公开(公告)号：US5786169A

公开(公告)日：1998-07-28

申请号：US461859

申请日：1995-06-05

申请人： Roger Brent ,  Jeno Gyuris ,  Erica Golemis

发明人： Roger Brent ,  Jeno Gyuris ,  Erica Golemis

IPC分类号： G01N33/53 ,  A61K38/00 ,  C07K14/39 ,  C07K14/47 ,  C07K16/14 ,  C07K16/18 ,  C12N1/19 ,  C12N9/12 ,  C12N9/16 ,  C12N15/09 ,  C12N15/10 ,  C12N15/12 ,  C12P21/02 ,  C12P21/08 ,  C12Q1/02 ,  C12Q1/68 ,  C12P21/06 ,  C12N15/00

CPC分类号： C12Q1/6897 ,  C07K14/4738 ,  C12N15/1055 ,  C12N9/1205 ,  C12N9/16 ,  A61K38/00 ,  C07K2319/00 ,  C07K2319/61 ,  C07K2319/71 ,  C07K2319/80

摘要： Disclosed is a method for determining whether a first protein is capable of physically interacting with a second protein. The method involves: (a) providing a host cell which contains (i) a reporter gene operably linked to a protein binding site; (ii) a first fusion gene which expresses a first fusion protein, the first fusion protein including the first protein covalently bonded to a binding moiety which is capable of specifically binding to the protein binding site; and (iii) a second fusion gene which expresses a second fusion protein, the second fusion protein including the second protein covalently bonded to a weak gene activating moiety; and (b) measuring expression of the reporter gene as a measure of an interaction between the first and the second proteins. Such a determination facilitates the isolation of the gene encoding the interacting protein. Also disclosed herein is recombinant Cdi1 polypeptide, nucleic acid encoding the Cdi1 polypeptide, and uses thereof.

摘要翻译： 公开了一种用于确定第一种蛋白质是否能够与第二种蛋白质物理相互作用的方法。 该方法包括：（a）提供宿主细胞，其包含（i）可操作地连接到蛋白质结合位点的报告基因; （ii）表达第一融合蛋白的第一融合基因，所述第一融合蛋白包括共价键合到能够特异性结合蛋白结合位点的结合部分的第一蛋白; 和（iii）表达第二融合蛋白的第二融合基因，所述第二融合蛋白包括与弱基因活化部分共价结合的第二蛋白质; 和（b）测量报告基因的表达作为第一和第二蛋白质之间相互作用的量度。 这样的测定有助于分离编码相互作用蛋白的基因。 本文还公开了重组Cdi1多肽，编码Cdi1多肽的核酸及其用途。

公开(公告)号：US5780262A

公开(公告)日：1998-07-14

申请号：US464051

申请日：1995-06-05

申请人： Roger Brent ,  Antonis S. Zervos

发明人： Roger Brent ,  Antonis S. Zervos

IPC分类号： C12N15/09 ,  A61K38/00 ,  C07K14/47 ,  C12N15/12 ,  C12P21/02 ,  C12P21/08 ,  C12Q1/18 ,  C12Q1/48 ,  C12Q1/68 ,  C12R1/91 ,  C12N5/10 ,  C12N15/54 ,  C12N15/63

CPC分类号： C07K14/47 ,  C12Q1/6886 ,  A61K38/00 ,  C12Q2600/136

摘要： Disclosed are substatially pure preparations of Max-Interacting (Mxi) polypeptides, DNA encoding such polypeptides, antibodies recognizing such polypeptides, and diagnostic and therapeutic methods utilizing such polypeptides.

