公开(公告)号：US20190010480A1

公开(公告)日：2019-01-10

申请号：US15752543

申请日：2016-08-29

申请人： Regents of the University of California

发明人： Justin Siegel ,  Steve Bertolani ,  Wai Shun Mak ,  James Liao ,  Stephen Tran ,  Ryan Marcheschi ,  James Thompson ,  David Baker

IPC分类号： C12N9/88 ,  C12N15/52 ,  C12P7/04

CPC分类号： C12N9/88 ,  C07K2319/70 ,  C12N15/52 ,  C12P7/04 ,  C12Y101/01086 ,  C12Y401/01001

摘要： 2-ketoacid decarboxylase enzymes, compositions encoding for 2 ketoacid decarboxylase enzymes, and host cells comprising such enzymes or compositions are provided

公开(公告)号：US20170275653A1

公开(公告)日：2017-09-28

申请号：US15467340

申请日：2017-03-23

申请人： Alliance for Sustainable Energy, LLC

发明人： Yannick J. BOMBLE ,  Michael E. HIMMEL ,  Jeffrey LINGER ,  Roman BRUNECKY ,  John AIKENS

IPC分类号： C12P7/18 ,  C12N9/10 ,  C12N9/02 ,  C12N11/00 ,  C12N9/04

CPC分类号： C12P7/18 ,  C07K14/195 ,  C12N9/0006 ,  C12N9/0008 ,  C12N9/0036 ,  C12N9/1022 ,  C12N11/00 ,  C12N11/06 ,  C12N11/18 ,  C12N15/62 ,  C12P7/42 ,  C12Y101/01006 ,  C12Y101/01076 ,  C12Y101/01086 ,  C12Y102/01 ,  C12Y102/01003 ,  C12Y106/03 ,  C12Y106/03001 ,  C12Y202/01006

摘要： Polypeptide scaffolds comprising enzymatic proteins are provided. The enzymatic polypeptide scaffolds comprise heterologous enzymes to form a heterologous metabolic pathway, and can be targeted to a substrate through a surface anchoring domain. The enzymatic polypeptide scaffolds leverage the high specificity and affinity protein/protein interaction between the cohesins and dockerins of microorganismal cellulosomes to form custom enzymatic arrays.

公开(公告)号：US09506071B2

公开(公告)日：2016-11-29

申请号：US14715992

申请日：2015-05-19

申请人： Butamax Advanced Biofuels LLC

发明人： Gail K. Donaldson ,  Andrew C. Eliot ,  Dennis Flint ,  Lori Ann Maggio-Hall ,  Vasantha Nagarajan

IPC分类号： C12P7/16 ,  C12N9/88 ,  C12N9/10 ,  C12N15/52 ,  C12N9/04 ,  C12N9/02 ,  C12N9/06 ,  C12N15/81 ,  C12N15/70 ,  C12N15/75 ,  C12N15/74

CPC分类号： C12P7/16 ,  C12N9/0006 ,  C12N9/0008 ,  C12N9/0016 ,  C12N9/1022 ,  C12N9/1096 ,  C12N9/88 ,  C12N15/52 ,  C12N15/70 ,  C12N15/74 ,  C12N15/746 ,  C12N15/75 ,  C12N15/81 ,  C12Y101/01001 ,  C12Y101/01002 ,  C12Y101/01086 ,  C12Y102/00 ,  C12Y102/01003 ,  C12Y102/04004 ,  C12Y202/01006 ,  C12Y401/01072 ,  C12Y402/01009 ,  Y02E50/10 ,  Y02E50/343 ,  Y02P20/52

摘要： Methods for the fermentative production of four carbon alcohols is provided. Specifically, butanol, preferably isobutanol is produced by the fermentative growth of a recombinant bacterium expressing an isobutanol biosynthetic pathway.

