公开(公告)号：US08192961B2

公开(公告)日：2012-06-05

申请号：US11923599

申请日：2007-10-24

申请人： John G. K. Williams

发明人： John G. K. Williams

IPC分类号： C12P19/34 ,  C12Q1/68 ,  C12M1/34 ,  C07H21/02 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12Q1/6874 ,  C07D209/12 ,  C07H19/10 ,  C07H19/20 ,  C07H21/00 ,  C12Q1/6869 ,  Y10T436/143333 ,  C12Q2565/301 ,  C12Q2565/1015

摘要： This invention relates to improved methods for sequencing and genotyping nucleic acid in a single molecule configuration. The method involves single molecule detection of fluorescent labeled PPi moieties released from NTPs as a polymerase extension product is created.

摘要翻译： 本发明涉及用于在单分子构型中测序和基因分型核酸的改进方法。 该方法涉及由NTPs释放的荧光标记的PPi部分的单分子检测，因为产生了聚合酶延伸产物。

公开(公告)号：US07939256B2

公开(公告)日：2011-05-10

申请号：US11877628

申请日：2007-10-23

申请人： John G. K. Williams

发明人： John G. K. Williams

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12P19/34 ,  G01N33/53 ,  C07H21/02 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  C12Q1/6834 ,  C12Q2600/156 ,  C12Q2521/101 ,  C12Q2523/101

摘要： The present invention provides compositions and methods for detecting incorporation of a labeled nucleotide triphosphate onto the growing end of a primer nucleic acid molecule. The method is used, for example, to genotype and sequence a nucleic acid. In a preferred embodiment, the method described herein detects individual NTP molecules.

摘要翻译： 本发明提供了用于检测标记的核苷酸三磷酸结合到引物核酸分子的生长末端上的组合物和方法。 该方法例如用于对核酸进行基因分型和序列化。 在优选实施方案中，本文所述的方法检测单个NTP分子。

公开(公告)号：US07858311B2

公开(公告)日：2010-12-28

申请号：US11877627

申请日：2007-10-23

申请人： John G. K. Williams

发明人： John G. K. Williams

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12P19/34 ,  C07H21/02 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  C12Q1/6834 ,  C12Q2600/156 ,  C12Q2521/101 ,  C12Q2523/101

摘要： The present invention provides compositions and methods for detecting incorporation of a labeled nucleotide triphosphate onto the growing end of a primer nucleic acid molecule. The method is used, for example, to genotype and sequence a nucleic acid. In a preferred embodiment, the method described herein detects individual NTP molecules.

公开(公告)号：US07229799B2

公开(公告)日：2007-06-12

申请号：US10438639

申请日：2003-05-14

申请人： John G. K. Williams

发明人： John G. K. Williams

IPC分类号： C12P19/34 ,  C12Q1/68 ,  C12M1/34 ,  C07H21/02 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12Q1/6874 ,  C07D209/12 ,  C07H19/10 ,  C07H19/20 ,  C07H21/00 ,  C12Q1/6869 ,  Y10T436/143333 ,  C12Q2565/301 ,  C12Q2565/1015

摘要： This invention relates to improved methods for sequencing and genotyping nucleic acid in a single molecule configuration. The method involves single molecule detection of fluorescent labeled PPi moieties released from NTPs as a polymerase extension product is created.

摘要翻译： 本发明涉及用于在单分子构型中测序和基因分型核酸的改进方法。 该方法涉及由NTPs释放的荧光标记的PPi部分的单分子检测，因为产生了聚合酶延伸产物。

公开(公告)号：US06306607B2

公开(公告)日：2001-10-23

申请号：US09816720

申请日：2001-03-21

申请人： John G. K. Williams

发明人： John G. K. Williams

IPC分类号： C12Q168

CPC分类号： C12Q1/6874 ,  C07D209/12 ,  C07H19/10 ,  C07H19/20 ,  C07H21/00 ,  C12Q1/6869 ,  Y10T436/143333 ,  C12Q2565/301 ,  C12Q2565/1015

摘要： Nucleotide triphosphate probes containing a fluorophore attached to the &ggr;-phosphate and a quencher moiety sufficiently proximal to the fluorophore moiety for use in pyrophosphate detection assays are disclosed. These probes exhibit distinguishable fluorescence characteristics when the fluorophore is attached to the nucleotide through the &ggr;-phosphate and when it is unattached to the nucleotide. The present invention also provides kits and integrated systems for practicing the assays described herein.

摘要翻译： 公开了含有连接到γ-磷酸盐上的荧光团和足够接近荧光团部分的猝灭剂部分以用于焦磷酸盐检测测定的核苷酸三磷酸探针。 当荧光团通过γ-磷酸盐连接到核苷酸时，当核苷酸不连接时，这些探针显示出可区分的荧光特性。 本发明还提供用于实施本文所述测定法的试剂盒和集成系统。

公开(公告)号：US06232075B1

公开(公告)日：2001-05-15

申请号：US09460304

申请日：1999-12-13

申请人： John G. K. Williams

发明人： John G. K. Williams

IPC分类号： C12Q168

CPC分类号： C12Q1/6874 ,  C07D209/12 ,  C07H19/10 ,  C07H19/20 ,  C07H21/00 ,  C12Q1/6869 ,  Y10T436/143333 ,  C12Q2565/301 ,  C12Q2565/1015

摘要： Nucleotide triphosphate probes containing a fluorophore attached to the &bgr;-phosphate and a quencher moiety sufficiently proximal to the fluorophore moiety for use in pyrophosphate detection assays are disclosed. These probes exhibit distinguishable fluorescence characteristics when the fluorophore is attached to the nucleotide through the &ggr;-phosphate and when it is unattached to the nucleotide. The present invention also provides kits and integrated systems for practicing the assays described herein.

