公开(公告)号：WO2010054004A2

公开(公告)日：2010-05-14

申请号：PCT/US2009063296

申请日：2009-11-04

Applicant: BLOOD CELL STORAGE INC ,  REED MICHAEL W ,  NANASSY OLIVER Z ,  HAYDOCK PAUL V ,  GESTWICK DANIEL P

Inventor： REED MICHAEL W ,  NANASSY OLIVER Z ,  HAYDOCK PAUL V ,  GESTWICK DANIEL P

IPC: C12N15/10 ,  B01L99/00 ,  C07H21/00 ,  C12M1/24 ,  C12Q1/68

CPC classification number: B01L3/5027 ,  B01L3/502715 ,  B01L7/525 ,  B01L2200/027 ,  B01L2200/10 ,  B01L2300/0645 ,  B01L2300/0816 ,  B01L2300/0861 ,  B01L2300/0864 ,  B01L2300/087 ,  B01L2300/0887 ,  B01L2300/1827 ,  B01L2400/0406 ,  B01L2400/0457 ,  B01L2400/0487 ,  B01L2400/0622 ,  B01L2400/0688 ,  B01L2400/084 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6851 ,  Y02P20/582 ,  Y10T137/85986 ,  C12Q2565/629 ,  C12Q2565/137 ,  C12Q2563/173

Abstract: Processes for extracting nucleic acid from a biological sample and related assemblies and kits are disclosed. The processes comprise the steps of (a) providing a device comprising an inner surface, an outer surface, a first port, and a second port, wherein the inner surface is composed of unmodified, smooth glass and defines a tubular lumen providing fluid communication between the first port and second port, wherein the lumen is circular, oval, or elliptical in cross-section, and wherein the lumen is essentially free of nucleic acid-specific binding sites; (b) introducing a nucleic acid-containing sample into the lumen of the device via the first port; (c) allowing nucleic acid in the sample to bind to the unmodified smooth glass surface; and (d) washing the bound nucleic acid.

Abstract translation: 公开了用于从生物样品和相关组件和试剂盒中提取核酸的方法。 所述方法包括以下步骤：（a）提供包括内表面，外表面，第一端口和第二端口的装置，其中所述内表面由未改性的光滑玻璃组成，并限定提供流体连通的管状内腔 所述第一端口和所述第二端口，其中所述内腔的横截面为圆形，椭圆形或椭圆形，并且其中所述内腔基本上没有核酸特异性结合位点; （b）通过第一端口将含有核酸的样品引入装置的内腔; （c）使样品中的核酸与未修饰的平滑玻璃表面结合; 和（d）洗涤结合的核酸。

公开(公告)号：WO2010043512A1

公开(公告)日：2010-04-22

申请号：PCT/EP2009/062926

申请日：2009-10-06

Applicant: F. HOFFMANN-LA ROCHE AG ,  ROEHL, Ingo ,  SCHUSTER, Markus ,  SEIFFERT, Stephan

Inventor： ROEHL, Ingo ,  SCHUSTER, Markus ,  SEIFFERT, Stephan

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6816 ,  C12Q2525/107 ,  C12Q2525/207 ,  C12Q2563/107 ,  C12Q2565/137

Abstract: The invention relates to a method for the detection of oligonucleotides using anion exchange high performance liquid chromatography. Fluorescently labelled peptide nucleic acid oligomers, complementary to the oligonucleotide are hybridized to the oligonucleotides. Anion exchange high performance liquid chromatography is then performed and the hybridized moieties detected and quantitated. The invention also relates to a method for the simultaneous detection of both strands of an oligonucleotide in parallel from one sample, and a kit for use in qualitative and quantitative detection of one or two strands of an oligonucleotide

Abstract translation: 本发明涉及使用阴离子交换高效液相色谱检测寡核苷酸的方法。 与寡核苷酸互补的荧光标记的肽核酸低聚物与寡核苷酸杂交。 然后进行阴离子交换高效液相色谱，检测和定量杂交部分。 本发明还涉及从一个样品同时检测寡核苷酸两条链的方法，以及用于定性和定量检测寡核苷酸的一条或两条链的试剂盒

