公开(公告)号：US08431693B2

公开(公告)日：2013-04-30

申请号：US13036788

申请日：2011-02-28

申请人： Muthiah Manoharan ,  Michael F. Jung ,  Kallanthottathil G. Rajeev ,  Rajendra K. Pandey ,  Gang Wang

发明人： Muthiah Manoharan ,  Michael F. Jung ,  Kallanthottathil G. Rajeev ,  Rajendra K. Pandey ,  Gang Wang

IPC分类号： C07H21/00 ,  C07C17/07

CPC分类号： C07H21/00 ,  C07H21/04 ,  Y02P20/55

摘要： The present invention relates to processes and reagents for oligonucleotide synthesis and purification. One aspect of the present invention relates to compounds useful for activating phosphoramidites in oligonucleotide synthesis. Another aspect of the present invention relates to a method of preparing oligonucleotides via the phosphoramidite method using an activator of the invention. Another aspect of the present invention relates to sulfur-transfer agents. In a preferred embodiment, the sulfur-transfer agent is a 3-amino-1,2,4-dithiazolidine-5-one. Another aspect of the present invention relates to a method of preparing a phosphorothioate by treating a phosphite with a sulfur-transfer reagent of the invention. In a preferred embodiment, the sulfur-transfer agent is a 3-amino-1,2,4-dithiazolidine-5-one. Another aspect of the present invention relates to compounds that scavenge acrylonitrile produced during the deprotection of phosphate groups bearing ethylnitrile protecting groups. In a preferred embodiment, the acrylonitrile scavenger is a polymer-bound thiol. Another aspect of the present invention relates to agents used to oxidize a phosphite to a phosphate. In a preferred embodiment, the oxidizing agent is sodium chlorite, chloroamine, or pyridine-N-oxide. Another aspect of the present invention relates to methods of purifying an oligonucleotide by annealing a first single-stranded oligonucleotide and second single-stranded oligonucleotide to form a double-stranded oligonucleotide; and subjecting the double-stranded oligonucleotide to chromatographic purification. In a preferred embodiment, the chromatographic purification is high-performance liquid chromatography.

摘要翻译： 本发明涉及寡核苷酸合成和纯化的方法和试剂。 本发明的一个方面涉及可用于在寡核苷酸合成中活化亚磷酰胺的化合物。 本发明的另一方面涉及使用本发明的活化剂通过亚磷酰胺方法制备寡核苷酸的方法。 本发明的另一方面涉及硫转移剂。 在优选的实施方案中，硫转移剂是3-氨基-1,2,4-二噻唑烷-5-酮。 本发明的另一方面涉及通过用本发明的硫转移试剂处理亚磷酸酯制备硫代磷酸酯的方法。 在优选的实施方案中，硫转移剂是3-氨基-1,2,4-二噻唑烷-5-酮。 本发明的另一方面涉及清除在带有乙腈基保护基团的磷酸酯基团去保护过程中产生的丙烯腈的化合物。 在优选的实施方案中，丙烯腈清除剂是聚合物结合的硫醇。 本发明的另一方面涉及用于将亚磷酸盐氧化成磷酸盐的试剂。 在优选的实施方案中，氧化剂是亚氯酸钠，氯胺或吡啶-N-氧化物。 本发明的另一方面涉及通过退火第一单链寡核苷酸和第二单链寡核苷酸来纯化寡核苷酸以形成双链寡核苷酸的方法; 并对双链寡核苷酸进行色谱纯化。 在优选的实施方案中，色谱纯化是高效液相色谱法。

公开(公告)号：US20090005549A1

公开(公告)日：2009-01-01

申请号：US12050633

申请日：2008-03-18

申请人： Muthiah Manoharan ,  Michael E. Jung ,  Kallanthottathil G. Rajeev ,  Rajendra K. Pandey ,  Gang Wang

发明人： Muthiah Manoharan ,  Michael E. Jung ,  Kallanthottathil G. Rajeev ,  Rajendra K. Pandey ,  Gang Wang