摘要翻译： 公开了最大相互作用（Mxi）多肽的基本纯的制剂，编码这种多肽的DNA，识别这种多肽的抗体，以及利用这种多肽的诊断和治疗方法。

公开(公告)号：US5580721A

公开(公告)日：1996-12-03

申请号：US50198

申请日：1993-10-07

申请人： Roger Brent ,  Erica Golemis ,  Karen F. Lech ,  Catherine Anderson

发明人： Roger Brent ,  Erica Golemis ,  Karen F. Lech ,  Catherine Anderson

IPC分类号： C12N1/00 ,  C12N1/19 ,  C12N5/10 ,  C12N15/09 ,  C12Q1/68 ,  G01N33/50 ,  G01N33/68 ,  A61K38/16 ,  C12N15/62 ,  C12N15/85

CPC分类号： G01N33/5011 ,  C12Q1/6897 ,  G01N33/68

摘要： A method for the identification of compounds as inhibitors of oncoprotein action is described. A compound is identified as an inhibitor of oncoprotein action based on its ability to modulate the transcription of a reporter gene. Transcription of the reporter gene is dependent upon the binding of a fusion oncoprotein to a specific DNA binding element positioned upstream of the reporter gene promoter. The fusion oncoprotein contains a transcriptional regulatory domain from an oncoprotein and a DNA binding domain from a different protein.

摘要翻译： PCT No.PCT / US91 / 06839 Sec。 371日期：1993年10月7日 102（e）日期1993年10月7日PCT 1991年9月20日提交PCT描述了鉴定作为癌蛋白作用抑制剂的化合物的方法。 基于其调节报告基因转录的能力，化合物被鉴定为癌蛋白作用的抑制剂。 报告基因的转录取决于融合癌蛋白与位于报告基因启动子上游的特异性DNA结合元件的结合。 融合癌蛋白包含来自癌蛋白的转录调节结构域和来自不同蛋白质的DNA结合结构域。

公开(公告)号：US4833080A

公开(公告)日：1989-05-23

申请号：US808166

申请日：1985-12-12

申请人： Roger Brent ,  Mark S. Ptashne

发明人： Roger Brent ,  Mark S. Ptashne

IPC分类号： C07K14/245 ,  C07K14/39 ,  C12N15/81

CPC分类号： C12N15/81 ,  C07K14/245 ,  C07K14/39 ,  C07K2319/00 ,  C07K2319/80 ,  C07K2319/81

摘要： Regulation of eucaryotic gene expression is controlled by procaryotic peptides. The peptides recognize specific DNA sequences present in the gene, which may be derived from procaryotic genes, and either activate or repress gene transcription. Hybrid procaryotic peptides may be used containing both repressor and activator peptides.

摘要翻译： 真核基因表达的调控由原核肽控制。 肽识别存在于基因中的特异性DNA序列，其可以源自原核基因，并且激活或抑制基因转录。 可以使用包含阻抑物和活化肽的混合原核肽。

公开(公告)号：US10467534B1

公开(公告)日：2019-11-05

申请号：US15374971

申请日：2016-12-09

申请人： Roger Brent

发明人： Roger Brent ,  James Ashley

IPC分类号： G06N5/02 ,  G06K9/00 ,  G06K9/46 ,  G06T7/269 ,  G06F16/903

摘要： A method of identifying substances in a material handling work environment that analyzes sensor input from the environment with an image processor to extract features of the substance using optical flow and object recognition, and operates a vector modeler and a particle modeler to generate multiple predictions about particle movement within the substance based on existing data models for physical properties to generate multiple predictions of physical properties of the substance.

公开(公告)号：US06171792B2

公开(公告)日：2001-01-09

申请号：US09189653

申请日：1998-11-10

申请人： Roger Brent ,  C. Wilson Xu ,  Andrew R. Mendelsohn ,  Walter L. Lok

发明人： Roger Brent ,  C. Wilson Xu ,  Andrew R. Mendelsohn ,  Walter L. Lok

IPC分类号： C12Q100

CPC分类号： C07K14/4705 ,  C07K14/4738 ,  C07K14/82 ,  C07K2319/00 ,  C07K2319/61 ,  C07K2319/71 ,  C07K2319/80 ,  C12N15/1055 ,  C12N15/62 ,  C12N15/81 ,  C12Q1/025 ,  C12Q1/6897 ,  G01N33/566 ,  G01N33/581 ,  C12Q2565/201

摘要： Disclosed herein are methods for detecting complex protein interactions and protein functional relationships, and reagents for carrying out those methods.

