公开(公告)号：US20050152836A1

公开(公告)日：2005-07-14

申请号：US10850941

申请日：2004-05-21

申请人： Euan Ashley ,  Mary Chen ,  Thomas Quertermous ,  David Xing-Fei Deng ,  Anya Tsalenko ,  Amir Ben-dor ,  Laurakay Bruhn ,  Zohar Yakhini

发明人： Euan Ashley ,  Mary Chen ,  Thomas Quertermous ,  David Xing-Fei Deng ,  Anya Tsalenko ,  Amir Ben-dor ,  Laurakay Bruhn ,  Zohar Yakhini

IPC分类号： A61K38/18 ,  A61K51/00 ,  C07K16/46 ,  C12Q1/68 ,  G01N33/53 ,  G01N33/566 ,  G01N33/567 ,  G01N33/68

CPC分类号： G01N33/6893 ,  A61K38/1709 ,  A61K47/6843 ,  G01N2333/912 ,  G01N2333/916 ,  G01N2800/325

摘要： The invention identifies genes whose expression is upregulated or downregulated following mechanical offloading in subjects with heart failure. The invention provides compositions comprising a targeting agent conjugated to a functional moiety, wherein the targeting agent selectively binds to a polypeptide encoded by one of these genes. The functional moiety can be an imaging agent, therapeutic agent, etc. The invention further provides methods for providing diagnostic or prognostic information related to heart failure involving detecting expression or activity of an expression product of one or more of the identified genes. The invention further provides diagnostic and therapeutic methods comprising detecting or administering an apelin peptide to a subject.

摘要翻译： 本发明鉴定在具有心力衰竭的受试者中机械卸载后其表达上调或下调的基因。 本发明提供了包含与功能部分缀合的靶向剂的组合物，其中所述靶向剂选择性地结合由这些基因之一编码的多肽。 功能部分可以是成像剂，治疗剂等。本发明还提供了提供与心力衰竭有关的诊断或预后信息的方法，其涉及检测一种或多种所鉴定的基因的表达产物的表达或活性。 本发明进一步提供诊断和治疗方法，其包括向受试者检测或施用apelin肽。

公开(公告)号：US20050048463A1

公开(公告)日：2005-03-03

申请号：US10841164

申请日：2004-05-07

申请人： David Deng ,  Anya Tsalenko ,  Zohar Yakhini ,  Laurakay Bruhn ,  Amir Ben-Dor

发明人： David Deng ,  Anya Tsalenko ,  Zohar Yakhini ,  Laurakay Bruhn ,  Amir Ben-Dor

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12Q1/70 ,  G06F19/00

CPC分类号： G16B40/00 ,  G16B25/00

摘要： The present invention provides systems and methods for determining the cell type composition of a mixed cell population. The invention provides systems and methods for identifying and defining pure cell type specific signatures. These pure cell type specific signatures may be used to determine the cell type composition of a mixed cell population. The systems and methods of the invention may be used for a variety of research and clinical purposes. For example, they may be used to detect the presence or absence of cells of particular types, and to determine whether variations in gene expression, e.g., between different samples, represent true changes in gene expression or differences in cell type composition of the samples.

摘要翻译： 本发明提供了用于确定混合细胞群体的细胞类型组成的系统和方法。 本发明提供用于识别和定义纯细胞类型特异性特征的系统和方法。 这些纯细胞类型特异性标记可用于确定混合细胞群体的细胞类型组成。 本发明的系统和方法可用于各种研究和临床目的。 例如，它们可以用于检测特定类型的细胞的存在或不存在，并且确定基因表达的变化，例如不同样品之间的变化是否代表基因表达的真实变化或样品的细胞类型组成的差异。

公开(公告)号：US20050207974A1

公开(公告)日：2005-09-22

申请号：US10802246

申请日：2004-03-17

申请人： David Deng ,  Anya Tsalenko ,  Laurakay Bruhn ,  Zohar Yakhini ,  Michael Ho ,  Thomas Quertermous ,  Eugene Yang

发明人： David Deng ,  Anya Tsalenko ,  Laurakay Bruhn ,  Zohar Yakhini ,  Michael Ho ,  Thomas Quertermous ,  Eugene Yang

IPC分类号： A61K47/48 ,  A61K51/00 ,  C07K16/28 ,  C07K16/46

CPC分类号： C07K16/28 ,  A61K47/6425

摘要： The present invention provides polynucleotides and polypeptides (VECSM polynucleotides and polypeptides) that are differentially expressed in vascular endothelial cells. The invention further provides a variety of compositions, diagnostic, and therapeutic methods based on identification of these markers. In particular, the invention provides a targeting agent linked to a functional moiety, wherein the functional moiety can comprise any of a number of different agents, including imaging agents, cytotoxic agents, and stimulators or inhibitors of angiogenesis.