IPC分类号： C07H19/00

CPC分类号： C07H21/00 ,  C07H21/04 ,  Y02P20/55

摘要： The present invention relates to processes and reagents for oligonucleotide synthesis and purification. One aspect of the present invention relates to compounds useful for activating phosphoramidites in oligonucleotide synthesis. Another aspect of the present invention relates to a method of preparing oligonucleotides via the phosphoramidite method using an activator of the invention. Another aspect of the present invention relates to sulfur-transfer agents. In a preferred embodiment, the sulfur-transfer agent is a 3-amino-1,2,4-dithiazolidine-5-one. Another aspect of the present invention relates to a method of preparing a phosphorothioate by treating a phosphite with a sulfur-transfer reagent of the invention. In a preferred embodiment, the sulfur-transfer agent is a 3-amino-1,2,4-dithiazolidine-5-one. Another aspect of the present invention relates to compounds that scavenge acrylonitrile produced during the deprotection of phosphate groups bearing ethylnitrile protecting groups. In a preferred embodiment, the acrylonitrile scavenger is a polymer-bound thiol. Another aspect of the present invention relates to agents used to oxidize a phosphite to a phosphate. In a preferred embodiment, the oxidizing agent is sodium chlorite, chloroamine, or pyridine-N-oxide. Another aspect of the present invention relates to methods of purifying an oligonucleotide by annealing a first single-stranded oligonucleotide and second single-stranded oligonucleotide to form a double-stranded oligonucleotide; and subjecting the double-stranded oligonucleotide to chromatographic purification. In a preferred embodiment, the chromatographic purification is high-performance liquid chromatography.

摘要翻译： 本发明涉及寡核苷酸合成和纯化的方法和试剂。 本发明的一个方面涉及可用于在寡核苷酸合成中活化亚磷酰胺的化合物。 本发明的另一方面涉及使用本发明的活化剂通过亚磷酰胺方法制备寡核苷酸的方法。 本发明的另一方面涉及硫转移剂。 在优选的实施方案中，硫转移剂是3-氨基-1,2,4-二噻唑烷-5-酮。 本发明的另一方面涉及通过用本发明的硫转移试剂处理亚磷酸酯制备硫代磷酸酯的方法。 在优选的实施方案中，硫转移剂是3-氨基-1,2,4-二噻唑烷-5-酮。 本发明的另一方面涉及清除在带有乙腈基保护基团的磷酸酯基团去保护过程中产生的丙烯腈的化合物。 在优选的实施方案中，丙烯腈清除剂是聚合物结合的硫醇。 本发明的另一方面涉及用于将亚磷酸盐氧化成磷酸盐的试剂。 在优选的实施方案中，氧化剂是亚氯酸钠，氯胺或吡啶-N-氧化物。 本发明的另一方面涉及通过退火第一单链寡核苷酸和第二单链寡核苷酸来纯化寡核苷酸以形成双链寡核苷酸的方法; 并对双链寡核苷酸进行色谱纯化。 在优选的实施方案中，色谱纯化是高效液相色谱法。

公开(公告)号：US08058448B2

公开(公告)日：2011-11-15

申请号：US12351605

申请日：2009-01-09

申请人： Muthiah Manoharan ,  Michael E. Jung ,  Kallanthottathil G. Rajeev ,  Rajendra K. Pandey ,  Gang Wang

发明人： Muthiah Manoharan ,  Michael E. Jung ,  Kallanthottathil G. Rajeev ,  Rajendra K. Pandey ,  Gang Wang

IPC分类号： C07D285/01 ,  C07H21/00

CPC分类号： C07H21/00 ,  C07H21/04 ,  Y02P20/55

摘要： The present invention relates to processes and reagents for oligonucleotide synthesis and purification. One aspect of the present invention relates to compounds useful for activating phosphoramidites in oligonucleotide synthesis. Another aspect of the present invention relates to a method of preparing oligonucleotides via the phosphoramidite method using an activator of the invention. Another aspect of the present invention relates to sulfur-transfer agents. In a preferred embodiment, the sulfur-transfer agent is a 3-amino-1,2,4-dithiazolidine-5-one. Another aspect of the present invention relates to a method of preparing a phosphorothioate by treating a phosphite with a sulfur-transfer reagent of the invention. In a preferred embodiment, the sulfur-transfer agent is a 3-amino-1,2,4-dithiazolidine-5-one. Another aspect of the present invention relates to compounds that scavenge acrylonitrile produced during the deprotection of phosphate groups bearing ethylnitrile protecting groups. In a preferred embodiment, the acrylonitrile scavenger is a polymer-bound thiol. Another aspect of the present invention relates to agents used to oxidize a phosphite to a phosphate. In a preferred embodiment, the oxidizing agent is sodium chlorite, chloramine, or pyridine-N-oxide. Another aspect of the present invention relates to methods of purifying an oligonucleotide by annealing a first single-stranded oligonucleotide and second single-stranded oligonucleotide to form a double-stranded oligonucleotide; and subjecting the double-stranded oligonucleotide to chromatographic purification. In a preferred embodiment, the chromatographic purification is high-performance liquid chromatography.

