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22 条记录 (耗时 0.028 秒)

    Probe optimization methods
    1.
    发明申请
    Probe optimization methods 审中-公开
    探针优化方法

    公开(公告)号：US20050282211A1

    公开(公告)日：2005-12-22

    申请号：US11157629

    申请日：2005-06-21

    申请人： Emile Nuwaysir ,  Roland Green ,  Rebecca Selzer ,  Todd Richmond ,  Mark McCormick ,  Steven Smith

    发明人： Emile Nuwaysir ,  Roland Green ,  Rebecca Selzer ,  Todd Richmond ,  Mark McCormick ,  Steven Smith

    IPC分类号： C12P19/34 ,  C12Q1/68

    CPC分类号： C12Q1/6837 ,  C12Q1/6806

    摘要： The present invention provides methods for optimizing nucleic acid detection assays for use in basic research and clinical research. Specifically, the invention provides a method for empirically optimizing nucleic acid probes by testing them with samples containing genomic DNA with variations in copy number in different regions of the genome. The invention enables the optimization of probes for any hybridization based assay including microarrays, bead-based assays, genotyping assays and RNAi assays.

    摘要翻译： 本发明提供用于优化用于基础研究和临床研究的核酸检测测定法的方法。 具体地，本发明提供了一种用于经验优化核酸探针的方法，通过用含有基因组不同区域中拷贝数变化的基因组DNA的样品进行测试。 本发明使得能够优化用于任何基于杂交的测定的探针，包括微阵列，基于珠的测定，基因分型测定和RNAi测定。

    Optimized probe selection method
    2.
    发明申请
    Optimized probe selection method 有权
    优化探头选择方法

    公开(公告)号：US20060177858A1

    公开(公告)日：2006-08-10

    申请号：US11346927

    申请日：2006-02-03

    申请人： Todd Richmond ,  Jason Norton ,  Emile Nuwaysir ,  Roland Green ,  Kate Nuwaysir

    发明人： Todd Richmond ,  Jason Norton ,  Emile Nuwaysir ,  Roland Green ,  Kate Nuwaysir

    IPC分类号： C12Q1/68

    CPC分类号： C12Q1/6837 ,  C12Q1/6811 ,  G06F19/20 ,  C12Q2537/165

    摘要： The present invention provides methods for optimizing oligonucleotide hybridization probes for use in basic and clinical research. Specifically, the invention involves hybridizing serially diluted genomic sample to the oligonucleotide probes on the array, such that a signal intensity is produced for each of the probes; computationally identifying optimized probes which exhibit signal intensities that correspond to the serial dilutions of genomic sample and are reproducibly strong relative to non-optimized probes.

    摘要翻译： 本发明提供用于优化用于基础和临床研究的寡核苷酸杂交探针的方法。 具体地，本发明包括将序列稀释的基因组样品与阵列上的寡核苷酸探针杂交，使得为每个探针产生信号强度; 计算识别优化的探针，其显示对应于基因组样品的系列稀释度的信号强度，并且相对于未优化的探针是可重现的。

    OPTIMIZED PROBE SELECTION METHOD
    3.
    发明申请
    OPTIMIZED PROBE SELECTION METHOD 有权
    优化探索选择方法

    公开(公告)号：US20140031244A1

    公开(公告)日：2014-01-30

    申请号：US13767207

    申请日：2013-02-14

    申请人： Todd Richmond ,  Jason Norton ,  Emile F. Nuwaysir ,  Roland Green ,  Kate Nuwaysir

    发明人： Todd Richmond ,  Jason Norton ,  Emile F. Nuwaysir ,  Roland Green ,  Kate Nuwaysir

    IPC分类号： C12Q1/68

    CPC分类号： C12Q1/6837 ,  C12Q1/6811 ,  G06F19/20 ,  C12Q2537/165

    摘要： The present invention provides methods for optimizing oligonucleotide hybridization probes for use in basic and clinical research. Specifically, the invention involves hybridizing serially diluted genomic sample to the oligonucleotide probes on the array, such that a signal intensity is produced for each of the probes; computationally identifying optimized probes which exhibit signal intensities that correspond to the serial dilutions of genomic sample and are reproducibly strong relative to non-optimized probes.

    摘要翻译： 本发明提供用于优化用于基础和临床研究的寡核苷酸杂交探针的方法。 具体地，本发明包括将序列稀释的基因组样品与阵列上的寡核苷酸探针杂交，使得为每个探针产生信号强度; 计算识别优化的探针，其显示对应于基因组样品的系列稀释度的信号强度，并且相对于未优化的探针是可重现的。

    OPTIMIZED PROBE SELECTION METHOD
    4.
    发明申请
    OPTIMIZED PROBE SELECTION METHOD 审中-公开
    优化探索选择方法

    公开(公告)号：US20110153222A1

    公开(公告)日：2011-06-23

    申请号：US12963076

    申请日：2010-12-08

    申请人： Todd Richmond ,  Jason Norton ,  Emile F. Nuwaysir ,  Roland Green ,  Kate Nuwaysir

    发明人： Todd Richmond ,  Jason Norton ,  Emile F. Nuwaysir ,  Roland Green ,  Kate Nuwaysir

    IPC分类号： G06F19/00 ,  G01N33/48

    CPC分类号： C12Q1/6837 ,  C12Q1/6811 ,  G16B25/00 ,  C12Q2537/165

    摘要： The present invention provides methods for optimizing oligonucleotide hybridization probes for use in basic and clinical research. Specifically, the invention involves hybridizing serially diluted genomic sample to the oligonucleotide probes on the array, such that a signal intensity is produced for each of the probes; computationally identifying optimized probes which exhibit signal intensities that correspond to the serial dilutions of genomic sample and are reproducibly strong relative to non-optimized probes.

