公开(公告)号：US09102924B2

公开(公告)日：2015-08-11

申请号：US12425303

申请日：2009-04-16

申请人： Keith A. Bauer ,  Ellen Fiss ,  David H. Gelfand ,  Edward S. Smith ,  Shawn Suko ,  Olga Budker ,  Nancy Schoenbrunner ,  Susanne Stoffel ,  Thomas Myers

发明人： Keith A. Bauer ,  Ellen Fiss ,  David H. Gelfand ,  Edward S. Smith ,  Shawn Suko ,  Olga Budker ,  Nancy Schoenbrunner ,  Susanne Stoffel ,  Thomas Myers

IPC分类号： C12N9/12

CPC分类号： C12N9/1252 ,  C12N9/1276 ,  C12P19/34

摘要： Disclosed are mutant DNA polymerases having improved extension rates relative to a corresponding, unmodified polymerase. The mutant polymerases are useful in a variety of disclosed primer extension methods. The mutant polymerases overcome the inhibitory effects by an intercalating dye. Therefore, the mutant polymerases are useful in a variety of disclosed methods in combination with an intercalating dye. Also disclosed are related compositions, including recombinant nucleic acids, vectors, and host cells, which are useful, e.g., for production of the mutant DNA polymerases.

摘要翻译： 公开了相对于相应的未修饰聚合酶具有改进的延伸速率的突变型DNA聚合酶。 突变型聚合酶可用于各种公开的引物延伸方法。 突变型聚合酶克服了嵌入染料的抑制作用。 因此，突变型聚合酶可与各种公开的方法结合插入染料使用。 还公开了相关组合物，包括重组核酸，载体和宿主细胞，其可用于例如用于产生突变型DNA聚合酶。

公开(公告)号：US20090280539A1

公开(公告)日：2009-11-12

申请号：US12425303

申请日：2009-04-16

申请人： Keith A. Bauer ,  Ellen Fiss ,  David H. Gelfand ,  Edward S. Smith ,  Shawn Suko ,  Olga Budker ,  Nancy Schoenbrunner ,  Susanne Stoffel

发明人： Keith A. Bauer ,  Ellen Fiss ,  David H. Gelfand ,  Edward S. Smith ,  Shawn Suko ,  Olga Budker ,  Nancy Schoenbrunner ,  Susanne Stoffel

IPC分类号： C12P19/34 ,  C12N9/12

CPC分类号： C12N9/1252 ,  C12N9/1276 ,  C12P19/34

摘要： Disclosed are mutant DNA polymerases having improved extension rates relative to a corresponding, unmodified polymerase. The mutant polymerases are useful in a variety of disclosed primer extension methods. The mutant polymerases overcome the inhibitory effects by an intercalating dye. Therefore, the mutant polymerases are useful in a variety of disclosed methods in combination with an intercalating dye. Also disclosed are related compositions, including recombinant nucleic acids, vectors, and host cells, which are useful, e.g., for production of the mutant DNA polymerases.

摘要翻译： 公开了相对于相应的未修饰聚合酶具有改进的延伸速率的突变型DNA聚合酶。 突变型聚合酶可用于各种公开的引物延伸方法。 突变型聚合酶克服了嵌入染料的抑制作用。 因此，突变型聚合酶可与各种公开的方法结合插入染料使用。 还公开了相关组合物，包括重组核酸，载体和宿主细胞，其可用于例如用于产生突变型DNA聚合酶。

公开(公告)号：US20110294168A1

公开(公告)日：2011-12-01

申请号：US13088049

申请日：2011-04-15

申请人： Keith A. Bauer ,  Ellen Fiss ,  David H. Gelfand ,  Edward S. Smith ,  Shawn Suko ,  Thomas Myers ,  Joseph San Filippo ,  Rachel Shahinian

发明人： Keith A. Bauer ,  Ellen Fiss ,  David H. Gelfand ,  Edward S. Smith ,  Shawn Suko ,  Thomas Myers ,  Joseph San Filippo ,  Rachel Shahinian

IPC分类号： C12P19/34 ,  C12N9/12

CPC分类号： C12P19/34 ,  C12N9/1252 ,  C12N9/1276 ,  C12Q1/686 ,  C12Y207/07049

摘要： Disclosed are mutant DNA polymerases having improved extension rates relative to a corresponding, unmodified polymerase. The mutant polymerases are useful in a variety of disclosed primer extension methods. The mutant polymerases overcome the inhibitory effects of a variety of polymerase and reverse transcriptase inhibitors. Therefore, the mutant polymerases are useful in a variety of disclosed methods in the presence of such inhibitors.

摘要翻译： 公开了相对于相应的未修饰聚合酶具有改进的延伸速率的突变型DNA聚合酶。 突变型聚合酶可用于各种公开的引物延伸方法。 突变型聚合酶克服了多种聚合酶和逆转录酶抑制剂的抑制作用。 因此，在这种抑制剂的存在下，突变型聚合酶可用于各种公开的方法。

公开(公告)号：US08962293B2

公开(公告)日：2015-02-24

申请号：US11873896

申请日：2007-10-17

申请人： Keith A. Bauer ,  Ellen Fiss ,  David H. Gelfand ,  Edward S. Smith ,  Shawn Suko ,  Thomas Myers

发明人： Keith A. Bauer ,  Ellen Fiss ,  David H. Gelfand ,  Edward S. Smith ,  Shawn Suko ,  Thomas Myers

IPC分类号： C12N9/12

CPC分类号： C12N9/1252 ,  C12N9/1276 ,  C12P19/34

摘要： Disclosed are mutant DNA polymerases having improved extension rates relative to a corresponding, unmodified polymerase. The mutant polymerases are useful in a variety of disclosed primer extension methods. Also disclosed are related compositions, including recombinant nucleic acids, vectors, and host cells, which are useful, e.g., for production of the mutant DNA polymerases.

