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    ENZYME MUTANT
    1.
    发明申请
    ENZYME MUTANT 审中-公开

    公开(公告)号：US20120100530A1

    公开(公告)日：2012-04-26

    申请号：US13147171

    申请日：2010-01-29

    申请人： Ruth Moysey ,  Michael Knaggs ,  Lakmal Jayasinghe ,  James White ,  Brian Mckeown ,  John Milton

    发明人： Ruth Moysey ,  Michael Knaggs ,  Lakmal Jayasinghe ,  James White ,  Brian Mckeown ,  John Milton

    IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12N9/16 ,  C07H21/04 ,  C12N11/00

    CPC分类号： C12N9/22 ,  C07K14/31 ,  C07K2319/03 ,  C12N9/1241 ,  C12N9/90

    摘要： The invention relates to constructs comprising a nucleic acid binding protein and a surface. At least one native accessible cysteine residue is removed from the binding protein. The binding protein is attached to the surface via one or more accessible cysteine residues. The removal of other accessible cysteine residues from the protein allows control attachment to the surface. The constructs can be used to generate transmembrane pores having a nucleic acid binding protein attached thereto. Such pores are particularly useful for sequencing nucleic acids. The enzyme handles the nucleic acid in such a way that the pore can detect each of its component nucleotides by stochastic sensing.

    摘要翻译： 本发明涉及包含核酸结合蛋白和表面的构建体。 从结合蛋白中去除至少一种天然存在的半胱氨酸残基。 结合蛋白通过一个或多个可接近的半胱氨酸残基连接到表面。 从蛋白质中去除其他可获得的半胱氨酸残基允许控制附着于表面。 构建体可用于产生具有与其连接的核酸结合蛋白的跨膜孔。 这样的孔特别可用于测序核酸。 酶以这样的方式处理核酸，使得孔可以通过随机感测来检测其每个组分核苷酸。

    HYBRIDIZATION LINKERS
    2.
    发明申请
    HYBRIDIZATION LINKERS 有权
    混合连接

    公开(公告)号：US20120064599A1

    公开(公告)日：2012-03-15

    申请号：US13147176

    申请日：2010-01-29

    申请人： Lakmal Jayasinghe ,  John Milton ,  Luke McNeill ,  James Clarke ,  James White ,  Ruth Moysey

    发明人： Lakmal Jayasinghe ,  John Milton ,  Luke McNeill ,  James Clarke ,  James White ,  Ruth Moysey

    IPC分类号： C07H21/00 ,  C09K3/00 ,  C12N9/96 ,  C07H1/00 ,  C07K14/00 ,  C07K1/107

    CPC分类号： C12N9/22 ,  C07K14/31 ,  C07K2319/03 ,  C12N9/1241 ,  C12N9/90

    摘要： The invention provides method of covalently coupling two or more moieties, the method comprising: (a) providing a first moiety having covalently attached thereto (i) at least one first linker comprising a first hybridizable region and (ii) at least one first group capable of forming a covalent bond; (b) providing a second moiety having covalently attached thereto (i) at least one second linker comprising a second hybridizable region capable of hybridizing to the first hybridizable region and (ii) at least a second group capable of forming a covalent bond with the first group; (c) contacting the first and second moieties under conditions that allow the first and second hybridizable regions to hybridize and link the moieties; and (d) exposing the linked moieties to conditions that allow the formation of a covalent bond between the first and second groups.

    摘要翻译： 本发明提供了共价偶联两个或更多个部分的方法，所述方法包括：（a）提供共价连接到其上的第一部分（i）至少一个包含第一可杂交区域的第一接头和（ii）至少一个能够 形成共价键; （b）提供共价连接到其上的第二部分（i）至少一个第二接头，其包含能够与第一可杂交区域杂交的第二可杂交区域和（ii）至少第二个能够与第一可共< 组; （c）在允许第一和第二可杂交区域杂交并连接部分的条件下使第一和第二部分接触; 和（d）将连接的部分暴露于允许在第一和第二基团之间形成共价键的条件。

    Hybridization linkers
    3.
    发明授权
    Hybridization linkers 有权
    杂交接头

    公开(公告)号：US09222082B2

    公开(公告)日：2015-12-29

    申请号：US13147176

    申请日：2010-01-29

    申请人： Lakmal Jayasinghe ,  John Milton ,  Luke McNeill ,  James Anthony Clarke ,  James White ,  Ruth Moysey

    发明人： Lakmal Jayasinghe ,  John Milton ,  Luke McNeill ,  James Anthony Clarke ,  James White ,  Ruth Moysey

    IPC分类号： C07K1/00 ,  C07K1/10 ,  A61K38/00 ,  C12Q1/68 ,  C12N9/22 ,  C07K14/31 ,  C12N9/12 ,  C12N9/90

    CPC分类号： C12N9/22 ,  C07K14/31 ,  C07K2319/03 ,  C12N9/1241 ,  C12N9/90

    摘要： The invention provides method of covalently coupling two or more moieties, the method comprising: (a) providing a first moiety having covalently attached thereto (i) at least one first linker comprising a first hybridizable region and (ii) at least one first group capable of forming a covalent bond; (b) providing a second moiety having covalently attached thereto (i) at least one second linker comprising a second hybridizable region capable of hybridizing to the first hybridizable region and (ii) at least a second group capable of forming a covalent bond with the first group; (c) contacting the first and second moieties under conditions that allow the first and second hybridizable regions to hybridize and link the moieties; and (d) exposing the linked moieties to conditions that allow the formation of a covalent bond between the first and second groups.

