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公开(公告)号：US20080194414A1
公开(公告)日：2008-08-14
申请号：US11970949
申请日：2008-01-08
申请人： Thomas J. Albert , Roland Green , Todd Richmond , Michael Molla , Jeffrey Jeddeloh , Jason Patrick Affourtit , Mathreyan Srinivasan , Brian Christopher Godwin , Matthew Rodesch
发明人： Thomas J. Albert , Roland Green , Todd Richmond , Michael Molla , Jeffrey Jeddeloh , Jason Patrick Affourtit , Mathreyan Srinivasan , Brian Christopher Godwin , Matthew Rodesch
CPC分类号： C12N15/1093 , C12Q1/6834
摘要： The present invention provides novel methods for reducing the complexity of preferably a genomic sample for further analysis such as direct DNA sequencing, resequencing or SNP calling. The methods use pre-selected immobilized oligonucleotide probes to capture target nucleic acid molecules from a sample containing denatured, fragmented (genomic) nucleic acids for reducing the genetic complexity of the original population of nucleic acid molecules.
摘要翻译： 本发明提供了用于降低优选用于进一步分析的基因组样品的复杂性的新方法，例如直接DNA测序，再测序或SNP呼叫。 该方法使用预先选择的固定化寡核苷酸探针从含有变性，片段（基因组）核酸的样品中捕获靶核酸分子，以降低核酸分子的原始群体的遗传复杂性。
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公开(公告)号：US20100222232A1
公开(公告)日：2010-09-02
申请号：US12754308
申请日：2010-04-05
申请人： Thomas J. Albert , Roland Green , Todd Richmond , Michael Molla , Jeffrey Jeddeloh , Jason Patrick Affourtit , Mathreyan Srinivasan , Brian Christopher Godwin , Matthew Rodesch
发明人： Thomas J. Albert , Roland Green , Todd Richmond , Michael Molla , Jeffrey Jeddeloh , Jason Patrick Affourtit , Mathreyan Srinivasan , Brian Christopher Godwin , Matthew Rodesch
CPC分类号： C12N15/1093 , C12Q1/6834
摘要： The present invention provides novel methods for reducing the complexity of preferably a genomic sample for further analysis such as direct DNA sequencing, resequencing or SNP calling. The methods use pre-selected immobilized oligonucleotide probes to capture target nucleic acid molecules from a sample containing denatured, fragmented (genomic) nucleic acids for reducing the genetic complexity of the original population of nucleic acid molecules.
摘要翻译： 本发明提供了用于降低优选用于进一步分析的基因组样品的复杂性的新方法，例如直接DNA测序，再测序或SNP呼叫。 该方法使用预先选择的固定化寡核苷酸探针从含有变性，片段（基因组）核酸的样品中捕获靶核酸分子，以降低核酸分子的原始群体的遗传复杂性。
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公开(公告)号：US08383338B2
公开(公告)日：2013-02-26
申请号：US12391001
申请日：2009-02-23
申请人： Jacob Kitzman , Todd Richmond , Mark D'Ascenzo , Thomas Albert , Matthew Rodesch , Jeffrey Jeddeloh , Christina Middle
发明人： Jacob Kitzman , Todd Richmond , Mark D'Ascenzo , Thomas Albert , Matthew Rodesch , Jeffrey Jeddeloh , Christina Middle
CPC分类号： C12Q1/6834 , C12N15/1093
摘要： The present invention provides methods and compositions for the enrichment of target nucleic acids in a microarray system. In particular, the present invention provides methods and compositions for uniform enrichment of target nucleic acid molecules in a microarray format. The present invention also provides for intentionally non-uniform enrichment among target nucleic acid molecules.
摘要翻译： 本发明提供了用于在微阵列系统中富集靶核酸的方法和组合物。 特别地，本发明提供了以微阵列形式均匀富集靶核酸分子的方法和组合物。 本发明还提供靶核酸分子之间有意的不均匀的富集。
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公开(公告)号：US20090221438A1
公开(公告)日：2009-09-03
申请号：US12391001
申请日：2009-02-23
申请人： Jacob Kitzman , Todd Richmond , Mark D'Ascenzo , Thomas Albert , Matthew Rodesch , Jeffrey Jeddeloh , Christina Middle
发明人： Jacob Kitzman , Todd Richmond , Mark D'Ascenzo , Thomas Albert , Matthew Rodesch , Jeffrey Jeddeloh , Christina Middle
CPC分类号： C12Q1/6834 , C12N15/1093
摘要： The present invention provides methods and compositions for the enrichment of target nucleic acids in a microarray system. In particular, the present invention provides methods and compositions for uniform enrichment of target nucleic acid molecules in a microarray format. The present invention also provides for intentionally non-uniform enrichment among target nucleic acid molecules.
摘要翻译： 本发明提供了用于在微阵列系统中富集靶核酸的方法和组合物。 特别地，本发明提供了以微阵列形式均匀富集靶核酸分子的方法和组合物。 本发明还提供靶核酸分子之间有意的不均匀的富集。
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公开(公告)号：US20120071357A1
公开(公告)日：2012-03-22
申请号：US13267964
申请日：2011-10-07
申请人： Jacob Kitzman , Todd Richmond , Mark D'Ascanzo , Thomas Albert , Jeffrey Jeddeloh , Christina Middle
发明人： Jacob Kitzman , Todd Richmond , Mark D'Ascanzo , Thomas Albert , Jeffrey Jeddeloh , Christina Middle
IPC分类号： C40B40/06
CPC分类号： C12Q1/6834 , C12N15/1093
摘要： The present invention provides methods and compositions for the enrichment of target nucleic acids in a microarray system. In particular, the present invention provides methods and compositions for uniform enrichment of target nucleic acid molecules in a microarray format. The present invention also provides for intentionally non-uniform enrichment among target nucleic acid molecules.
