公开(公告)号：US20130237435A1

公开(公告)日：2013-09-12

申请号：US13825453

申请日：2011-09-22

申请人： Masayuki Machida ,  Hideaki Koike ,  Maiko Umemura ,  Kiyoshi Asai ,  Katsuhisa Horimoto ,  Totai Mitsuyama

发明人： Masayuki Machida ,  Hideaki Koike ,  Maiko Umemura ,  Kiyoshi Asai ,  Katsuhisa Horimoto ,  Totai Mitsuyama

IPC分类号： G06F19/18

CPC分类号： G16B20/00 ,  G16B25/00

摘要： The present invention provides a method for searching for or identifying a useful gene logically, systematically, and efficiently in an extremely short time without largely relying on searcher's knowledge, experience, or the like and even without sequentially conducting gene disruption experiments as in conventional techniques of searching for a useful gene. The present invention also provides an apparatus for the method. Virtual gene clusters each comprising two or more genes are individually scored by summing the respective pieces of differential expression information (obtained using, for example, microarrays) of genomic genes on a per-cluster basis. On the basis of the obtained scores of the virtual gene clusters, a gene cluster containing a useful gene and the useful gene contained in the cluster are searched for.

摘要翻译： 本发明提供了一种用于在非常短的时间内逻辑，系统和有效地搜索或鉴定有用基因的方法，而不需要大量依赖于搜索者的知识，经验等，并且甚至没有依次进行基因破坏实验，如常规技术 寻找有用的基因。 本发明还提供了一种用于该方法的装置。 通过在基于每个簇的基础上对基因组基因的差异表达信息（例如，微阵列获得）的各个片段进行求和来分别计算每个包含两个或更多个基因的虚拟基因簇。 在获得的虚拟基因簇得分的基础上，搜索包含有用基因的基因簇和簇中包含的有用基因。

公开(公告)号：US07186540B2

公开(公告)日：2007-03-06

申请号：US10327388

申请日：2002-12-24

申请人： Masayuki Machida ,  Keietsu Abe ,  Katsuya Gomi ,  Kiyoshi Asai ,  Motoaki Sano ,  Taishin Kin ,  Hideki Nagasaki ,  Akira Hosoyama ,  Osamu Akita ,  Naotake Ogasawara ,  Satoru Kuhara ,  Kotaro Ito ,  Kenichiro Matsushima ,  Yasuji Koyama

发明人： Masayuki Machida ,  Keietsu Abe ,  Katsuya Gomi ,  Kiyoshi Asai ,  Motoaki Sano ,  Taishin Kin ,  Hideki Nagasaki ,  Akira Hosoyama ,  Osamu Akita ,  Naotake Ogasawara ,  Satoru Kuhara ,  Kotaro Ito ,  Kenichiro Matsushima ,  Yasuji Koyama

IPC分类号： C12N9/80 ,  C12N5/00 ,  C12N15/00 ,  C12N1/20 ,  C12N1/00 ,  C07H21/04 ,  C12P21/06 ,  C07K14/00 ,  C12N9/78

CPC分类号： C12N9/80 ,  C12N9/0022 ,  C12N9/48 ,  C12P21/06

摘要： A completely novel glutaminase is provided: (a) a protein consisting of an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, or (b) a protein consisting of an amino acid sequence derived from the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 by deletion, substitution or addition of one or more amino acids, and possessing glutaminase activity. This protein is a novel glutaminase possessing excellent thermostability and the like.