公开(公告)号：WO2009034842A1

公开(公告)日：2009-03-19

申请号：PCT/JP2008/065307

申请日：2008-08-27

Applicant: 株式会社カネカ ,  友野 潤

Inventor： 友野 潤

IPC: C12Q1/68 ,  C12M1/00 ,  C12N15/09 ,  G01N33/53 ,  G01N33/566 ,  G01N33/58

CPC classification number: G01N33/5308 ,  C12Q1/6844 ,  G01N33/566 ,  Y02A50/59 ,  C12Q2565/113 ,  C12Q2563/107 ,  C12Q2565/625 ,  C12Q2565/137 ,  C12Q2565/531

Abstract: 　第１物質が特異的に結合することが可能な第１物質結合部位を含む、核酸増幅法によるＤＮＡ増幅断片を用意する。該ＤＮＡ増幅断片を上記第１物質に結合させることによって、該ＤＮＡ増幅断片を濃縮する。ＤＮＡは、濃縮により高感度に検出することができる。したがって、上記構成によれば、核酸増幅法によるＤＮＡ増幅断片を、特殊な装置を必要とすることなく、簡便かつ高精度に検出することができる。

Abstract translation: 提供通过核酸扩增方法产生的DNA扩增片段，其含有第一物质可特异结合的第一物质结合位点。 将DNA扩增片段与第一物质结合以浓缩DNA扩增片段。 该浓度使得能够以高灵敏度检测DNA。 根据该构成，可以简单且高精度地检测通过核酸扩增方法产生的DNA扩增片段，而不需要任何专门的装置。

公开(公告)号：WO2008002882A3

公开(公告)日：2008-04-24

申请号：PCT/US2007072047

申请日：2007-06-25

Applicant: BLOOD CELL STORAGE INC ,  REED MICHAEL W ,  NANASSY OLIVIER Z ,  HAYDOCK PAUL V ,  SHARMA NIGEL R ,  BARDELL RONALD L ,  HARGRAVE PERRY

Inventor： REED MICHAEL W ,  NANASSY OLIVIER Z ,  HAYDOCK PAUL V ,  SHARMA NIGEL R ,  BARDELL RONALD L ,  HARGRAVE PERRY

IPC: C12Q1/68 ,  B01L3/00

CPC classification number: C12Q1/6851 ,  B01L3/5027 ,  B01L3/50273 ,  B01L7/525 ,  B01L2200/10 ,  B01L2300/0816 ,  B01L2300/0887 ,  B01L2400/0457 ,  B01L2400/0487 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/686 ,  Y10T436/143333 ,  C12Q2565/629 ,  C12Q2565/137 ,  C12Q2563/173

Abstract: Device and methods for extracting and analyzing nucleic acids from biological samples.

Abstract translation: 用于从生物样品中提取和分析核酸的装置和方法。

公开(公告)号：WO2005118863A3

公开(公告)日：2006-12-07

申请号：PCT/US2005017295

申请日：2005-05-17

Applicant: UNIV UTAH RES FOUND ,  SMITH ROGER E ,  VOELKERDING KARL V ,  ELGORT MARC G ,  DURTSCHI JACOB

Inventor： SMITH ROGER E ,  VOELKERDING KARL V ,  ELGORT MARC G ,  DURTSCHI JACOB

IPC: C12Q1/68 ,  B01D67/00 ,  B01D71/02 ,  B01J3/00 ,  B01J8/00 ,  B01J15/00 ,  B01J16/00 ,  B01J19/00 ,  B01L3/00 ,  B32B23/02 ,  C02F5/02 ,  C02F5/08 ,  C12Q1/70 ,  G01N27/26

CPC classification number: C12Q1/703 ,  B01D67/0065 ,  B01D67/0088 ,  B01D67/0093 ,  B01D69/12 ,  B01D71/022 ,  B01D71/025 ,  B01J2219/00286 ,  B01J2219/00545 ,  B01J2219/00572 ,  B01J2219/00641 ,  B01J2219/00722 ,  B01J2219/00725 ,  B01L3/50255 ,  B01L2300/0636 ,  B01L2300/0681 ,  B01L2300/0829 ,  B01L2300/0851 ,  B82Y10/00 ,  B82Y20/00 ,  B82Y30/00 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/6813 ,  C12Q1/6844 ,  G01N21/4738 ,  G01N21/6428 ,  G01N21/6456 ,  G01N21/6458 ,  Y10T428/249978 ,  C12Q2565/137

Abstract: Methods for separating one or more analytes present in a fluid sample by passing the fluid through or into a mioroporous material (100), wherein the analytes are localized near the surface of the microporous material. Microporous material (100) has planar surface (120) and external surface (130) have holes or pores (110) therethrough. An internal surafce (140) is formed by channel (150). The analyte localizes: (i) in the region (160) 10 microns below the planar surface (120), (ii) adjacent to the planar surface (120), or (iii) in theregion (170) 25 microns above the planar surface.

