公开(公告)号：US20050106627A1

公开(公告)日：2005-05-19

申请号：US10715329

申请日：2003-11-17

申请人： Yingming Zhao ,  John Falck

发明人： Yingming Zhao ,  John Falck

IPC分类号： C12P19/60 ,  G01N33/53 ,  G01N33/68

CPC分类号： G01N33/6842 ,  G01N33/5306 ,  G01N33/6803 ,  Y10S435/803 ,  Y10S435/814 ,  Y10S435/815 ,  Y10S435/961 ,  Y10S435/964 ,  Y10S436/815 ,  Y10S436/905 ,  Y10T436/141111 ,  Y10T436/16 ,  Y10T436/17

摘要： The invention provides methods and compositions for azide tagging of biomolecules. In one embodiment of the invention, proteins are tagged by metabolic incorporation of prenylated azido-analog substrates. Examples of such analogs are azido famesyl diphosphate and azido famesyl alcohol. The azido moiety in the resulting modified proteins provides an affinity tag, which can be chemoselectively captured by an azide-specific conjugation reaction, such as the Staudinger reaction, using a phosphine capture reagent. When the capture agent is biotinylated, the resulting conjugates can be detected and affinity-purified by streptavidin-linked-HRP and streptavidin-conjugated agarose beads, respectively. The invention allows detection and isolation of proteins with high yield, high specificity, and low contamination without harsh treatment of proteins.

摘要翻译： 本发明提供了用于生物分子的叠氮标签的方法和组合物。 在本发明的一个实施方案中，蛋白质通过代谢并入预先化合的叠氮基 - 类似物底物进行标记。 这种类似物的实例是叠氮基法甲基二磷酸酯和叠氮基茴香醇。 得到的修饰蛋白质中的叠氮基部分提供亲和标签，其可以使用磷化氢捕获试剂通过叠氮化物特异性缀合反应（例如Staudinger反应）进行化学选择性捕获。 当捕获剂被生物素化时，可以分别通过链霉亲和素连接的HRP和链霉抗生物素蛋白缀合的琼脂糖珠分别检测所得的缀合物并进行亲和纯化。 本发明允许以高产量，高特异性和低污染物检测和分离蛋白质，而不严格地处理蛋白质。

公开(公告)号：US20050038259A1

公开(公告)日：2005-02-17

申请号：US10489205

申请日：2002-09-09

申请人： John Falck ,  Noriyuki Miyata ,  Naoya Ono ,  Tomomichi Chonan ,  Hitomi Hirano ,  Yoshihisa Toda ,  Tohru Tanami ,  Shigeru Okuyama

发明人： John Falck ,  Noriyuki Miyata ,  Naoya Ono ,  Tomomichi Chonan ,  Hitomi Hirano ,  Yoshihisa Toda ,  Tohru Tanami ,  Shigeru Okuyama

IPC分类号： C07D277/20 ,  A61K31/047 ,  A61K31/08 ,  A61K31/16 ,  A61K31/18 ,  A61K31/185 ,  A61K31/201 ,  A61K31/231 ,  A61K31/275 ,  A61K31/41 ,  A61K31/426 ,  A61P1/02 ,  A61P1/04 ,  A61P1/16 ,  A61P1/18 ,  A61P7/02 ,  A61P9/00 ,  A61P9/10 ,  A61P11/00 ,  A61P11/06 ,  A61P11/08 ,  A61P13/12 ,  A61P15/00 ,  A61P15/06 ,  A61P17/02 ,  A61P17/06 ,  A61P19/00 ,  A61P19/02 ,  A61P27/02 ,  A61P29/00 ,  A61P31/00 ,  A61P31/04 ,  A61P37/02 ,  A61P37/06 ,  A61P43/00 ,  C07C33/04 ,  C07C33/044 ,  C07C33/42 ,  C07C59/01 ,  C07C59/42 ,  C07C59/46 ,  C07C59/60 ,  C07C69/708 ,  C07C69/732 ,  C07C235/28 ,  C07C255/15 ,  C07C255/16 ,  C07C259/06 ,  C07C309/08 ,  C07C309/10 ,  C07C309/20 ,  C07C309/23 ,  C07C309/24 ,  C07C309/68 ,  C07C311/04 ,  C07C311/17 ,  C07C311/51 ,  C07C317/44 ,  C07C323/52 ,  C07C323/66 ,  C07D257/04 ,  C07D277/34 ,  C07D277/12 ,  C11C3/00