摘要翻译： 提供了一种全新的谷氨酰胺酶：（a）由SEQ ID NO：2所示的氨基酸序列组成的蛋白质，或（b）由SEQ ID NO：2所示的氨基酸序列衍生的氨基酸序列组成的蛋白质， 2通过缺失，取代或添加一个或多个氨基酸，并且具有谷氨酰胺酶活性。 该蛋白质是具有优异的热稳定性等的新型谷氨酰胺酶。

公开(公告)号：US07285407B2

公开(公告)日：2007-10-23

申请号：US11085185

申请日：2005-03-22

申请人： Masayuki Machida ,  Motoaki Sano ,  Misao Sunagawa ,  Tasuku Nakajima ,  Keietsu Abe ,  Katsuya Gomi ,  Kiyoshi Asai ,  Taishin Kin ,  Hideki Nagasaki ,  Akira Hosoyama ,  Osamu Akita ,  Naotake Ogasawara ,  Satoru Kuhara

发明人： Masayuki Machida ,  Motoaki Sano ,  Misao Sunagawa ,  Tasuku Nakajima ,  Keietsu Abe ,  Katsuya Gomi ,  Kiyoshi Asai ,  Taishin Kin ,  Hideki Nagasaki ,  Akira Hosoyama ,  Osamu Akita ,  Naotake Ogasawara ,  Satoru Kuhara

IPC分类号： C12N9/24 ,  C12N9/30 ,  C12N1/00 ,  C12N15/00 ,  C12P21/06 ,  C07H21/02 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12P19/04 ,  C12N9/2405 ,  C12Y302/01039 ,  C12Y302/01058

摘要： The purpose of the present invention is to isolate a gene encoding novel exo-, or endo-β-1,3-glucanase, to obtain a microorganism having an enhanced expression of said gene and to degrade β-1,3-glucan to its low molecular weight form by means of said enzymes. The present invention relates to a gene or DNA encoding novel enzymes having β-1,3-glucanase activity (exo-, or endo-β-1,3-glucanase), a recombinant expression vector comprising them, a microorganism having the recombinant expression vector, the novel enzymes having β-1,3-glucanase activity, and a method for the production of said enzymes.

摘要翻译： 本发明的目的是分离编码新的外切或内切-β-1,3-葡聚糖酶的基因，以获得具有增强的所述基因表达的微生物，并将β-1,3-葡聚糖降解为其 低分子量形式通过所述酶。 本发明涉及编码具有β-1,3-葡聚糖酶活性的新型酶（外切-β-1,3-葡聚糖酶）的基因或DNA，包含它们的重组表达载体，具有重组表达的微生物 载体，具有β-1,3-葡聚糖酶活性的新型酶以及所述酶的生产方法。

公开(公告)号：US20050142650A1

公开(公告)日：2005-06-30

申请号：US10498517

申请日：2002-12-25

申请人： Kensuke Yuuki ,  Atsuki Toumoto ,  Masayuki Machida ,  Katsuya Gomi ,  Kiyoshi Asai ,  Motoaki Sano ,  Taishin Kin ,  Hideki Nagasaki ,  Akira Hosoyama ,  Osamu Akita ,  Naotake Ogasawara ,  Satoru Kuhara

发明人： Kensuke Yuuki ,  Atsuki Toumoto ,  Masayuki Machida ,  Katsuya Gomi ,  Kiyoshi Asai ,  Motoaki Sano ,  Taishin Kin ,  Hideki Nagasaki ,  Akira Hosoyama ,  Osamu Akita ,  Naotake Ogasawara ,  Satoru Kuhara

IPC分类号： C12N1/15 ,  C12N1/19 ,  C12N1/21 ,  C12N9/06 ,  C12N9/48 ,  C12N9/62 ,  C12N9/80 ,  C12N15/52 ,  C12N15/53 ,  C12N15/57 ,  C12P21/06 ,  C07H21/04 ,  C12N1/16 ,  C12N1/18 ,  C12N15/74

CPC分类号： C12N9/80 ,  C12N9/0022 ,  C12N9/48 ,  C12P21/06

摘要： Lysyl oxidase derived from filamentous fungi and a DNA encoding thereof are provided. Lysyl oxidase including a protein described in of the following (a) or (b): (a) a protein having an amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2; or (b) a protein having an amino acid sequence obtained by modifying a part of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2, and functioning as lysyl oxidase.