Abstract translation: 用于通过使流体通过或渗透到多孔材料（100）中来分离存在于流体样品中的一种或多种分析物的方法，其中所述分析物位于所述微孔材料的表面附近。 微孔材料（100）具有平坦表面（120），并且外表面（130）具有穿过其中的孔或孔（110）。 内部溢流（140）由通道（150）形成。 分析物定位：（i）在平坦表面（120）下方10微米的区域（160）中，（ii）邻近平面表面（120），或（iii）在平面上方25微米处的（170） 。

公开(公告)号：WO2004050910A1

公开(公告)日：2004-06-17

申请号：PCT/EP2003/013601

申请日：2003-12-02

Applicant: PAMGENE BV ,  WU, Ying ,  VAN BEUNINGEN, Marinus, Gerardus,Johannes ,  CHAN, Alan

Inventor： WU, Ying ,  VAN BEUNINGEN, Marinus, Gerardus,Johannes ,  CHAN, Alan

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6832 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/6834 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q2565/518 ,  C12Q2565/137 ,  C12Q2537/143 ,  C12Q2565/631 ,  C12Q2527/125

Abstract: The present invention is directed to a novel method of efficiently hybridising probes onto immobilized genomic DNA and/or RNA comprising the steps of (a) providing intact genomic DNA and denaturing said intact genomic DNA; (b) immobilizing said denatured intact genomic DNA onto a matrix; said matrix comprising pore sizes within a range of 0.6 µm to 2 µm including the outer limits (c) providing a set of probes and passing said probes through said matrix under conditions favouring hybridisation of the probes to its complementary sequence in said intact genomic DNA; and (d) washing off non-hybridised probes through said matrix, leaving formed hybridised intact genomic DNA/probe complexes for further analysis.The present invention is further directed to a novel method for target nucleic acid detection and quantification in a genomic DNA sample comprising the steps of: (a) providing intact genomic DNA and denaturing said intact genomic DNA; (b) performing a hybridisation according to a method as described above; (c) recovering hybridised probes; and essentially simultaneously amplifying any recovered probe using a single primer pair, each member of said primer pair binding to each recovered probe onto the respective flanking primer attachment sequences of said probe, and (d) qualitatively and quantitatively analysing the recovered amplified probes of step (c).The present invention also relates to the uses thereof as well as devices, apparatus and kits for performing said methods of the invention.

Abstract translation: 本发明涉及一种将探针高效地杂交到固定的基因组DNA和/或RNA上的新方法，包括以下步骤：（a）提供完整的基因组DNA并使所述完整的基因组DNA变性; （b）将所述变性的完整基因组DNA固定在基质上; 所述基质包含0.6μm至2μm范围内的孔径，包括外部限制（c）提供一组探针，并在有利于将探针与所述完整基因组DNA中的互补序列杂交的条件下将所述探针通过所述基质; 通过所述基质洗去未杂交的探针，留下形成的杂交的完整基因组DNA /探针复合物进行进一步分析。本发明还涉及基因组DNA样品中靶核酸检测和定量的新方法，其包括 步骤：（a）提供完整的基因组DNA并使所述完整基因组DNA变性; （b）根据上述方法进行杂交; （c）回收杂交探针; 并且使用单个引物对基本上同时扩增任何回收的探针，所述引物对的每个成员与每个回收的探针结合到所述探针的相应侧翼引物连接序列上，和（d）定性和定量分析步骤（ c）。本发明还涉及其用途以及用于执行本发明的方法的装置，装置和试剂盒。

