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    Methods for identification of alleles using allele-specific primers for amplification
    1.
    发明授权
    Methods for identification of alleles using allele-specific primers for amplification 有权
    使用等位基因特异性引物鉴定等位基因进行扩增的方法

    公开(公告)号：US09133516B2

    公开(公告)日：2015-09-15

    申请号：US12305193

    申请日：2007-06-29

    申请人： Caixia Li ,  Huafang Gao ,  Xiang Liu ,  Bin Cai ,  Di Zhang ,  Jing Cheng

    发明人： Caixia Li ,  Huafang Gao ,  Xiang Liu ,  Bin Cai ,  Di Zhang ,  Jing Cheng

    IPC分类号： C12Q1/68

    CPC分类号： C12Q1/6883 ,  C12Q1/6858 ,  C12Q2600/156 ,  C12Q2600/16 ,  C12Q2565/501 ,  C12Q2535/125 ,  C12Q2525/161

    摘要： The invention provides a method for identification of alleles. In this method, genomic DNA is used as target. Multiple allele-specific PCR amplification are carried out with a group of primers comprising one or more allele-specific primers for a target gene, a universal primer, and a common primer; and a DNA polymerase without 5′ to 3′ exonuclease activity. The PCR products are hybridized with tag probes immobilized on a DNA chip. Results are determined based on the signal intensity and the position of the probe immobilized on the array. Each allele-specific primer comprises a unique tag sequence at the 5′ end. Each tag probe immobilized on the DNA chip comprises a sequence identical to its corresponding tag sequence; and each tag probe hybridizes only with the complementary sequence in the PCR amplification product.

    摘要翻译： 本发明提供了一种鉴定等位基因的方法。 在该方法中，使用基因组DNA作为靶。 使用包含靶基因，通用引物和通用引物的一个或多个等位基因特异性引物的引物组进行多重等位基因特异性PCR扩增; 和没有5'至3'外切核酸酶活性的DNA聚合酶。 PCR产物与固定在DNA芯片上的标签探针杂交。 结果基于信号强度和固定在阵列上的探针的位置来确定。 每个等位基因特异性引物包含在5'末端的唯一标签序列。 固定在DNA芯片上的每个标签探针包含与其相应的标签序列相同的序列; 并且每个标签探针仅与PCR扩增产物中的互补序列杂交。

    METHODS FOR IDENTIFICATION OF ALLELES
    2.
    发明申请
    METHODS FOR IDENTIFICATION OF ALLELES 有权
    方法识别对象

    公开(公告)号：US20100041563A1

    公开(公告)日：2010-02-18

    申请号：US12305193

    申请日：2007-06-29

    申请人： Caixia Li ,  Huafang Gao ,  Xiang Liu ,  Bin Cai ,  Di Zhang ,  Jing Cheng

    发明人： Caixia Li ,  Huafang Gao ,  Xiang Liu ,  Bin Cai ,  Di Zhang ,  Jing Cheng

    IPC分类号： C40B30/04 ,  C40B40/08

    CPC分类号： C12Q1/6883 ,  C12Q1/6858 ,  C12Q2600/156 ,  C12Q2600/16 ,  C12Q2565/501 ,  C12Q2535/125 ,  C12Q2525/161

    摘要： The invention provides a method for identification of alleles. In this method, genomic DNA is used as target. Multiple allele-specific PCR amplification are carried out with a group of primers comprising one or more allele-specific primers for a target gene, a universal primer, and a common primer; and a DNA polymerase without 5′ to 3′ exonuclease activity. The PCR products are hybridized with tag probes immobilized on a DNA chip. Results are determined based on the signal intensity and the position of the probe immobilized on the array. Each allele-specific primer comprises a unique tag sequence at the 5′ end. Each tag probe immobilized on the DNA chip comprises a sequence identical to its corresponding tag sequence; and each tag probe hybridizes only with the complementary sequence in the PCR amplification product.