摘要翻译： 本发明涉及寡核苷酸合成和纯化的方法和试剂。 本发明的一个方面涉及可用于在寡核苷酸合成中活化亚磷酰胺的化合物。 本发明的另一方面涉及使用本发明的活化剂通过亚磷酰胺方法制备寡核苷酸的方法。 本发明的另一方面涉及硫转移剂。 在优选的实施方案中，硫转移剂是3-氨基-1,2,4-二噻唑烷-5-酮。 本发明的另一方面涉及通过用本发明的硫转移试剂处理亚磷酸酯制备硫代磷酸酯的方法。 在优选的实施方案中，硫转移剂是3-氨基-1,2,4-二噻唑烷-5-酮。 本发明的另一方面涉及清除在带有乙腈基保护基团的磷酸酯基团去保护过程中产生的丙烯腈的化合物。 在优选的实施方案中，丙烯腈清除剂是聚合物结合的硫醇。 本发明的另一方面涉及用于将亚磷酸盐氧化成磷酸盐的试剂。 在优选的实施方案中，氧化剂是亚氯酸钠，氯胺或吡啶-N-氧化物。 本发明的另一方面涉及通过退火第一单链寡核苷酸和第二单链寡核苷酸来纯化寡核苷酸以形成双链寡核苷酸的方法; 并对双链寡核苷酸进行色谱纯化。 在优选的实施方案中，色谱纯化是高效液相色谱法。

公开(公告)号：US08063198B2

公开(公告)日：2011-11-22

申请号：US12050633

申请日：2008-03-18

申请人： Muthiah Manoharan ,  Michael E. Jung ,  Kallanthottathil G. Rajeev ,  Rajendra K. Pandey ,  Gang Wang

发明人： Muthiah Manoharan ,  Michael E. Jung ,  Kallanthottathil G. Rajeev ,  Rajendra K. Pandey ,  Gang Wang

IPC分类号： C07H21/00 ,  C07C17/07

CPC分类号： C07H21/00 ,  C07H21/04 ,  Y02P20/55

摘要： The present invention relates to processes and reagents for oligonucleotide synthesis and purification. One aspect of the present invention relates to compounds useful for activating phosphoramidites in oligonucleotide synthesis. Another aspect of the present invention relates to a method of preparing oligonucleotides via the phosphoramidite method using an activator of the invention. Another aspect of the present invention relates to sulfur-transfer agents. In a preferred embodiment, the sulfur-transfer agent is a 3-amino-1,2,4-dithiazolidine-5-one. Another aspect of the present invention relates to a method of preparing a phosphorothioate by treating a phosphite with a sulfur-transfer reagent of the invention. In a preferred embodiment, the sulfur-transfer agent is a 3-amino-1,2,4-dithiazolidine-5-one. Another aspect of the present invention relates to compounds that scavenge acrylonitrile produced during the deprotection of phosphate groups bearing ethylnitrile protecting groups. In a preferred embodiment, the acrylonitrile scavenger is a polymer-bound thiol. Another aspect of the present invention relates to agents used to oxidize a phosphite to a phosphate. In a preferred embodiment, the oxidizing agent is sodium chlorite, chloroamine, or pyridine-N-oxide. Another aspect of the present invention relates to methods of purifying an oligonucleotide by annealing a first single-stranded oligonucleotide and second single-stranded oligonucleotide to form a double-stranded oligonucleotide; and subjecting the double-stranded oligonucleotide to chromatographic purification. In a preferred embodiment, the chromatographic purification is high-performance liquid chromatography.

