公开(公告)号：US11085076B2

公开(公告)日：2021-08-10

申请号：US15763364

申请日：2016-09-28

申请人： Jingyue Ju ,  Xiaoxu Li ,  Xin Chen ,  Zengmin Li ,  Shiv Kumar ,  Shundi Shi ,  Cheng Guo ,  Jianyi Ren ,  Min-Kang Hsieh ,  Minchen Chien ,  Chuanjuan Tao ,  Ece Erturk ,  Sergey Kalachikov ,  James J. Russo

发明人： Jingyue Ju ,  Xiaoxu Li ,  Xin Chen ,  Zengmin Li ,  Shiv Kumar ,  Shundi Shi ,  Cheng Guo ,  Jianyi Ren ,  Min-Kang Hsieh ,  Minchen Chien ,  Chuanjuan Tao ,  Ece Erturk ,  Sergey Kalachikov ,  James J. Russo

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C07H19/10 ,  C07H19/14 ,  C07H19/20 ,  C12Q1/6869

摘要： Disclosed herein, inter alia, are compounds, compositions, and methods of use thereof in the sequencing of a nucleic acid.

公开(公告)号：US20220411860A1

公开(公告)日：2022-12-29

申请号：US17373295

申请日：2021-07-12

申请人： Jingyue Ju ,  Xiaoxu Li ,  Xin Chen ,  Zengmin Li ,  Shiv Kumar ,  Shundi Shi ,  Cheng Guo ,  Jianyi Ren ,  Min-Kang Hsieh ,  Minchen Chien ,  Chuanjuan Tao ,  Ece Erturk ,  Sergey Kalachikov ,  James J. Russo

发明人： Jingyue Ju ,  Xiaoxu Li ,  Xin Chen ,  Zengmin Li ,  Shiv Kumar ,  Shundi Shi ,  Cheng Guo ,  Jianyi Ren ,  Min-Kang Hsieh ,  Minchen Chien ,  Chuanjuan Tao ,  Ece Erturk ,  Sergey Kalachikov ,  James J. Russo

IPC分类号： C12Q1/6869 ,  C07H19/10 ,  C07H19/14 ,  C07H19/20

摘要： Disclosed herein, inter alfa, are compounds, compositions, and methods of use thereof in the sequencing of a nucleic acid.

公开(公告)号：US10662463B2

公开(公告)日：2020-05-26

申请号：US15560820

申请日：2016-03-22

申请人： Jingyue Ju ,  Youngjin Cho ,  Shiv Kumar ,  Sergey Kalachikov ,  Chuanjuan Tao ,  Minchen Chien ,  James J. Russo

发明人： Jingyue Ju ,  Youngjin Cho ,  Shiv Kumar ,  Sergey Kalachikov ,  Chuanjuan Tao ,  Minchen Chien ,  James J. Russo

IPC分类号： C12Q1/6827 ,  C12Q1/6869 ,  G01N33/487

摘要： This invention provides methods of using labeled nucleotide polyphosphate analogues to detect the identity or presence of a nucleotide at certain positions in nucleic acid sequences with single molecule sensitivity using nanopore detection, nucleotides and primer-conjugated nanopore proteins for use in such methods, and processes for producing such nucleotides and primer-conjugated nanopore proteins.

公开(公告)号：US20130264207A1

公开(公告)日：2013-10-10

申请号：US13994431

申请日：2011-12-16

申请人： Jingyue Ju ,  Shiv Kumar ,  Zengmin Li ,  Chuanjuan Tao ,  Minchen Chien ,  James J. Russo ,  Sergey Kalachikov ,  Ken Shepard ,  Jacob Karl Rosenstein

发明人： Jingyue Ju ,  Shiv Kumar ,  Zengmin Li ,  Chuanjuan Tao ,  Minchen Chien ,  James J. Russo ,  Sergey Kalachikov ,  Ken Shepard ,  Jacob Karl Rosenstein

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C07H21/00 ,  C07H19/10

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  C07H19/10 ,  C07H21/00 ,  G01N33/48721 ,  C12Q2525/113 ,  C12Q2525/117 ,  C12Q2565/518 ,  C12Q2565/631

摘要： This disclosure is related to a method of sequencing a single-stranded DNA using deoxynucleotide polyphosphate analogues and translocation of tags from incorporated deoxynucleotide polyphosphate analogues through a nanopore.

摘要翻译： 本公开涉及使用脱氧核苷酸多磷酸酯类似物测序单链DNA并通过纳米孔从掺入的脱氧核苷酸多磷酸酯类似物转运标签的方法。

公开(公告)号：US11499186B2

公开(公告)日：2022-11-15

申请号：US16653278

申请日：2019-10-15

申请人： Jingyue Ju ,  Shiv Kumar ,  Zengmin Li ,  Chuanjuan Tao ,  Minchen Chien ,  James J. Russo ,  Sergey Kalachikov ,  Ken Shepard ,  Jacob Karl Rosenstein

发明人： Jingyue Ju ,  Shiv Kumar ,  Zengmin Li ,  Chuanjuan Tao ,  Minchen Chien ,  James J. Russo ,  Sergey Kalachikov ,  Ken Shepard ,  Jacob Karl Rosenstein

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12Q1/6869 ,  C07H19/10 ,  C07H21/00 ,  G01N33/487

摘要： This disclosure is related to a method of sequencing a single-stranded DNA using deoxynucleotide polyphosphate analogues and translocation of tags from incorporated deoxynucleotide polyphosphate analogues through a nanopore.