    摘要翻译： 本发明提供用于优化用于基础和临床研究的寡核苷酸杂交探针的方法。 具体地，本发明包括将序列稀释的基因组样品与阵列上的寡核苷酸探针杂交，使得为每个探针产生信号强度; 计算识别优化的探针，其显示对应于基因组样品的系列稀释度的信号强度，并且相对于未优化的探针是可重现的。

    Optimized probe selection method
    6.
    发明授权
    Optimized probe selection method 有权
    优化探头选择方法

    公开(公告)号：US07869959B2

    公开(公告)日：2011-01-11

    申请号：US11346927

    申请日：2006-02-03

    申请人： Todd Richmond ,  Jason Norton ,  Emile F. Nuwaysir ,  Roland Green ,  Kate Nuwaysir

    发明人： Todd Richmond ,  Jason Norton ,  Emile F. Nuwaysir ,  Roland Green ,  Kate Nuwaysir

    IPC分类号： C12Q1/68 ,  G01N33/48

    CPC分类号： C12Q1/6837 ,  C12Q1/6811 ,  G06F19/20 ,  C12Q2537/165

    摘要： The present invention provides methods for optimizing oligonucleotide hybridization probes for use in basic and clinical research. Specifically, the invention involves hybridizing serially diluted genomic sample to the oligonucleotide probes on the array, such that a signal intensity is produced for each of the probes; computationally identifying optimized probes which exhibit signal intensities that correspond to the serial dilutions of genomic sample and are reproducibly strong relative to non-optimized probes.

    摘要翻译： 本发明提供用于优化用于基础和临床研究的寡核苷酸杂交探针的方法。 具体地，本发明包括将序列稀释的基因组样品与阵列上的寡核苷酸探针杂交，使得为每个探针产生信号强度; 计算识别优化的探针，其显示对应于基因组样品的系列稀释度的信号强度，并且相对于未优化的探针是可重现的。

    Computer software to assist in identifying SNPS with microarrays
    8.
    发明申请
    Computer software to assist in identifying SNPS with microarrays 失效
    计算机软件帮助识别SNPS与微阵列

    公开(公告)号：US20060014164A1

    公开(公告)日：2006-01-19

    申请号：US11043294

    申请日：2005-01-26

    申请人： Michael Molla ,  Todd Richmond ,  Steven Smith ,  Thomas Albert

    发明人： Michael Molla ,  Todd Richmond ,  Steven Smith ,  Thomas Albert

    IPC分类号： C12Q1/68 ,  G06F19/00

    CPC分类号： G06F19/24 ,  G06F19/20 ,  G06F19/22 ,  Y10S977/792

    摘要： The present invention is a method to assist in the identification of single nucleotide polymorphisms (SNP) from microarray hybridization data. Data from hybridization protocols run on microarrays often have variations in the data resulting from variations in hybridization conditions and efficiencies and variations in optical intensities. An algorithm is described to screen the results to identify those data points most likely to be real SNPs as opposed to variations in the hybridization or sensing data.

    摘要翻译： 本发明是一种帮助从微阵列杂交数据鉴定单核苷酸多态性（SNP）的方法。 在微阵列上运行的杂交方案的数据通常在杂交条件和效率的变化以及光学强度的变化中导致的数据变化。 描述了一种算法来筛选结果以识别最可能是真实SNP的那些数据点，而不是杂交或感测数据的变化。

    Computer software to assist in identifying SNPS with microarrays
    9.
    发明授权
    Computer software to assist in identifying SNPS with microarrays 失效
    计算机软件帮助识别SNPS与微阵列

    公开(公告)号：US07904250B2

    公开(公告)日：2011-03-08

    申请号：US11043294

    申请日：2005-01-26

    申请人： Michael Molla ,  Todd Richmond ,  Steven Smith ,  Thomas Albert

    发明人： Michael Molla ,  Todd Richmond ,  Steven Smith ,  Thomas Albert

    IPC分类号： G01N33/50

    CPC分类号： G06F19/24 ,  G06F19/20 ,  G06F19/22 ,  Y10S977/792

    摘要： The present invention is a method to assist in the identification of single nucleotide polymorphisms (SNP) from microarray hybridization data. Data from hybridization protocols run on microarrays often have variations in the data resulting from variations in hybridization conditions and efficiencies and variations in optical intensities. An algorithm is described to screen the results to identify those data points most likely to be real SNPs as opposed to variations in the hybridization or sensing data.

    摘要翻译： 本发明是一种帮助从微阵列杂交数据鉴定单核苷酸多态性（SNP）的方法。 在微阵列上运行的杂交方案的数据通常在杂交条件和效率的变化以及光学强度的变化中导致的数据变化。 描述了一种算法来筛选结果以识别最可能是真实SNP的那些数据点，而不是杂交或感测数据的变化。