摘要翻译： 本文公开了用于检测复合蛋白质相互作用和蛋白质功能关系的方法以及用于实施这些方法的试剂。

公开(公告)号：US20090130676A1

公开(公告)日：2009-05-21

申请号：US12079358

申请日：2008-03-26

申请人： Roger Brent ,  John M. McCoy ,  Timm H. Jessen ,  Chanxing Wilson Xu

发明人： Roger Brent ,  John M. McCoy ,  Timm H. Jessen ,  Chanxing Wilson Xu

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12N9/0036 ,  C07K2319/00 ,  C07K2319/35 ,  C07K2319/70 ,  C07K2319/71 ,  C07K2319/80 ,  C12N15/1055 ,  C12Q1/6897

摘要： Disclosed herein is a method of determining whether a first protein is capable of physically interacting with a second protein, involving: (a) providing a host cell which contains (i) a reporter gene operably linked to a protein binding site; (ii) a first fusion gene which expresses a first fusion protein, the first fusion protein including the first protein covalently bonded to a binding moiety which is capable of specifically binding to the protein binding site; and (iii) a second fusion gene which expresses a second fusion protein, the second fusion protein including the second protein covalently bonded to a gene activating moiety and being conformationally-constrained; and (b) measuring expression of the reporter gene as a measure of an interaction between the first and the second proteins. Also disclosed are methods for assaying protein interactions, and identifying antagonists and agonists of protein interactions. Proteins isolated by these methods are also discussed. Finally, populations of eukaryotic cells are disclosed, each cell having a recombinant DNA molecule encoding a conformationally-constrained intracellular peptide.

摘要翻译： 本文公开了一种确定第一蛋白质是否能够与第二蛋白质物理相互作用的方法，涉及：（a）提供宿主细胞，其包含（i）可操作地连接到蛋白质结合位点的报告基因; （ii）表达第一融合蛋白的第一融合基因，所述第一融合蛋白包括共价键合到能够特异性结合蛋白结合位点的结合部分的第一蛋白; 和（iii）表达第二融合蛋白的第二融合基因，所述第二融合蛋白包括共价键合到基因激活部分并被构象约束的第二蛋白; 和（b）测量报告基因的表达作为第一和第二蛋白质之间相互作用的量度。 还公开了用于测定蛋白质相互作用的方法，以及鉴定蛋白质相互作用的拮抗剂和激动剂。 还讨论了通过这些方法分离的蛋白质。 最后，公开了真核细胞群，每个细胞具有编码构象约束细胞内肽的重组DNA分子。

公开(公告)号：US06569685B1

公开(公告)日：2003-05-27

申请号：US09412732

申请日：1999-10-05

申请人： Robert H. Carlson ,  Ian E. Burbulis ,  Roger Brent

发明人： Robert H. Carlson ,  Ian E. Burbulis ,  Roger Brent

IPC分类号： G01N2162

CPC分类号： G01N33/582 ,  G01N33/542 ,  G01N33/6803

摘要： A system and method for characterizing protein molecules. A protein molecule of interest is isolated from other types of protein molecules. The protein molecule of interest is modified to a one-dimensional structure from the natural three-dimensional structure of the protein molecule. Each of a first type of amino acid residue of the protein molecule is labeled with a first tag. Each of a second type of amino acid residue of the protein molecule is labeled with a second tag. The first and second tags impart to the protein molecule a detectable set of characteristic ancillary properties that facilitates distinction of the protein molecule of interest from other types of protein molecules. When these ancillary properties are detected, a fingerprint of the protein molecule is revealed. A listing of known protein molecules and of the fingerprints corresponding to each of the known protein molecules serves as a library to facilitate identification of unknown proteins. A fingerprint of a protein molecule of interest determined in the same manner as the fingerprints of known proteins listed in the library is compared with fingerprints of the known protein molecules to identify the protein molecule of interest.