摘要翻译： 提供衍生自丝状真菌的赖氨酰氧化酶及其编码的DNA。 包含以下（a）或（b）所述的蛋白质的赖氨酰氧化酶：（a）具有SEQ ID NO：2所示的氨基酸序列的蛋白质; 或（b）具有通过修饰SEQ ID NO：2所示氨基酸序列的一部分而作为赖氨酰氧化酶起作用的氨基酸序列的蛋白质。

公开(公告)号：US07348170B2

公开(公告)日：2008-03-25

申请号：US10498517

申请日：2002-12-25

申请人： Kensuke Yuuki ,  Atsuki Toumoto ,  Masayuki Machida ,  Keietsu Abe ,  Katsuya Gomi ,  Kiyoshi Asai ,  Motoaki Sano ,  Taishin Kin ,  Hideki Nagasaki ,  Akira Hosoyama ,  Osamu Akita ,  Naotake Ogasawara ,  Satoru Hisahara

发明人： Kensuke Yuuki ,  Atsuki Toumoto ,  Masayuki Machida ,  Keietsu Abe ,  Katsuya Gomi ,  Kiyoshi Asai ,  Motoaki Sano ,  Taishin Kin ,  Hideki Nagasaki ,  Akira Hosoyama ,  Osamu Akita ,  Naotake Ogasawara ,  Satoru Hisahara

IPC分类号： C12N9/02 ,  C12N15/00 ,  C12N1/00 ,  C12P21/06 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12N9/80 ,  C12N9/0022 ,  C12N9/48 ,  C12P21/06

摘要： Lysyl oxidase derived from filamentous fungi and a DNA encoding thereof are provided. Lysyl oxidase including a protein described in of the following (a) or (b): (a) a protein having an amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2; or (b) a protein having an amino acid sequence obtained by modifying a part of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2, and functioning as lysyl oxidase.

摘要翻译： 提供衍生自丝状真菌的赖氨酰氧化酶及其编码的DNA。 包含以下（a）或（b）所述的蛋白质的赖氨酰氧化酶：（a）具有SEQ ID NO：2所示的氨基酸序列的蛋白质; 或（b）具有通过修饰SEQ ID NO：2所示氨基酸序列的一部分而作为赖氨酰氧化酶起作用的氨基酸序列的蛋白质。

公开(公告)号：US20070004003A1

公开(公告)日：2007-01-04

申请号：US10547708

申请日：2004-03-02

申请人： Katsuhiko Kitamoto ,  Manabu Arioka ,  Shotaro Yamaguchi ,  Masayuki Machida ,  Keletsu Abe ,  Katsuya Gomi ,  Kiyoshi Asai ,  Motoaki Sano ,  Taishin Kin ,  Hideki Nagasaki ,  Akira Hosoyama ,  Osamu Akita ,  Naotake Ogasawara ,  Satoru Kuhara

发明人： Katsuhiko Kitamoto ,  Manabu Arioka ,  Shotaro Yamaguchi ,  Masayuki Machida ,  Keletsu Abe ,  Katsuya Gomi ,  Kiyoshi Asai ,  Motoaki Sano ,  Taishin Kin ,  Hideki Nagasaki ,  Akira Hosoyama ,  Osamu Akita ,  Naotake Ogasawara ,  Satoru Kuhara

IPC分类号： C12P21/06 ,  C12N9/16 ,  C07H21/04 ,  C12N1/16 ,  C12N15/74

CPC分类号： C12N9/20 ,  C12Y301/01004

摘要： It is intended to provide koji mold-origin phospholipase A2 and a DNA encoding it. Namely, phospholipase A2 comprising the following protein (a) or (b): (a) a protein having an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or 2; and (b) a protein having an amino acid sequence derived from an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or 2 by a partial modification and serving as phospholipase A2.

