因。 在其它实施方案中，组合物涉及赋予或与性状相关的遗传元件。 在一个示例性实施例中，性状是增强的增长率。 在另一个示例性实施方案中，赋予增强的细菌生长速率的遗传元件包含SEQ ID NO：1，SEQ ID NO：2，SEQ ID NO：3，SEQ ID NO：4或SEQ ID NO：5的部分或全部序列 。 在其他实施方案中，赋予增强的细菌生长速率的遗传元件对应于大肠杆菌的YliF，adrA，yeaP，yddV或ydeH基因。