一种模拟配体分子与靶标受体反应并计算预测该反应的热力学与动力学参数的方法和系统

    公开(公告)号:CN102930152B

    公开(公告)日:2016-08-03

    申请号:CN201210418450.3

    申请日:2012-10-26

    IPC分类号: G06F19/00

    摘要: 本发明涉及一种基于计算机模拟配体分子与靶标受体反应并计算预测该反应的热力学(Thermodynamics)和动力学(Kinetics)参数的方法及应用系统。主要包括:1)设计计算配体分子与靶标受体结合自由能的方法,基于该方法设计了多目标分子对接方法并开发出其应用系统;2)采用该系统对配体分子与靶标受体相互作用模式的模拟和采样、获取结合自由能评分,据模拟采样结果构建配体分子与靶标受体的结合自由能势能面的方法系统;3)根据势能面获取配体分子与靶标受体识别反应路径的方法系统;4)确定反应的活性位点和过渡态位点来计算出热力学与动力学参数。本发明为药物研发提供重要依据与预测评价手段,有望提高药物研发效率并大幅度节省实验费用,成为药物研发的有效辅助工具。

    6,7,8,9-四氢-5H-苯并[7]轮烯-2-烷基胺类化合物及其用途

    公开(公告)号:CN106414392A

    公开(公告)日:2017-02-15

    申请号:CN201480077716.X

    申请日:2014-06-10

    CPC分类号: A61K31/137 C07C211/30

    摘要: 本发明提供了式I所示的6,7,8,9-四氢-5H-苯并[7]轮烯-2-烷基胺类化合物或其在药学上可接受的盐及其用途。该类化合物对金黄色葡萄球菌的金黄色色素的合成显示出较强的抑制活性。金黄色葡萄球菌的金黄色色素具有帮助金黄色葡萄球菌逃避人体先天免疫系统产生的活性氧的杀害的能力,是决定细菌致病能力的一个关键毒力因子。金黄色色素还可以增加细菌对油酸的抵抗能力,通过提高细菌抗氧化的能力从而增加细菌的毒力。抑制金黄色葡萄球菌的毒力因子金黄色色素合成是新的、有效的抗菌药物策略。本发明的化合物通过靶向抑制金黄色色素的合成,不但有望开发成新型的单一用药方式的抗菌药物,而且还可以开发成与现有抗生素组合给药方式的抗菌药物。

    苯并呋喃-7-烷基胺类化合物及其用途

    公开(公告)号:CN105566262A

    公开(公告)日:2016-05-11

    申请号:CN201610013304.0

    申请日:2016-01-11

    IPC分类号: C07D307/79 A61P31/04

    CPC分类号: C07D307/79

    摘要: 本发明的发明人设计、并合成了一种具有全新结构的苯并呋喃-7-烷基胺类化合物。经测试表明:本发明公开的苯并呋喃-7-烷基胺类化合物中大部分化合物对金黄色色素合成有强效的抑制活性,其中某些化合物对耐药菌(S.aureus USA400 MW2,USA300 LAC,Mu50)色素抑制活性极强,在体外显著地增强过氧化氢杀伤和增强人血液杀伤。在体内对于敏感菌株(S.aureus Newman)和两株耐药菌株(S.aureus USA400 MW2,Mu50)感染的动物模型中,可显著降低细菌在小鼠内脏(肾,心和肝)中定植。本发明为今后进一步设计开发新型抗细菌感染药物奠定了结构基础。