    摘要翻译： 本发明提供了共价偶联两个或更多个部分的方法，所述方法包括：（a）提供共价连接到其上的第一部分（i）至少一个包含第一可杂交区域的第一接头和（ii）至少一个能够 形成共价键; （b）提供共价连接到其上的第二部分（i）至少一个第二接头，其包含能够与第一可杂交区域杂交的第二可杂交区域和（ii）至少第二个能够与第一可共< 组; （c）在允许第一和第二可杂交区域杂交并连接部分的条件下使第一和第二部分接触; 和（d）将连接的部分暴露于允许在第一和第二基团之间形成共价键的条件。

    Modified nucleotides
    6.
    发明授权
    Modified nucleotides 有权
    修饰的核苷酸

    公开(公告)号：US08071739B2

    公开(公告)日：2011-12-06

    申请号：US12804352

    申请日：2010-07-20

    申请人： John Milton ,  Xiaolin Wu ,  Mark Smith ,  Joseph Brennan ,  Colin Barnes ,  Xiaohai Liu ,  Silke Ruediger

    发明人： John Milton ,  Xiaolin Wu ,  Mark Smith ,  Joseph Brennan ,  Colin Barnes ,  Xiaohai Liu ,  Silke Ruediger

    IPC分类号： C07H21/02 ,  C07H21/04 ,  C07H19/04 ,  C12Q1/68

    CPC分类号： C12Q1/6869 ,  C07H1/00 ,  C07H19/06 ,  C07H19/10 ,  C07H19/14 ,  C07H19/16 ,  C07H19/20 ,  C07H21/00 ,  C12Q2525/186 ,  C12Q2535/113 ,  Y02P20/55 ,  C12Q2525/197

    摘要： The invention provides modified nucleotide or nucleoside molecule comprising a purine or pyrimidine base and a ribose or deoxyribose sugar moiety having a removable 3′-OH blocking group covalently attached thereto, such that the 3′ carbon atom has attached a group of the structure —O—Z wherein Z is any of —C(R′)2-O—R″, —C(R′)2-N(R″)2, —C(R′)2-N(H)R″, —C(R′)2-S—R″ and —C(R′)2-F, wherein each R″ is or is part of a removable protecting group; each R′ is independently a hydrogen atom, an alkyl, substituted alkyl, arylalkyl, alkenyl, alkynyl, aryl, heteroaryl, heterocyclic, acyl, cyano, alkoxy, aryloxy, heteroaryloxy or amido group, or a detectable label attached through a linking group; or (R′)2 represents an alkylidene group of formula ═C(R′″)2 wherein each R′″ may be the same or different and is selected from the group comprising hydrogen and halogen atoms and alkyl groups; and wherein said molecule may be reacted to yield an intermediate in which each R″ is exchanged for H or, where Z is —C(R′)2-F, the F is exchanged for OH, SH or NH2, preferably OH, which intermediate dissociates under aqueous conditions to afford a molecule with a free 3′OH; with the proviso that where Z is —C(R′)2-S—R″, both R′ groups are not H.

    摘要翻译： 本发明提供了修饰的核苷酸或核苷分子，其包含嘌呤或嘧啶碱基和核糖或脱氧核糖糖部分，其具有共价连接到其上的可移除的3'-OH封闭基团，使得3'碳原子连接一组结构-O -Z其中Z是-C（R'）2 -O-R“，-C（R'）2 -N（R”）2，-C（R'）2 -N（H）R“ -C（R'）2 -S-R“和-C（R'）2 -F，其中每个R”为或可移除的保护基团的一部分; 每个R'独立地是氢原子，烷基，取代的烷基，芳基烷基，烯基，炔基，芳基，杂芳基，杂环，酰基，氰基，烷氧基，芳氧基，杂芳氧基或酰氨基，或通过连接基团连接的可检测标记; 或（R'）2表示式≡C（R'“）2的亚烷基，其中每个R”可以相同或不同，并且选自氢和卤素原子和烷基; 并且其中所述分子可以反应以产生其中每个R“被交换为H的中间体，或其中Z是-C（R'）2 -F，F被交换成OH，SH或NH 2，优选OH，其中 中间体在水性条件下解离得到具有游离3'OH的分子; 条件是其中Z是-C（R'）2 -S-R“，两个R'基团不是H.