摘要翻译： 本发明涉及用于寡核苷酸合成和纯化的方法和试剂。 本发明的一个方面涉及可用于在寡核苷酸合成中活化亚磷酰胺的化合物。 本发明的另一方面涉及使用本发明的活化剂通过亚磷酰胺方法制备寡核苷酸的方法。 本发明的另一方面涉及硫转移剂。 在优选的实施方案中，硫转移剂是3-氨基-1,2,4-二噻唑烷-5-酮。 本发明的另一方面涉及通过用本发明的硫转移试剂处理亚磷酸酯制备硫代磷酸酯的方法。 在优选的实施方案中，硫转移剂是3-氨基-1,2,4-二噻唑烷-5-酮。 本发明的另一方面涉及清除在带有乙腈基保护基团的磷酸酯基团去保护过程中产生的丙烯腈的化合物。 在优选的实施方案中，丙烯腈清除剂是聚合物结合的硫醇。 本发明的另一方面涉及用于将亚磷酸盐氧化成磷酸盐的试剂。 在优选的实施方案中，氧化剂是亚氯酸钠，氯胺或吡啶-N-氧化物。 本发明的另一方面涉及通过退火第一单链寡核苷酸和第二单链寡核苷酸来纯化寡核苷酸以形成双链寡核苷酸的方法; 并对双链寡核苷酸进行色谱纯化。 在优选的实施方案中，色谱纯化是高效液相色谱法。

公开(公告)号：US20110250138A1

公开(公告)日：2011-10-13

申请号：US12671677

申请日：2008-07-30

申请人： Yupeng Fan ,  Martin Maier ,  Rajendra K. Pandey ,  Muthiah Manoharan ,  Kallanthottathil G. Rajeev

发明人： Yupeng Fan ,  Martin Maier ,  Rajendra K. Pandey ,  Muthiah Manoharan ,  Kallanthottathil G. Rajeev

IPC分类号： A61K49/00 ,  C07F5/00

CPC分类号： A61K49/0017 ,  A61K49/0052 ,  A61K49/085 ,  A61K49/126

摘要： The invention provides modified oligonucleotides of formula (I), comprising at least one metal chelator which provides a powerful tool for study of the pharmacokinetics of siRNA and its correlation with in vivo activity. The chelated metals provide luminescent properties enable detection of the oligonucleotides through the use of time-resolved fluorescent quenching based on energy transfer from the metal ion to a nonfluorescent quencher which can be used as non-isotopic labels of oligonucleotides for diagnostics and evaluation of cellular uptake.

摘要翻译： 本发明提供了修饰的式（I）寡核苷酸，其包含至少一种金属螯合剂，其提供用于研究siRNA的药代动力学的强大工具及其与体内活性的相关性。 螯合金属提供了通过使用基于从金属离子到非荧光猝灭剂的能量转移的时间分辨荧光猝灭来检测寡核苷酸，其可以用作用于诊断和评价细胞摄取的寡核苷酸的非同位素标记 。

公开(公告)号：US20120035115A1

公开(公告)日：2012-02-09

申请号：US13120389

申请日：2009-09-23

申请人： Muthiah Manoharan ,  Kallanthottathil G. Rajeev ,  Takeshi Yamada ,  David Butler ,  K. Narayanannair Jayaprakash ,  Muthusamy Jayraman ,  Shigeo Matsuda ,  Rajendra K. Pandey ,  Chang Geng Peng

发明人： Muthiah Manoharan ,  Kallanthottathil G. Rajeev ,  Takeshi Yamada ,  David Butler ,  K. Narayanannair Jayaprakash ,  Muthusamy Jayraman ,  Shigeo Matsuda ,  Rajendra K. Pandey ,  Chang Geng Peng

IPC分类号： A61K38/14 ,  C07H19/10 ,  C07F9/6561 ,  C07H21/02 ,  A61K31/7072 ,  A61K31/675 ,  C07H1/00 ,  A61P31/12 ,  A61P31/04 ,  A61P33/00 ,  A61P35/00 ,  A61P37/08 ,  A61P37/06 ,  A61P37/04 ,  C07K9/00 ,  A61K31/7088

CPC分类号： C12N15/113 ,  A61K31/713 ,  A61K47/544 ,  A61K47/64 ,  C07H21/00 ,  C12N2310/14 ,  C12N2310/141 ,  C12N2310/3513 ,  C12N2310/3515 ,  H04L65/602 ,  H04L67/36 ,  Y02A50/465

摘要： The invention features compounds of formula I or II: In one embodiment, the invention relates compounds and processes for conjugating ligand to oligonucleotide. The invention further relates to methods for treating various disorders and diseases such as viral infections, bacterial infections, parasitic infections, cancers, allergies, autoimmune diseases, immunodeficiencies and immunosuppression.