摘要翻译： 本发明提供了用于在微阵列系统中富集靶核酸的方法和组合物。 特别地，本发明提供了以微阵列形式均匀富集靶核酸分子的方法和组合物。 本发明还提供靶核酸分子之间有意的不均匀的富集。
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6.发明申请System and method for improved processing of nucleic acids for production of sequencable libraries 审中-公开用于生产可序列文库的核酸改进处理系统和方法公开(公告)号：US20110003701A1
公开(公告)日：2011-01-06
申请号：US12380139
申请日：2009-02-23
申请人： Gianni Calogero Ferreri , Jan F. Simons , Michael Todd Ronan , Michael Egholm , Brian C. Godwin , David Roderick Riches , Stephen Kyle Hutchison , Michael S. Braverman , Melinda D. Palmer , Jeffrey Jeddeloh , Jacob Kitzman , Thomas J. Albert
发明人： Gianni Calogero Ferreri , Jan F. Simons , Michael Todd Ronan , Michael Egholm , Brian C. Godwin , David Roderick Riches , Stephen Kyle Hutchison , Michael S. Braverman , Melinda D. Palmer , Jeffrey Jeddeloh , Jacob Kitzman , Thomas J. Albert
CPC分类号： C12N15/66
摘要： An embodiment of an adaptor element for efficient target processing is described that comprises a semi-complementary double stranded nucleic acid adaptor comprising a non-complementary region and a complementary region, where the non-complementary region comprises a first amplification primer site and a second amplification primer site and the complementary region comprises a sequencing primer site and one or more inosine species.
摘要翻译： 描述了用于有效靶处理的衔接子元件的实施方案，其包含半互补双链核酸衔接子，其包含非互补区域和互补区域，其中所述非互补区域包含第一扩增引物位点和第二扩增 引物位点和互补区包含测序引物位点和一种或多种肌苷物质。
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公开(公告)号：US20050158739A1
公开(公告)日：2005-07-21
申请号：US10971339
申请日：2004-10-21
申请人： Jeffrey Jeddeloh , Nathan Lakey
发明人： Jeffrey Jeddeloh , Nathan Lakey
IPC分类号： C07H21/02 , C07H21/04 , C12N20060101 , C12P19/34 , C12Q20060101 , C12Q1/68 , G01N33/48 , G01N33/50
CPC分类号： C12Q1/683 , C12Q1/6858 , C12Q2521/331 , C12Q2545/101
摘要： The present invention provides methods for detecting the presence of methylation at a locus within a population of nucleic acids.
摘要翻译： 本发明提供了用于检测核酸群体内的位点甲基化存在的方法。
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8.发明申请公开(公告)号：US20050153316A1
公开(公告)日：2005-07-14
申请号：US10971986
申请日：2004-10-21
申请人： Jeffrey Jeddeloh , Nathan Lakey
发明人： Jeffrey Jeddeloh , Nathan Lakey
IPC分类号： C07H21/02 , C07H21/04 , C12N20060101 , C12P19/34 , C12Q20060101 , C12Q1/68 , G01N33/48 , G01N33/50 , G06F19/00
CPC分类号： C12Q1/683 , C12Q1/6858 , C12Q2521/331 , C12Q2545/101
摘要： The present invention is a novel method of determining the average DNA methylation density of a locus of interest within a population of DNA fragments.
摘要翻译： 本发明是确定DNA片段群体内目的基因座的平均DNA甲基化密度的新方法。
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公开(公告)号：US20070298506A1
公开(公告)日：2007-12-27
申请号：US11809355
申请日：2007-05-30
申请人： Jared Ordway , Jeffrey Jeddeloh , Joseph Bedell
发明人： Jared Ordway , Jeffrey Jeddeloh , Joseph Bedell
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q2600/154 , C12Q2600/156 , C12Q2600/158 , Y10T436/143333
摘要： The present invention provides DNA biomarker sequences that are differentially methylated in samples from normal individuals and individuals with cancer. The invention further provides methods of identifying differentially methylated DNA biomarker sequences and their use in detecting and diagnosing cancer.
摘要翻译： 本发明提供了在具有癌症的正常个体和个体的样品中差异甲基化的DNA生物标志物序列。 本发明还提供鉴定差异甲基化DNA生物标志物序列及其在检测和诊断癌症中的用途的方法。
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公开(公告)号：US20050272065A1
公开(公告)日：2005-12-08
申请号：US11071013
申请日：2005-03-02
申请人： Nathan Lakey , Jeffrey Jeddeloh , Yulia Korshunova
发明人： Nathan Lakey , Jeffrey Jeddeloh , Yulia Korshunova
CPC分类号： C12Q1/6858 , C12Q2525/155 , C12Q2521/331
摘要： The present invention provides methods for detecting the presence of methylation at a locus within a population of nucleic acids.
摘要翻译： 本发明提供了用于检测核酸群体内的位点甲基化存在的方法。
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