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    ENGINEERED FLUORESCENT DYE LABELED NUCLEOTIDE ANALOGS FOR DNA SEQUENCING
    1.
    发明申请
    ENGINEERED FLUORESCENT DYE LABELED NUCLEOTIDE ANALOGS FOR DNA SEQUENCING 有权
    用于DNA测序的工程化荧光染料标记核苷类似物

    公开(公告)号：US20120028248A1

    公开(公告)日：2012-02-02

    申请号：US13115284

    申请日：2011-05-25

    申请人： Gene Shen ,  Paul Peluso ,  Arkadusz Bibillo

    发明人： Gene Shen ,  Paul Peluso ,  Arkadusz Bibillo

    IPC分类号： C12Q1/68 ,  C07H19/207 ,  C07H19/10

    CPC分类号： C07H19/04

    摘要： Engineered nucleotide compositions, having polymerase interacting components that improve the interactivity of the polymerase and the nucleotide, particularly for nucleic acid sequencing applications. Compositions include the interactive polymerases along with the nucleotide analogs. Kits, methods and systems are provided for analysis of nucleoc acid synthesis reactions.

    摘要翻译： 具有改进聚合酶和核苷酸的相互作用的聚合酶相互作用组分的工程化核苷酸组合物，特别是用于核酸测序应用。 组合物包括与核苷酸类似物一起的交互聚合酶。 提供试剂盒，方法和系统用于分析核酸合成反应。

    Engineered fluorescent dye labeled nucleotide analogs for DNA sequencing
    2.
    发明授权
    Engineered fluorescent dye labeled nucleotide analogs for DNA sequencing 有权
    用于DNA测序的工程荧光染料标记的核苷酸类似物

    公开(公告)号：US08133702B2

    公开(公告)日：2012-03-13

    申请号：US13115284

    申请日：2011-05-25

    申请人： Gene Shen ,  Paul Peluso ,  Arkadusz Bibillo

    发明人： Gene Shen ,  Paul Peluso ,  Arkadusz Bibillo

    IPC分类号： C12P19/34 ,  C12Q1/68 ,  C07H21/00

    CPC分类号： C07H19/04

    摘要： Engineered nucleotide compositions, having polymerase interacting components that improve the interactivity of the polymerase and the nucleotide, particularly for nucleic acid sequencing applications. Compositions include the interactive polymerases along with the nucleotide analogs. Kits, methods and systems are provided for analysis of nucleic acid synthesis reactions.

    摘要翻译： 具有改进聚合酶和核苷酸的相互作用的聚合酶相互作用组分的工程化核苷酸组合物，特别是用于核酸测序应用。 组合物包括与核苷酸类似物一起的交互聚合酶。 提供了用于分析核酸合成反应的试剂盒，方法和系统。

    Engineered fluorescent dye labeled nucleotide analogs for DNA sequencing
    3.
    发明授权
    Engineered fluorescent dye labeled nucleotide analogs for DNA sequencing 有权
    用于DNA测序的工程荧光染料标记的核苷酸类似物

    公开(公告)号：US07973146B2

    公开(公告)日：2011-07-05

    申请号：US12412068

    申请日：2009-03-26

    申请人： Gene Shen ,  Paul Peluso ,  Arkadusz Bibillo

    发明人： Gene Shen ,  Paul Peluso ,  Arkadusz Bibillo

    IPC分类号： C07G3/00 ,  C07H21/04 ,  C12Q1/68 ,  C12P19/34

    CPC分类号： C07H19/04

    摘要： Engineered nucleotide compositions, having polymerase interacting components that improve the interactivity of the polymerase and the nucleotide, particularly for nucleic acid sequencing applications. Compositions include the interactive polymerases along with the nucleotide analogs. Kits, methods and systems are provided for analysis of nucleic acid synthesis reactions.

    摘要翻译： 具有改进聚合酶和核苷酸的相互作用的聚合酶相互作用组分的工程化核苷酸组合物，特别是用于核酸测序应用。 组合物包括与核苷酸类似物一起的相互作用聚合酶。 提供了用于分析核酸合成反应的试剂盒，方法和系统。

    ENGINEERED FLUORESCENT DYE LABELED NUCLEOTIDE ANALOGS FOR DNA SEQUENCING
    4.
    发明申请
    ENGINEERED FLUORESCENT DYE LABELED NUCLEOTIDE ANALOGS FOR DNA SEQUENCING 有权
    用于DNA测序的工程化荧光染料标记核苷类似物

    公开(公告)号：US20090246791A1

    公开(公告)日：2009-10-01

    申请号：US12412068

    申请日：2009-03-26

    申请人： Gene Shen ,  Paul Peluso ,  Arkadusz Bibillo

    发明人： Gene Shen ,  Paul Peluso ,  Arkadusz Bibillo

    IPC分类号： C12Q1/68 ,  C07H19/04

    CPC分类号： C07H19/04

    摘要： Engineered nucleotide compositions, having polymerase interacting components that improve the interactivity of the polymerase and the nucleotide, particularly for nucleic acid sequencing applications. Compositions include the interactive polymerases along with the nucleotide analogs. Kits, methods and systems are provided for analysis of nucleic acid synthesis reactions.

