公开(公告)号：US09777320B2

公开(公告)日：2017-10-03

申请号：US13218439

申请日：2011-08-25

申请人： Stephen Yue ,  Gene Shen ,  Louis Brogley ,  Lubomir Sebo ,  Jeffrey Wegener

发明人： Stephen Yue ,  Gene Shen ,  Louis Brogley ,  Lubomir Sebo ,  Jeffrey Wegener

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C09B23/10 ,  C07D209/14 ,  C07D401/14 ,  C07D405/14 ,  G01N33/58 ,  C09B23/00 ,  C09B23/06 ,  C09B23/08 ,  C07H19/10 ,  C09B23/01 ,  C07K5/09 ,  C07K5/11

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  C07D209/14 ,  C07D401/14 ,  C07D405/14 ,  C07H19/10 ,  C07K5/0815 ,  C07K5/1019 ,  C09B23/0025 ,  C09B23/0033 ,  C09B23/0066 ,  C09B23/06 ,  C09B23/083 ,  C09B23/105 ,  C09B23/164 ,  C12Q1/6844 ,  C12Q1/6876 ,  G01N33/52 ,  G01N33/582 ,  G01N2333/9126

摘要： In various embodiments, the present invention provides fluorescent dyes that are linked to another species through an adaptor moiety. In an exemplary embodiment, the dye is linked to a polyphosphate nucleic acid through an adaptor. An adaptor can be a component of a linker. These conjugates find use in single molecule DNA sequencing and other applications. In various embodiments, the dye moiety is a cyanine dye. Cyanine dyes that are highly charged, such as those including multiple sulfonate, alkylsulfonate, carboxylate and/or alkylcarboxylate moieties are examples of cyanine dyes of use in the compounds of the invention.

公开(公告)号：US20100152424A1

公开(公告)日：2010-06-17

申请号：US12621352

申请日：2009-11-18

申请人： Jonas Korlach ,  Jeffrey Wegener

发明人： Jonas Korlach ,  Jeffrey Wegener

IPC分类号： C07K14/00 ,  C07H19/04 ,  C07H1/00 ,  B01J19/00

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  C07H19/10 ,  C12Q1/6818 ,  C12Q1/6874 ,  G01N33/5308

摘要： Nucleic acid compositions, methods of making and using such compositions that comprise modular functional groups that can be configured to provide desired functionality to different nucleotide types through a swappable and preferably non-covalent linkage component. Such compositions are useful in a variety of applications including nucleic acid analyses.

摘要翻译： 核酸组合物，制备和使用这样的组合物的方法，所述组合物包含模块化官能团，其可被配置为通过可交换且优选非共价连接组分为不同核苷酸类型提供所需功能。 这样的组合物可用于各种应用，包括核酸分析。

公开(公告)号：US20070072196A1

公开(公告)日：2007-03-29

申请号：US11241809

申请日：2005-09-29

申请人： Yue Xu ,  Jeffrey Wegener ,  Arek Bibillo

发明人： Yue Xu ,  Jeffrey Wegener ,  Arek Bibillo

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C07H19/04 ,  C12P19/34 ,  C07F9/02

CPC分类号： C07H19/10 ,  C07H21/00 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2533/101 ,  C12Q2525/117 ,  C12Q2525/101

摘要： Labeled nucleotide analogs used in place of naturally occurring nucleoside triphosphates or other analogs in template directed nucleic acid synthesis reactions and other nucleic acid reactions, and various analyses based thereon, including DNA sequencing, single base identification, hybridization assays and others.

摘要翻译： 在模板定向核酸合成反应和其他核酸反应中使用代替天然存在的核苷三磷酸或其他类似物的标记的核苷酸类似物，以及基于其的各种分析，包括DNA测序，单碱基鉴定，杂交测定等。

公开(公告)号：US09063156B2

公开(公告)日：2015-06-23

申请号：US12814075

申请日：2010-06-11

申请人： Jonas Korlach ,  Stephen Turner ,  Benjamin Flusberg ,  Mark Chaisson ,  Eric Schadt ,  Jeffrey Wegener

发明人： Jonas Korlach ,  Stephen Turner ,  Benjamin Flusberg ,  Mark Chaisson ,  Eric Schadt ,  Jeffrey Wegener

IPC分类号： C12Q1/68 ,  G01N33/53 ,  G01N33/68 ,  G01N33/542 ,  G01N33/543

CPC分类号： G01N33/68 ,  C12Q1/6825 ,  C12Q1/6827 ,  C12Q1/6869 ,  G01N33/542 ,  G01N33/54306 ,  G01N33/54373 ,  G01N33/582 ,  G01N33/6875 ,  G01N2333/705 ,  G01N2458/10 ,  C12Q2563/107 ,  C12Q2522/101 ,  C12Q2561/113 ,  C12Q2537/164 ,  C12Q2523/125

摘要： The present invention is generally directed to compositions, methods, and systems for performing single-molecule, real-time analysis of a variety of different biological reactions, and for determining various characteristics of the different biological reactions. The ability to analyze such reactions provides an opportunity to study those reactions as well as to potentially identify factors and/or approaches for impacting such reactions, e.g., to stimulate, enhance, or inhibit such reactions.