摘要翻译： 本发明的特征在于式I或II化合物：在一个实施方案中，本发明涉及将配体与寡核苷酸缀合的化合物和方法。 本发明还涉及治疗各种病症和疾病如病毒感染，细菌感染，寄生虫感染，癌症，过敏症，自身免疫疾病，免疫缺陷和免疫抑制的方法。

公开(公告)号：US08962580B2

公开(公告)日：2015-02-24

申请号：US13120389

申请日：2009-09-23

申请人： Muthiah Manoharan ,  Kallanthottathil G. Rajeev ,  Takeshi Yamada ,  David Butler ,  Narayanannair K. Jayaprakash ,  Muthusamy Jayaraman ,  Shigeo Matsuda ,  Rajendra K. Pandey ,  Chang Geng Peng

发明人： Muthiah Manoharan ,  Kallanthottathil G. Rajeev ,  Takeshi Yamada ,  David Butler ,  Narayanannair K. Jayaprakash ,  Muthusamy Jayaraman ,  Shigeo Matsuda ,  Rajendra K. Pandey ,  Chang Geng Peng

IPC分类号： A61K48/00 ,  H04L29/06 ,  C07H21/00 ,  H04L29/08

CPC分类号： C12N15/113 ,  A61K31/713 ,  A61K47/544 ,  A61K47/64 ,  C07H21/00 ,  C12N2310/14 ,  C12N2310/141 ,  C12N2310/3513 ,  C12N2310/3515 ,  H04L65/602 ,  H04L67/36 ,  Y02A50/465

摘要： The invention features compounds of formula I or II: In one embodiment, the invention relates compounds and processes for conjugating ligand to oligonucleotide. The invention further relates to methods for treating various disorders and diseases such as viral infections, bacterial infections, parasitic infections, cancers, allergies, autoimmune diseases, immunodeficiencies and immunosuppression.

摘要翻译： 本发明的特征在于式I或II化合物：在一个实施方案中，本发明涉及将配体与寡核苷酸缀合的化合物和方法。 本发明还涉及治疗各种病症和疾病如病毒感染，细菌感染，寄生虫感染，癌症，过敏症，自身免疫疾病，免疫缺陷和免疫抑制的方法。

公开(公告)号：US09186325B2

公开(公告)日：2015-11-17

申请号：US13128283

申请日：2009-11-10

申请人： Muthiah Manoharan ,  Muthusamy Jayaraman ,  Kallanthottathil G. Rajeev ,  Laxman Eltepu ,  Steven Ansell ,  Jianxin Chen

发明人： Muthiah Manoharan ,  Muthusamy Jayaraman ,  Kallanthottathil G. Rajeev ,  Laxman Eltepu ,  Steven Ansell ,  Jianxin Chen

IPC分类号： A61K39/12 ,  A61K9/127 ,  A61K39/00 ,  C12N15/11

CPC分类号： A61K47/44 ,  A61K9/1272 ,  A61K31/7088 ,  A61K31/713 ,  A61K39/00 ,  A61K39/39 ,  A61K47/10 ,  A61K47/18 ,  A61K47/20 ,  A61K47/28 ,  A61K2039/55555 ,  A61K2039/55561 ,  C07C229/08 ,  C07C229/30 ,  C07C237/16 ,  C07C251/38 ,  C07C251/78 ,  C07C271/12 ,  C07C271/20 ,  C07C323/25 ,  C07D203/10 ,  C07D317/28 ,  C07D317/44 ,  C07D317/46 ,  C07D317/72 ,  C07D319/06 ,  C07D405/12 ,  C07D491/056 ,  C07D491/113 ,  C12N15/111 ,  C12N15/113 ,  C12N2310/14 ,  C12N2310/3515 ,  C12N2320/32 ,  Y02A50/464