公开(公告)号：US09267158B2

公开(公告)日：2016-02-23

申请号：US14206835

申请日：2014-03-12

申请人： Intrexon Corporation

发明人： William J. Coleman ,  Genevieve M. Vidanes ,  Guillaume Cottarel ,  Sheela Muley ,  Roy Kamimura ,  Akbar F. Javan ,  Jianping Sun ,  Eli S. Groban

IPC分类号： C12P7/16 ,  C12N9/04 ,  C12N9/10 ,  C12N9/88

CPC分类号： C12P7/16 ,  C12N9/0006 ,  C12N9/1022 ,  C12N9/1025 ,  C12N9/88 ,  C12N15/52 ,  C12Y101/01001 ,  C12Y101/01004 ,  C12Y101/01086 ,  C12Y202/01006 ,  C12Y203/03006 ,  C12Y401/01072 ,  C12Y402/01009 ,  C12Y402/01033 ,  C12Y403/01019 ,  Y02E50/10

摘要： Multi-carbon compounds such as ethanol, n-butanol, sec-butanol, isobutanol, tert-butanol, fatty (or aliphatic long chain) alcohols, fatty acid methyl esters, 2,3-butanediol and the like, are important industrial commodity chemicals with a variety of applications. The present invention provides metabolically engineered host microorganisms which metabolize methane (CH4) as their sole carbon source to produce multi-carbon compounds for use in fuels (e.g., bio-fuel, bio-diesel) and bio-based chemicals. Furthermore, use of the metabolically engineered host microorganisms of the invention (which utilize methane as the sole carbon source) mitigate current industry practices and methods of producing multi-carbon compounds from petroleum or petroleum-derived feedstocks, and ameliorate much of the ongoing depletion of arable food source “farmland” currently being diverted to grow bio-fuel feedstocks, and as such, improve the environmental footprint of future bio-fuel, bio-diesel and bio-based chemical compositions.

摘要翻译： 多碳化合物如乙醇，正丁醇，仲丁醇，异丁醇，叔丁醇，脂肪（或脂肪族长链）醇，脂肪酸甲酯，2,3-丁二醇等是重要的工业商品化学品 具有多种应用。 本发明提供代谢工程的宿主微生物，其代谢甲烷（CH4）作为其唯一的碳源，以生产用于燃料（例如生物燃料，生物柴油）和生物基化学品的多碳化合物。 此外，使用本发明的代谢工程的宿主微生物（其利用甲烷作为唯一碳源）减轻了目前的行业实践和从石油或石油衍生的原料生产多碳化合物的方法，并且改善了大部分正在进行的耗尽 目前正在转用生物燃料原料的可耕食源“农田”，从而改善未来生物燃料，生物柴油和生物基化学成分的环境足迹。

公开(公告)号：US09169467B2

公开(公告)日：2015-10-27

申请号：US13891963

申请日：2013-05-10

申请人： BUTAMAX ADVANCED BIOFUELS, LLC

发明人： Sridhar Govindarajan ,  Yougen Li ,  Der-Ing Liao ,  Daniel P. O'Keefe ,  Jeremy Stephen Minshull ,  Steven Cary Rothman ,  Alexander Vincent Tobias

IPC分类号： C12N9/04 ,  C12P7/16

CPC分类号： C12N9/0006 ,  C12P7/16 ,  C12P7/42 ,  C12P7/44 ,  C12P13/02 ,  C12P13/06 ,  C12P13/08 ,  C12Y101/01086 ,  Y02E50/10 ,  Y02P20/52

摘要： Provided herein are polypeptides having ketol-aid reductoisomerase activity as well as microbial host cells comprising such polypeptides. Polypeptides provided herein may be used in biosynthetic pathways, including, but not limited to, isobutanol biosynthetic pathways.