    摘要翻译： 本发明提供了一种鉴定等位基因的方法。 在该方法中，使用基因组DNA作为靶。 使用包含靶基因，通用引物和通用引物的一个或多个等位基因特异性引物的引物组进行多重等位基因特异性PCR扩增; 和没有5'至3'外切核酸酶活性的DNA聚合酶。 PCR产物与固定在DNA芯片上的标签探针杂交。 结果基于信号强度和固定在阵列上的探针的位置来确定。 每个等位基因特异性引物包含在5'末端的唯一标签序列。 固定在DNA芯片上的每个标签探针包含与其相应的标签序列相同的序列; 并且每个标签探针仅与PCR扩增产物中的互补序列杂交。

    Dna chip based genetic typing
    8.
    发明申请
    Dna chip based genetic typing 有权
    基于Dna芯片的遗传分型

    公开(公告)号：US20070134661A1

    公开(公告)日：2007-06-14

    申请号：US10562803

    申请日：2003-07-18

    申请人： Huafang Gao ,  Xuemei Ma ,  Chi Zhang ,  Qian Chen ,  Dong Wang ,  Yizhe Zhang ,  Yue Tian ,  Rui Zhang ,  Gengxin Lan ,  Yuxiang Zhou ,  Jing Cheng

    发明人： Huafang Gao ,  Xuemei Ma ,  Chi Zhang ,  Qian Chen ,  Dong Wang ,  Yizhe Zhang ,  Yue Tian ,  Rui Zhang ,  Gengxin Lan ,  Yuxiang Zhou ,  Jing Cheng

    IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12M3/00

    CPC分类号： C12Q1/6837

    摘要： This invention relates generally to the field of nucleic acid analysis. In particular, the invention provides a method for typing a target gene, using, inter alia, a chip comprising a support suitable for use in nucleic acid hybridization having immobilized thereon an oligonucleotide probe complementary to said target nucleotide sequence and at least one of the following oligonucleotide control probes: a positive control probe, a negative control probe, a hybridization control probe and an immobilization control probe. Oligonucleotide probes or probes arrays for typing a HLA target gene are also provided.

    摘要翻译： 本发明一般涉及核酸分析领域。 特别地，本发明提供了一种用于对目标基因进行分型的方法，特别地，使用包含适合用于核酸杂交的载体的芯片，其上固定有与所述靶核苷酸序列互补的寡核苷酸探针和至少一种以下 寡核苷酸对照探针：阳性对照探针，阴性对照探针，杂交对照探针和固定化对照探针。 还提供了用于分型HLA靶基因的寡核苷酸探针或探针阵列。

    LUMINOPHORE-LABELED MOLECULES COUPLED WITH PARTICLES FOR MICROARRAY-BASED ASSAYS
    10.
    发明申请
    LUMINOPHORE-LABELED MOLECULES COUPLED WITH PARTICLES FOR MICROARRAY-BASED ASSAYS 有权
    与基于微量元素测定的颗粒偶联的荧光标记分子

    公开(公告)号：US20130267436A1

    公开(公告)日：2013-10-10

    申请号：US13877320

    申请日：2010-10-27

    申请人： Huafang Gao ,  Guangxin Xiang ,  Di Jiang ,  Wanli Xing ,  Jing Cheng

    发明人： Huafang Gao ,  Guangxin Xiang ,  Di Jiang ,  Wanli Xing ,  Jing Cheng

    IPC分类号： G01N33/58 ,  C12Q1/68

    CPC分类号： G01N33/582 ,  C12Q1/6816 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q1/6883 ,  C12Q2600/156 ,  C12Q2600/158 ,  C12Q2600/16 ,  C40B30/04 ,  G01N33/54333 ,  G01N33/54386 ,  C12Q2563/103 ,  C12Q2565/501

    摘要： A microarray-based assay is provided, which is used for analyzing molecular interactions, including polynucleotides, polypeptides, antibodies, small molecule compounds, peptides and carbohydrates. Such method comprises labeling a target molecule with a luminophore, coupling the target molecule to a particle, and binding to a probe molecule on microarray. In particular, multiplexed genetic analysis of nucleic acid fragments can be implemented. Specific genes, single nucleotide polymorphisms or gene mutations, such as deletions, insertions, and indels, can be identified. This technology, with high sensitivity, enables the detection and interpretation of molecular interactions in an efficient way.

    摘要翻译： 提供基于微阵列的测定法，其用于分析分子相互作用，包括多核苷酸，多肽，抗体，小分子化合物，肽和碳水化合物。 这种方法包括用发光体标记目标分子，将靶分子偶联到颗粒上，并在微阵列上结合探针分子。 特别地，可以实现核酸片段的多重遗传分析。 可以鉴定特异性基因，单核苷酸多态性或基因突变，例如缺失，插入和插入。 该技术具有高灵敏度，能够以有效的方式检测和解释分子相互作用。