合成阿福豆素和儿茶素的酿酒酵母菌株及其应用

    公开(公告)号:CN113846026B

    公开(公告)日:2023-10-27

    申请号:CN202111106294.2

    申请日:2021-09-22

    Applicant: 江南大学

    Abstract: 本发明公开了合成阿福豆素和儿茶素的酿酒酵母菌株及其应用,属于基因工程技术领域。将F3H,F3’H和CPR整合至酿酒酵母基因组,得到了阿福豆素和儿茶素前体的从头合成菌株,筛选了最好催化活性的FaDFR和的VvLAR,通过连接肽的使用极大地促进了向阿福豆素和儿茶素的代谢通量,利用GAL7p和ERG1p启动子启动基因的表达,最后在阿福豆素从头合成菌株AF12中过表达TYR1,在儿茶素从头合成菌株AF13中过表达TYR1、ARO8和ZWF1,在摇瓶水平上产量分别为64 mg/l、41 mg/L,经过5 L发酵罐的优化,最终可使阿福豆素与儿茶素的产量分别达到500.5 mg/L、321.3 mg/L。

    一种基于深度学习的大肠杆菌启动子识别及强弱分类方法

    公开(公告)号:CN116705167A

    公开(公告)日:2023-09-05

    申请号:CN202310575873.4

    申请日:2023-05-22

    Applicant: 江南大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于深度学习的大肠杆菌启动子识别及强弱分类方法,属于生物信息技术领域。所述方法包括:对基因序列进行数字化处理、对训练样本进行扩充、构建深度学习网络模型用于特征学习。本发明采用的残差网络结合自注意力机制,具有更深的网络深度并且可有效识别序列的小区段关键区域与全长序列的关联。相比于现有的采用一维卷积神经网络结合双向长短期记忆,其中,启动子真伪数据集仅包含6764个样本;启动子强弱数据集包含3382个样本。本发明旨在通过增加网络深度、数据集样本量来提高整体的判别精度,所构建的模型不仅可以用于启动子识别与强弱判定,且更有助于辅助挖掘强启动子。

    一种合成赤霉素3的重组酿酒酵母菌株及其应用

    公开(公告)号:CN116640677A

    公开(公告)日:2023-08-25

    申请号:CN202310606617.7

    申请日:2023-05-26

    Applicant: 江南大学

    Abstract: 本发明公开了一种合成赤霉素3的重组酿酒酵母菌株及其应用,属于基因工程与生物工程技术领域。本发明将关键基因KS整合于基因组位点表达,并将来源于藤仓赤霉菌的双功能二磷酸合成酶GfKS、GA碳13氧化酶GfC13ox、GA去饱和酶GfDES,来源于拟南芥的贝壳杉烷氧化酶AtKO、贝壳杉烯酸氧化酶AtKAO、GA碳3氧化酶AtC3ox和GA碳20氧化酶AtC20ox用于赤霉素3合成途径的构建,进一步通过启动子的筛选、引入电子传递系统,并融合AtKO和AtKAO进一步提高了重组酿酒酵母的赤霉素3产量,使发酵120h的产量达424.1mg/L,是目前赤霉素3在酿酒酵母中的最高产量。

    一种合成角鲨烯的酿酒酵母菌株及其应用

    公开(公告)号:CN113234610B

    公开(公告)日:2023-06-13

    申请号:CN202110244286.8

    申请日:2021-03-05

    Applicant: 江南大学

    Abstract: 本发明公开了一种合成角鲨烯的酿酒酵母菌株及其应用,属于基因工程技术领域。本发明将tHMG1和IDI1在酿酒酵母多拷贝位点Ty2整合,显著促进了角鲨烯的合成积累,并异源表达NADH依赖的HMG1,平衡酵母细胞中氧化还原水平,进一步替换了对ERG1转录有显著抑制作用的启动子HXT1,阻碍角鲨烯向下游的转化,还异源表达ACL1,ACL2、过表达PEX11和FOX3,利用β氧化强化胞质内角鲨烯合成前体乙酰辅酶A的积累,进一步促进了角鲨烯的积累,可使酿酒酵母发酵96h的角鲨烯产量达1253.4mg/L。

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