摘要翻译： 本文提供具有酮促辅助还原异构酶活性的多肽以及包含这种多肽的微生物宿主细胞。 本文提供的多肽可用于生物合成途径，包括但不限于异丁醇生物合成途径。

公开(公告)号：US20150218594A1

公开(公告)日：2015-08-06

申请号：US14422192

申请日：2013-08-20

申请人： Michael Kraus ,  André Koltermann ,  Ulrich Kettling ,  Daniel Garbe ,  Thomas Brueck ,  Jan-Karl Guterl ,  Volker Sieber

发明人： Michael Kraus ,  André Koltermann ,  Ulrich Kettling ,  Daniel Garbe ,  Thomas Brueck ,  Jan-Karl Guterl ,  Volker Sieber

IPC分类号： C12P7/16 ,  C12N9/10 ,  C12N9/88 ,  C12N9/02 ,  C12P7/14 ,  C12N9/04

CPC分类号： C12P7/16 ,  C12N9/0006 ,  C12N9/0008 ,  C12N9/1022 ,  C12N9/88 ,  C12N15/52 ,  C12P7/06 ,  C12P7/14 ,  C12Y101/01001 ,  C12Y101/01047 ,  C12Y101/01086 ,  C12Y102/01003 ,  C12Y202/01006 ,  C12Y401/02014 ,  C12Y402/01009 ,  Y02E50/10 ,  Y02E50/17

摘要： Provided are enzymatic processes for the production of chemicals like ethanol from carbon sources like glucose, in particular, a process for the production of a target chemical is disclosed using a cell-free enzyme system that converts carbohydrate sources to the intermediate pyruvate and subsequently the intermediate pyruvate to the target chemical wherein a minimized number of enzymes and only one cofactor is employed.

摘要翻译： 提供了用于生产诸如葡萄糖等碳源的化学品如乙醇的酶促方法，特别是使用无细胞酶系统公开了生产目标化学物质的方法，该方法将碳水化合物源转化为中间体丙酮酸盐，随后将中间体 丙酮酸至目标化学品，其中使用最少量的酶和仅使用一种辅因子。

公开(公告)号：US09068190B2

公开(公告)日：2015-06-30

申请号：US13539125

申请日：2012-06-29

申请人： Gail K. Donaldson ,  Andrew C. Eliot ,  Dennis Flint ,  Lori Ann Maggio-Hall ,  Vasantha Nagarajan

发明人： Gail K. Donaldson ,  Andrew C. Eliot ,  Dennis Flint ,  Lori Ann Maggio-Hall ,  Vasantha Nagarajan

IPC分类号： C12P21/06 ,  C12P7/16 ,  C12N9/00 ,  C12N1/20 ,  C07H21/04 ,  C12N15/81 ,  C12N9/04 ,  C12N9/02 ,  C12N9/06 ,  C12N9/10 ,  C12N9/88 ,  C12N15/52 ,  C12N15/70 ,  C12N15/75 ,  C12N15/74

CPC分类号： C12P7/16 ,  C12N9/0006 ,  C12N9/0008 ,  C12N9/0016 ,  C12N9/1022 ,  C12N9/1096 ,  C12N9/88 ,  C12N15/52 ,  C12N15/70 ,  C12N15/74 ,  C12N15/746 ,  C12N15/75 ,  C12N15/81 ,  C12Y101/01001 ,  C12Y101/01002 ,  C12Y101/01086 ,  C12Y102/00 ,  C12Y102/01003 ,  C12Y102/04004 ,  C12Y202/01006 ,  C12Y401/01072 ,  C12Y402/01009 ,  Y02E50/10 ,  Y02E50/343 ,  Y02P20/52

摘要： Methods for the fermentative production of four carbon alcohols is provided. Specifically, butanol, preferably isobutanol is produced by the fermentative growth of a recombinant bacterium expressing an isobutanol biosynthetic pathway.

公开(公告)号：US08889385B2

公开(公告)日：2014-11-18

申请号：US13838949

申请日：2013-03-15

申请人： Butamax(TM) Advanced Biofuels LLC

发明人： Gail K. Donaldson ,  Andrew C. Eliot ,  Dennis Flint ,  Lori Ann Maggio-Hall ,  Vasantha Nagarajan

IPC分类号： C12P21/06 ,  C12P7/04 ,  C12P7/16 ,  C12N9/00 ,  C12N1/20 ,  C12N15/00 ,  C07H21/04 ,  C12N15/52 ,  C12N15/75 ,  C12N15/74 ,  C12N9/02 ,  C12N9/10 ,  C12N15/81 ,  C12N9/88 ,  C12N9/06 ,  C12N9/04 ,  C12N15/70