摘要翻译： 本发明一般涉及用于进行各种不同生物反应的单分子实时分析以及用于确定不同生物反应的各种特征的组合物，方法和系统。 分析这些反应的能力提供研究这些反应的机会，并且潜在地鉴定影响这些反应的因素和/或方法，例如刺激，增强或抑制这些反应。

公开(公告)号：US08252910B2

公开(公告)日：2012-08-28

申请号：US12621352

申请日：2009-11-18

申请人： Jonas Korlach ,  Jeffrey Wegener

发明人： Jonas Korlach ,  Jeffrey Wegener

IPC分类号： C07G3/00 ,  C07H21/04 ,  G01N15/06

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  C07H19/10 ,  C12Q1/6818 ,  C12Q1/6874 ,  G01N33/5308

摘要： Nucleic acid compositions, methods of making and using such compositions that comprise modular functional groups that can be configured to provide desired functionality to different nucleotide types through a swappable and preferably non-covalent linkage component. Such compositions are useful in a variety of applications including nucleic acid analyses.

摘要翻译： 核酸组合物，制备和使用这样的组合物的方法，所述组合物包含模块化官能团，其可被配置为通过可交换且优选非共价连接组分为不同核苷酸类型提供所需功能。 这样的组合物可用于各种应用，包括核酸分析。

公开(公告)号：US20100323912A1

公开(公告)日：2010-12-23

申请号：US12814075

申请日：2010-06-11

申请人： Jonas Korlach ,  Stephen Turner ,  Benjamin Flusberg ,  Mark Chaisson ,  Eric Schadt ,  Jeffrey Wegener

发明人： Jonas Korlach ,  Stephen Turner ,  Benjamin Flusberg ,  Mark Chaisson ,  Eric Schadt ,  Jeffrey Wegener

IPC分类号： C40B30/04 ,  C12Q1/68 ,  G01N33/566 ,  C40B50/14

CPC分类号： G01N33/68 ,  C12Q1/6825 ,  C12Q1/6827 ,  C12Q1/6869 ,  G01N33/542 ,  G01N33/54306 ,  G01N33/54373 ,  G01N33/582 ,  G01N33/6875 ,  G01N2333/705 ,  G01N2458/10 ,  C12Q2563/107 ,  C12Q2522/101 ,  C12Q2561/113 ,  C12Q2537/164 ,  C12Q2523/125

摘要： The present invention is generally directed to compositions, methods, and systems for performing single-molecule, real-time analysis of a variety of different biological reactions, and for determining various characteristics of the different biological reactions. The ability to analyze such reactions provides an opportunity to study those reactions as well as to potentially identify factors and/or approaches for impacting such reactions, e.g., to stimulate, enhance, or inhibit such reactions.

摘要翻译： 本发明一般涉及用于进行各种不同生物反应的单分子实时分析以及用于确定不同生物反应的各种特征的组合物，方法和系统。 分析这些反应的能力提供研究这些反应的机会，并且潜在地鉴定影响这些反应的因素和/或方法，例如刺激，增强或抑制这些反应。

公开(公告)号：US07777013B2

公开(公告)日：2010-08-17

申请号：US12121641

申请日：2008-05-15

申请人： Yue Xu ,  Jeffrey Wegener ,  Arek Bibillo

发明人： Yue Xu ,  Jeffrey Wegener ,  Arek Bibillo

IPC分类号： C07G11/00 ,  C07H21/00 ,  C07H21/02 ,  C07H19/04

CPC分类号： C07H19/10 ,  C07H21/00 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2533/101 ,  C12Q2525/117 ,  C12Q2525/101

摘要： Labeled nucleotide analogs used in place of naturally occurring nucleoside triphosphates or other analogs in template directed nucleic acid synthesis reactions and other nucleic acid reactions, and various analyses based thereon, including DNA sequencing, single base identification, hybridization assays and others.