摘要翻译： 公开了含有连接到β-磷酸酯的荧光团和足够接近荧光团部分的猝灭剂部分以用于焦磷酸盐检测测定的核苷酸三磷酸探针。 当荧光团通过γ-磷酸盐连接到核苷酸时，当核苷酸不连接时，这些探针显示出可区分的荧光特性。 本发明还提供用于实施本文所述测定法的试剂盒和集成系统。

公开(公告)号：US06936702B2

公开(公告)日：2005-08-30

申请号：US09876374

申请日：2001-06-06

申请人： John G. K. Williams ,  Gregory R. Bashford ,  Jiyan Chen ,  Dan Draney ,  Nara Narayanan ,  Bambi L. Reynolds ,  Pamela Sheaff

发明人： John G. K. Williams ,  Gregory R. Bashford ,  Jiyan Chen ,  Dan Draney ,  Nara Narayanan ,  Bambi L. Reynolds ,  Pamela Sheaff

IPC分类号： G01N21/64 ,  C07B61/00 ,  C07H19/10 ,  C07H19/20 ,  C07H21/00 ,  C12N15/09 ,  C12Q1/00 ,  C12Q1/42 ,  C12Q1/44 ,  C12Q1/48 ,  C12Q1/68 ,  G01N27/447 ,  G01N33/483 ,  G01N33/53 ,  C07H19/00 ,  C07H21/02 ,  C07H21/04

CPC分类号： C07H19/10 ,  C07H19/20 ,  C07H21/00 ,  C12Q1/6869 ,  C40B40/00 ,  C12Q2565/629 ,  C12Q2565/607 ,  C12Q2565/301 ,  C12Q2533/101

摘要： The present invention provides compounds, methods and systems for sequencing nucleic acid using single molecule detection. Using labeled NPs that exhibit charge-switching behavior, single-molecule DNA sequencing in a microchannel sorting system is realized. In operation, sequencing products are detected enabling real-time sequencing as successive detectable moieties flow through a detection channel. By electrically sorting charged molecules, the cleaved product molecules are detected in isolation without interference from unincorporated NPs and without illuminating the polymerase-DNA complex.

摘要翻译： 本发明提供了使用单分子检测来测序核酸的化合物，方法和系统。 使用表现出电荷转换行为的标记NP，实现了微通道分选系统中的单分子DNA测序。 在操作中，随着连续的可检测部分流经检测通道，测序产物被检测成能够进行实时测序。 通过电分选带电分子，分离检测产物分子而不受未结合的NP的干扰，而不照射聚合酶-DNA复合物。

公开(公告)号：US06762048B2

公开(公告)日：2004-07-13

申请号：US09859104

申请日：2001-05-14

申请人： John G. K. Williams

发明人： John G. K. Williams

IPC分类号： C12M134

CPC分类号： C12Q1/6874 ,  C07D209/12 ,  C07H19/10 ,  C07H19/20 ,  C07H21/00 ,  C12Q1/6869 ,  Y10T436/143333 ,  C12Q2565/301 ,  C12Q2565/1015

摘要： This invention relates to improved methods for sequencing and genotyping nucleic acid in a single molecule configuration. The method involves single molecule detection of fluorescent labeled PPi moieties released from NTPs as a polymerase extension product is created.

摘要翻译： 本发明涉及用于在单分子构型中测序和基因分型核酸的改进方法。 该方法涉及由NTPs释放的荧光标记的PPi部分的单分子检测，因为产生了聚合酶延伸产物。

公开(公告)号：US5921477A

公开(公告)日：1999-07-13

申请号：US713507

申请日：1996-09-13

申请人： Dwight T. Tomes ,  John G. K. Williams ,  Michael E. Moore

发明人： Dwight T. Tomes ,  John G. K. Williams ,  Michael E. Moore

IPC分类号： C12M1/33 ,  C12M3/08 ,  B02C19/12

CPC分类号： C12M47/06 ,  G01N1/286 ,  G01N2001/2866 ,  G01N2001/2873

摘要： An apparatus and method for preparing tissue samples for DNA, RNA or protein extraction of the present invention includes a reciprocating saw mounted to a frame and connected to a plurality of tissue sample containers containing tissue samples and agitation members. By activating the reciprocating saw, the tissue samples are ground by the agitation members. A control circuit is connected to the saw for controlling the speed and duration of the agitation.

摘要翻译： 用于制备本发明的DNA，RNA或蛋白质提取的组织样品的装置和方法包括安装到框架并连接到包含组织样本和搅拌构件的多个组织样本容器的往复锯。 通过激活往复锯，组织样品被搅拌构件研磨。 控制电路连接到锯上，用于控制搅拌的速度和持续时间。

公开(公告)号：US08530154B2

公开(公告)日：2013-09-10

申请号：US11459182

申请日：2006-07-21

申请人： John G. K. Williams

发明人： John G. K. Williams

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C07H21/02 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12Q1/6874 ,  C07D209/12 ,  C07H19/10 ,  C07H19/20 ,  C07H21/00 ,  C12Q1/6869 ,  Y10T436/143333 ,  C12Q2565/301 ,  C12Q2565/1015

摘要： This invention relates to improved methods for sequencing and genotyping nucleic acid in a single molecule configuration. The method involves single molecule detection of fluorescent labeled PPi moieties released from NTPs as a polymerase extension product is created.