CPC分类号： C12P7/16 ,  C12N9/0006 ,  C12N9/0008 ,  C12N9/0016 ,  C12N9/1022 ,  C12N9/1096 ,  C12N9/88 ,  C12N15/52 ,  C12N15/70 ,  C12N15/74 ,  C12N15/746 ,  C12N15/75 ,  C12N15/81 ,  C12Y101/01001 ,  C12Y101/01002 ,  C12Y101/01086 ,  C12Y102/00 ,  C12Y102/01003 ,  C12Y102/04004 ,  C12Y202/01006 ,  C12Y401/01072 ,  C12Y402/01009 ,  Y02E50/10 ,  Y02E50/343 ,  Y02P20/52

摘要： Methods for the fermentative production of four carbon alcohols is provided. Specifically, butanol, preferably isobutanol is produced by the fermentative growth of a recombinant bacterium expressing an isobutanol biosynthetic pathway.

摘要翻译： 提供了发酵生产四种碳醇的方法。 具体地，通过表达异丁醇生物合成途径的重组细菌的发酵生长来制备丁醇，优选异丁醇。

公开(公告)号：US20140335582A1

公开(公告)日：2014-11-13

申请号：US14339388

申请日：2014-07-23

申请人： Butamax Advanced Biofuels LLC

发明人： Gail K. DONALDSON ,  Andrew C. Eliot ,  Dennis Flint ,  Michael Charles Grady ,  Mehmedalija Jahic ,  Lori Ann Maggio-Hall ,  Vasantha Nagarajan ,  Ranjan Patnaik

IPC分类号： C10L1/182 ,  C12P7/16

CPC分类号： C10L1/1824 ,  C12N9/0006 ,  C12N9/0008 ,  C12N9/0016 ,  C12N9/1022 ,  C12N9/1096 ,  C12N9/88 ,  C12N15/52 ,  C12N15/81 ,  C12P7/16 ,  C12Y101/01001 ,  C12Y101/01086 ,  C12Y102/04004 ,  C12Y202/01006 ,  C12Y401/01072 ,  C12Y402/01009 ,  Y02E50/10 ,  Y02P20/52

摘要： Methods for the fermentative production of four carbon alcohols is provided. Specifically, butanol, preferably isobutanol is produced by the fermentative growth of a recombinant bacterium expressing an isobutanol biosynthetic pathway.

摘要翻译： 提供了发酵生产四种碳醇的方法。 具体地，通过表达异丁醇生物合成途径的重组细菌的发酵生长来生产丁醇，优选异丁醇。

公开(公告)号：US20140004526A1

公开(公告)日：2014-01-02

申请号：US13730742

申请日：2012-12-28

申请人： Butamax™ Advanced Biofuels LLC

发明人： Michael DAUNER ,  Arthur Leo Kruckeberg ,  Robert A. Larossa ,  Brian James Paul

IPC分类号： C12P7/16 ,  C12P7/26

CPC分类号： C12P7/16 ,  C12P7/26 ,  C12Y101/01001 ,  C12Y101/01008 ,  C12Y101/01043 ,  C12Y101/01047 ,  C12Y101/01086 ,  C12Y202/01006 ,  C12Y203/01008 ,  C12Y301/01031 ,  C12Y301/03009 ,  C12Y401/02009 ,  Y02E50/10

摘要： The invention relates to suitable screening strategies for evaluating various candidate promoters for differential gene expression during the propagation and production phases of a fermentation process. The invention also relates to recombinant host cells that comprise identified promoter nucleic acid sequences and methods for producing fermentation products employing the same.

摘要翻译： 本发明涉及用于评估在发酵过程的繁殖和生产阶段期间差异基因表达的各种候选启动子的合适的筛选策略。 本发明还涉及包含鉴定的启动子核酸序列的重组宿主细胞和使用其的发酵产物的生产方法。