    摘要翻译： 具有改进聚合酶和核苷酸的相互作用的聚合酶相互作用组分的工程化核苷酸组合物，特别是用于核酸测序应用。 组合物包括与核苷酸类似物一起的交互聚合酶。 提供了用于分析核酸合成反应的试剂盒，方法和系统。

    CONTROLLED INITIATION OF PRIMER EXTENSION
    5.
    发明申请
    CONTROLLED INITIATION OF PRIMER EXTENSION 审中-公开
    控制引擎扩展

    公开(公告)号：US20080009007A1

    公开(公告)日：2008-01-10

    申请号：US11763746

    申请日：2007-06-15

    申请人： John Lyle ,  Paul Peluso ,  Gene Shen

    发明人： John Lyle ,  Paul Peluso ,  Gene Shen

    IPC分类号： C12Q1/68

    CPC分类号： C12Q1/6874 ,  C12Q2561/113 ,  C12Q2525/186 ,  C12Q2523/313

    摘要： Controlled initiation of primer extension in determination of nucleic acid sequence information by incorporation of nucleotides or nucleotide analogs. Preferred aspects include photo-initiated extension through the use of photo-cleavable blocking, groups on termini of primer sequences followed by non-terminating primer extension using nucleotides or nucleotide analogs that are not extension terminators.

    摘要翻译： 通过掺入核苷酸或核苷酸类似物来测定核酸序列信息中引物延伸的控制引发。 优选的方面包括通过使用光可切割阻断的光引发的延伸，引物序列的末端的基团，随后使用不是延伸终止子的核苷酸或核苷酸类似物的非终止引物延伸。

    Preparations, compositions, and methods for nucleic acid sequencing
    7.
    发明授权
    Preparations, compositions, and methods for nucleic acid sequencing 有权
    用于核酸测序的制备物，组合物和方法

    公开(公告)号：US08795961B2

    公开(公告)日：2014-08-05

    申请号：US12553478

    申请日：2009-09-03

    申请人： David R. Rank ,  Paul Peluso

    发明人： David R. Rank ,  Paul Peluso

    IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12P19/34

    CPC分类号： C12Q1/6869 ,  C12Q2565/537 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q2535/101

    摘要： Preparations, compositions and methods of sequencing nucleic acids are provided. The preparations, methods and compositions employ multiple priming sites on a target nucleic acid and typically utilize single molecule sequencing processes to identify sequence portions of the target which are then assembled to obtain the sequence of the target.

    摘要翻译： 提供了测序核酸的制备，组合物和方法。 制备，方法和组合物在靶核酸上采用多个引发位点，并且通常利用单分子测序过程来鉴定靶的序列部分，然后将其组装以获得靶序列。

    Generation of modified polymerases for improved accuracy in single molecule sequencing
    9.
    发明授权
    Generation of modified polymerases for improved accuracy in single molecule sequencing 有权
    修饰聚合酶的生成，提高了单分子测序的准确性

    公开(公告)号：US08257954B2

    公开(公告)日：2012-09-04

    申请号：US12384112

    申请日：2009-03-30

    申请人： Sonya Clark ,  Arek Bibillo ,  Paul Peluso ,  Fred Christians ,  Molly He ,  Insil Park ,  Harold Lee ,  Keith Bjornson ,  Lei Jia ,  Robin Emig

    发明人： Sonya Clark ,  Arek Bibillo ,  Paul Peluso ,  Fred Christians ,  Molly He ,  Insil Park ,  Harold Lee ,  Keith Bjornson ,  Lei Jia ,  Robin Emig

    IPC分类号： C12N9/12 ,  C12P19/34

    CPC分类号： C12N9/1252 ,  C12Q1/6844 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2521/101

    摘要： Provided are compositions comprising modified recombinant polymerases that exhibit branching fractions that are less than the branching fractions of the polymerases from which they were derived, or branching fractions that are less than about 25% for a phosphate-labeled nucleotide analog. Also provided are compositions comprising modified recombinant polymerases that exhibit closed polymerase/DNA complexes with increased stability relative to the parental polymerases. Also provided are compositions comprising modified recombinant polymerases that exhibit decreased rate constants relative to the parental polymerases. Provided are methods for generating polymerases with the aforementioned phenotypes. Provided are methods of using such polymerases to make a DNA or to sequence a DNA template.

    摘要翻译： 提供了包含修饰的重组聚合酶的组合物，其表现出小于其衍生自其的聚合酶的支化部分的支化部分，或对于磷酸酯标记的核苷酸类似物的支化部分小于约25％。 还提供了包含修饰的重组聚合酶的组合物，其表现出相对于亲本聚合酶具有增加的稳定性的闭合的聚合酶/ DNA复合物。 还提供了包含修饰的重组聚合酶的组合物，其相对于亲本聚合酶表现出降低的速率常数。 提供了产生具有上述表型的聚合酶的方法。 提供使用这种聚合酶制备DNA或顺序DNA模板的方法。