公开(公告)号：US20240294974A1

公开(公告)日：2024-09-05

申请号：US18649255

申请日：2024-04-29

申请人： 10x Genomics, Inc.

发明人： Christina Galonska ,  Ariel Royall ,  Malte Kuhnemund

IPC分类号： C12Q1/6841 ,  G01N1/30

CPC分类号： C12Q1/6841 ,  G01N1/30

摘要： Provided herein are methods, compositions, and kits for the spatial analysis of target nucleic acids, or complements thereof, by their 5′ end.

公开(公告)号：US20240175080A1

公开(公告)日：2024-05-30

申请号：US18404317

申请日：2024-01-04

申请人： 10x Genomics, Inc.

发明人： Christina Galonska ,  Marco Mignardi

IPC分类号： C12Q1/6837 ,  C12Q1/6841 ,  C12Q1/6855

CPC分类号： C12Q1/6837 ,  C12Q1/6841 ,  C12Q1/6855

摘要： Provided herein are methods of detecting an analyte of interest to interrogate spatial gene expression in a sample.

公开(公告)号：US11332790B2

公开(公告)日：2022-05-17

申请号：US17220529

申请日：2021-04-01

申请人： 10x Genomics, Inc.

发明人： James Michael Chell ,  Marlon Stoeckius ,  Jonathan Alles ,  Caroline Julie Gallant ,  Christina Galonska ,  Felice Alessio Bava ,  Layla Katiraee

IPC分类号： C12Q1/6876 ,  C12Q1/6811 ,  C12Q1/25 ,  C12Q1/6816 ,  C12Q1/6841 ,  C12Q1/6851

摘要： Provided herein are methods of detecting an analyte of interest to interrogate spatial gene expression in a sample using RNA-templated ligation.

公开(公告)号：US20230080543A1

公开(公告)日：2023-03-16

申请号：US17882241

申请日：2022-08-05

申请人： 10x Genomics, Inc.

发明人： Layla Katiraee ,  Michael Schnall-Levin ,  Christina Galonska ,  Marlon Stoeckius

IPC分类号： C12Q1/6837 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6876

摘要： Provided herein are methods of identifying a methylation status of an analyte in a biological sample. Also provided herein are methods that combine identifying the methylation status with spatial technology to identify the location of a methylation status in a biological sample.

公开(公告)号：US20230064372A1

公开(公告)日：2023-03-02

申请号：US17896520

申请日：2022-08-26

申请人： 10x Genomics, Inc.

发明人： James Michael Chell ,  Marlon Stoeckius ,  Jonathan Alles ,  Caroline Julie Gallant ,  Christina Galonska ,  Layla Katiraee

IPC分类号： C12Q1/6876 ,  C12Q1/6811 ,  C12Q1/25 ,  C12Q1/6816 ,  C12Q1/6841 ,  C12Q1/6851

摘要： Provided herein are methods of detecting an analyte of interest to interrogate spatial gene expression in a sample using RNA-templated ligation.

公开(公告)号：US20220127666A1

公开(公告)日：2022-04-28

申请号：US17573119

申请日：2022-01-11

申请人： 10x Genomics, Inc.

发明人： Layla Katiraee ,  Michael Schnall-Levin ,  Christina Galonska ,  Marlon Stoeckius

IPC分类号： C12Q1/6837 ,  C12Q1/6876 ,  C12Q1/6806

摘要： Provided herein are methods of identifying a methylation status of an analyte in a biological sample. Also provided herein are methods that combine identifying the methylation status with spatial technology to identify the location of a methylation status in a biological sample.

公开(公告)号：US11981958B1

公开(公告)日：2024-05-14

申请号：US17406824

申请日：2021-08-19

申请人： 10x Genomics, Inc.

发明人： Christina Galonska

IPC分类号： C12Q1/6827 ,  C12Q1/6876

CPC分类号： C12Q1/6827 ,  C12Q1/6876 ,  C12Q2600/156

摘要： Provided herein are methods of detecting an analyte of interest to interrogate spatial gene expression in a sample using DNA templated ligation. For example, provided herein are methods for detecting an gDNA analyte in a biological sample where (i) the first RTL probe and second RTL probe hybridize to adjacent sequences on the gDNA analyte, (ii) enzyme-mediate cleavage of a 5′ FLAP results in release of the 5′ FLAP, and (iii) the sequence of the 5′ FLAP is determined and used to detect the gDNA analyte in the biological sample.

公开(公告)号：US20230340576A1

公开(公告)日：2023-10-26

申请号：US18302421

申请日：2023-04-18

申请人： 10x Genomics, Inc.

发明人： Layla Katiraee ,  Michael Schnall-Levin ,  Christina Galonska ,  Marlon Stoeckius

IPC分类号： C12Q1/6837 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6876

CPC分类号： C12Q1/6837 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6876 ,  C12Q2600/154

摘要： Provided herein are methods of identifying a methylation status of an analyte in a biological sample. Also provided herein are methods that combine identifying the methylation status with spatial technology to identify the location of a methylation status in a biological sample.

公开(公告)号：US20230220455A1

公开(公告)日：2023-07-13

申请号：US18179795

申请日：2023-03-07

申请人： 10x Genomics, Inc.

发明人： Christina Galonska ,  Marco Mignardi

IPC分类号： C12Q1/6837 ,  C12Q1/6855 ,  C12Q1/6841

CPC分类号： C12Q1/6837 ,  C12Q1/6855 ,  C12Q1/6841

摘要： Provided herein are methods of detecting an analyte of interest to interrogate spatial gene expression in a sample.

公开(公告)号：US20230160008A1

公开(公告)日：2023-05-25

申请号：US18100133

申请日：2023-01-23

申请人： 10x Genomics, Inc.

发明人： James Michael Chell ,  Marlon Stoeckius ,  Jonathan Alles ,  Caroline Julie Gallant ,  Christina Galonska ,  Felice Alessio Bava ,  Layla Katiraee

IPC分类号： C12Q1/6876 ,  C12Q1/6811 ,  C12Q1/25 ,  C12Q1/6816 ,  C12Q1/6841 ,  C12Q1/6851

CPC分类号： C12Q1/6876 ,  C12Q1/6811 ,  C12Q1/25 ,  C12Q1/6816 ,  C12Q1/6841 ,  C12Q1/6851

摘要： Provided herein are methods of detecting an analyte of interest to interrogate spatial gene expression in a sample using RNA-templated ligation.