公开(公告)号：WO03001181A9

公开(公告)日：2003-12-31

申请号：PCT/US0219696

申请日：2002-06-21

Applicant: QUEST DIAGNOSTICS INC ,  SAMOSZUK MICHAEL ,  ZHU DAN

Inventor： SAMOSZUK MICHAEL ,  ZHU DAN

IPC: C12Q1/68 ,  C07H21/02 ,  C12P19/34

CPC classification number: C12Q1/6827 ,  C12Q2531/113 ,  C12Q2565/137

Abstract: The present invention provides methods and compositions for detecting and analyzing clonal T-cell receptor (TCR) gene rearrangement using temporal temperature gradient gel electrophoresis (TTGE), which employs a gradual and uniform increase in the temperature of a constant denaturing gel to resolve different DNA molecules based on base pair composition. The present invention also provides methods and compositions for providing appropriate DNA migration markers for TTGE analysis.

Abstract translation: 本发明提供了使用时间温度梯度凝胶电泳（TTGE）检测和分析克隆T细胞受体（TCR）基因重排的方法和组合物，其使用恒定变性凝胶的温度逐渐均匀地提高以分辨不同的DNA 基于碱基对组成的分子。 本发明还提供了用于提供用于TTGE分析的合适的DNA迁移标记物的方法和组合物。

公开(公告)号：WO03093429A2

公开(公告)日：2003-11-13

申请号：PCT/US0313665

申请日：2003-04-30

Applicant: CLINICAL MICRO SENSORS INC ,  YU CHANGJUN ,  BLACKBURN GARY ,  KAYYEM JON FAIZ ,  TAO CHUNLIN

Inventor： YU CHANGJUN ,  BLACKBURN GARY ,  KAYYEM JON FAIZ ,  TAO CHUNLIN

IPC: C12Q1/68 ,  C12N

CPC classification number: B82Y30/00 ,  B82Y15/00 ,  C12Q1/6827 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q1/6874 ,  C12Q2533/101 ,  C12Q2565/137 ,  C12Q2563/113 ,  C12Q2565/537 ,  C12Q2563/137 ,  C12Q2535/101

Abstract: The present invention is directed to methods and compositions for the use of electron transfer moieties with different redox potentials to electronically detect nucleic acids, particularly for the electrochemical sequencing of DNA.

Abstract translation: 本发明涉及使用具有不同氧化还原电位的电子转移部分电子检测核酸的方法和组合物，特别是用于DNA的电化学测序。

公开(公告)号：WO2003039703A2

公开(公告)日：2003-05-15

申请号：PCT/EP2002/012333

申请日：2002-11-05

Applicant: HAIN LIFESCIENCE GMBH ,  WEIZENEGGER, Michael

Inventor： WEIZENEGGER, Michael

IPC: B01D15/00

CPC classification number: B01J20/281 ,  B01J20/286 ,  B01J20/3212 ,  B01J20/3219 ,  B01J20/3274 ,  B01J20/3282 ,  B01J2220/54 ,  C12Q1/6834 ,  G01N30/48 ,  G01N30/90 ,  C12Q2565/137

Abstract: Die vorliegende Erfindung betrifft das Gebiet der Diagnostik von Nukleinsäuren. Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist insbesondere ein hock sensitives Verfahren zum Nachweis, zur Differenzierung und zur Charakterisierung von Nukleinsäuren in Form eines Trocken-schnelltestes; der Trockenschnelltest enthaltend ein chromatographisches Material umfassend - eine Probenaufnahmezone, - eine Trennzone mit Bindungsbereich in welchem eine oder mehrere sequenzspezifische Nu-kleinsäuresonden immobilisiert sind and - eine hinter der Trennzone mit Bindungsbereich liegende Flüssigkeit absorbierende Zone, dadurch gekennzeichnet, dass die sequenzspezifischen Nukleinsäuresonden über einen Polymerlinker immobilisiert sind und weiterhin dadurch gekennzeichnet, dass das Verfahren folgende Schritte umfasst: i) die nachzuweisende Nukleinsäure wird im Falle doppelsträngiger Nukleinsäuren denaturiert und anschliessend neutralisiert,ii) die nachzuweisende Nukleinsäure wird auf die Probenaufnahmezone in einem Laufpuffer, welcher mild denaturierende Agenzien enthält, aufgetragen, iii) die nachzuweisende Nukleinsäure bewegt sich von der robenaufnahmezone in Richtung Flüssigkeit absorbierende Zone, iv) die nachzuweisende Nukleinsäure wird im Bindungsbereich der Trennstrecke mit der se-quenzspezifischen Nukleinsäuresonde in Kontakt gebracht and hybridisiert an die sequenz-spezifische Nukleinsäuresonde v) die nachzuweisende Nukleinsäure beziehungsweise die Hybridisierung der nachzuweisen-den Nukleinsäure an die sequenzspezifische Nukleinsäuresonde wird detektiert über eine Markierung, die an der nachzuweisenden Nukleinsäure angebracht ist oder über die Detektion einer Markierung des Nukleinsäuredoppelstranges. Des weiteren ist Gegenstand der vorliegenden Erfindung eine Vorrichtung zur Durchftihrung des erfindungsgemässen Verfahrens.