摘要： The present invention provides lipids that are advantageously used in lipid particles for the in vivo delivery of therapeutic agents to cells. In particular, the invention formula (I) provides lipids having the following structure XXXIII wherein: R1 and R2 are each independently for each occurrence optionally substituted C10-C30 alkyl, optionally substituted C10-C30 alkenyl, optionally substituted C10-C30 alkynyl, optionally substituted C10-C30 acyl, or -linker-ligand; R3 is H, optionally substituted C1-C10 alkyl, optionally substituted C2-C10 alkenyl, optionally substituted C2-C10 alkynyl, alky lhetro cycle, alkylphosphate, alkylphosphorothioate, alkylphosphorodithioate, alkylphosphonates, alkylamines, hydroxyalkyls, ω-aminoalkyls, ω-(substituted)aminoalkyls, ω-phosphoalkyls, ω-thiophosphoalkyls, optionally substituted polyethylene glycol (PEG, mw 100-40K), optionally substituted mPEG (mw 120-40K), heteroaryl, heterocycle, or linker-ligand; and E is C(O)O or OC(O).

摘要翻译： 本发明提供有利地用于脂质颗粒以用于体内递送治疗剂至细胞的脂质。 具体地，本发明式（I）提供具有以下结构XXXIII的脂质，其中：R1和R2各自独立地为任何取代的C 10 -C 30烷基，任选取代的C 10 -C 30烯基，任选取代的C 10 -C 30炔基，任选取代的 C10-C30酰基或 - 连接子 - 配体; R 3是H，任选取代的C 1 -C 10烷基，任选取代的C 2 -C 10烯基，任选取代的C 2 -C 10炔基，烷基杂芳基，烷基磷酸酯，烷基硫代磷酸酯，烷基磷酸二烷基酯，烷基膦酸酯，烷基胺，羟基烷基，ω-氨基烷基，ω-（取代的） 氨基烷基，ω-磷酸烷基酯，ω-硫代磷酰基烷基，任选取代的聚乙二醇（PEG，mw 100-40K），任选取代的mPEG（mw 120-40K），杂芳基，杂环或连接体 - 配体; 并且E是C（O）O或OC（O）。

公开(公告)号：US08754201B2

公开(公告)日：2014-06-17

申请号：US12721413

申请日：2010-03-10

申请人： Muthiah Manoharan ,  Kallanthottathil G. Rajeev ,  David Bumcrot

发明人： Muthiah Manoharan ,  Kallanthottathil G. Rajeev ,  David Bumcrot

IPC分类号： C07H21/04 ,  C12N15/113

CPC分类号： C12N15/113 ,  A01K67/0275 ,  A01K2217/05 ,  A01K2227/105 ,  A01K2267/0362 ,  A61K31/713 ,  A61K47/48123 ,  C07H21/02 ,  C07K14/775 ,  C12N15/111 ,  C12N15/1137 ,  C12N15/1138 ,  C12N2310/14 ,  C12N2310/315 ,  C12N2310/321 ,  C12N2310/344 ,  C12N2310/3515 ,  C12N2310/533 ,  C12N2320/32 ,  C12N2320/51 ,  C12N2320/53 ,  C12N2330/30

摘要： This application relates to therapeutic siRNA agents and methods of making and using the agents.

摘要翻译： 本申请涉及治疗性siRNA剂及其制备和使用方法。

公开(公告)号：US08642076B2

公开(公告)日：2014-02-04

申请号：US13211094

申请日：2011-08-16

申请人： Muthiah Manoharan ,  Kallanthottathil G. Rajeev ,  Akin Akinc ,  Narayanannair K. Jayaprakash ,  Muthusamy Jayaraman ,  Martin Maier

发明人： Muthiah Manoharan ,  Kallanthottathil G. Rajeev ,  Akin Akinc ,  Narayanannair K. Jayaprakash ,  Muthusamy Jayaraman ,  Martin Maier

IPC分类号： A61K9/48

CPC分类号： C07C219/06 ,  A61K9/1272 ,  A61K9/1273 ,  A61K31/325 ,  A61K47/34 ,  C07C209/78 ,  C07C233/36 ,  C07C271/10 ,  C07C323/25

摘要： Compositions and methods useful in administering nucleic acid based therapies, for example association complexes such as liposomes and lipoplexes are described.

摘要翻译： 描述了用于施用基于核酸的疗法，例如缔合复合物如脂质体和脂质复合物的组合物和方法。