摘要翻译： 公开了相对于相应的未修饰聚合酶具有改进的延伸速率的突变型DNA聚合酶。 突变型聚合酶可用于各种公开的引物延伸方法。 还公开了相关组合物，包括重组核酸，载体和宿主细胞，其可用于例如用于产生突变型DNA聚合酶。

公开(公告)号：US20090148891A1

公开(公告)日：2009-06-11

申请号：US11873896

申请日：2007-10-17

申请人： Keith A. Bauer ,  Ellen Fiss ,  David H. Gelfand ,  Edward S. Smith ,  Shawn Suko

发明人： Keith A. Bauer ,  Ellen Fiss ,  David H. Gelfand ,  Edward S. Smith ,  Shawn Suko

IPC分类号： C12P21/02 ,  C12N9/00 ,  C12N15/11 ,  C12P19/34 ,  C12N15/00 ,  C12N1/21

CPC分类号： C12N9/1252 ,  C12N9/1276 ,  C12P19/34

摘要： Disclosed are mutant DNA polymerases having improved extension rates relative to a corresponding, unmodified polymerase. The mutant polymerases are useful in a variety of disclosed primer extension methods. Also disclosed are related compositions, including recombinant nucleic acids, vectors, and host cells, which are useful, e.g., for production of the mutant DNA polymerases.

摘要翻译： 公开了相对于相应的未修饰聚合酶具有改进的延伸速率的突变型DNA聚合酶。 突变型聚合酶可用于各种公开的引物延伸方法。 还公开了相关组合物，包括重组核酸，载体和宿主细胞，其可用于例如用于产生突变型DNA聚合酶。

公开(公告)号：US20100041053A1

公开(公告)日：2010-02-18

申请号：US12538971

申请日：2009-08-11

申请人： Ellen Fiss ,  Thomas William Myers

发明人： Ellen Fiss ,  Thomas William Myers

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12P19/34 ,  C07H21/00 ,  C12N9/10

CPC分类号： C12Q1/6853 ,  C12Q2525/185 ,  C12Q2525/125 ,  C12Q2525/113 ,  C12Q2525/121

摘要： The present invention provides for primer extension reactions, including polymerase chain reactions, in which a polymerase having 3′-5′ exonuclease activity edits a primer that is not fully complementary thereby allowing for amplification and detection of target nucleic acids that may have variability in their sequences.

摘要翻译： 本发明提供引物延伸反应，包括聚合酶链反应，其中具有3'-5'核酸外切酶活性的聚合酶编码不完全互补的引物，从而允许扩增和检测可能具有它们的变异性的靶核酸 序列。

公开(公告)号：US07989168B2

公开(公告)日：2011-08-02

申请号：US12538971

申请日：2009-08-11

申请人： Ellen Fiss ,  Thomas William Myers

发明人： Ellen Fiss ,  Thomas William Myers

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6853 ,  C12Q2525/185 ,  C12Q2525/125 ,  C12Q2525/113 ,  C12Q2525/121

摘要： The present invention provides for primer extension reactions, including polymerase chain reactions, in which a polymerase having 3′-5′ exonuclease activity edits a primer that is not fully complementary thereby allowing for amplification and detection of target nucleic acids that may have variability in their sequences.

摘要翻译： 本发明提供引物延伸反应，包括聚合酶链反应，其中具有3'-5'核酸外切酶活性的聚合酶编码不完全互补的引物，从而允许扩增和检测可能具有它们的变异性的靶核酸 序列。

公开(公告)号：US06465175B2

公开(公告)日：2002-10-15

申请号：US09146157

申请日：1998-09-03

申请人： Thomas Horn ,  Hartmut R. Schroeder ,  Brian D. Warner ,  Ellen Fiss ,  Todd Sells ,  Say-Jong Law

发明人： Thomas Horn ,  Hartmut R. Schroeder ,  Brian D. Warner ,  Ellen Fiss ,  Todd Sells ,  Say-Jong Law

IPC分类号： C12Q168

CPC分类号： C07H21/00 ,  C12Q1/6816 ,  C12Q1/6818

摘要： Methods are provided for reducing background signals encountered in nucleic acid hybridization assays and other assays that involve hybridization of a labeled oligomer to its complement. The method is premised on the significant reduction of signal generation that occurs when a quenchable dye-labeled oligomer forms a hybrid complex. In addition, a method is provided for enhancing the detectable signal emitted from an amplification multimer hybridized to an oligomer probe to which a quenchable dye has been conjugated through a linker such that the emission from the dye is not quenched upon hybrid complex formation. Novel oligonucleotide probes are also provided that comprise an oligomer to which has been directly or indirectly through a linker a quenchable dye.

摘要翻译： 提供了用于减少在核酸杂交测定中遇到的背景信号的方法和涉及标记的寡聚物与其互补体杂交的其它测定。 该方法的前提是当可淬灭的染料标记的寡聚物形成杂交复合物时发生的信号产生的显着减少。 此外，提供了一种用于增强从与已经通过接头共轭可淬灭染料的寡聚体探针杂交的扩增多聚体发射的可检测信号的方法，使得来自染料的发射在杂交复合物形成时不被淬灭。 还提供了新的寡核苷酸探针，其包含已经通过接头直接或间接通过可淬灭染料的低聚物。