摘要翻译： 在模板定向核酸合成反应和其他核酸反应中使用代替天然存在的核苷三磷酸或其他类似物的标记的核苷酸类似物，以及基于其的各种分析，包括DNA测序，单碱基鉴定，杂交测定等。

公开(公告)号：US20070238679A1

公开(公告)日：2007-10-11

申请号：US11394352

申请日：2006-03-30

申请人： David Rank ,  Jonas Korlach ,  Yue Xu ,  Stephen Turner ,  Jeffrey Wegener ,  Daniel Roitman ,  John Lyle

发明人： David Rank ,  Jonas Korlach ,  Yue Xu ,  Stephen Turner ,  Jeffrey Wegener ,  Daniel Roitman ,  John Lyle

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6874 ,  B01J19/0046 ,  B01J2219/00427 ,  B01J2219/0045 ,  B01J2219/00605 ,  B01J2219/0061 ,  B01J2219/00612 ,  B01J2219/00617 ,  B01J2219/00626 ,  B01J2219/00635 ,  B01J2219/00637 ,  B01J2219/00639 ,  B01J2219/00659 ,  B01J2219/00711 ,  B01J2219/00722 ,  B82Y20/00 ,  B82Y30/00 ,  C12Q1/6837 ,  Y10T29/49002 ,  C12Q2565/629 ,  C12Q2527/127

摘要： Methods of producing substrates having selected active chemical regions by employing elements of the substrates in assisting the localization of active chemical groups in desired regions of the substrate. The methods may include optical, chemical and/or mechanical processes for the deposition, removal, activation and/or deactivation of chemical groups in selected regions of the substrate to provide selective active regions of the substrate.

摘要翻译： 通过使用底物的元素来辅助活性化学基团在基底的所需区域中的定位来制备具有选定的活性化学区域的基底的方法。 所述方法可以包括用于沉积，去除，激活和/或去活衬底的选定区域中的化学基团的光学，化学和/或机械方法，以提供衬底的选择性活性区域。

公开(公告)号：US08846881B2

公开(公告)日：2014-09-30

申请号：US13552952

申请日：2012-07-19

申请人： Jonas Korlach ,  Jeffrey Wegener

发明人： Jonas Korlach ,  Jeffrey Wegener

IPC分类号： C07H15/00 ,  C07H19/04 ,  C12Q1/68 ,  C12P19/34

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  C07H19/10 ,  C12Q1/6818 ,  C12Q1/6874 ,  G01N33/5308

摘要： Nucleic acid compositions, methods of making and using such compositions that comprise modular functional groups that can be configured to provide desired functionality to different nucleotide types, through a swappable and preferably non-covalent linkage component. Such compositions are useful in a variety of applications including nucleic acid analyses.

摘要翻译： 核酸组合物，制备和使用这样的组合物的方法，所述组合物包含可被配置为通过可交换并优选非共价连接组分为不同核苷酸类型提供期望功能的模块化官能团。 这样的组合物可用于各种应用，包括核酸分析。

公开(公告)号：US20120302459A1

公开(公告)日：2012-11-29

申请号：US13487978

申请日：2012-06-04

申请人： David R. Rank ,  Jeffrey Wegener ,  Jonas Korlach ,  Daniel Roitman ,  Yue Xu ,  John Lyle ,  Stephen Turner ,  Paul Peluso ,  Geoff Otto ,  Ron Cicero

发明人： David R. Rank ,  Jeffrey Wegener ,  Jonas Korlach ,  Daniel Roitman ,  Yue Xu ,  John Lyle ,  Stephen Turner ,  Paul Peluso ,  Geoff Otto ,  Ron Cicero

IPC分类号： C40B50/14 ,  C40B30/04

CPC分类号： C12Q1/6874 ,  B01J19/0046 ,  B01J2219/00427 ,  B01J2219/0045 ,  B01J2219/00605 ,  B01J2219/0061 ,  B01J2219/00612 ,  B01J2219/00617 ,  B01J2219/00626 ,  B01J2219/00635 ,  B01J2219/00637 ,  B01J2219/00639 ,  B01J2219/00659 ,  B01J2219/00711 ,  B01J2219/00722 ,  B82Y20/00 ,  B82Y30/00 ,  C12Q1/6837 ,  Y10T29/49002 ,  C12Q2565/629 ,  C12Q2527/127

摘要： Methods of producing substrates having selected active chemical regions by employing elements of the substrates in assisting the localization of active chemical groups in desired regions of the substrate. The methods may include optical, chemical and/or mechanical processes for the deposition, removal, activation and/or deactivation of chemical groups in selected regions of the substrate to provide selective active regions of the substrate.

摘要翻译： 通过使用底物的元素来辅助活性化学基团在基底的所需区域中的定位来制备具有选定的活性化学区域的基底的方法。 所述方法可以包括用于沉积，去除，激活和/或去活衬底的选定区域中的化学基团的光学，化学和/或机械方法，以提供衬底的选择性活性区域。