摘要翻译： 旨在提供曲霉起源磷脂酶A 2 N 2和编码它的DNA。 即，包含以下蛋白质（a）或（b）的磷脂酶A 2 ：（a）具有SEQ ID NO：1或2所示的氨基酸序列的蛋白质; 和（b）通过部分修饰具有源自SEQ ID NO：1或2所示的氨基酸序列的氨基酸序列并用作磷脂酶A 2的蛋白质。

公开(公告)号：US20050287634A1

公开(公告)日：2005-12-29

申请号：US11085185

申请日：2005-03-22

申请人： Masayuki Machida ,  Motoaki Sano ,  Misao Sunagawa ,  Tasuku Nakajima ,  Keietsu Abe ,  Katsuya Gomi ,  Kiyoshi Asai ,  Taishin Kin ,  Hideki Nagasaki ,  Akira Hosoyama ,  Osamu Akita ,  Naotake Ogasawara ,  Satoru Kuhara

发明人： Masayuki Machida ,  Motoaki Sano ,  Misao Sunagawa ,  Tasuku Nakajima ,  Keietsu Abe ,  Katsuya Gomi ,  Kiyoshi Asai ,  Taishin Kin ,  Hideki Nagasaki ,  Akira Hosoyama ,  Osamu Akita ,  Naotake Ogasawara ,  Satoru Kuhara

IPC分类号： C07H21/04 ,  C12N1/16 ,  C12N9/24 ,  C12N15/74 ,  C12P19/04 ,  C12P21/06

CPC分类号： C12P19/04 ,  C12N9/2405 ,  C12Y302/01039 ,  C12Y302/01058

摘要： The purpose of the present invention is to isolate a gene encoding novel exo-, or endo-β-1,3-glucanase, to obtain a microorganism having an enhanced expression of said gene and to degrade β-1,3-glucan to its low molecular weight form by means of said enzymes. The present invention relates to a gene or DNA encoding novel enzymes having β-1,3-glucanase activity (exo-, or endo-β-1,3-glucanase), a recombinant expression vector comprising them, a microorganism having the recombinant expression vector, the novel enzymes having β-1,3-glucanase activity, and a method for the production of said enzymes.

摘要翻译： 本发明的目的是分离编码新的外切或内切-β-1,3-葡聚糖酶的基因，以获得具有增强的所述基因表达的微生物，并将β-1,3-葡聚糖降解为其 低分子量形式通过所述酶。 本发明涉及编码具有β-1,3-葡聚糖酶活性的新型酶（外切-β-1,3-葡聚糖酶）的基因或DNA，包含它们的重组表达载体，具有重组表达的微生物 载体，具有β-1,3-葡聚糖酶活性的新型酶以及所述酶的生产方法。

公开(公告)号：US07763444B2

公开(公告)日：2010-07-27

申请号：US12489827

申请日：2009-06-23

申请人： Katsuhiko Kitamoto ,  Manabu Arioka ,  Shotaro Yamaguchi ,  Masayuki Machida ,  Keietsu Abe ,  Katsuya Gomi ,  Kiyoshi Asai ,  Motoaki Sano ,  Taishin Kin ,  Hideki Nagasaki ,  Akira Hosoyama ,  Osamu Akita ,  Naotake Ogasawara ,  Satoru Kuhara

发明人： Katsuhiko Kitamoto ,  Manabu Arioka ,  Shotaro Yamaguchi ,  Masayuki Machida ,  Keietsu Abe ,  Katsuya Gomi ,  Kiyoshi Asai ,  Motoaki Sano ,  Taishin Kin ,  Hideki Nagasaki ,  Akira Hosoyama ,  Osamu Akita ,  Naotake Ogasawara ,  Satoru Kuhara

IPC分类号： C12N1/15 ,  C12N15/74 ,  C07H21/00

CPC分类号： C12N9/20 ,  C12Y301/01004

摘要： It is intended to provide koji mold-origin phospholipase A2 and a DNA encoding it. Namely, phospholipase A2 comprising the following protein (a) or (b): (a) a protein having an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or 2; and (b) a protein having an amino acid sequence derived from an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or 2 by a partial modification and serving as phospholipase A2.

