一种全新的基于CRISPR-Cas12b的碱基编辑器的构建及其应用

    公开(公告)号:CN117487778A

    公开(公告)日:2024-02-02

    申请号:CN202311435035.3

    申请日:2023-10-31

    Applicant: 江南大学

    Abstract: 本发明公开了一种全新的基于CRISPR‑Cas12b的碱基编辑器的构建及其应用,属于基因工程技术领域。本发明通过对BhCas12b进行失活突变,获得了失活版本的dBhCas12b。本发明基于dBhCas12b,在微生物中构建了具有拓展编辑窗口的碱基编辑器,编辑窗口在大肠杆菌中最高可达63nt,是目前微生物细胞中编辑窗口最宽的CBE系统。最终,本发明将该系统用于基因表达的多样化以及蛋白质的原位进化中,并且获得了一系列梯度表达的构建体以及高版本底盘细胞。本发明提供了一种超宽编辑窗口的新型BE系统,该系统能够在代谢工程、蛋白质工程以及基因工程的各个方面体现出巨大的应用价值。

    一种基于AIP诱导的生物传感器及其应用

    公开(公告)号:CN112481278B

    公开(公告)日:2023-02-21

    申请号:CN202011449689.8

    申请日:2020-12-09

    Applicant: 江南大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于AIP诱导的生物传感器及其应用,属于基因工程技术领域。本发明将agr群体感应系统感受AIP的关键组分异源构建至枯草芽孢杆菌168中,使其能够在AIP的诱导下表达绿色荧光蛋白sfGFP。利用该系统,可以通过sfGFP的表达荧光反应AIP的浓度。同时将AIP合成相关基因异源构建至大肠杆菌中,使得大肠杆菌能够合成分泌AIP,获得AIP产生菌。在AIP产生菌中建立AIP的突变体库,在AIP感应菌种筛选突变的AIP,实现AIP高通量突变和筛选。该系统能够方便地研究AIP不同位点突变对其功能的影响,并且获得具有不同特性的突变体AIP。

    一种理性设计提升腈水解酶活性的方法及应用

    公开(公告)号:CN114250217A

    公开(公告)日:2022-03-29

    申请号:CN202111478385.9

    申请日:2021-12-06

    Applicant: 江南大学

    Abstract: 本发明公开了一种理性设计提升腈水解酶活性的方法及应用,属于酶工程领域。本发明通过腈水解酶的晶体结构进行分析,通过底物对接确定了催化口袋附近与催化活性相关的位点,对每个点做饱和突变后,通过两种计算方法Rosetta‑Cartesian和FEP对获得的突变体进行稳定性和结合自由能分析,对满足要求的突变体做酶活测定。将单点突变酶活高于野生型的位点进行组合突变再进行计算,最终获得符合要求的突变体进行酶活测定。通过这种方法我们最后获得了两个单点突变体,比酶活为野生型的2、1.5倍,组合突变体F64YW170G比酶活为野生型的4.56倍。

    一种腈水合酶氨基酸基序的改造及其应用

    公开(公告)号:CN114107269A

    公开(公告)日:2022-03-01

    申请号:CN202111395709.2

    申请日:2021-11-23

    Applicant: 江南大学

    Abstract: 本发明提供了一种腈水合酶氨基酸基序的改造及其应用,属于生物工程技术领域。所述基序在α亚基上酶活中心的108、111和113位点均是高度保守的,它们分别与钴离子形成配位键。通过序列与结构比对,其他来源的腈水合酶在这些对应的氨基酸残基位点也是高度保守的。本发明通过将所述将腈水合酶β亚基上的第129号位的丙氨酸进行突变,得到突变体A129R的比酶活较野生型显著提升,且底物谱较野生型拓宽,对于异丁腈、正戊腈、烟腈、2‑氰基吡嗪、苯甲腈、肉桂腈、1‑萘甲腈和噻虫啉等具有较好的催化活性。

    一种钴离子诱导型蛋白表达系统及应用

    公开(公告)号:CN111269926A

    公开(公告)日:2020-06-12

    申请号:CN201911414867.0

    申请日:2019-12-31

    Applicant: 江南大学

    Abstract: 本发明公开了一种钴离子诱导型蛋白表达系统及应用,属于生物工程技术领域。本发明通过将响应钴离子的阻遏蛋白RcnR及其操纵序列rcnO与来源于枯草芽孢杆菌的强启动子Pveg构建在一起,得到了钴离子诱导型高效基因表达系统。当利用该系统表达腈水合酶时,以500μM钴离子作为诱导剂,酶活最高达到106.2±4.6U/mL,接近使用IPTG诱导系统的水平(121.4±4.0U/mL)。在利用该钴离子诱导型系统表达腈水合酶过程中,钴离子同时作为腈水合酶的诱导剂和金属配体,不需要额外添加化学诱导剂,降低了生产成本,简化了生产工艺。

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