公开(公告)号：US10443096B2

公开(公告)日：2019-10-15

申请号：US13994431

申请日：2011-12-16

申请人： Jingyue Ju ,  Shiv Kumar ,  Zengmin Li ,  Chuanjuan Tao ,  Minchen Chien ,  James J. Russo ,  Sergey Kalachikov ,  Ken Shepard ,  Jacob Karl Rosenstein

发明人： Jingyue Ju ,  Shiv Kumar ,  Zengmin Li ,  Chuanjuan Tao ,  Minchen Chien ,  James J. Russo ,  Sergey Kalachikov ,  Ken Shepard ,  Jacob Karl Rosenstein

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12Q1/6869 ,  C07H19/10 ,  C07H21/00 ,  G01N33/487

摘要： This disclosure is related to a method of sequencing a single-stranded DNA using deoxynucleotide polyphosphate analogues and translocation of tags from incorporated deoxynucleotide polyphosphate analogues through a nanopore.

公开(公告)号：US20170058335A1

公开(公告)日：2017-03-02

申请号：US15118812

申请日：2015-02-12

申请人： Chuanjuan Tao ,  Shiv Kumar ,  Minchen Chien ,  Jingyue Ju

发明人： Chuanjuan Tao ,  Shiv Kumar ,  Minchen Chien ,  Jingyue Ju

IPC分类号： C12Q1/68

摘要： This invention provides methods of using labeled primers or probes for nucleic acid target detection and to detect the identity or presence of a nucleotide at certain positions in nucleic acid sequences with single molecule sensitivity using nanopore detection, and sets of oligonucleotide primers for use in such methods, as well as methods of quantitative PCR coupled with nanopore detection.

摘要翻译： 本发明提供使用标记的引物或探针用于核酸靶标检测的方法，并使用纳米孔检测法检测具有单分子敏感性的核酸序列的某些位置的核苷酸的同一性或存在，以及用于这些方法的寡核苷酸引物组 ，以及与纳米孔检测结合的定量PCR方法。

公开(公告)号：US20150111759A1

公开(公告)日：2015-04-23

申请号：US14391320

申请日：2013-04-08

申请人： Jingyue Ju ,  Shiv Kumar ,  Chuanjuan Tao ,  Minchen Chien ,  James J. Russo ,  John J. Kasianowicz ,  Joseph W.F. Robertson

发明人： Jingyue Ju ,  Shiv Kumar ,  Chuanjuan Tao ,  Minchen Chien ,  James J. Russo ,  John J. Kasianowicz ,  Joseph W.F. Robertson

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C07H19/00 ,  B82Y5/00 ,  C07H19/06 ,  C07H19/16 ,  C12Q1/42 ,  C12Q1/48 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/6883 ,  C12Q2600/158 ,  G01N33/48721 ,  G01N2333/9125 ,  C12Q2521/525 ,  C12Q2521/543 ,  C12Q2535/107 ,  C12Q2565/631

摘要： This disclosure provides systems and methods for sequencing nucleic acids using nucleotide analogues and translocation of tags from incorporated nucleotide analogues through a nanopore. In aspects, this disclosure is related to composition, method, and system for sequencing a nucleic acid using tag molecules and detection of translocation through a nanopore of tags released from incorporation of the molecule.

摘要翻译： 本公开提供了使用核苷酸类似物对核酸进行测序的系统和方法，以及通过纳米孔从掺入的核苷酸类似物转移标签。 在一些方面，本公开涉及使用标签分子对核酸进行测序的组合物，方法和系统，以及通过从分子掺入释放的标记的纳米孔的易位检测。

公开(公告)号：US11999999B2

公开(公告)日：2024-06-04

申请号：US17373295

申请日：2021-07-12

申请人： Jingyue Ju ,  Xiaoxu Li ,  Xin Chen ,  Zengmin Li ,  Shiv Kumar ,  Shundi Shi ,  Cheng Guo ,  Jianyi Ren ,  Min-Kang Hsieh ,  Minchen Chien ,  Chuanjuan Tao ,  Ece Erturk ,  Sergey Kalachikov ,  James J. Russo

发明人： Jingyue Ju ,  Xiaoxu Li ,  Xin Chen ,  Zengmin Li ,  Shiv Kumar ,  Shundi Shi ,  Cheng Guo ,  Jianyi Ren ,  Min-Kang Hsieh ,  Minchen Chien ,  Chuanjuan Tao ,  Ece Erturk ,  Sergey Kalachikov ,  James J. Russo

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C07H19/10 ,  C07H19/14 ,  C07H19/20 ,  C12Q1/6869

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  C07H19/10 ,  C07H19/14 ,  C07H19/20 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2525/117 ,  C12Q2563/107

摘要： Disclosed herein, inter alia, are compounds, compositions, and methods of use thereof in the sequencing of a nucleic acid.

公开(公告)号：US20190309008A1

公开(公告)日：2019-10-10

申请号：US16371646

申请日：2019-04-01

申请人： Jingyue JU ,  Shiv KUMAR ,  Chuanjuan TAO ,  Minchen CHIEN ,  James J. RUSSO ,  John J. KASIANOWICZ ,  Joseph W.F. ROBERTSON

发明人： Jingyue JU ,  Shiv KUMAR ,  Chuanjuan TAO ,  Minchen CHIEN ,  James J. RUSSO ,  John J. KASIANOWICZ ,  Joseph W.F. ROBERTSON

IPC分类号： C07H19/00 ,  C12Q1/48 ,  C12Q1/42 ,  C07H19/16 ,  C12Q1/6869 ,  C07H19/06 ,  G01N33/487 ,  C12Q1/6883

摘要： This disclosure provides systems and methods for sequencing nucleic acids using nucleotide analogues and translocation of tags from incorporated nucleotide analogues through a nanopore. In aspects, this disclosure is related to composition, method, and system for sequencing a nucleic acid using tag molecules and detection of translocation through a nanopore of tags released from incorporation of the molecule.