Abstract translation: 本发明涉及的核酸诊断领域。 本发明是在用于检测，分化和核酸在干燥快速测试的形式表征特定一个跗敏感的方法; 干快速测试包括含有色谱材料 - 一个样品接收区， - 分离区包括其中一个或多个序列特异性核酸探针被固定和结合区域 - 一个位于所述分离区的后面，包括一个结合区域的液体吸收区，其特征在于在聚合物接头序列特异性核酸探针 被固定和进一步的特征在于所述方法包括以下步骤：i）所述核酸变性中的双链核酸的情况下，然后中和，ii）所述核酸被施加到在其中包含温和变性剂运行缓冲液中的样品接收区，施加 iii）所述核酸从在液体吸收区的方向接收区中的长袍移动，iv）所述核酸是在分离路径的结合区域 在与接触的SE-quenzspezifischen核酸探针接触，并杂交到序列特异性核酸探针v）的核酸，或通过附接到所述核酸或所述标签的核酸序列特异性核酸探针的杂交 检测核酸双链的标记物。 此外，本发明是一种用于本发明方法的Durchftihrung的装置。

公开(公告)号：WO03033740A2

公开(公告)日：2003-04-24

申请号：PCT/US0221715

申请日：2002-07-10

Applicant: MASSACHUSETTS INST TECHNOLOGY

Inventor： PARAMESWARAN LALITHA ,  YOUNG ALBERT ,  BORTOLIN LAURA T ,  HOLLIS MARK A ,  HARPER JAMES ,  BOBROW JOHANNA

IPC: B01L3/00 ,  B01L3/02 ,  C12N1/08 ,  C12N15/10 ,  C12P19/34 ,  C12Q1/68

CPC classification number: B01L3/0282 ,  B01L3/0241 ,  B01L3/5023 ,  B01L2400/0406 ,  B01L2400/0415 ,  B01L2400/049 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q2565/137 ,  C12Q2549/125

Abstract: A method for preparing a nucleic acid component of a sample for amplification includes contacting the sample with a porous support that deactivates a nucleic acid amplification inhibitor component of the sample and directing a fluid through the porous support, whereby the nucleic acid component of the sample is directed through at least a portion of the porous support and is separated from the support, thereby preparing the nucleic acid component for amplification. The method can be conducted in an apparatus that includes a porous support having a component that deactivates a nucleic acid amplification inhibitor component of a sample contacting the porous support and a housing having an opening and defining an interior, said interior being in fluid communication with the porous support, whereby at least a portion of a fluid directed through the opening is directed through at least a portion of the porous support and separates at least a portion of a nucleic acid component of a sample contacting the porous support from the support, thereby preparing the nucleic acid component for amplification.

Abstract translation: 用于制备用于扩增的样品的核酸组分的方法包括使样品与多孔载体接触，多孔载体使样品的核酸扩增抑制剂组分失活并引导流体通过多孔载体，由此样品的核酸组分为 引导通过多孔载体的至少一部分并与载体分离，由此制备用于扩增的核酸组分。 该方法可以在包括多孔载体的装置中进行，所述多孔载体具有使与多孔载体接触的样品的核酸扩增抑制剂组分失活的组分和具有开口并限定内部的壳体，所述内部与 多孔载体，其中通过开口引导的流体的至少一部分被引导通过多孔载体的至少一部分，并将与多孔载体接触的样品的核酸组分的至少一部分与载体分离，由此制备 用于扩增的核酸组分。