公开(公告)号：US08058031B2

公开(公告)日：2011-11-15

申请号：US12833870

申请日：2010-07-09

申请人： Yue Xu ,  Jeffrey Wegener ,  Arek Bibillo

发明人： Yue Xu ,  Jeffrey Wegener ,  Arek Bibillo

IPC分类号： C12P19/34 ,  C12Q1/68 ,  C07H21/00 ,  C07H21/02

CPC分类号： C07H19/10 ,  C07H21/00 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2533/101 ,  C12Q2525/117 ,  C12Q2525/101

摘要： Labeled nucleotide analogs used in place of naturally occurring nucleoside triphosphates or other analogs in template directed nucleic acid synthesis reactions and other nucleic acid reactions, and various analyses based thereon, including DNA sequencing, single base identification, hybridization assays and others.

摘要翻译： 在模板定向核酸合成反应和其他核酸反应中使用代替天然存在的核苷三磷酸或其他类似物的标记的核苷酸类似物，以及基于其的各种分析，包括DNA测序，单碱基鉴定，杂交测定等。

公开(公告)号：US20110059450A1

公开(公告)日：2011-03-10

申请号：US12833870

申请日：2010-07-09

申请人： Yue Xu ,  Jeffrey Wegener ,  Arek Bibillo

发明人： Yue Xu ,  Jeffrey Wegener ,  Arek Bibillo

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C07H19/10 ,  C07H21/00 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2533/101 ,  C12Q2525/117 ,  C12Q2525/101

摘要： Labeled nucleotide analogs used in place of naturally occurring nucleoside triphosphates or other analogs in template directed nucleic acid synthesis reactions and other nucleic acid reactions, and various analyses based thereon, including DNA sequencing, single base identification, hybridization assays and others.

摘要翻译： 在模板定向核酸合成反应和其他核酸反应中使用代替天然存在的核苷三磷酸或其他类似物的标记的核苷酸类似物，以及基于其的各种分析，包括DNA测序，单碱基鉴定，杂交测定等。

公开(公告)号：US07405281B2

公开(公告)日：2008-07-29

申请号：US11241809

申请日：2005-09-29

申请人： Yue Xu ,  Jeffrey Wegener ,  Arek Bibillo

发明人： Yue Xu ,  Jeffrey Wegener ,  Arek Bibillo

IPC分类号： C07G3/00 ,  C12Q1/68 ,  C12P19/34 ,  C07H21/02 ,  C07H21/04

CPC分类号： C07H19/10 ,  C07H21/00 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2533/101 ,  C12Q2525/117 ,  C12Q2525/101

摘要： Labeled nucleotide analogs used in place of naturally occurring nucleoside triphosphates or other analogs in template directed nucleic acid synthesis reactions and other nucleic acid reactions, and various analyses based thereon, including DNA sequencing, single base identification, hybridization assays and others.

摘要翻译： 在模板定向核酸合成反应和其他核酸反应中使用代替天然存在的核苷三磷酸或其他类似物的标记的核苷酸类似物，以及基于其的各种分析，包括DNA测序，单碱基鉴定，杂交测定等。

公开(公告)号：US09175338B2

公开(公告)日：2015-11-03

申请号：US12945767

申请日：2010-11-12

申请人： Benjamin Flusberg ,  Jonas Korlach ,  Jeffrey Wegener ,  Tyson A. Clark ,  Igor Vilfan ,  Andrey Kislyuk ,  Stephen Turner ,  Jon Sorenson ,  Kevin Travers ,  Cheryl Heiner ,  Austin B. Tomaney ,  Patrick Marks ,  Jessica Lee ,  Lei Jia ,  Dale Webster ,  John Lyle ,  Jeremiah Hanes ,  Joseph Puglisi

发明人： Benjamin Flusberg ,  Jonas Korlach ,  Jeffrey Wegener ,  Tyson A. Clark ,  Igor Vilfan ,  Andrey Kislyuk ,  Stephen Turner ,  Jon Sorenson ,  Kevin Travers ,  Cheryl Heiner ,  Austin B. Tomaney ,  Patrick Marks ,  Jessica Lee ,  Lei Jia ,  Dale Webster ,  John Lyle ,  Jeremiah Hanes ,  Joseph Puglisi