摘要翻译： 用于表征蛋白质分子的系统和方法。 感兴趣的蛋白质分子从其他类型的蛋白质分子中分离出来。 将目的蛋白质分子从蛋白质分子的天然三维结构修饰成一维结构。 蛋白质分子的第一类氨基酸残基中的每一个用第一标签标记。 蛋白质分子的第二类型的氨基酸残基中的每一个用第二个标签标记。 第一和第二标签赋予蛋白质分子可检测的一组特征性辅助性质，其有助于将目的蛋白质分子与其它类型的蛋白质分子区分开。 当检测到这些辅助性质时，显示出蛋白质分子的指纹图谱。 已知蛋白质分子和对应于每个已知蛋白质分子的指纹的列表用作有助于鉴定未知蛋白质的文库。 将以与文库中列出的已知蛋白质的指纹相同的方式测定的感兴趣的蛋白质分子的指纹与已知蛋白质分子的指纹进行比较，以鉴定感兴趣的蛋白质分子。

公开(公告)号：US06399296B1

公开(公告)日：2002-06-04

申请号：US08630052

申请日：1996-04-09

申请人： Roger Brent ,  John M. McCoy ,  Timm H. Jessen ,  Chanxing Wilson Xu

发明人： Roger Brent ,  John M. McCoy ,  Timm H. Jessen ,  Chanxing Wilson Xu

IPC分类号： C12Q168

CPC分类号： C12Q1/025 ,  C07K7/08 ,  C07K14/00 ,  C07K2319/00 ,  C12N9/0036 ,  C12N15/1055 ,  C12Q1/6897 ,  C40B30/04 ,  G01N33/68 ,  G01N33/6845

摘要： Disclosed herein is a method of determining whether a first protein is capable of physically interacting with a second protein, involving: (a) providing a host cell which contains (i) a reporter gene operably linked to a protein binding site; (ii) a first fusion gene which expresses a first fusion protein, the first fusion protein including the first protein covalently bonded to a binding moiety which is capable of specifically binding to the protein binding site; and (iii) a second fusion gene which expresses a second fusion protein, the second fusion protein including the second protein covalently bonded to a gene activating moiety and being conformationally-constrained; and (b) measuring expression of the reporter gene as a measure of an interaction between the first and the second proteins. Also disclosed are methods for assaying protein interactions, and identifying antagonists and agonists of protein interactions.

摘要翻译： 本文公开了一种确定第一蛋白质是否能够与第二蛋白质物理相互作用的方法，涉及：（a）提供宿主细胞，其包含（i）可操作地连接到蛋白质结合位点的报告基因; （ii）表达第一融合蛋白的第一融合基因，所述第一融合蛋白包括共价键合到能够特异性结合蛋白结合位点的结合部分的第一蛋白; 和（iii）表达第二融合蛋白的第二融合基因，所述第二融合蛋白包括共价键合到基因激活部分并被构象约束的第二蛋白; 和（b）测量报告基因的表达作为第一和第二蛋白质之间相互作用的量度。 还公开了用于测定蛋白质相互作用的方法，以及鉴定蛋白质相互作用的拮抗剂和激动剂。

公开(公告)号：US5852169A

公开(公告)日：1998-12-22

申请号：US462498

申请日：1995-06-05

申请人： Roger Brent ,  Antonis S. Zervos

发明人： Roger Brent ,  Antonis S. Zervos

IPC分类号： C12N15/09 ,  A61K38/00 ,  C07K14/47 ,  C12N15/12 ,  C12P21/02 ,  C12P21/08 ,  C12Q1/18 ,  C12Q1/48 ,  C12Q1/68 ,  C12R1/91

CPC分类号： C07K14/47 ,  C12Q1/6886 ,  A61K38/00 ,  C12Q2600/136

摘要： Disclosed are substatially pure preparations of Max-Interacting (Mxi) polypeptides, DNA encoding such polypeptides, antibodies recognizing such polypeptides, and diagnostic and therapeutic methods utilizing such polypeptides.