CPC分类号： C07D257/04 ,  C07C33/044 ,  C07C33/423 ,  C07C33/426 ,  C07C59/42 ,  C07C59/46 ,  C07C59/60 ,  C07C69/708 ,  C07C235/28 ,  C07C255/15 ,  C07C259/06 ,  C07C309/10 ,  C07C309/20 ,  C07C309/23 ,  C07C309/24 ,  C07C309/68 ,  C07C311/17 ,  C07C311/51 ,  C07C317/44 ,  C07C323/52 ,  C07C323/66 ,  C07C2601/08 ,  C07C2601/14 ,  C07D277/34

摘要： A hydroxyeicosenoic acid analog represented by the following Formula (I), the bond ≡ represents a cis-vinylene group or an ethynylene group; Y represents CH2, O or S(O)p wherein p is 0, 1 or 2; m represents an integer of 1 to 4 inclusive; n represents an integer of 0 to 3 inclusive; the sum of m and n is an integer of 3 to 7 inclusive; R1 represents a C1-4 alkyl group or a C3-8 cycloalkyl group; R2 represents a hydrogen atom or a methyl group; R3 represents COR4, a nitrile group, a halogen atom, a tetrazole group or a thiazolidinedione group; R4 represents OR6, NHR6, N(OH)R6, NHSO2R5, glycerol or functionalized glycerols; R5 represents a C1-15 alkyl group, a C6-10 aryl group or a C7-14 aryl group substituted with alkyl groups, halogens or amino groups; R6 represents a hydrogen, a C1-10 alkyl group or a C1-10 alkyl group substituted with a hydroxyl group, or a pharmaceutically acceptable salt or hydrate thereof. The compounds of the present invention are useful as an elastase release inhibitor.

摘要翻译： 由下式（I）表示的羟基二十碳烯酸类似物，键=表示顺式亚乙烯基或亚乙炔基; Y表示CH 2，O或S（O）p，其中p为0,1或2; m表示1〜4的整数， n表示0〜3的整数， m和n的和为3〜7的整数， R 1表示C 1-4烷基或C 3-8环烷基; R 2表示氢原子或甲基; R 3表示COR 4，腈基，卤素原子，四唑基或噻唑烷二酮基; R 4表示OR 6，NHR 6，N（OH）R 6，NHSO 2 R 5，甘油或官能化甘油; R 5代表C1-15烷基，C6-10芳基或被烷基，卤素或氨基取代的C7-14芳基; R 6表示氢，C 1-10烷基或被羟基取代的C 1-10烷基，或其药学上可接受的盐或水合物。 本发明的化合物可用作弹性蛋白酶释放抑制剂。

公开(公告)号：US20050020680A1

公开(公告)日：2005-01-27

申请号：US10489204

申请日：2002-09-09

申请人： John Falck ,  Noriyuki Miyata ,  Naoya Ono ,  Tomomichi Chonan ,  Hitomi Hirano ,  Yoshihisa Toda ,  Tohru Tanami ,  Shigeru Okuyama

发明人： John Falck ,  Noriyuki Miyata ,  Naoya Ono ,  Tomomichi Chonan ,  Hitomi Hirano ,  Yoshihisa Toda ,  Tohru Tanami ,  Shigeru Okuyama

IPC分类号： C07C33/044 ,  C07C33/42 ,  C07C59/42 ,  C07C59/46 ,  C07C59/60 ,  C07C69/708 ,  C07C235/28 ,  C07C255/15 ,  C07C259/06 ,  C07C309/10 ,  C07C309/20 ,  C07C309/23 ,  C07C309/24 ,  C07C309/68 ,  C07C311/17 ,  C07C311/51 ,  C07C317/44 ,  C07C323/52 ,  C07C323/66 ,  C07D257/04 ,  C07D277/34 ,  A61K31/185 ,  C07

CPC分类号： C07D257/04 ,  C07C33/044 ,  C07C33/423 ,  C07C33/426 ,  C07C59/42 ,  C07C59/46 ,  C07C59/60 ,  C07C69/708 ,  C07C235/28 ,  C07C255/15 ,  C07C259/06 ,  C07C309/10 ,  C07C309/20 ,  C07C309/23 ,  C07C309/24 ,  C07C309/68 ,  C07C311/17 ,  C07C311/51 ,  C07C317/44 ,  C07C323/52 ,  C07C323/66 ,  C07C2601/08 ,  C07C2601/14 ,  C07D277/34

摘要： A hydroxyfattysulfonic acid analog represented by Formula (I): wherein X is an ethylene group, a vinylene group or an ethynylene group; Y is an ethylene group, a vinylene group, an ethynylene group, OCH2 or S(O)pCH2 wherein p is 0, 1 or 2; m is an integer of 1 to 5 inclusive; n is an integer of 0 to 4 inclusive; R1 is a C1-8 alkyl group, a C3-8 cycloalkyl group, a C1-4 alkyl group substituted with a C3-8 cycloalkyl group, a C1-4 alkyl group substituted with an aryl group or a C1-4 alkyl group substituted with an aryloxy group; R2 is a hydrogen atom or a methyl group; R1 and R2 together with the carbon atom to which they are attached may form a C3-8 cycloalkyl group; R3 is a hydrogen atom or a C2-8 acyl group; R4 is OR5 or NHR6, wherein R5 is a hydrogen atom, a C1-4 alkyl group, an alkali metal, an alkaline earth metal or an ammonium group and R6 is a hydrogen atom or a C1-4 alkyl group; or a pharmaceutically acceptable salt or a hydrate thereof. The compounds of the present invention are useful as an elastase release inhibitor.