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q1/6858 ,  C12Q1/6874 ,  C12Q1/689 ,  C12Q2600/154 ,  C12Q2537/164 ,  C12Q2527/113 ,  C12Q2521/101 ,  C12Q2525/307 ,  C12Q2525/117

摘要： Methods, compositions, and systems are provided for characterization of modified nucleic acids. In certain preferred embodiments, single molecule sequencing methods are provided for identification of modified nucleotides within nucleic acid sequences. Modifications detectable by the methods provided herein include chemically modified bases, enzymatically modified bases, abasic sites, non-natural bases, secondary structures, and agents bound to a template nucleic acid.

摘要翻译： 提供了方法，组合物和系统用于表征修饰的核酸。 在某些优选实施方案中，提供单分子测序方法用于鉴定核酸序列内的修饰的核苷酸。 通过本文提供的方法可检测的修饰物包括化学修饰的碱基，酶修饰的碱基，脱碱基位点，非天然碱基，二级结构和与模板核酸结合的试剂。

公开(公告)号：US08772202B2

公开(公告)日：2014-07-08

申请号：US13487978

申请日：2012-06-04

申请人： David R. Rank ,  Jeffrey Wegener ,  Jonas Korlach ,  Daniel Roitman ,  Yue Xu ,  John Lyle ,  Stephen Turner ,  Paul Peluso ,  Geoff Otto ,  Ronald L. Cicero

发明人： David R. Rank ,  Jeffrey Wegener ,  Jonas Korlach ,  Daniel Roitman ,  Yue Xu ,  John Lyle ,  Stephen Turner ,  Paul Peluso ,  Geoff Otto ,  Ronald L. Cicero

IPC分类号： C40B99/00

CPC分类号： C12Q1/6874 ,  B01J19/0046 ,  B01J2219/00427 ,  B01J2219/0045 ,  B01J2219/00605 ,  B01J2219/0061 ,  B01J2219/00612 ,  B01J2219/00617 ,  B01J2219/00626 ,  B01J2219/00635 ,  B01J2219/00637 ,  B01J2219/00639 ,  B01J2219/00659 ,  B01J2219/00711 ,  B01J2219/00722 ,  B82Y20/00 ,  B82Y30/00 ,  C12Q1/6837 ,  Y10T29/49002 ,  C12Q2565/629 ,  C12Q2527/127

摘要： Methods of producing substrates having selected active chemical regions by employing elements of the substrates in assisting the localization of active chemical groups in desired regions of the substrate. The methods may include optical, chemical and/or mechanical processes for the deposition, removal, activation and/or deactivation of chemical groups in selected regions of the substrate to provide selective active regions of the substrate.

摘要翻译： 通过使用底物的元素来辅助活性化学基团在基底的所需区域中的定位来制备具有选定的活性化学区域的基底的方法。 所述方法可以包括用于沉积，去除，激活和/或去活衬底的选定区域中的化学基团的光学，化学和/或机械方法，以提供衬底的选择性活性区域。

公开(公告)号：US20130183663A1

公开(公告)日：2013-07-18

申请号：US13688667

申请日：2012-11-29

申请人： Jeffrey Wegener ,  Jonas Korlach

发明人： Jeffrey Wegener ,  Jonas Korlach

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C07H21/00 ,  C07H19/10 ,  C07H19/20 ,  C12Q1/6844 ,  C12Q1/686 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2563/107

摘要： Labeled reactant compositions, and particularly labeled nucleic acid reaction compositions, that include structural components that maintain potentially damaging labeling components sufficiently distal from the reactant portion of the molecule such that damaging effects of the label group on other reaction components, such as enzymes, are reduced, minimized and/or eliminated.