摘要翻译： 本发明提供在血管内皮细胞中差异表达的多核苷酸和多肽（VECSM多核苷酸和多肽）。 本发明还提供了基于鉴定这些标记物的各种组合物，诊断和治疗方法。 特别地，本发明提供了与功能部分连接的靶向剂，其中功能性部分可以包含许多不同的试剂，包括成像剂，细胞毒性剂，以及血管发生的刺激剂或抑制剂中的任何一种。

公开(公告)号：US08232055B2

公开(公告)日：2012-07-31

申请号：US10744595

申请日：2003-12-22

申请人： Laurakay Bruhn ,  Alicia F. Scheffer ,  Michael T. Barrett ,  Douglas A. Amorese ,  Stephen S. Laderman

发明人： Laurakay Bruhn ,  Alicia F. Scheffer ,  Michael T. Barrett ,  Douglas A. Amorese ,  Stephen S. Laderman

IPC分类号： C12Q1/68 ,  G01N33/50

CPC分类号： C12Q1/6837 ,  C12Q1/6809 ,  C12Q2565/501

摘要： Comparative genomic hybridization assays and compositions for use in practicing the same are provided. A characteristic of the subject comparative genomic hybridization assays is that solid support immobilized oligonucleotide feature elements, e.g., in the form of an array, are employed. Specifically, at least first and second nucleic acid populations prepared from genomic templates are contacted with a plurality of distinct oligonucleotide feature elements immobilized on a solid support surface and the binding of the at least first and second populations is then evaluated. Also provided are kits for use in practicing the subject methods.

摘要翻译： 提供了比较基因组杂交测定法和用于实践其的组合物。 本发明比较基因组杂交测定法的特征在于使用固体支持物固定的寡核苷酸特征元件，例如阵列形式。 具体地，从基因组模板制备的至少第一和第二核酸群体与固定在固体支持物表面上的多个不同的寡核苷酸特征元件接触，然后评估至少第一和第二群体的结合。 还提供了用于实践主题方法的套件。

公开(公告)号：US20050026154A1

公开(公告)日：2005-02-03

申请号：US10633609

申请日：2003-07-31

申请人： Laurakay Bruhn ,  Douglas Amorese ,  Michael Caren ,  Leslie Leonard ,  Richard Pittaro ,  Carol Schembri ,  Peter Webb ,  Paul Wolber

发明人： Laurakay Bruhn ,  Douglas Amorese ,  Michael Caren ,  Leslie Leonard ,  Richard Pittaro ,  Carol Schembri ,  Peter Webb ,  Paul Wolber

IPC分类号： B01J19/00 ,  B01L3/00 ,  C12Q1/68 ,  C40B40/06 ,  G01N21/25 ,  G01N33/48 ,  G01N33/483 ,  G01N33/50 ,  G01N33/53 ,  G01N33/58 ,  G06F19/00

CPC分类号： B01L3/545 ,  B01J2219/00662 ,  B01J2219/00693 ,  B01J2219/00722 ,  B01L3/5088 ,  B01L2200/025 ,  B01L2300/024 ,  B01L2300/0819 ,  C40B40/06 ,  G01N21/253

摘要： A method of using a chemical array unit having a chemical array with probes at multiple feature locations. A request for test may be read, which test uses a sub-array of the array. A pattern of the sub-array may be retrieved from a memory using the test request, which memory carries a pattern for the sub-array which is retrievable with the different test request. Also, a method of reading a chemical array unit which has been exposed to a sample, and feature locations of which have been rendered incapable of providing signal data representative of binding of a sample component. Further methods, apparatus, and computer program products are provided.