摘要翻译： 由式（I）表示的羟基脂肪磺酸类似物：其中X是亚乙基，亚乙烯基或亚乙炔基; Y是亚乙基，亚乙烯基，亚乙炔基，OCH 2或S（O）pCH 2，其中p是0,1或2; m为1〜5的整数， n为0〜4的整数， R 1是C 1-8烷基，C 3-8环烷基，被C 3-8环烷基取代的C 1-4烷基，被芳基取代的C 1-4烷基或C 1-4 被芳氧基取代的烷基; R 2是氢原子或甲基; R 1和R 2与它们所连接的碳原子一起可以形成C 3-8环烷基; R 3是氢原子或C 2-8酰基; R 4是OR 5或NHR 6，其中R 5是氢原子，C 1-4烷基，碱金属，碱土金属或铵基，R 6是 氢原子或C 1-4烷基; 或其药学上可接受的盐或其水合物。 本发明的化合物可用作弹性蛋白酶释放抑制剂。

公开(公告)号：US20060128803A1

公开(公告)日：2006-06-15

申请号：US11302836

申请日：2005-12-14

申请人： Peter Klimko ,  Daniel Gamache ,  Gustav Graff ,  Mark Hellberg ,  John Falck ,  John Yanni

发明人： Peter Klimko ,  Daniel Gamache ,  Gustav Graff ,  Mark Hellberg ,  John Falck ,  John Yanni

IPC分类号： A61K31/202

CPC分类号： A61K31/201 ,  A61K31/202

摘要： The topical use of 13(S)-HODE and analogs are disclosed for the treatment of dry eye disorders.

摘要翻译： 公开了13（S）-HODE和类似物的局部用途，用于治疗干眼症。

公开(公告)号：US20080241862A1

公开(公告)日：2008-10-02

申请号：US12021960

申请日：2008-01-29

申请人： YINGMING ZHAO ,  John Falck ,  Yue Chen

发明人： YINGMING ZHAO ,  John Falck ,  Yue Chen

IPC分类号： G01N33/574 ,  G01N33/566 ,  C07K14/00 ,  C12P13/08 ,  C07K16/18 ,  G01N33/53

CPC分类号： C07K16/44 ,  C07K16/18 ,  G01N33/6812 ,  G01N33/6842

摘要： While the identification of acetylated lysine residues on proteins is well-known, the modification of lysine residues through propionylation and butyrylation is not very well understood. A method for the identification and mapping of propionylated and butyrylated lysine residues has been developed. Anti-acetyllysine antibody, normally used to affinity purify a protein mixture based on the presence of acetylated lysine, can also be used to affinity purity proteins having propionylated and butyrylated lysine residues due to the structural similarity. The method involves searching protein databases to locate mass spectrometry datasets for those proteins purified by anti-acetyllysine antibody. The located spectra are manually reviewed to identify those peptides having propionyllysine and butyryllysine residues. These identified peptides are synthesized, with the lysine modifications added at the appropriate positions. The synthesized proteins are then analyzed with mass spectrometry and the resultant spectra are compared to those located in the protein databases to confirm the location of the lysine modifications.

摘要翻译： 虽然蛋白质上的乙酰化赖氨酸残基的鉴定是众所周知的，但是通过丙酰化和丁酰化修饰赖氨酸残基不是很好地理解。 已经开发了用于鉴定和测定丙酰化和丁酰化赖氨酸残基的方法。 通常用于亲和纯化基于乙酰化赖氨酸存在的蛋白质混合物的抗乙酰赖氨酸抗体也可用于由于结构相似性而具有丙酰化和丁酰化赖氨酸残基的亲和纯度蛋白质。 该方法包括搜索蛋白质数据库来定位由抗乙酰赖氨酸抗体纯化的蛋白质的质谱数据集。 手工检查定位的光谱，以鉴定具有丙酰赖氨酸和丁酰赖氨酸残基的那些肽。 合成这些鉴定的肽，其中在适当位置加入赖氨酸修饰。 然后通过质谱分析合成的蛋白质，并将所得光谱与位于蛋白质数据库中的蛋白质进行比较，以确认赖氨酸修饰的位置。