摘要翻译： 旨在提供曲霉起源磷脂酶A2和编码它的DNA。 即，包含以下蛋白质（a）或（b）的磷脂酶A2：（a）具有SEQ ID NO：1或2所示的氨基酸序列的蛋白质; 和（b）通过部分修饰具有源自SEQ ID NO：1或2所示的氨基酸序列的氨基酸序列并作为磷脂酶A2的蛋白质。

公开(公告)号：US20090263888A1

公开(公告)日：2009-10-22

申请号：US12489827

申请日：2009-06-23

申请人： Katsuhiko Kitamoto ,  Manabu Arioka ,  Shotaro Yamaguchi ,  Masayuki Machida ,  Keietsu Abe ,  Katsuya Gomi ,  Kiyoshi Asai ,  Motoaki Sano ,  Taishin Kin ,  Hideki Nagasaki ,  Akira Hosoyama ,  Osamu Akita ,  Naotake Ogasawara ,  Satoru Kuhara

发明人： Katsuhiko Kitamoto ,  Manabu Arioka ,  Shotaro Yamaguchi ,  Masayuki Machida ,  Keietsu Abe ,  Katsuya Gomi ,  Kiyoshi Asai ,  Motoaki Sano ,  Taishin Kin ,  Hideki Nagasaki ,  Akira Hosoyama ,  Osamu Akita ,  Naotake Ogasawara ,  Satoru Kuhara

IPC分类号： C12N1/15 ,  C07H21/00 ,  C12N15/74

CPC分类号： C12N9/20 ,  C12Y301/01004

摘要： It is intended to provide koji mold-origin phospholipase A2 and a DNA encoding it. Namely, phospholipase A2 comprising the following protein (a) or (b): (a) a protein having an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or 2; and (b) a protein having an amino acid sequence derived from an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or 2 by a partial modification and serving as phospholipase A2.

摘要翻译： 旨在提供曲霉起源磷脂酶A2和编码它的DNA。 即，包含以下蛋白质（a）或（b）的磷脂酶A2：（a）具有SEQ ID NO：1或2所示的氨基酸序列的蛋白质; 和（b）通过部分修饰具有源自SEQ ID NO：1或2所示的氨基酸序列的氨基酸序列并作为磷脂酶A2的蛋白质。

公开(公告)号：US20060234320A1

公开(公告)日：2006-10-19

申请号：US10500251

申请日：2002-12-26

申请人： Masayuki Machida ,  Keietsu Abe ,  Katsuya Gomi ,  Kiyoshi Asai ,  Motoaki Sano ,  Taishin Kin ,  Hideki Nagasaki ,  Akira Hosoyama ,  Osamu Akita ,  Naotake Ogasawara ,  Satoru Kuhara ,  Chikara Tokunaga ,  Itaru Toda ,  Chiaki Saitoh ,  Akihiro Senoh

发明人： Masayuki Machida ,  Keietsu Abe ,  Katsuya Gomi ,  Kiyoshi Asai ,  Motoaki Sano ,  Taishin Kin ,  Hideki Nagasaki ,  Akira Hosoyama ,  Osamu Akita ,  Naotake Ogasawara ,  Satoru Kuhara ,  Chikara Tokunaga ,  Itaru Toda ,  Chiaki Saitoh ,  Akihiro Senoh

IPC分类号： G01N33/569 ,  C07H21/04 ,  C12P21/06 ,  C12N9/50 ,  C12N15/74 ,  C12N1/16

CPC分类号： C12N9/80 ,  C12N9/0022 ,  C12N9/48 ,  C12P21/06

摘要： The present invention provides DNA encoding novel pyroglutamyl peptidase derived from Aspergillus oryzae, pyroglutamyl peptidase which is produced by using the DNA, and a method for producing a protein lysate with a good flavor at a high hydrolysis rate.

摘要翻译： 本发明提供了编码来自米曲霉的新型焦谷氨酰肽酶的DNA，通过使用该DNA产生的焦谷氨酰肽酶，以及以高水解速率生产具有良好风味的蛋白质裂解物的方法。