公开(公告)号：US08354252B2

公开(公告)日：2013-01-15

申请号：US13115288

申请日：2011-05-25

申请人： Jeffrey Wegener ,  Jonas Korlach

发明人： Jeffrey Wegener ,  Jonas Korlach

IPC分类号： C12P19/34 ,  C12Q1/68 ,  C07H21/00 ,  C07H21/02

CPC分类号： C07H21/00 ,  C07H19/10 ,  C07H19/20 ,  C12Q1/6844 ,  C12Q1/686 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2563/107

摘要： Labeled reactant compositions, and particularly labeled nucleic acid reaction compositions, that include structural components that maintain potentially damaging labeling components sufficiently distal from the reactant portion of the molecule such that damaging effects of the label group on other reaction components, such as enzymes, are reduced, minimized and/or eliminated.

摘要翻译： 标记的反应物组合物和特别标记的核酸反应组合物包括结构成分，其维持足够远离分子的反应物部分的潜在的有害的标记组分，使得标记基团对其它反应组分如酶的损害作用降低 ，最小化和/或消除。

公开(公告)号：US20110311964A1

公开(公告)日：2011-12-22

申请号：US13115288

申请日：2011-05-25

申请人： Jeffrey Wegener ,  Jonas Korlach

发明人： Jeffrey Wegener ,  Jonas Korlach

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C07H21/00 ,  C07H19/10 ,  C07H19/20 ,  C12Q1/6844 ,  C12Q1/686 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2563/107

摘要： Labeled reactant compositions, and particularly labeled nucleic acid reaction compositions, that include structural components that maintain potentially damaging labeling components sufficiently distal from the reactant portion of the molecule such that damaging effects of the label group on other reaction components, such as enzymes, are reduced, minimized and/or eliminated.

摘要翻译： 标记的反应物组合物和特别标记的核酸反应组合物包括结构成分，其维持足够远离分子的反应物部分的潜在的有害的标记组分，使得标记基团对其它反应组分如酶的损害作用降低 ，最小化和/或消除。

公开(公告)号：US07968702B2

公开(公告)日：2011-06-28

申请号：US12403090

申请日：2009-03-12

申请人： Jeffrey Wegener ,  Jonas Korlach

发明人： Jeffrey Wegener ,  Jonas Korlach

IPC分类号： C07H19/04 ,  C07K2/00 ,  C12Q1/00 ,  C12Q1/68 ,  C12P19/34

CPC分类号： C07H21/00 ,  C07H19/10 ,  C07H19/20 ,  C12Q1/6844 ,  C12Q1/686 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2563/107

摘要： Labeled reactant compositions, and particularly labeled nucleic acid reaction compositions, that include structural components that maintain potentially damaging labeling components sufficiently distal from the reactant portion of the molecule such that damaging effects of the label group on other reaction components, such as enzymes, are reduced, minimized and/or eliminated.

摘要翻译： 标记的反应物组合物和特别标记的核酸反应组合物包括结构成分，其维持足够远离分子的反应物部分的潜在的有害的标记组分，使得标记基团对其它反应组分如酶的损害作用降低 ，最小化和/或消除。

公开(公告)号：US20090018324A1

公开(公告)日：2009-01-15

申请号：US12121641

申请日：2008-05-15

申请人： Yue Xu ,  Jeffrey Wegener ,  Arek Bibillo

发明人： Yue Xu ,  Jeffrey Wegener ,  Arek Bibillo

IPC分类号： C07H19/20

CPC分类号： C07H19/10 ,  C07H21/00 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2533/101 ,  C12Q2525/117 ,  C12Q2525/101

摘要： Labeled nucleotide analogs used in place of naturally occurring nucleoside triphosphates or other analogs in template directed nucleic acid synthesis reactions and other nucleic acid reactions, and various analyses based thereon, including DNA sequencing, single base identification, hybridization assays and others.

摘要翻译： 在模板定向核酸合成反应和其他核酸反应中使用代替天然存在的核苷三磷酸或其他类似物的标记的核苷酸类似物，以及基于其的各种分析，包括DNA测序，单碱基鉴定，杂交测定等。