摘要翻译： 一种在多个特征位置使用具有化学阵列的化学阵列单元和探针的方法。 可以读取测试请求，哪个测试使用数组的子阵列。 可以使用测试请求从存储器检索子阵列的模式，该存储器携带用于使用不同测试请求可检索的子阵列的模式。 此外，读取已经暴露于样品的化学阵列单元的方法，其特征位置已经不能提供表示样品组分的结合的信号数据。 提供其他方法，装置和计算机程序产品。

公开(公告)号：US20120231968A1

公开(公告)日：2012-09-13

申请号：US13480348

申请日：2012-05-24

申请人： Laurakay Bruhn ,  Alicia F. Scheffer ,  Michael T. Barrett ,  Douglas A. Amorese ,  Stephen S. Laderman

发明人： Laurakay Bruhn ,  Alicia F. Scheffer ,  Michael T. Barrett ,  Douglas A. Amorese ,  Stephen S. Laderman

IPC分类号： C40B30/04

CPC分类号： C12Q1/6837 ,  C12Q1/6809 ,  C12Q2565/501

摘要： Comparative genomic hybridization assays and compositions for use in practicing the same are provided. A characteristic of the subject comparative genomic hybridization assays is that solid support immobilized oligonucleotide feature elements, e.g., in the form of an array, are employed. Specifically, at least first and second nucleic acid populations prepared from genomic templates are contacted with a plurality of distinct oligonucleotide feature elements immobilized on a solid support surface and the binding of the at least first and second populations is then evaluated. Also provided are kits for use in practicing the subject methods.

摘要翻译： 提供了比较基因组杂交测定法和用于实践其的组合物。 本发明比较基因组杂交测定法的特征在于使用固体支持物固定的寡核苷酸特征元件，例如阵列形式。 具体地，从基因组模板制备的至少第一和第二核酸群体与固定在固体支持物表面上的多个不同的寡核苷酸特征元件接触，然后评估至少第一和第二群体的结合。 还提供了用于实践主题方法的套件。

公开(公告)号：US20050026304A1

公开(公告)日：2005-02-03

申请号：US10631033

申请日：2003-07-30

申请人： Laurakay Bruhn ,  Leslie Leonard ,  Peter Webb ,  Paul Wolber ,  Douglas Amorese

发明人： Laurakay Bruhn ,  Leslie Leonard ,  Peter Webb ,  Paul Wolber ,  Douglas Amorese

IPC分类号： G01N33/543

CPC分类号： G01N33/54366 ,  G01N33/54373

摘要： An apparatus and method for separating and identifying chemical moieties. The apparatus employs a microarray device coupled to a nanopore system. The apparatus both separates and identifies target molecules without the requirement of extraneous tags or fluorescent markers. Methods for using the apparatus are also disclosed.

摘要翻译： 用于分离和鉴定化学部分的装置和方法。 该装置采用耦合到纳米孔系统的微阵列装置。 该装置既分离和鉴定靶分子，又不需要外来标签或荧光标记物。 还公开了使用该装置的方法。

公开(公告)号：US06458583B1

公开(公告)日：2002-10-01

申请号：US09150504

申请日：1998-09-09

申请人： Laurakay Bruhn ,  Michael P. Caren ,  Carol T. Schembri ,  Arthur Schleifer

发明人： Laurakay Bruhn ,  Michael P. Caren ,  Carol T. Schembri ,  Arthur Schleifer

IPC分类号： C12M134

CPC分类号： B01L3/0268 ,  B01J19/0046 ,  B01J2219/00378 ,  B01J2219/00529 ,  B01J2219/0059 ,  B01J2219/00608 ,  B01J2219/00612 ,  B01J2219/00637 ,  B01J2219/00677 ,  B01J2219/00722 ,  B01L2400/0442 ,  B82Y30/00 ,  C40B40/06 ,  C40B60/14 ,  Y10T436/143333

摘要： Methods and devices for depositing a nucleic acid on a substrate surface are provided. In the subject methods, a thermal inkjet head loaded with nucleic acid fluid composition is positioned in opposing relationship to, e.g. over, a substrate surface. Actuation of the thermal inkjet results in the expulsion of volume of the nucleic acid composition onto the substrate surface. The subject methods and devices find use in a variety of applications, particularly in the preparation of nucleic acid arrays, and more particular arrays of oligonucleotides or polynucleotides, e.g. cDNAs.

摘要翻译： 提供了用于在基底表面上沉积核酸的方法和装置。 在本发明的方法中，装载有核酸流体组合物的热喷墨头与例如， 在基底表面上。 热喷墨的致动导致将核酸组合物的体积排出到基底表面上。 本发明的方法和装置可用于各种应用，特别是在制备核酸阵列，以及更具体的寡核苷酸或多核苷酸阵列，例如， cDNAs。